- Transcript 'Phmamm.CG.MTP2014.S2...'
Transcript Model
Transcript Id
Phmamm.CG.MTP2014.S210.g05440.01.t
Possible name(s)
GPS1; PSMD6
Gene model
Location
S210 [182,712 / 189,371]
Amino acid sequence
Length: 338
>Phmamm.CG.MTP2014.S210.g05440.01.p
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CKIGAKDESLAVFRKAYDKTIALGHRLDIIFNLIRIGLFYMDHDLITRNVDKAKQLIEEG
GDWDRRNRLKVYQGLYSIAIRDFKSAATLFLETVSTFTSYELMDYETFVTYTVYVSMMAL
DRPQLRDKVVKGSEILEILYDQTSTKQYLFSLYDCHYAQFFLRLAEVETVMKRDRYFNPH
YRFYIREMRVLAYTQLLESYRSLTLEYMAQAFGVTVEFIDHELSRFIAVGRLHCKIDKVG
GVVETNRPDSKNWQYQETIKKGDLLLNRIQKLSRVINL
Nucleotide sequence
Length: 4,518
>Phmamm.CG.MTP2014.S210.g05440.01.t
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AGGTCTTCCTAAGATTCCTAATTTAAACATTGCAAACCTTGCGTTTCTTTATACTTTGGA
GCCCACCGAAGCAACATGGGTTGAATTATTGGGATTTGTAAAGAAAGACAGTGAGTATTA
TTAAAAACATAAGTTTAAACAGCATTGATATGTATTTCTAATTTATTGTTTACCCAAACT
TAGACATGGCCCCTTATTATGAGAAAATTTGTGCGGATTTAAACAAGCCTCTTGATGAAA
AACTGCTTCAAAAAATGAAGGAGGAAAATGAGAAAGAAATTAAAAAACTAGATGAGAAAA
TTTCGGAGGAAGTTGATTATGAATCTGACGAAAAAGATGCACTTCTTTCCAAGGCAGAAT
ATCTCTGTAAGATTGGTGCTAAGGATGAAAGTCTGGCTGTTTTTCGAAAAGCCTATGACA
AAACAATTGCGCTTGGTCATAGATTGGACATCATTTTCAACCTTATACGAATTGGTTTGT
TTTATATGGACCATGACTTAATCACAAGAAATGTAGACAAAGCAAAACAGTTAATTGAAG
AAGGTGGTGACTGGGACAGAAGAAACAGATTAAAAGTCTATCAGGGCTTATACTCAATTG
CTATCAGAGATTTTAAATCTGCAGCTACCTTGTTTCTTGAAACGGTTTCCACTTTTACTT
CTTATGAATTAATGGACTATGAGACTTTTGTCACATACACAGTTTATGTTTCAATGATGG
CTCTGGATCGACCACAATTAAGAGATAAAGTTGTAAAGGGTTCTGAAATTCTTGAGATTC
TTTATGATCAGACAAGCACAAAACAATATCTGTTTTCCCTGTATGATTGCCATTATGCTC
AGTTTTTTCTCAGACTTGCTGAAGTGGAAACAGTAATGAAGAGAGATCGTTATTTTAACC
CACATTATCGTTTCTACATCAGAGAAATGAGAGTTTTGGCATACACCCAGCTTCTTGAGT
CGTACAGAAGTTTAACACTTGAGTACATGGCACAAGCCTTTGGTGTCACTGTAGAATTTA
TTGACCATGAATTGTCACGATTTATTGCTGTTGGACGACTGCATTGCAAGATTGACAAAG
TTGGTGGAGTGGTAGAAACCAATCGCCCCGACAGCAAAAATTGGCAATACCAGGAAACTA
TCAAAAAAGGAGATCTGCTGCTAAACAGGATCCAGAAACTGTCCAGAGTTATTAATTTAT
AACATTATTGTCTTTTGCTTCACACATGTGTTTGTTTGTGCATAAAAAAGTTCAACTTGA
AGTGAACTACTTTGACAAACATAAAACAATTGATTTACACTAAGTTTGGCATTTTTTGCT
GCAATCTGTTTTTCAAGTCATATTTGTAGGTCCAAGCTACAAGAGCTTTGTGCTGTTTGA
AACAATAAACTTGATACAACCGATTCTGGTAAATGAATTTTGACAAAGTCACTGATTGCT
GGTTTCCATATTTATTGAAAATTGCCTGTTATCAGTAACCCAAAAGTGATTTCAGACAGA
AGCACCATTTATTGCTTGGATGACACTTAATGACACATAAAAACCTAAATAAAATTAATT
CAAACAAACATGTTTGGATACATTTATCAGTGTAAGTGGTACAACAAGAACAAAAAAGAG
ACAAAGTGCAGTTTGTTATTTGTGATGCAACGATTGAAACACTAACCATAAAGATCCAAC
CTACTAAATATTTGGAAGGTATGCTATGTAAATAATGCAGTTAAACTTGTTCATAACACT
CCAAAACATCTTTCATAATGTATTAGATGCACACAAAAATAACAACAGTGCCTGTGTTTT
GTAAAGACAATGTTAAAACATTTAAGCAAACTATAGTACAGTGTATCGCTACTTATAATA
CCTCTACAACATCAACAAGAACATGCCTGAGCATTACAAAACAGTGCAACTGTACCAGCC
TTATTTAAATATGGTCCTTCCACTAAAACTTGAAGCATGAGGATCAAACTCTATCCCTTT
GCAGCGGTGCAAGTAAACACAGTGAAATATTAATTACAAAGAATCAAATTGTTCTAAAGT
GCGTGGCAAAAGATCAACCATCTCTCTGCAAACTCCAATTTCAGCTTTGACAGCAGCCTC
TGCTTCTTGGTGTGTGTCCACATAGTTGGTTATAAACTTGTAATTTTCAAGTGCCAGTCT
CTTGTTTTGAAGATTGCTTTCAACTGAAGCAGCAGGTTTTTTCGAGTATAATCTTTTCAA
AAAATTTGTACCAAATTAAATACAATTTGTTTTAATGCCTAAATTGTGGTTTTGACCCAA
AAATTCGAAAGATTTAAGAAAATTCTTTGCTCGTCTAGTAAAGACCTGTTTTAAAATGCA
TTACTTAAGTGAATACAGCTGGTTGATGGAACATATATGTAGTATATACCTTCCAATGTA
GAAATGAGCCAAGAGTGTGGATCTTTCCATCTCTGGCTCGAATCTGTCTGGAAAGTTACC
ATCTGGCAGCTTGTGTGTGTTTAAAAACATTCGAAAGTATCCAATTCTAGCCCATAAATG
TTAGAAAATTTTAAATTGAAGAAAACACATTTTACACAATGCTTCATCTAATACAAGGGT
AACTTTGATGCTTATAGATCCCACAACCCTAAATACTTAAACTTGTATTTTGAATAAGAA
ATATAAAAAGTGCTAATGCCTGAGCAACTGGTCAAAATAAAATGTCCTCATCAATTTCAA
AATAGAATGCCCTTATCAATTCAATAATTACATACCCAGAATTGCAAAGTGTTGTCATTT
TCTTTATCATATGAGTGGTGGGTGAATTTCCACTTCCCTCAGCTAACAACAACTTTAGTG
AAAACATTTCATTGTAGGTCTTTCCAATCTCATATTGAAGTTGCCTAATAAATCCAAAAA
AAACCTTGTTACTGCTATAGATGAAAACCTGTTTTATAGTACATCTAACAAAAAACGTAC
AAAGTAATGATGCAAATACTGATTCTCACCTGCATATTGCAAGGTAATACTGTATGTTAA
GTTCCTTCAACACAACAGACAACAAATCAATCCTCCGTTTGTGCATCTTACACTGAACCT
CTTTGCTTGGTTCAAAGAATGCCATGTACTGGTAAAGGTGACTTAAATCCTATATGCATG
CATATAGGTGTTAATTACTAGTAAATCTCACCTGTCAAATCCCAAGAAAAAAAGAACACA
AAACATGCCAGATAAAAGAACACAAAATAAAATTAAACCAAGGTTAATTCAATCACATAT
TTTTTGATGCTGACCCCTATTAACTCCAACCCCACATTTGAAACTGCAACTCCTCAACTC
TGGCTTAAACACACAACAGAAATGTTCTTGGTCATGCATTTTCACCTGTATCAGTTCCAC
ATGATCAGTAACAAAACCATCCATGACAAAAAATTTAAGGGCATCCTCAGCATACTGCTT
TCCTTTCAAAAATATAGCTCTTGCCTACCACAAAACAAACAATGACATAATTTATTGCCT
TGAACAAAAAAAGGATAGTTAAGTTTCTTGTAAATGTTACAACACATTATCCACAGCTTA
AAGGCGATTTATAGCATGATTCAACTAATAAGTTTGACATAGAAAATACTGGATTTTTTC
TAATTACCAATTTTATATTGTGGGCATAGTTATGAGGAATGGACTCTTCAATTGATGTTA
CTTCCAAACCGAATCTTTCAAAAGATTTGTCATCATCTTCTCCAGTGCCACTTTGTTCAT
TCTGAACTGCTTGGATTTGGAGATTTATGTCTAACTCACCTGATCGGAAATAGATCAACA
AAGAAAATGTCATGGTAAATTTTTACTTTGTGCAAGCATGGCAAAGGGCAAAAAATCAGG
ATGCTTAAAAATGCTACATAACAGTTAATAAGAGTGCCAAAAAACTTGCCCTCATTCAAC
AGTATTACAAAACAAAGTGTCTGGAACATACCATATTCATCAGACAGCTTTTCTTTTGAT
TCATCAAGTAGGTTGACAAAATATTTCACCCAGCATCTAGCAACATCAGACTCAGCCTGT
TCAATTCTGTCAATATCATTATCTGCAAGCAATCGTGTTTAAATTCTTAAAGCAATCTAC
TTGCAAATGTTAGTATTTAAGAAGGTACTTTTGCTCGAAGTGCAAAAATTAGAGAAACGT
GAATTGTAAACTCCATTTAGGGTAGTTCAAGGCAAGAGATTTTTTTTCTTACCCTCAGCT
TTAATCTTCTCTTCCGCAAGAAGGTAGTTGGCACATGATAGACAGTGTTTGGCTTCTTTG
AATTTGTTTCTCACCACATAGTACTGGGAAAGTGATGCACAATTTATAGCCCAGTCAACT
GGTTTGTATTCATTAAATTTTAATTGCCTGTGTAAGGTCTGCATGCAGCATTCCGCTGAC
TCATCGCGTTTATCTAAA
| PANTHER |
PSMD6 (IPR035268) - T[1-338] 7.3E-165 |
| Pfam |
Rpn7/CSN1 (IPR019585) - T[17-188] 8.2E-55 |
| SUPERFAMILY |
TPR-like_helical_dom_sf (IPR011990) - T[39-164] 1.64E-5 |
| ProSiteProfiles |
PCI_dom (IPR000717) - T[142-310] 22.814 |
| Pfam |
PCI_dom (IPR000717) - T[206-306] 1.5E-14 |
| SUPERFAMILY |
WH_DNA-bd_sf (IPR036390) - T[234-315] 3.81E-18 |
| SMART |
PCI_dom (IPR000717) - T[239-322] 1.7E-23 |
| Protein Name | Identity | Bit Score | e-value |
|---|---|---|---|
| CSN1_HUMAN | 23.134 % | 85.5 | 2.33E-18 |
| PSMD6_HUMAN | 72.059 % | 512 | 0 |