Aniseed - Transcript Card

Transcript Model

Transcript Id

Phmamm.CG.MTP2014.S91.g02969.02.t

Possible name(s)

DEGS1; DEGS2; SEZ6L

Gene model

Phmamm.CG.MTP2014.S91.g02969

Location

S91 [122,869 / 125,229]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 398

>Phmamm.CG.MTP2014.S91.g02969.02.p
EFGVNRNILIRIVDFKLIMGAKVSREDFQWTYTDQPHGDRRKAMLKKYPQIKQLFVTDNH
FTYVVAAMVAMQVVMCYLVKDMSWPAAIFWAYVFGGSINHSLTLAIHDISHNTAFGYHHS
RWNRYFGMFANLPIGVPMSIGFKKYHIDHHRYLGGDNLDVDLPTEWEGRFFGNSFMKIIW
LFLNPLFYVLRPLAVNPKPITTLEIHNLFIQLLFDGWILHMWGVKPVVYLFAGTLLSLGL
HPISGHFISEHYMYTQGFETYSYYGSLNLITFNVGYHVEHHDFPAIPSSKLPLMKKIAPD
YYDELPFYTSWCKVLWDFVFDPAIGPFARIRRDIDLKGKTKASESNGAIQNGHQPNGVKQ
NGISNGHVGNGKICSKGSSNGIANGHMVNGNGHVPMQS

Nucleotide sequence

Length: 1,451

>Phmamm.CG.MTP2014.S91.g02969.02.t
GGAGTTTGGGGTTAATAGGAACATTTTAATTAGAATTGTAGATTTTAAGCTAATCATGGG
GGCAAAAGTGTCCAGAGAAGATTTTCAGTGGACATACACTGATCAACCACATGGGGATAG
AAGAAAAGCCATGCTTAAAAAATACCCACAAATCAAGCAGCTATTCGTCACAGACAACCA
CTTTACGTATGTTGTGGCAGCCATGGTGGCTATGCAAGTTGTCATGTGCTATTTGGTTAA
GGATATGAGTTGGCCTGCGGCAATATTTTGGGCTTATGTTTTCGGTGGATCTATCAATCA
CTCCCTCACTTTGGCAATTCATGACATTTCGCACAACACAGCTTTTGGCTACCACCATTC
AAGGTGGAACCGCTACTTTGGGATGTTTGCAAATCTTCCTATTGGTGTTCCAATGTCGAT
TGGTTTTAAAAAATATCACATCGACCATCACCGATATTTGGGTGGTGACAATTTAGATGT
TGATCTGCCGACAGAATGGGAAGGAAGATTTTTTGGCAACAGTTTTATGAAAATAATCTG
GTTGTTCCTTAACCCTCTCTTCTATGTTCTGAGACCACTGGCTGTGAACCCCAAACCTAT
CACAACATTAGAAATACACAATCTCTTTATTCAATTGTTGTTTGATGGATGGATTTTGCA
TATGTGGGGTGTAAAACCAGTTGTGTACCTGTTTGCTGGCACCCTGTTGTCCCTCGGACT
TCACCCAATTTCAGGCCATTTCATTTCTGAGCACTATATGTATACACAGGGATTTGAAAC
GTACTCTTACTATGGAAGTTTAAATCTGATAACATTTAATGTTGGTTATCATGTGGAACA
CCATGACTTCCCTGCCATTCCTAGCTCAAAGTTACCACTGATGAAAAAAATTGCACCTGA
TTATTACGATGAACTTCCATTCTACACATCTTGGTGTAAAGTTCTCTGGGATTTTGTGTT
TGATCCAGCCATTGGACCATTTGCCAGAATTCGCAGAGATATAGATTTGAAGGGGAAAAC
CAAGGCCTCAGAATCAAATGGAGCTATTCAAAATGGCCATCAACCCAATGGTGTAAAGCA
AAATGGCATTTCCAATGGGCATGTAGGCAATGGTAAAATATGTAGCAAAGGTAGTTCAAA
CGGAATAGCAAATGGACACATGGTCAACGGTAATGGACATGTACCAATGCAAAGTTGAAG
CTATTAAACAGTGTTTTGTATTTTCCAAATTATAGATTTTATACTTTACCAATATATATA
GTAAATTTATCAAGCTCATTTTCACTAGCTCCAACCTACAATCAGAGAAGTGCCTATTTG
TGTTACTAATTTGTCAGATATACATAATTGTTTTGTTTGGTTGCATAAGTAGCTTCTAGC
TTTCAATTAATTCTGCTATTTTCATTTAATTTTCACATCTTTTCATTTTCTTTCAACAGT
TTGTTGAAATG

InterProScan

PIRSF	DES1/DES2 (IPR011388) - T[18-353] 5.1E-153
SMART	Sphingolipid_d4-desaturase_N (IPR013866) - T[23-61] 1.6E-17
Pfam	Sphingolipid_d4-desaturase_N (IPR013866) - T[24-58] 5.0E-17
CDD	DES1/DES2 (IPR011388) - T[44-332] 7.14444E-159
Pfam	FA_desaturase_dom (IPR005804) - T[83-304] 5.7E-23

Best Blast Hits in UniProt

Protein Name	Identity	Bit Score	e-value
DEGS1_HUMAN	60.51 %	396	5.41E-138
DEGS2_HUMAN	59.873 %	405	2.63E-141