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  1. Transcript 'Phmamm.CG.MTP2014.S4...'

Transcript Model

Transcript Id

Phmamm.CG.MTP2014.S4360.g18360.01.t

Possible name(s)

MED13; MED13L

Location

S4360 [578 / 7,461]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 1,267

>Phmamm.CG.MTP2014.S4360.g18360.01.p
GMFEEEEAGVPTPPDDADEIQHQQRPNTVPYQPSVTAAMATDLTSNVDLQRIYPTPPSLE
PCQPFSPEIRQTLPQPLSNDNLLSSPEPTISCQYRNGLIDCDQPDIQPNLSNISLASPIS
MTRHSELLSTHSCHKTENYPTPFAYAPVKCLTLDLPPSTVSYTPTWQLPATIVQPPPAYP
LPTPSEEYVGFQPLTPATPANCVRTPGTPGRTSVKTPASVQAFQQSPAQLSVPTPRTPGR
SGIRSVDQLDSPLSSMTTPSSLITPRRSYYDQHGNAAICMNLLLSDSVMNLFRDHSFDQC
ALCVCNSNITGADVEFGYLPAISGKDSPFACTCGFSAVRNRMASVGSGLFLEDEFDVVGK
RFENTILEFREAQFKKRHLNQSKIAQKLTDIEDEIIRIVLEHCSSPFSIVDICKQTVRNS
PVPNYDNVIVKHDISEAIAQALSASLSAMEPPLRIEVDVLNAPPIHPWKQTESDVLKCAS
TLDVFRLLISLKPVLQDAIQKKRTSRSFGTTQHVKGPLTWREFCKEAGKNAEPQPIPSMV
VGYDQDWLCVSPQALNYWEKLFLEPYSRQRDVAYVVMCPDSDDVSTSTKYFFKELGSVYE
SCRLGKLKPINRVLRDNGLLRISENNANLSQTPLDNWFLEYIGSVKHTDKSVSEDSIRKL
LLYAKTTVNILAPLLNAEPSLDLSSLHVRDVRSRSHNITSNILQFSNYNSQSQNVSNTTS
QNSSKDTRSGLTSYNAATAASIVVFFLDPFQGCLSRGLWQCFLMLQKYLSKPLCDHVFFQ
VIPVEKMSQATTSGDQDSFVHNIRSLAFNTFAQCKKNMHYTNSIKSMTGFGPAASEKETL
QEINGMDGASLFSPPYVLSLPRDRHVESSVGGNTDKGSDVLFVSYCLSHNQKYVLASATD
QCGEILETCCINIDVPPRRMLVSRKHRVSVRGEAIRKLWEFCTCIISKLSTKAWRIVIGR
LGRLSHGEIRDWAKYLNRKNLLLSGQRSHCSQCKLQHTGESTFLVSACLTSLEPDSALML
MPDVVQTNNFGRSSNSSSQNAQLKTPEDISCTHIYVFPTSAVAQPTPTTYQSANGEDPYL
GPTGPELILPDIDGLSEEDDMLINLLNVNNFLGPTSPNPNPLPFAMEEDDVVKRQTAEPL
LPIDGTGTEEPLSQQPLALGYLVSTAPPGPLPSWFWRTCPVAQHRNPVFFRSALHIQATS
TEPSPGGKTEQHPLDSNKTAVTLRFVLECYNALSWLSRDPATRDRRSCLPVHCLSLMQLY
QLIQNLL

Nucleotide sequence

Length: 4,525

>Phmamm.CG.MTP2014.S4360.g18360.01.t
GTGGAATGTTTGAAGAAGAAGAGGCAGGTGTTCCTACTCCCCCAGATGATGCTGATGAAA
TTCAGCATCAACAAAGGCCAAATACTGTTCCATACCAGCCCAGTGTTACTGCTGCAATGG
CAACAGATCTTACGTCTAATGTTGACTTGCAAAGGATATATCCAACTCCACCATCTTTGG
AACCTTGTCAGCCCTTCTCCCCTGAGATTCGACAAACTTTGCCCCAGCCCTTGAGCAATG
ACAATCTCCTATCATCACCTGAACCAACAATCTCCTGCCAGTACAGAAATGGTTTGATAG
ACTGTGATCAGCCCGATATACAGCCAAATTTGTCCAACATAAGTCTGGCTTCCCCAATAT
CTATGACAAGACACTCAGAATTACTTTCAACACACAGCTGTCACAAAACAGAAAACTACC
CAACCCCCTTTGCATATGCTCCTGTGAAGTGCCTTACCCTTGACCTACCTCCAAGTACTG
TGTCCTACACTCCAACATGGCAGCTCCCAGCAACGATTGTTCAGCCTCCTCCTGCCTATC
CCTTACCTACACCAAGCGAGGAATATGTTGGATTTCAACCACTAACTCCTGCAACTCCTG
CAAACTGTGTCAGAACTCCTGGTACACCAGGTCGAACATCGGTTAAAACCCCAGCTTCTG
TGCAGGCTTTCCAACAATCCCCTGCTCAGTTGTCTGTTCCAACACCAAGAACTCCTGGGC
GCTCTGGCATTCGAAGTGTTGACCAACTAGATTCTCCTCTGTCCTCAATGACTACACCTT
CCTCTCTAATAACTCCAAGACGTAGCTACTATGATCAGCATGGCAATGCTGCGATTTGTA
TGAACCTTTTGTTGTCAGACTCAGTCATGAATTTGTTTCGAGACCATTCTTTTGATCAAT
GTGCATTATGTGTGTGCAACTCCAATATCACTGGAGCTGATGTAGAGTTTGGATATTTAC
CTGCTATTTCCGGAAAAGACTCTCCTTTTGCATGTACCTGCGGCTTTAGTGCTGTCCGAA
ATCGCATGGCATCAGTTGGTAGCGGACTTTTTTTGGAAGACGAGTTTGATGTGGTTGGAA
AACGGTTTGAGAATACTATTTTAGAATTTAGAGAAGCTCAGTTTAAAAAAAGACACTTAA
ACCAATCAAAAATTGCCCAGAAACTGACTGATATTGAAGATGAGATTATTCGAATTGTTT
TGGAACATTGCTCATCTCCATTTAGTATTGTTGACATATGCAAGCAAACTGTGAGAAATT
CTCCAGTACCAAACTATGACAATGTGATTGTAAAACATGATATAAGTGAAGCAATTGCTC
AAGCTTTAAGTGCCAGTCTTTCAGCAATGGAACCTCCTTTACGAATTGAAGTTGATGTGT
TAAATGCTCCACCCATACATCCATGGAAACAAACTGAAAGTGACGTATTAAAGTGTGCCA
GTACTTTGGATGTCTTTCGGTTGCTTATCTCTTTGAAGCCAGTCTTGCAAGATGCTATTC
AAAAGAAAAGAACATCCCGTTCGTTTGGAACAACGCAGCATGTAAAAGGCCCTTTAACGT
GGCGAGAGTTTTGTAAAGAAGCTGGAAAAAATGCCGAGCCTCAGCCTATCCCGTCAATGG
TCGTTGGTTACGACCAGGATTGGTTATGTGTGTCGCCGCAAGCATTGAATTACTGGGAAA
AGTTATTTCTTGAACCCTACTCTCGCCAACGCGATGTTGCCTATGTTGTCATGTGTCCCG
ATAGTGACGATGTTTCAACAAGCACAAAATATTTTTTCAAAGAACTCGGATCGGTGTATG
AGTCTTGCCGATTAGGAAAACTGAAACCCATCAACCGCGTTTTGCGCGATAACGGATTGC
TTCGAATTAGTGAGAACAACGCGAATTTATCCCAGACCCCTCTGGACAACTGGTTTTTAG
AGTACATTGGTTCAGTTAAACACACGGACAAATCAGTTTCAGAGGACAGCATCCGCAAGC
TGCTTCTTTATGCCAAAACTACGGTTAACATACTTGCCCCTCTACTAAATGCTGAACCAA
GTTTGGATTTATCATCGCTTCATGTTCGCGATGTACGATCACGATCCCACAACATAACCT
CAAATATTCTCCAATTTTCCAATTACAACTCCCAATCGCAAAATGTCTCCAATACTACCT
CACAAAACAGTTCCAAGGACACCCGAAGTGGTTTGACATCATATAACGCAGCAACTGCAG
CAAGCATTGTTGTGTTTTTTCTTGATCCTTTTCAAGGTTGCCTTTCTCGAGGATTGTGGC
AGTGTTTTCTAATGTTGCAAAAGTATCTCAGCAAACCCTTGTGCGATCATGTTTTTTTTC
AGGTCATTCCAGTCGAAAAAATGTCACAGGCGACCACATCTGGCGACCAGGACTCGTTTG
TGCACAACATCCGCTCATTAGCTTTTAATACCTTTGCACAGTGCAAAAAGAATATGCATT
ACACAAACAGCATCAAGTCGATGACGGGTTTCGGTCCTGCTGCGTCTGAAAAAGAAACTT
TACAAGAAATAAACGGAATGGATGGCGCTTCGCTTTTTTCGCCACCTTATGTTCTAAGTT
TACCACGTGACCGCCATGTTGAGTCGTCGGTTGGAGGCAATACAGATAAAGGCTCTGATG
TATTGTTTGTTTCTTATTGTCTTTCACACAACCAAAAATACGTGCTTGCTTCGGCCACCG
ATCAATGTGGAGAAATACTTGAAACTTGTTGCATTAATATCGATGTTCCGCCGAGACGAA
TGTTAGTGTCGCGAAAACATCGGGTTTCTGTAAGGGGTGAAGCCATTCGAAAACTGTGGG
AATTTTGCACTTGCATTATTTCCAAACTTTCAACCAAGGCGTGGCGCATTGTGATTGGCC
GGTTGGGACGATTAAGTCACGGGGAAATTCGCGATTGGGCCAAATATTTGAATCGTAAGA
ACCTGCTTTTAAGCGGGCAACGTTCACACTGTTCACAGTGCAAGTTGCAGCATACGGGGG
AAAGTACTTTTCTGGTCAGCGCTTGTCTTACATCGCTGGAACCCGACAGTGCACTTATGC
TTATGCCAGATGTGGTGCAAACCAACAACTTCGGACGCTCTAGTAATAGCTCCAGTCAAA
ATGCACAGTTGAAGACCCCGGAAGACATATCGTGCACTCACATTTATGTGTTTCCTACTT
CAGCTGTGGCGCAACCTACTCCAACCACCTACCAGTCGGCAAACGGAGAAGATCCTTACC
TGGGTCCAACCGGACCTGAACTAATTCTTCCTGATATCGACGGACTATCGGAGGAGGATG
ACATGTTGATTAATCTGTTAAACGTAAACAATTTTTTGGGCCCTACTTCACCAAACCCAA
ATCCACTCCCGTTTGCTATGGAGGAGGATGATGTTGTAAAGCGTCAAACTGCCGAACCTC
TTTTGCCAATCGATGGTACTGGAACTGAAGAACCACTTTCCCAACAACCTCTTGCACTTG
GTTATCTTGTCTCTACCGCCCCACCTGGTCCTTTGCCCTCCTGGTTTTGGAGAACTTGTC
CTGTCGCCCAACACCGAAATCCAGTGTTTTTCCGTTCTGCACTGCACATTCAAGCAACCA
GTACCGAGCCTTCCCCTGGGGGTAAGACGGAACAGCACCCTTTAGATTCAAACAAAACCG
CAGTGACTTTAAGGTTTGTTTTGGAATGTTACAACGCATTGTCATGGCTCAGTCGTGATC
CAGCGACTCGTGACAGACGATCTTGTTTGCCGGTTCACTGTCTTTCTTTGATGCAATTGT
ACCAGTTGATTCAAAATTTATTATGAAATTTAATAAATGGTGAATTTAATCGCATTTTTA
ACTTCACATCCTATGTGTGCCCGAATTAGCTGTTTTAATGCACTACACAAGACATCTTAA
TTTTCGAGAAAAAAAACATGATAAATGTGGACACAATAGTATACTCTTCTGGTACTTTGG
TCAGGTTTTTATTTTCATGTGAACGTTTCTAGCCAAGGTCATCAGACCGCGATCGCTCGT
TGTCAGCCTTACAATACAATTAAGCGGCTGCCTTTAAAAGTGTTGACATTCAAGTGCAAT
ATTACAGTGGTCGGGCAAAATAATCATGGGTGAGGCACAAACATTTTTATCACTCGCATG
TATTTATTAATCCGGGTCCGCTTGTGTAAGAAATCCGTGAAAACATCTCCGCAGTCCAAA
AACGATCACTGCCGTTGACCTGGAATCACCTCGTTTTGCTTGGGGTCGTTTCCGTATTCT
TAAATGAAATGCATTATTGAAGTATTTTTTCGTTTTTGAACATATTTTGTACAAGTTTTA
ATAACCTTATGTTTTACTGTCTGACCTGCCTCGTACTTTCGTGGCAAGTTTTCTTGCTTT
GCAAAATGTCAATAAGCAAAGGTGTTCCGCACTAAACAGTTTAAGTTTAATTCGCCGTAT
TTGTTTTGGTACACCACTTAACATATTGCTTAGCCCCGATATGTGTTCACCTGGGTGTCC
AACTCGTGTGGGTTTTTGTACATAC

InterProScan

Pfam
Mediator_Med13 (IPR009401) - T[853-1253] 4.5E-86

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
MD13L_HUMAN 38.278 % 352 2.93E-100
MED13_HUMAN 39.854 % 385 7.72E-111