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Transcript Model
Transcript Id
Phmamm.CG.MTP2014.S2180.g16327.01.t
Possible name(s)
HMBS
Gene model
Location
S2180 [11,531 / 16,225]
Amino acid sequence
Length: 256
>Phmamm.CG.MTP2014.S2180.g16327.01.p
REDPRDAVIMHPTNKGKTLKELSTGSVVGTSSLRRIAQLKKLFPHLKFKSIRGNLNTRLH
KLDSADTFSAIILAVAGVKRMGWSERISYILPTDQCLYAIGQGALAIETRADDAQSIKFV
EELHDRDTVIRTVAERAFLKTLGGGCSVPQAVHTWIDDSQLYMTGGVFNLNGSRSLIETM
QTQLPNQEASVIEPVDPDTCCEFASITTSHKLLDAGFLKAAGHLGRDLALLLLKKGARDI
LDEARQQNLANENDVV
Nucleotide sequence
Length: 2,545
>Phmamm.CG.MTP2014.S2180.g16327.01.t
CGGGAAGATCCCCGGGATGCTGTTATCATGCACCCTACAAACAAAGGAAAAACGCTTAAA
GAATTATCTACAGGGAGTGTTGTTGGAACAAGCTCCTTGCGTCGTATTGCTCAATTGAAG
AAACTTTTTCCTCATTTGAAGTTTAAAAGCATTCGTGGTAACCTAAACACTCGACTTCAC
AAGTTGGACTCTGCTGATACTTTTTCAGCAATAATATTAGCAGTTGCTGGTGTGAAGAGA
ATGGGGTGGAGTGAACGAATTTCTTATATTTTACCTACAGATCAATGCCTATATGCAATT
GGTCAAGGTGCTTTGGCTATTGAGACAAGAGCTGATGATGCACAGAGCATAAAGTTTGTT
GAGGAACTTCATGATCGTGACACTGTTATACGAACTGTGGCTGAACGTGCCTTTTTGAAA
ACTTTGGGTGGGGGATGTTCAGTGCCACAGGCAGTACATACATGGATTGATGATTCACAG
CTTTATATGACTGGGGGAGTATTTAATCTTAATGGATCAAGGTCGTTGATAGAAACAATG
CAAACACAGCTGCCAAATCAAGAAGCAAGTGTGATTGAACCAGTGGATCCTGACACATGT
TGTGAGTTTGCAAGCATCACTACTAGTCATAAGCTACTGGATGCTGGTTTTCTTAAAGCC
GCTGGGCATCTTGGGCGTGATCTAGCTTTGCTTCTGTTAAAAAAGGGGGCCAGAGATATT
CTGGATGAAGCAAGACAGCAAAATTTAGCAAATGAAAATGATGTTGTTTAGTATGCTTGT
GAGTGTAAACAACACACTGAAGTTCAAAAATTTGTGATATTTGCCTTTTTGAACTTATAG
TTTGTGCAATTAATATTTTTCCAAATTATCTCGAGGTTTGTCAATGCTTGCTATGCAACT
GAAAACATCTAACCAACCACCATGATGCTTGATTTAATTTTTGTGTTGTGTTAATGTGGT
ACATTGCTGCTATCCTTACATCATACCTACATGTTTAGCCTTTTTACTAACAAAAAGCAC
ATGTTTTTGCACTTTTGTTACATCAGTTTGTCTATTCGAATGAGCTTTGTACATGTAACA
TTAGGACATGTGAAAGTTGGAAATATTGGCACACAAACAATATTGCTGGATTCTTTATTA
ACAATAAAATTTAAACTTGAATATGCAGTGATTAAAAAAAAATTTTGGGGACTGTGTGAA
AAGATCACAGCATACAGAGTTTAAATTATTGCACATTCAGCTCTGCATCACTTGATTTTG
TAGAATATTTTACTTTTTTCGATACTGCATTTACTTTTTGTAGTTGGCAGACAATTTATT
AAAAATGACAAAAGATACAGGTTGTGGTAAATAGCATGTACAAAATAAAACACACACACA
CTCATATATATATATATATACTCCTAGTTAAGATGAAGATAGCACTAGCTTGTCCTTTGC
TAGACTACAAAAGTATAGACAAAAAATAAAAAAAATATAATAGGTAAAAGGAACATGCAA
ATTCTGACAGTGCCTAAGATTCTACCAGTGTATGCCATCGACTGACAACTTTCCCCTTTG
CTTCTCTCATTTCCAACCAATGTTGTTCATCAGATTCACTGCTGCTGTTTTGACCAAGTG
AAATCCAACCAATCATGAATTTGCGTTTAATTGTGCGCGTACAATGCACGCTTACCATAA
GCGACACTTCAGCCAGCTGAAACAGGGCAACCTGTCCAAAATATAATAACATTGAAAAAA
AACACCAAGTGTATTTATCCTCTGAGGCAGAAATGCTCAATCTTTTTGACTCAAGCTTGA
TGTAAAATCTTGGGATCTTTTTCTGAGCCCTGTTTTACAGAAAACTTCTAATTTAATCTT
TAAAATACAATATTGAAAAAAGAGTTAACCTGCCCAAGCGCAGAGCAATTTCTATTTTCT
TGTGAAGAACATAGGGTGCATTTATGACTGTGCACAGCTACCTGGGTGGATTACTATTTC
AAATGGGCAATTATATTAGAAGCACAGCTAAACCCTTTTAGTAAATTGAATACACAACAA
ACTAGAAGGGTGGCTTAGCACATATTGCCCTTGCATATACACTATACCCTATTTTAAAAC
ATGAATATATTTCCTATGCTTATTTTGTATTGGGTCCCATATTAGCCATCGTCTTTTATA
ACTTTAAGTCGTTTCTGCAGGCAAAAACTCATGGGTCCCCACACATGCAAAGTGAAAAAT
AATGCAATTCAAGAGATAACCATGAGAAAGTCGGGTGTTGTAAGGTAAAACACAGTGATC
AGCACTGGGCTTAAATAATAATACTATGTAGAATACAAACTATAAAATTAGATTCATCCC
AGATATTGTTTGAAGTATGTCCTATTTAACGTTTTAAAAAACTGACCCATTTTAGGGGGC
TAGTAGGGCAACTAATTGGGTTCGACACACAAACTAAAAAATATATAAAAACCACAATGA
CTCAATCAATAGTACTGCAAAATTTCAGCCCAATCCGCCAATGTTTAAAATTTCGACCAC
TAGAGGTGTTTTGAGCAACAACCGT
| Pfam |
Porphobilin_deaminase_N (IPR022417) - T[1-115] 1.2E-39 |
| TIGRFAM |
HemC (IPR000860) - T[1-183] 3.9E-55 |
| PIRSF |
HemC (IPR000860) - T[1-252] 4.5E-69 |
| PANTHER |
HemC (IPR000860) - T[1-250] 6.7E-78 |
| PRINTS |
HemC (IPR000860) - T[27-44] 4.3E-24 - T[46-63] 4.3E-24 - T[134-151] 4.3E-24 |
| SUPERFAMILY |
Porphobilinogen_deaminase_C_sf (IPR036803) - T[124-189] 7.06E-16 |
| Gene3D |
Porphobilinogen_deaminase_C_sf (IPR036803) - T[125-251] 2.2E-33 |
| Pfam |
Porphobilinogen_deaminase_C (IPR022418) - T[131-189] 2.5E-14 |
| Protein Name | Identity | Bit Score | e-value |
|---|---|---|---|
| HEM3_HUMAN | 54.15 % | 255 | 2.44E-84 |