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  1. Transcript 'Phmamm.CG.MTP2014.S3...'

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Transcript Id

Phmamm.CG.MTP2014.S32.g01273.01.t

Possible name(s)

UBAP2; UBAP2L

Location

S32 [326,855 / 349,481]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 1,318

>Phmamm.CG.MTP2014.S32.g01273.01.p
MVVAPRTQRRDKSANGQKQPQATAEQMRLAQIIDGNGKEEDRQYQLVEKVMEVTGTTEDN
ARTALYDANNDTGRAIELILENGSFEQNSEWETAGRKKSKGPQNPPSKAYDTFDEDIKDT
APSSGGRYDRTESRGRGRGRNTNRRRADQDKSTEDDGRGNSENRDKNRGARRGRGRGGSY
ASRGRQPGRGPRRFVRYNRERSENAESGAGEGALNNFDEEFGTFTNKSAENAAATNEAWG
ADNEEWDLKVGTWSNDDSKKQTEKKSDSYSEPWGTDSWADDLTETKVFQSQNAQIAPPTS
IAGALHSAHIAVQNHNPAQGTAPPQMGERIDIGALFKKNSGPTNDSTPGYGQSLGSNGLP
GQSGLNYSSNEANSTPSVIHQLQGQSSSLFSDNKPVNDLEASSRLFTSYENQTQNSSVGA
GSIGPYTSTRSSDTSYSQFNGKLGVDSSDRNSSSLLGSFGEQFKSQEKTVQSGMLGQISD
LSKSAFTPLKPNPSQGVTSAVVGSEYSSFTQTQQQREATEAVKASLGLSPVNNDQLDTDN
MHSGLPGLSHTTSMSQNTLSFGAPLPMRQSKEPRRKQPPVNTKIPAAAVEMPGVGGGGYH
DLSTFDLQFGIDDNCVPTATNEFGSVNTVPGKPVTQNSLFSKGAVTSQGSIRNHIPSGSI
TDNSMFPNQLSSQQTESRPIQRSSYQSLQNDFSQTGKQLGATGDSLSLSSQQATDPTSLH
GSQRFSEAGPKQNEPLRGPPGLTHPSSLSSSSNSIGNSHGSITGSNQQGGDLSASYGSSR
MVPGQLNAMSSESTHDPTGITNSAHSYYTSTSLGQSQQQLGSDHSSSAGRSMRSPVPSTS
LQGSLQGSPMPHMSVTPSKDDLPSGVASTAISSLASGLGQTHITSHTSGPSETSPTAPLN
IPGATTTNAPTLGGTGAYGSMGMHLPYSASPQASQASAIPTVTSPGKHLPTSDLYPSGLP
SSLHHNHQQSSSTTVSTMIGSALGNAALSSVAGTPKSSTSLSTPSTKTGPPNLPLGVPPL
LPNQYGIPMGAGLMTAYAPEAALYAGYTDPLMAVPSRVVNPMPNYYDVSSFHTSNNQTAN
PTTVNRETTASNVNQGKFGHREQSSPTSVIGMIGGSVGSGLAQQVAGQHGAQLKASQTGT
HQAQPFVNLPTAPAAYPGYANVYYNAFQYPPMFAAAAATAVPQSGKHNVNVTTAFQQHGT
GFGNAYSTASINASTASSLHDLQGQGYNKNHVTLTAAMAAANNAGAGGGAAGPGMSPYTQ
SPFMTMLPTHPNSQIHLHVQQQHGDVGHGVGSQRGQNTNTIGKSTAKPGFGSAPYWGN

Nucleotide sequence

Length: 6,675

>Phmamm.CG.MTP2014.S32.g01273.01.t
AATGGTTGTTGCCCCACGAACACAACGAAGAGATAAGTCCGCAAATGGACAGAAGCAGCC
ACAAGCCACAGCTGAGCAAATGCGGCTCGCTCAAATAATCGATGGCAATGGCAAAGAAGA
AGATAGACAGTATCAGCTGGTTGAAAAGGTAATGGAAGTAACAGGAACCACAGAAGACAA
TGCAAGAACAGCTCTTTATGATGCAAACAATGACACAGGCCGAGCAATTGAGTTAATTTT
AGAAAATGGATCTTTCGAACAGAACAGTGAATGGGAAACTGCCGGCAGAAAGAAAAGCAA
AGGTCCACAGAACCCCCCGTCCAAGGCTTATGACACATTTGATGAGGACATAAAGGACAC
AGCTCCATCGAGTGGTGGCCGTTATGATCGCACAGAGTCCCGTGGGAGGGGTAGAGGACG
AAACACAAACAGACGCAGAGCTGATCAAGACAAGTCTACTGAAGATGATGGTAGAGGCAA
TTCAGAAAACCGGGACAAAAACCGCGGTGCTCGTCGAGGGCGTGGCAGAGGTGGTTCCTA
CGCCAGTCGAGGCCGTCAGCCTGGGCGCGGACCAAGAAGATTTGTACGCTATAACAGAGA
AAGGTCAGAGAACGCAGAATCAGGAGCTGGTGAAGGGGCATTGAATAACTTTGATGAAGA
ATTTGGAACATTCACCAATAAAAGTGCTGAAAATGCTGCAGCTACAAATGAAGCATGGGG
TGCAGACAATGAAGAATGGGACCTAAAGGTTGGAACCTGGTCAAATGACGACTCAAAAAA
ACAGACAGAAAAGAAAAGTGATTCATATTCAGAACCTTGGGGCACAGATAGCTGGGCCGA
TGATCTCACTGAAACGAAAGTATTTCAGTCTCAAAATGCTCAGATTGCGCCGCCAACCAG
TATTGCTGGGGCCCTGCACTCTGCTCACATCGCTGTGCAGAATCACAACCCCGCGCAAGG
CACTGCTCCTCCACAAATGGGCGAAAGAATCGATATTGGTGCCTTGTTCAAGAAAAATTC
AGGTCCAACTAATGATTCCACACCTGGCTATGGTCAGTCATTAGGCAGCAATGGACTTCC
AGGTCAATCGGGTTTGAATTACAGTTCAAATGAGGCAAATTCAACACCTTCAGTTATTCA
CCAACTGCAAGGCCAGTCTAGCTCATTGTTCAGTGACAATAAACCTGTCAATGATTTGGA
AGCCTCTTCTCGCCTTTTCACATCCTATGAAAATCAAACACAGAACTCGTCAGTGGGTGC
AGGCTCCATTGGTCCCTACACATCTACAAGAAGTTCAGATACATCCTATTCCCAATTTAA
TGGGAAGCTCGGCGTGGACAGCAGCGATCGCAACAGTTCATCTTTACTTGGTTCATTTGG
TGAACAGTTTAAGTCACAGGAAAAGACTGTGCAATCAGGAATGTTAGGACAAATTTCAGA
TTTATCCAAGTCAGCGTTCACCCCGCTTAAACCGAATCCTTCACAAGGTGTAACTTCAGC
AGTTGTTGGTTCCGAGTACTCGAGTTTTACACAAACCCAGCAGCAACGAGAGGCCACAGA
GGCTGTAAAAGCTTCGCTTGGACTATCACCAGTCAACAATGACCAACTGGACACAGACAA
CATGCATTCTGGACTGCCTGGTCTTAGTCACACGACGTCTATGAGTCAAAACACTCTCTC
GTTTGGTGCACCTCTGCCCATGAGACAGTCCAAGGAGCCGCGAAGAAAACAACCTCCAGT
CAATACCAAGATCCCTGCTGCAGCAGTTGAGATGCCTGGTGTTGGTGGTGGAGGTTATCA
TGACCTTTCAACTTTTGACCTTCAGTTTGGCATTGATGACAACTGTGTGCCTACTGCTAC
AAACGAATTTGGCAGCGTTAATACAGTTCCAGGAAAGCCTGTTACACAGAACAGCTTGTT
TTCTAAAGGCGCTGTCACATCTCAAGGTTCGATAAGAAACCACATTCCATCTGGTTCAAT
TACCGACAACTCAATGTTTCCCAACCAGCTATCTTCCCAACAGACGGAGTCACGGCCTAT
CCAACGTTCCAGTTACCAAAGTTTGCAAAATGATTTCTCTCAAACTGGAAAACAGCTCGG
TGCAACGGGAGACAGTCTGTCGCTTTCTTCACAGCAGGCGACCGATCCTACCTCATTACA
TGGTTCCCAGCGTTTCTCGGAAGCTGGCCCAAAGCAAAATGAGCCTCTTCGTGGCCCGCC
TGGTCTAACGCATCCAAGCTCCCTCTCGTCATCAAGCAACTCAATTGGTAATTCCCATGG
TTCCATAACAGGGTCAAATCAGCAAGGTGGCGACCTTTCGGCCTCTTATGGGTCTTCGAG
GATGGTTCCAGGGCAACTTAATGCTATGTCTTCAGAGTCAACACACGACCCAACTGGTAT
TACAAACTCGGCACATTCGTACTATACCTCCACATCGCTGGGTCAATCGCAACAACAACT
TGGTTCCGACCATTCAAGCTCTGCAGGCCGGAGCATGAGGTCTCCTGTTCCTTCAACGAG
TTTACAAGGAAGTTTACAAGGTTCACCGATGCCACATATGTCTGTAACCCCATCCAAAGA
TGATTTACCTTCTGGCGTTGCATCAACTGCGATTTCGTCCCTTGCAAGCGGTCTTGGCCA
GACACACATAACATCACATACGAGTGGTCCATCTGAGACTTCACCCACTGCCCCTCTCAA
TATTCCTGGTGCCACAACAACCAATGCCCCAACCCTTGGTGGAACTGGTGCTTATGGTTC
AATGGGAATGCATTTGCCTTACAGCGCATCACCACAGGCTTCTCAGGCATCAGCGATCCC
CACGGTAACATCACCGGGAAAACACCTTCCCACAAGCGACCTTTACCCTTCTGGCCTCCC
GTCGTCATTACATCACAATCACCAACAAAGTTCCAGCACCACTGTTTCAACCATGATTGG
GTCGGCACTCGGTAATGCGGCTCTATCATCAGTGGCAGGCACTCCAAAGTCATCAACATC
GCTAAGCACGCCTTCAACCAAAACTGGTCCTCCAAACCTACCACTAGGGGTCCCACCGTT
GCTGCCAAATCAATATGGAATCCCTATGGGTGCAGGATTAATGACAGCTTATGCACCGGA
AGCTGCCTTGTATGCTGGTTACACTGACCCGTTGATGGCAGTGCCTTCAAGAGTCGTAAA
TCCAATGCCCAACTATTATGACGTCTCATCTTTTCACACTTCAAACAATCAGACTGCAAA
CCCAACAACAGTAAATAGAGAAACGACGGCCAGCAACGTTAACCAAGGCAAATTTGGACA
CAGGGAGCAATCAAGCCCAACATCGGTAATTGGTATGATTGGAGGGTCAGTCGGTTCAGG
TCTGGCCCAGCAAGTAGCAGGTCAACATGGTGCACAATTAAAAGCATCGCAGACAGGAAC
TCACCAAGCTCAACCTTTCGTAAATCTACCGACGGCCCCAGCTGCATATCCTGGTTATGC
AAATGTTTATTACAACGCCTTTCAGTATCCACCTATGTTTGCTGCAGCAGCAGCTACAGC
GGTACCACAGAGTGGAAAGCACAATGTAAACGTGACGACAGCGTTTCAGCAACATGGCAC
AGGTTTTGGAAATGCTTATTCTACAGCCTCAATCAATGCTTCGACAGCCAGTAGTCTTCA
TGACTTACAAGGGCAAGGGTACAACAAGAATCACGTGACACTAACTGCTGCCATGGCAGC
CGCTAACAATGCTGGGGCCGGTGGTGGGGCTGCGGGGCCCGGAATGAGTCCGTACACCCA
GTCTCCATTTATGACAATGTTACCAACTCACCCAAACTCTCAGATTCATCTTCATGTGCA
GCAGCAACACGGCGATGTAGGGCATGGTGTTGGATCACAAAGAGGGCAGAATACAAACAC
TATTGGAAAATCAACTGCAAAGCCTGGATTTGGCAGTGCACCATACTGGGGCAACTAAAC
TCAACTGTCAATGTTAACTGTTTGTTTGTCTATTCCCTTCTTTTGCCCCAGCTATGTGCC
ACCTGTACCTTGTATTATACTGTTTCATCCATTCAGTTTAGTACCTTAATAATCTCGAAG
CTTATGTGGCTGTCTTTTCAACAAGATGCCCTCATTTATTTTTTGTACAAAAAGCTCTTG
TTGGCATGTGCTATTTGTAGTAAAACGACTGTGTTGTCACGTGTTTTGTATTGCTTCGCT
TTTTCAAGGTCCAATGTCCCGTGTGGCCTAGCTCTCTTCCCATTTTAGGACTCGATCTTG
CTCCCAAACATGTCACTGACAGTTATTACAAATTGCTCTTTTTTCCTTCCCCCCACCATA
CACAGCTTTGACATGTTGATTATGTTCATGGTGGCCCATGTATGTTCTCAAATGCATTCA
ATGTTTGGTGTTTGCAAAGTCATTTAGGACACCCTCTGTTAAGTCAGTAAAATACTTATC
AATTCAAAGGCAAAGACTGCAGTAAATCGGTACTCTAAACATGTGAAAGAAACAGCCCAA
TTGTATAGATTTGCTGCACTCAGCTGTCAACACACTTGGTTATGGGTTTTGCATTCATGG
CTAATCTATTTGTACAAACAGCACTCAAAACTGTAATAAATTTTGTTCTGTCTGAAAAAT
GTACACTAGCTTTCCACGCTGACTATTCTGGGCGAAATGTGTTAGATAACAGATGAAGGG
TTTTTTACCCCCTTTGAATTAGCTTGGTTTTTCAAAGTTCCATGCAATCCAAACTTCTGT
TTGTAATAGTCTACCGTTTGTATTTTGAGCTCCATCAGTTACATGAACATAAACCCAACC
TGTAGATGCCTGTTTGGTGATTTGTATTAGCAAAAGGCAGAAGTCTGAAGTTAGCACCAG
AGTAGACGAGTTAAAATCTAGTTCCAGTGTAAAAAACAAATGTCAACAGATGTTAAAAAA
CTGCACCACTAATAAAAATGTTTAAAACCTGGACCAAAAGTGTAAGTGCATGAGGCAACA
CAAAAAACAGTAAAGTACAATTATTGATTTTAAAAACCAGGAGAAATCAGTTAAGCTGCT
GATGTGAGATGATCAAACAACTGGTGCCTTGGTTGCACTGAAAAAATTTCCTTGTTTTGT
AAACAAACATCGCATGCCCAAATTGCAAGCTCTTCTGATTTAAGATGACTATAGGCAGCT
TCTGTTAGTCCTACACAAGTGCGGTGGTACCACTGTCGACAGCTAGCCAGGCAACGAATT
ACATCATCAGTTGAGGCGATGTCATTGGAACAACTTTTACATTTCTGTGGAAGCACAGGG
GGTATAGAATGTGGAACAACATTATGATCCATGCTTTCTTGACTAGCTGCCTTTTCAGCC
TCTGCCTTCTTAGATTCGGCTGACGGCTTCTTTTCAGACTTTTTTCGCGACTTACTAGAT
GGCTCACTGCTTTTGGGTGATTTGCCTTCAGTTTTGCTTGAGCTAGTGGATGTTTTACGT
CCAGATGTGCTTGGGGATGGTAACTGAGCAGGGGGTCGGGTCAGCGCTTTCATTTGCCCA
GTATTTTGAAGCATGTGTCCATGGTTTCCACCAGACATCATACCTGCTCCCATGCTTTGA
TTATCCATCATCACACTATCTGGTCCAGGTGAACCCAATGGCCCCATCCCTGGCCGCACA
CTGTTCATATGCATTCTTGGCGAAGCCCTAAAAGGGGGCATACCTGGACCATAAGGGGGC
CTGTTCATGTAGCCATTGTTTGGCATGTTGGGATTTGGTGTCATATTATGATGGTAACCT
GGGTGTGTGCTCATTCCATTGTTGCTGTGCATTGGTACATTCCAGCCAGGTCCAACAGGT
CCACCAGGTCCAGGATATCGCATTCCATGAAGTTCCGGCCGTCCTGGAAATCCAGGGTAT
GGGGACCCCATTCCTCCGCCGGGGGCTTGGAGTCGGACCATGGGCTGATTGGGGAAAAAT
CCAGGGCCCATTTTCATTGAGTTTTGTGGGGGATCGTCAAAAGGATTAGAAGCAACAAGA
TGAGTTGCGGAAGGGTTGGGAGGTGGAACTATATCTCCTGCTCCTGGGGAAGTTGTGCTA
GTATCCTTTGATGTTGCAGAGGTTTTCCTGGCCTTTTTTGATTCTTGAGATTCCTTTTTC
TTAGGCATGGTATTTAAGTGAACCAAATATACAGCATCCAATAGGTAAATATTATTAGAA
AAACTATTTTTTTCTTATTTTTTACATGATTTAATTTGATGAAACTAATGGCAAGGTCAT
TTCTATTTCCTGTGGGTATGGCAAATTTTAAATCATCGAAACATTTTGCACTTTTTATTT
GTGTTTCTCGATCTTTCTATTTTTAGTTAAACGGGTAACCTTTCAATTTCAGAATAACGC
TGTAAAGCTATATTATAGTGTCGAACTGAACTCTCAAAAAACACAAAAATATTGCAAGTC
TATATTTGTGCTCGAAAGTGTTATGAATTTCACTTTTTTGACAAGAAACTTTCATTTCAA
AGGAATTAGGCAGTATCTATGACAGACTGAAAACTACCAAACTCAGAATAACTGTATCTT
AGATTGTTAATTGTCGAACTCTAAAAGACACAAAAATATTGCAAGTCTATAATTTGCTCC
AAAGTGTAATAAAATTAACTTTTCTAAGCAGAAAACTTTGTTTCTAAAGAATTAAAGTCG
TTTCTTACGGAATCT

InterProScan

SUPERFAMILY
UBA-like_sf (IPR009060) - T[16-103] 2.11E-15
Pfam
DUF3697_Uba2 (IPR022166) - T[581-610] 1.1E-4

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
UBAP2_HUMAN 26.133 % 89.4 7.73E-18