Aniseed - Transcript Card

Transcript Model

Transcript Id

Phmamm.CG.MTP2014.S6601.g19058.01.t

Possible name(s)

TPRA1

Gene model

Phmamm.CG.MTP2014.S6601.g19058

Location

S6601 [417 / 2,081]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 259

>Phmamm.CG.MTP2014.S6601.g19058.01.p
VILRFFLLMAEMSVLVFGIAFGHLDSKSSIKRVLFVTTSLALIYSIVQGTMEMLETDPRF
QIETKHWSVYGHGGSLFCFVTSAIFLIMYVFVGCLPFVNWLQKYLSVPTRKSFYVYVGFM
AVLNLLAVVGCGLLLEWNWIGLCLLDGYSLAYFTMFAPLVYWTFLSSYFGTAQPSSMLFS
YATHVDESQNDITDFDMPATGGNVDSTLSGILVFDHGDTAGYQVPNGHIEEPLHNFTDGS
SDLISPSVDSTHSFFHSNA

Nucleotide sequence

Length: 979

>Phmamm.CG.MTP2014.S6601.g19058.01.t
GTGATATTGCGATTCTTTTTGTTGATGGCTGAGATGAGTGTTTTAGTGTTTGGAATTGCA
TTTGGACACCTTGACAGCAAAAGCAGCATAAAGCGGGTATTGTTTGTAACAACATCTCTT
GCTCTGATTTACTCTATTGTGCAGGGAACAATGGAGATGCTTGAAACTGATCCGAGATTT
CAAATCGAAACAAAGCATTGGTCAGTTTATGGACATGGAGGAAGTCTTTTTTGTTTTGTA
ACATCAGCTATATTTTTAATTATGTATGTTTTTGTCGGTTGTTTGCCGTTTGTGAATTGG
TTGCAAAAGTACTTGTCAGTTCCAACAAGAAAATCGTTTTACGTGTATGTCGGTTTCATG
GCAGTTCTAAATTTGTTAGCAGTTGTAGGCTGTGGGCTGTTGTTGGAATGGAATTGGATT
GGTTTATGCCTTCTTGATGGATATTCACTTGCTTACTTTACAATGTTTGCACCTTTGGTA
TATTGGACATTTTTATCATCCTACTTTGGCACAGCTCAACCAAGTAGTATGCTATTTTCA
TATGCAACTCATGTGGATGAAAGTCAAAACGACATCACCGATTTTGACATGCCAGCCACT
GGTGGGAATGTTGATTCAACATTAAGTGGCATCCTGGTATTTGATCATGGTGATACTGCT
GGTTACCAGGTGCCAAATGGACATATCGAAGAACCTCTACATAACTTCACAGATGGTTCA
TCAGATTTAATATCACCGAGTGTAGACAGCACACACAGTTTTTTTCATAGCAATGCGTAG
ACGTTGTGAAGTATGCGAGGTATTTAATGGCTACTCTTTATATTATTGCCAGTTTCACAT
ATTGCTGCAAGTGCTTGAACCTGTCATATATATACATTGCTTTGCATGCTTGAATGCTTG
TTTGTAAGCAAGTCACAACTGTATTATTAAGCAACAGGTAAAAAGCCAACTTACAGCCTG
ATTAAACATTTCTGCAAGT

InterProScan

PANTHER	TPRA40 (IPR018781) - T[1-200] 1.1E-65
Pfam	TPRA40 (IPR018781) - T[2-172] 5.6E-40

Best Blast Hits in UniProt

Protein Name	Identity	Bit Score	e-value
TPRA1_HUMAN	46.701 %	153	1.7E-44