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  1. Transcript 'Boleac.CG.SB_v3.S523...'
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  4. Transcript 'Moocul.CG.ELv1_2.S10...'
  5. Transcript 'Phmamm.CG.MTP2014.S5...'

Transcript Model

Transcript Id

Phmamm.CG.MTP2014.S51.g01911.01.t

Possible name(s)

FBXO45; SPSB1; SPSB2

Location

S51 [106,627 / 111,779]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 264

>Phmamm.CG.MTP2014.S51.g01911.01.p
PTTNVTLSSNNTTTAQNLPTTVFEKIFSFLSLEDLQSCSLVCKSWFHYLNDGNNDVWRLQ
CVRKLAAEALQSDVLSSLPTYKEKLRAFYHSWNSSDCSGNIYIKPGGFTLHRKPEAQCTD
AARGKIGFDSGRHSWDVRWRGPLGTVAMVGVATKEAPLRMGGYKPLLGSTDQSWAWNLVD
NYLFHGGSRRDPYPKCNNPPKYQVGEKITVVLDMEDNTLAFERDYEFLGIAFRGLPQTRL
YPSISAVYGNTEVTMVYKGNPTDG

Nucleotide sequence

Length: 3,764

>Phmamm.CG.MTP2014.S51.g01911.01.t
CCTACAACAAATGTAACATTGTCTAGTAACAATACAACGACTGCCCAAAACCTGCCAACA
ACTGTATTTGAAAAGATATTCTCATTTTTATCGTTAGAAGACCTGCAATCGTGTTCACTT
GTTTGTAAATCGTGGTTTCATTATTTAAATGACGGCAACAACGACGTATGGAGGTTGCAA
TGTGTTAGAAAATTAGCAGCTGAGGCTTTGCAATCTGACGTTCTATCCTCATTACCTACC
TATAAAGAAAAGCTTCGAGCATTTTACCATTCATGGAATTCTAGTGACTGTTCCGGGAAT
ATTTACATAAAACCTGGTGGATTTACCTTACACAGAAAGCCTGAAGCCCAGTGCACCGAT
GCTGCTCGAGGAAAAATTGGATTTGATTCTGGCAGACACAGTTGGGACGTTCGATGGAGG
GGTCCACTGGGTACAGTGGCAATGGTCGGGGTTGCCACAAAAGAAGCCCCACTTCGTATG
GGGGGATATAAACCTCTCCTCGGATCAACAGACCAAAGCTGGGCTTGGAATTTAGTTGAC
AATTACTTATTTCACGGTGGATCTCGTAGAGACCCTTACCCTAAATGCAACAACCCACCT
AAGTATCAGGTGGGCGAAAAAATCACTGTGGTGTTAGATATGGAAGACAATACTCTGGCT
TTTGAAAGAGATTACGAATTTCTAGGCATTGCTTTTCGCGGATTGCCACAAACTAGACTT
TACCCATCAATTTCTGCTGTTTATGGAAATACTGAAGTTACAATGGTTTACAAAGGTAAC
CCAACGGACGGATGATTAGTTGTCACAGACACAGGATATCTACTTTATCGTGTTGTTGCA
CTAATGTGTGTGTACTTGGGAAGCAAAGTCACGGCCTTGCCACAGTATGGCATTTTGTTT
CTTGCTCCTGTCTTGTCCTTCTTTGTGTTGTGGGCTAATTGGTCCTGAATCCAATGCACT
AGCCCAACAAATTTCTTACCGCAAAATATGTGTGTATTTTTTGTGTCAGAAATGGAACAC
ATCACAAACTGTACTAGAGATGTGCCTAAACCACTTAACGTTGAATATGAGATGTATGTA
AGTTGTCAACTTACATTCATCTCATTTCTGAGATGCTTTGTTTTTCAGTGAAAATCCATT
GGTGCAAAATATTTGACAAGTTGCTACTGTTTGCCATTCCACGGAGAAGCAGTTTTCTTG
AAACTCTTCTCTGTTTTGTAGGCAATATGTTACTACAAAGTGCATTGTGTGAAGTTCATT
TCTTTTTCTTATTTGAAAAACCCACCAAGACTTCTTAGCTTGAGAACTATTTCCTTCAGT
TTCTCTCAAATTTCCGGGTGAAATATTTCACATGTTCAGCCTGAATATTGTGATGACATC
ACTACCATGGGTCTTACTGCATGGTATTTATTGTTCTGTCATTATAAAGAAAACCTTGCA
TCTATTTGTGGGTCATTATGTGCTTGAAGAATGAAACTATAAACTGCACAATAACACACA
GGAAGAATTAATAAAAGTCGTTTTTATTTAATATTCAAAGCATACAAACATTTTAGGCAC
AGTTTACAAACAAAGTATATATCTGTATAAAGCTTCATTTTAATATGTCATAAAAAGTCA
TTGGCAAGTTTGTAAAACAGGGAATATGTATTTCCAATGGTTAAATATGTTCAAAGGCTT
CATCTTAACATGTCATATTGTATCTCAAGTTTGTAATATGTATCACTTACATACTTTCAT
CAAAAGAAACCCACAATTTAAGGCAAAAATACAAAAACCGTGTACAAATACAATATTGCA
CCAATATCGCACAGTGTATACATTTACATGTAATAAGCTCCCGTTAAAATATTACAGACT
GTTATAATTGGATGTTAGCTGAACTTAAATCAGATCAGACCACATGTATGTCACCTTTAC
ACCTATTACAACAATTCAAAGTCACATTATCATACACCGTATATGAATGAAACCGGTTGA
TCTTTGGGTTATCAAGTGCATATCGAGTGACAGAATGGAAGGCTGATTGTGGCAGATTCA
GTTGGGGCATTGACTTCTGTTGTTCACTGAGCAGCTAGAAAAGAAGACAGTTTAAATAAT
AACATGTTCCTTTACAAATTAAATACTAGCTAACACAGTAAATAAAGGAATTCTATTTAA
CTGTTAATCTTATATATGTTGTATTTAATAACAGTTTGACCCCCCCCCCGTTTAAATAAT
AACATGTTCCTTTACAAATTAAATACTAGCTAACACATTAAATAAAGGAATTCTATTTAA
CTATTAATCTTATGTTGTATTTAATAACAGTTTGAGGTTGTTAAACAATTGAAATATAAT
ATGCTGCTTGGATAGATTGTTAAATAATTTAAAAGCAGTACTGCACATAGCATTTTCTCA
ATACATACTAATTTAGGTAATCCTGCCTTATTAGGTACATTTTACTGTGTACCTAAACAT
AAATCAATGAAAAAATGTCAAGTATGCACTATAATTGCATCAAAGAGATCTGCAAATGCT
TGTTTTTGCACTTTAGAAAGCAAATTCAATCAACACAAAATTAATTACAAAGCATCAGTT
TAAACCATATTTACCTGAAGAACATATTTCTCTGCAGGTGTCGATCCCCCCCCCCGTTCC
CAACCAGGGCCCATGGCCCCCCAGGGGGGCCACGAGCTGTGTTTTGGGGGGCCACGGGTG
TAGATTCGCCAGAAACACCCACTAAAAGCCATTTTCTTTTTAGCATTATTCCCTAATTTA
ATCGACTATTTCACATACTATTTGTGTATAGTGAGGTTTTTCACAATTACAGATGCTTAT
TTACGCTATTGGACCTGATTAAAGCCGAAATTAGTACCGAATTTTAAAACGAGATTGCCA
TTTACATTTTTAGGGGGGCCACAGGTCCTACAGCGTTACTTAAGGGGGGCCACACCCCCC
CCCCATTACAATTCTCAGAACTGTCTTGTGGATTCGGTTTTGGGATTTCCTTTGGTAGCC
GAAGAACATCTGTCAGTGATTGAAGGGTTCTGTGACAAAAAACAGTGGTATTTAGACTTG
TAACACATTCAGGTTTGAATGAAAGTTCAGTTTTTGGACGTTTTTTTAAAGGTTTAGTTT
GAGTTTCAGGTTTGAACTTTACCCCCCCCCCATTACAATTCTCAGAACTGTCTTGTGGAT
TCGGTTTTGGGATTTCCTTCGGTAGCCGAAGAACATCTGTCAGTGATTGAAGTGTTCTGT
GACAAAAAACGGTGGTATGTAGACTTGTAACACATTCAGGTTTGAATGAAAGTTCGGCCC
TGGCATCACTTTTTGGACTTGCGTTTTTTAAAGGTTTAGTTTGGGTTTCAGGTTTGAACT
TTTCCCCCCCCCCCTTTTAGGGGGCCACGGTCCACGAAAGGTTGGGAACCACTGGTTTAA
ACCATATTTACCTGAAGAACATATTTCTCTGCAGGTGTTGATGATGTTGTCTCACATGCT
TTATGCATTTTGCTTATAGAAATCTTAGATTGCTTTCCGAGAAAATGTTGTGAAAGTCTT
TGCGCCAGATCCCCCCCCCCCGTCTGCCTACACCTCTGGGTCTACTTGTGACAAAACAGT
GCTGCTTTCTAGTCAAAAATGAAATTTTTAATAAGCAGATTTTTATTCCATACCCCTGTA
GGCTTTCCAAGTTTTTAGATCTTTGCCAGTGTTCTCTTAGTAACCCTCGAACAGCACTTT
CCATTTCTTGCTGACATCTTTCCTGTAAAACAAATGGAAAAAAC

InterProScan

SUPERFAMILY
F-box-like_dom_sf (IPR036047) - T[10-67] 9.37E-13
ProSiteProfiles
F-box_dom (IPR001810) - T[12-60] 12.624
Pfam
F-box_dom (IPR001810) - T[16-58] 1.4E-8
SMART
F-box_dom (IPR001810) - T[18-60] 3.5E-5
SUPERFAMILY
ConA-like_dom_sf (IPR013320) - T[56-261] 1.16E-49
ProSiteProfiles
B30.2/SPRY (IPR001870) - T[70-262] 15.411
CDD
SPRY_FBXO45 (IPR035784) - T[90-264] 3.11441E-132
SMART
SPRY_dom (IPR003877) - T[130-262] 3.4E-14
Pfam
SPRY_dom (IPR003877) - T[132-256] 4.1E-16

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
SPSB1_HUMAN 41.579 % 144 6.15E-42
SPSB2_HUMAN 44.886 % 148 1.86E-43
FBSP1_HUMAN 62.5 % 341 5.51E-119