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  1. Transcript 'Phmamm.CG.MTP2014.S7...'

Transcript Model

Transcript Id

Phmamm.CG.MTP2014.S70.g02472.01.t

Possible name(s)

PGAP3

Location

S70 [126,384 / 130,576]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 337

>Phmamm.CG.MTP2014.S70.g02472.01.p
RLATRLVLTVLSLASIFDRMKVFLTIFALSLFSTTSASNGDRSGAYQNCLKPCVNNNCSG
VEYPVDQPLYLKAMGWDCKEECKYSCMWVAVDIYADHGVACPQFHGKWPFIRILGMQEPA
SVLFSVLNGVASIIGFRRYLREVPTTTPMFNVAVLQTVVGVNAWIWSAVYHSRDFVWTET
LDYFCATSLVMFSFYVAIHRWSYEARVESRARIRWIAGHVLAGLYVTHICYLSFDKFDYG
YNMKANVAVALSNSVAWLWLWKQKKKSFPYFWKIFFIIVATQIFLLFELFDFPPLLWILD
AHSIWHLLTIPMPVLMFSFFKDDHLNLESTSSKDKVP

Nucleotide sequence

Length: 3,666

>Phmamm.CG.MTP2014.S70.g02472.01.t
CGAGGTTAGCCACCAGACTAGTGTTAACAGTATTAAGCCTTGCGAGCATTTTTGACAGAA
TGAAAGTTTTCCTTACAATTTTTGCACTCAGTTTGTTTTCAACGACTTCTGCTTCAAATG
GAGACAGATCTGGCGCTTATCAGAATTGCCTTAAACCATGCGTCAACAACAATTGCAGTG
GTGTTGAATATCCCGTGGACCAGCCTCTGTATTTGAAAGCAATGGGCTGGGATTGTAAAG
AGGAATGCAAATACTCATGTATGTGGGTGGCTGTTGACATATATGCAGATCATGGCGTGG
CATGTCCTCAGTTTCATGGAAAGTGGCCGTTTATCAGAATACTTGGCATGCAGGAACCAG
CATCAGTGCTGTTTTCTGTCTTAAACGGTGTCGCCAGTATAATTGGATTTCGAAGATATT
TGAGAGAAGTTCCAACCACTACACCCATGTTTAACGTAGCTGTTCTACAAACTGTGGTTG
GTGTCAACGCTTGGATTTGGTCGGCTGTCTACCATTCAAGGGATTTTGTTTGGACAGAAA
CTCTTGATTATTTTTGTGCAACCTCTTTAGTGATGTTCTCTTTTTATGTCGCTATACATC
GTTGGTCTTATGAGGCCAGGGTTGAAAGCAGAGCCAGGATTCGTTGGATAGCTGGGCATG
TGCTTGCAGGACTCTACGTTACTCACATATGTTACTTGAGTTTTGATAAGTTTGATTATG
GATATAACATGAAAGCAAATGTGGCCGTCGCCCTTAGCAACTCGGTAGCATGGCTGTGGC
TTTGGAAACAGAAGAAAAAAAGTTTTCCATACTTTTGGAAAATATTTTTCATTATTGTGG
CAACTCAAATTTTCCTTTTGTTTGAGTTGTTTGATTTTCCACCGCTGTTATGGATACTTG
ATGCCCATTCCATCTGGCATCTGCTCACTATACCAATGCCTGTACTTATGTTCTCATTTT
TTAAAGATGACCATCTAAATTTGGAAAGCACTTCGTCGAAAGATAAAGTTCCTTGACCAG
CAATTATTTATAAGATGCTGGTCTTGACTGGAAGTAACAGCACCCAACTTGCGAATGCAT
CGTTAACTTTCCTGTACTAACCACCAAGGAAAATTGTTTAAAGATTTGAGCACATTTGGT
TGTTTTACACTTACTCCCTTTGTTGAAGTTTGGTGGTATGATGCTGTATTGTATCTTTCG
CAGATATTGTGAGCTGTGAACAAATTATATGCAAAGTGTATTCTTCATAGATGGCTTTGT
CTTCTCTGCGTACTTATATTTTATTAAACACTGTATGAACAGTTAACTGATCTCTATTTC
TGTTTGGGGCTTTTCATGAAACTGAAATAAACGTTAAATAAACTTTTATTTCACCCAAAA
GCAAAACTATAAAATAATTGTGCCACGAGTAAATAGACAAGACACCACAAAGATAAAACA
ACAAAACACAATAAATAAAATTATACAGAAAAAAAAATTATTTTGCGATTCATACAGTAT
TTTTCGAGAATAGCAGAACAACATTTTCCAATTTTCATCGCTTAATACTGCATGCTTCCC
CATCACATTACTGTCAATTGCTCAAATGACTGGAGAGTTTATGGTCAAAATTATTACACT
CAACGGCACCAATCCCGTTTAAAACAGACGCTCATACTTTATAGAATTGATTTGAAATTA
CTAAGTGCCTTCACTATAATTATTTTACCAGGGAAATTATCCAAACAGTAACATGTTGCT
GATAACCAATTCACACAGTTCATTAGTGTGCAAAAAATATCGAAAAGTCTTGCAAGCTTG
TAGCATTCATGTAACTTTAGTGAATTTAAATGTCCGCCACATTTTGCTTTGCATACTTTT
AAGGTAAAACCCCTTTTGTGAGAAAACATTTCAAATAAACCTGAACTTTAAAGTTGAGGT
TCAACACACAAATGTCAATTCGCTTCAACATCAAAATATTGCACAGTCTGAAAGTTTTTG
TGAGAATCAAAATCCCCCCCCCCAAATAAACCTGAACTTTAAAGTTGAGGTTCAACACAC
AAATGTCAATTTGCTTCAACATCAAAATATTGCACAGTCTGAAAGTTTTTGTGAGAATCA
CAACTCATCTTTTCTCTCTTTGTCTTGTTCAACGTGCATTTTGTGAAACATGTCCAAGTA
TTTTATGCTTTTAGACAACCTGTCAAAAATAGTGTAACAGTTTGGTCATTGAAATTGTCT
TTTCAAAACATGAAATAGTGTATTTAAGTATTAGATAAGTGAAGACAGTTCCGTTGGTCA
CCACCCGTTATACAGGGTGATTCCTGTAGTCTGTTCTTAACACCTATAAGTTGACTGTTT
GTATTTGCTTCAAATGACTTACAGCTCTTACAGCAGTGGATCTCATACTGTGGTATGCCG
TAACTTTTCTGGTGGTACGCGAGTAGCTTTCTGCTATACCTGATTGGAGTCCGGTCTAAA
ATTGCAACTTAAATTTTGAATTTGCTAAATATGCTAGCCGGGTTGAGAAAATGTGCCCAT
TTCTTGGTCCATCCGATCAAACAGGGTTTAGGACTTTAGGCGGTATGCAGGGATAGAAAA
AGTTGTCAGGTGGTTTGTGACCCAGAAAAGGTTGAGAACCACCACCTTACAAGAATCAAC
CATTACTTTAAGAAGTGCAAACAAATAAACACAGCAGAGTCTTGGCTTTACAGTTGGCCT
TAATCTCAAATTATGGTAAGGATTTTTTTAAAATATTACCGTTCATAATCTTGAATGCCT
GGATATGTTGAATGCTGTGTGAAAGCCTGTCAACATTAATAACAAAGTTACTTGCTGAAA
ACAAACAGAACAGATTGTCTTCTATGCTATTCTTCATTCACTTTAAAACTGAGACACTTC
TGCTTCATTACTCCCCCCCCCCCAAATGTGCCCATTTCTTGGTCCATCCGATCAAACAGG
GTTTAGGACTTGAGGCGACGCAGGGATAGAAAAAGTTGTCAGGTGGTTTGCGACCCAGAA
AAGATTGAGAACCACTGGCTTTCAAGAATCAACCATTACTTTAAGAAGTGCAAACAAACA
AACACAACAGAGTCTTGGCTTTACAGTTGGCCTTAATCTCAAATTATAGTAAAGATTTTT
TTTAAATATTACCGTTCATAATCTTGAATGCCTGTATATGTTGAATGCTGTGTGAAAGCC
TGCCAACATTAATAACAAAGTTACTTGCTGAAAACGAACAGATTTTGTTCTATGCTATTC
TTAATTCACTTTAAAATTGAGACACTTCTGCTTTATTACTTACTAACTATGAATTGACTT
ATTGTCTGATATCACCATTGTCTGCAAGCCTGAATGAAACAGTTGCTTCCTGCTATACTA
TCGACATAATATGGAGAAGCTGAGTAATTATTCAAAACTTTTCTGGACAAATCGAATTTT
TAACCAATCTTTGCTTGTACAGTGTTACCAGTCTAATGTACTTGCAATTGCAAAATTATG
ACAATGGTTTTGACATGCTGGTGAATTTAGCAGTTTGATGTTTTCTTTGTAAACAGTGGA
TTACCTTGCGAAGCCGTTGACAAGCGAAACAACTTCTTGACGTACAAGTCTGAACGGTTT
ACCGTCACCATCAATTTCTTTTTCAGAGAAGAGGATTTTCAAAGCGGTTCCCAAACCTTT
CGTCTG

InterProScan

PANTHER
Per1-like (IPR007217) - T[20-333] 1.6E-109
Pfam
Per1-like (IPR007217) - T[68-323] 4.5E-87

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
PGAP3_HUMAN 45.246 % 249 3.11E-81