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  1. Clone 'AHC0AAA200YN09'
  2. Transcript 'Boschl.CG.Botznik201...'
  3. Transcript 'Phmamm.CG.MTP2014.S7...'

Transcript Model

Transcript Id

Phmamm.CG.MTP2014.S72.g02526.01.t

Possible name(s)

SCAMP1; SCAMP2; SCAMP3

Location

S72 [112,823 / 117,284]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 339

>Phmamm.CG.MTP2014.S72.g02526.01.p
CLLTFVMGDFDANPFADPFKDGSVTQATSEADKANLDDFNPFANNENATIPANSSAMMQP
TNPPDYGTNYAVSAPPVSAPPPSAPVPGHEELLRRQEELERKAEELQRREQQLSSANYNP
RANNWPPLPSWFPLRPCFYQDFTVDIPHEFQRTVKMLYYLWMFYVIALFLNVLSSLAAYI
GCAKQNLGTGFGLSILWWLLFTPCSLCWYRPAYKAFRSDSSFNFFLFFFMMFFQFCWSVL
MCVGIENWGYAGWILAIACFGESLPVGIIVCIQATLFTVTAVFSLLLLKKAHSLYRTTGA
SFEKAQQEFATGVMKNPGVQTAAQNAASTAVQSSLKGQY

Nucleotide sequence

Length: 2,375

>Phmamm.CG.MTP2014.S72.g02526.01.t
TGCCTGTTAACTTTCGTTATGGGTGACTTTGATGCCAACCCGTTCGCCGATCCATTCAAA
GATGGCTCAGTGACACAAGCCACTTCTGAAGCTGACAAAGCTAATTTGGATGATTTTAAT
CCGTTTGCAAACAATGAAAATGCCACGATTCCTGCTAATTCATCAGCAATGATGCAACCC
ACCAATCCACCTGATTATGGAACAAATTATGCCGTCTCAGCTCCCCCGGTTTCCGCACCC
CCACCTTCGGCGCCAGTTCCAGGACATGAAGAGTTGCTACGAAGACAAGAGGAGTTGGAA
AGAAAAGCAGAAGAGTTACAGAGGAGAGAGCAGCAATTATCATCAGCCAATTACAACCCA
AGAGCCAACAACTGGCCTCCGCTTCCGAGTTGGTTTCCACTCCGTCCATGTTTCTACCAG
GATTTCACAGTAGACATCCCTCACGAGTTTCAGAGAACAGTTAAAATGCTATACTATCTG
TGGATGTTCTACGTCATTGCATTGTTTCTGAATGTCCTATCATCACTTGCTGCTTACATC
GGTTGTGCCAAGCAAAACCTGGGCACCGGTTTTGGTTTGTCCATCCTCTGGTGGCTGCTT
TTCACTCCGTGTTCTCTATGTTGGTATAGACCAGCGTACAAAGCATTCAGAAGTGACAGC
TCTTTCAACTTCTTTCTATTTTTCTTCATGATGTTCTTTCAGTTTTGCTGGTCAGTTCTT
ATGTGTGTTGGGATTGAAAACTGGGGTTATGCTGGATGGATTCTTGCTATCGCATGTTTC
GGAGAAAGTCTGCCAGTTGGTATTATTGTCTGCATTCAAGCAACTCTTTTCACTGTCACT
GCAGTCTTTTCTCTTCTTCTGTTGAAAAAGGCCCACTCATTGTATCGTACGACTGGAGCA
AGTTTTGAGAAGGCTCAACAAGAATTTGCTACTGGTGTGATGAAAAATCCTGGTGTTCAA
ACTGCTGCACAAAATGCAGCCTCAACTGCAGTGCAGAGTAGTCTCAAGGGACAGTATTGA
TTCAAAATAATGCTGATCTGCCCAATAACGAGCGTTCCAACTTGGAGAGCTGATTGCATG
CGGACCAAGCAATGCAGATGGACAATTTTTGATTCAACCAAAATTTCCATCAGATAGTTA
GTCTGTAATAATGTACATACATACATATATGTGTAAGCTATATATATCTAGTTTTTAATA
TTAGAGAGAGCTCTGCGACATGCAATCTTCCCAAGATGCAGGTCATGCTTTTCTGTGTTG
GCACTAATATATATTGTGATGAATTTGTCAACAATACTATGTGTATGCGACTTGCTTGTA
AAGCTGCATTGGTGAAGGTTACTTGGTGTTCACCGATTAACTGAGGTGGAATGCCACTGT
TATGTAACCAACCATTTCCCCCATGTTCCACAAATCATTCTTCATTTCCAAAGTTGTTCA
AATTTAAACAGCAAAAATCAATCTTATGTATTCCTAAACTGTAATTAAATTCTAATTGTA
CTGTTTTGATAATATTTCTGTCTCTTAGTTAGATTTTTGTTGGTCTGAAAATATTTAGGT
GTTGTTTATATTTGCAAGTGCTACAAATTAGTTATGAAATATAATGCCATAATTTTCACC
ACGGAATATAAAATAACAGAATGTTTTAAACCAAAATTATTTAAAGCCCCCCCCCCTGGT
CTGAAAATATTTAGGTGTTGTTTATATTTGCAAGTGCTACAAATAAGTTATGAAATATAA
TGCCATAATTTTCACCACGGAATATAAAATAACCGAATGTTTTAAACCAAAATTATTTAA
ATTGCTAAAATCAAGTTCAGCAGATTATTTGTGACCAGAGTCTCATTAAATAAATTGTGC
AATGTTTATGTAAATATAAGATTCCTGGTGAGTTTTGTTGCACATTGTTTCATGTTGTTT
AACACTAATTTATAAATGCAAGTTATGTTGTGACGAACCAATGTGTTTGTGTTTAGTTAA
AACTGTTACTACATTTGCTGTTAGAAGTATGACTGATAAAATGGTTGAAGTTACAACTAT
AGCTCCTCTACACCTTAGCTGCACAATTAAGCCTATTAGGTTGATTAAATAATTTTAGTC
TTATCCTGTTTTCTGAATGAATGCTGTAAAGAATCCCGCCCAACAATTAATGCACCATGG
TTTAGCGGTGGTACTAAATATAGCTTGGTGAGCATTTCTCAATAAACATATTTCATGCAA
AATTTATGATTTCGCACACTTTTAAAAGTGCTGACTGTTGAACTTAAAATATCACTGCAA
TCTGGCCTCATTTTCCCGTTGTAGAGGCTCATTTTCTCACCCTTTACAAATCATCTGTTA
TACTGTGCGATTTACCATGCAGTATTTAGTACCAC

InterProScan

PANTHER
SCAMP (IPR007273) - T[8-338] 3.9E-120
Pfam
SCAMP (IPR007273) - T[123-298] 1.7E-65

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
SCAM1_HUMAN 52.599 % 308 3.6E-104
SCAM2_HUMAN 48.256 % 276 1.75E-91
SCAM3_HUMAN 46.866 % 264 1.21E-86