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  1. Transcript 'Phmamm.CG.MTP2014.S2...'

Transcript Model

Transcript Id

Phmamm.CG.MTP2014.S2054.g16111.01.t

Possible name(s)

UFD1

Location

S2054 [5,921 / 16,291]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 308

>Phmamm.CG.MTP2014.S2054.g16111.01.p
MFGMLDEFRIGPRGNVFKNKYRCYSSSFGALSETKSNDIQKGGKVILPPSALDQLSRLNI
SYPMLFKLTNSNKTNRSTHCGVLEFVAEEGIMFLPYWMMQNLLLAEGDLVLIENCTLPVA
TYAKFKPQSTEFLDISDPKAVLENALRNFACLTKGDVIAIQYNNRQYELYVLEVRPQDAV
CIIECDISLEFDAPVGYQKQEVDSAPEQTTFGTPDVKKAIEDYMKENAEFSAFEGTGFRL
DGRKKNTKSKKNEFDPSQVKRGIPNYKWKVGSITYNRNNTKPKVEEDDPSNNFSAFKGKG
QALRKKRT

Nucleotide sequence

Length: 3,331

>Phmamm.CG.MTP2014.S2054.g16111.01.t
ATTAGATTCACCCGGCACCATGAAAGCTTGGTTCAAACCAAGGCTTATCATCATAGGTGC
TGGTGGTAGTGTCCACTGCCTACTTAGACTTTTTTTAAATTTAGGTTGGTGCTAGTAGGC
TGTGGCTATCTTACTATAATAGCAATAATGCTATTATTTTTGGTATTTCAGTGAAAAAAT
ATTTTTTTAATGAAGGTCGGTGGTGGAGTAAATAAGTTGAAAAGCCCTGGTTTAAATGGT
TGAAAAGGAGTCAAATTAATCAGCTATTGGCAGACATTTTAGATTCCCTTTTTCTGTTAA
TTTTCAGAAACTAGTCTAGCATACATTCCTTGAACAATAGGATATGTTTGGAATGTTAGA
TGAGTTTCGTATTGGTCCAAGAGGAAATGTATTCAAAAACAAATATCGATGTTACTCCAG
CAGCTTTGGTGCTTTATCTGAAACTAAAAGTAATGATATTCAAAAGGGAGGAAAAGTGAT
ATTGCCTCCATCTGCTTTGGACCAACTAAGCAGGTTAAACATATCATATCCTATGCTATT
TAAGTTGACAAACAGTAATAAGACAAATCGTTCAACGCATTGTGGTGTATTGGAATTTGT
AGCAGAAGAAGGGATAATGTTTCTGCCATACTGGATGATGCAGAATTTGCTACTTGCGGA
GGGTGATCTTGTTCTGATTGAAAACTGCACTTTACCAGTGGCAACATATGCAAAGTTTAA
ACCCCAGTCTACAGAGTTTTTGGATATTTCTGATCCCAAAGCAGTTCTTGAAAATGCACT
AAGGAACTTTGCATGCCTAACAAAAGGAGATGTGATTGCTATTCAGTACAACAATAGACA
GTATGAACTATATGTTCTTGAAGTGCGCCCACAAGATGCAGTATGTATTATTGAATGTGA
CATTAGTTTGGAATTTGATGCTCCAGTGGGTTATCAAAAACAGGAAGTAGACAGTGCACC
TGAACAGACTACATTTGGGACTCCAGATGTCAAAAAAGCCATAGAAGACTACATGAAAGA
AAATGCTGAATTTTCGGCCTTTGAAGGAACTGGTTTTCGCCTTGATGGAAGGAAAAAAAA
TACCAAGTCTAAGAAAAATGAGTTTGACCCAAGTCAAGTTAAACGAGGTATTCCCAATTA
CAAGTGGAAGGTTGGGTCTATCACTTACAATAGGAATAACACCAAGCCTAAAGTTGAGGA
GGACGATCCATCCAACAATTTTTCAGCATTTAAAGGAAAAGGCCAGGCGCTAAGAAAAAA
GAGAACTTAGATTCAGAAGTTTAAAAAACTTGGGCAGCCTGTACTACCAACTGATGGCAC
TGTGAATAAGGCATCTTATTTCTACAACATGAATGTGCAGGAAATAATAGTAGAATAAAG
TTACTTTTTACAGTATTATATTCTTCTGAACAGCTTTGAAGTGCTATTATTCCTGCAATG
TATGTTTACAAGCTACCCTAGTTGTTCTATCCAGAACTGGTCAGTTAATGGACTTAAAAA
AAATAAAAAACATTGGGTTTTCTGAAATAGGGAATGTAACTTGGCATTTTCTGGTCCGTT
TCTGGCAACTGTTTGTCAAGTACTGCAATAAATGTTGAGATATTTAAATACTTTGATTTA
GAACAACGTTACTTGCGAGGTGACAAAGTCATGTGCTCTAAAATGGTAGAAAGTTTTGGA
TGTGACATTGTTTTACAGACATTAAACACGTATTTGTTTACAAGTGAATCGTGGGCCATT
GTTATACAACAGTAAGTCTGTAATATTTATAGCTGTGATGCACTGAAGTTTAAGGTTGGA
CAAAATATATATCGGCCGAATATGCTGTTTGGTGAATGTTTCGGTTTCGTCCCGAACTTT
TTTGAATATCCGGCCGAAACCAAACTTTTTTAGTGTATCAAATTATTGCCTAAACTTTGA
ATATCGCCAATTTAAAACGTCCTAAATTAACTAATTTATGTGTGTAGAAAACACGAGCCA
TGTTGTCTGCAAAATATTAGATGTTTGTCGGGCTTTTGCATTGTAAAATTCGTTTTGGGT
TGTCAGAAATAGGTTCACATGCATCAATAACGCAAGGTTCAATTGAAAACATCCATCAAA
AAAGGTATTCTAGGTTCGGCCTTTTGATGCGGTTCGTAGCATCACCAGTTATAGGTACGC
AATTCTCCTGTATGTGCTGCCCACATCTACACAATTTAATGAGGTAACAACATAGAGGCG
ACGTTCAGCTTAACCTCTTAACGCGAGCATATACATCGTTCGTGAAAATAAATTGTGTCA
GTGTGCTTTACTTTTCCGCTCAGAAAAAAACAAACAATTTTTTTTAAAACTTTGGGGTGT
GGTTGCCCTCTGTCCCGAATTAGGGACATTCGTCCACTATAGGGTAAAAAATCCCCTCAT
TTTGGTTTCAAATTTATCAAACAATCGGTTTTGTTCAGTGACCTCATAGGTTGGCTCCAA
AATAATCCTTTTTGCATTTGTGACGTCATAACCACATTTATAAAATTTCGTATTTTTCGG
CTTTTCGTTTAGTACACTGGTTCCCAACCTTTGTGTCCTGTGTACCCTTTTAGTCGATAT
TCAAATCTATTTCCCCCCTACAATTTTAGTTTGCTCATATATGGCAAATGCAGCAATAAC
ACATAGTACGTACAACCAGTGTTTTTTTAAGGTGTTATGAAAAATTTTCTCCAGCGGTTT
CCCAAAATGGCTATTTAAGCAAATATGGCTATTTTTGGTATTTAAATGAAACACTTGCGG
TCTCTTAAAACTACTTAGCGGTCACCCAAACCAAACCTTAAAAAAAACCTGCGTACAACC
AGTGAGAGATTAATATTGTGACACAAATTCCCCCCCCCCCTAGTGGGGAATTCCCCACCA
CTGGTTTAGTACACGGCTTCAGAACTCACTCTTCAACATAAACTGCAATTAAAAAACAAA
AATGCATTTTTAGGATTTTAGGACGGGTAAAAATTGGTGCAACAAATACTGTGTTTGTTT
ATGCACAGATTATTGTTGCATTTTTTGCAAAACATCACAGTTTAGCTATTACAATTTAAC
ATCTTGCACCTCTGCCGCTTTTCTCCGACCTCGGGCCAATGCCCGACGCCACCAAACCGT
GTTTCATTATGCGGTCGTTTCGCCGGGTTGGAATATCTGTGTGCCCATGAATGAACACGT
TCGTTTGACGGTCGACTTTTTTGGGTTTGATATCATTTCCTTCTTTGTGTGAAGAATCTG
CAATGCCAATTTTAAACTGAAGAAGTACTTTTCTTTTATTGTGCGGTATGTCGAACCAAT
CACAATCTCTTCTATACAGAATGCATCCGTT

InterProScan

PANTHER
Ufd1-like (IPR004854) - T[11-296] 2.3E-98
Pfam
Ufd1-like (IPR004854) - T[17-194] 1.2E-76

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
UFD1_HUMAN 58.305 % 336 6.97E-116