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  1. Transcript 'Phmamm.CG.MTP2014.S1...'

Transcript Model

Transcript Id

Phmamm.CG.MTP2014.S18.g00767.01.t

Possible name(s)

EFR3A; EFR3B

Location

S18 [270,407 / 275,374]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 804

>Phmamm.CG.MTP2014.S18.g00767.01.p
QMLHYCSIHVYVNEVVIFSLNMASCSCCPAFRPRYKRLVDNIFPSVQSEGLVRSEMEKLT
YYAVSAPEKLDRIGDYLARRLTRDIARKRDQSVFVAMEALNQLLLACHAQQINLFVESFL
KMVATLLESDNYNFQALGTNSFEKFSKIEEDTASYHRRYDFFVSKFSAMCHSNEENLSVR
RKIQLHGVHGLRGVIRKTVSDELQVNIWEKQHMDKIIPSLLYSMQNSQEKNPSDAASDVE
QPSTLAEESLRELLSRAAFSNVSAAIYPALAHMDNHELWAPDNSFAIKSFKIIMYSIQGQ
YSHVIVKLLLDHIDTHDNNDQPIRASILKVLCAIVPIPASTAIGPSVIDVFNRLSQHLRI
SAESTNQKTFQTALIETTGVLSSVVPDYQKLEAMSFYINRALEAISDHDLREATTADLNY
SSLLLQCIQQISKTYRINTLSSLSSSLLEPLLKITLNVGPNDRLIAQNVLLVLLDKNNNR
TKLKLVNSESDIDQLGLVSSTASKQDCEFLDQRLHSIYLWLYECFTLEDNSTDNFQALYK
LVSVLCLSVMSADVILELCRIVLAAQNSVVENSGESFQVDSNQQTMQLLSSTAACILVLA
HLSAVPEFQHYANQVMLERNSVAPQIMPSFTPGRKRLNNTLLDSSSLSKIVFSSTLISDS
LRGRGGFNVEKLSQPLASYQIDTVSADGHRGPVDIESINIEFPINKEAPSMTAVGVKPVE
AITYQYFKQLLNKPPISRKEQIEINSKVAEHIKSVPFEQLMAERPPDPCVITRNWINQVR
EAEDFTTEDDDGLDALHFPSIYAY

Nucleotide sequence

Length: 4,437

>Phmamm.CG.MTP2014.S18.g00767.01.t
GCCAGATGTTACATTATTGCAGCATCCATGTGTATGTTAATGAAGTTGTGATATTTTCGT
TAAACATGGCAAGTTGCTCCTGTTGCCCAGCATTTCGGCCGCGGTATAAGCGCCTTGTGG
ACAATATCTTTCCATCAGTACAATCAGAAGGGTTGGTTCGCAGTGAAATGGAAAAGTTGA
CCTACTATGCTGTTTCTGCACCAGAGAAATTGGACAGGATTGGGGATTATCTTGCTAGGC
GATTGACAAGAGATATTGCAAGGAAAAGAGACCAATCAGTGTTTGTGGCAATGGAAGCCC
TTAATCAACTACTTTTGGCATGCCATGCTCAGCAAATAAATTTGTTTGTTGAAAGCTTTT
TAAAAATGGTTGCAACACTGTTAGAGTCTGACAACTACAATTTTCAAGCACTTGGAACAA
ACTCATTTGAGAAGTTTTCTAAAATTGAAGAAGACACTGCTTCATATCATAGAAGATACG
ACTTTTTTGTGTCTAAGTTTAGTGCAATGTGCCACAGCAACGAAGAAAATCTTTCAGTTC
GAAGAAAAATACAGCTTCATGGTGTTCATGGTCTGAGAGGTGTAATACGCAAAACAGTCA
GTGATGAGTTACAAGTGAACATATGGGAGAAACAGCACATGGACAAGATTATCCCATCAT
TGCTTTACAGTATGCAAAACAGTCAAGAAAAAAATCCTTCAGATGCGGCTTCTGATGTTG
AACAACCTTCAACCTTAGCTGAAGAATCGCTTCGTGAATTACTTTCAAGAGCAGCTTTCT
CCAATGTTTCTGCAGCTATTTATCCTGCTTTAGCGCACATGGATAATCATGAGCTTTGGG
CACCTGACAATTCATTTGCCATTAAGTCCTTTAAAATCATCATGTACTCCATACAAGGTC
AATACAGCCATGTAATTGTCAAACTTCTGCTGGATCACATTGACACACATGACAATAATG
ACCAGCCAATTAGGGCAAGCATACTTAAAGTTTTGTGCGCAATTGTCCCTATTCCAGCAT
CCACAGCTATTGGGCCATCTGTAATTGATGTGTTTAACAGACTGTCACAACATCTAAGAA
TTTCAGCAGAATCTACTAATCAAAAAACATTTCAAACTGCTCTAATCGAAACAACTGGTG
TTCTGTCCAGTGTGGTTCCAGACTACCAAAAACTTGAAGCGATGTCGTTTTATATTAACA
GAGCACTTGAAGCTATATCTGACCATGATTTAAGAGAAGCAACAACTGCTGACTTGAACT
ATTCCAGTTTGTTGTTGCAGTGTATTCAACAAATTTCAAAGACTTACAGAATAAATACCT
TATCTTCTTTATCATCCAGCTTGTTAGAGCCTCTACTTAAAATCACCCTGAATGTTGGTC
CAAATGACAGATTAATTGCACAAAATGTATTACTTGTTTTGTTGGACAAGAATAATAACA
GAACAAAGTTAAAGTTGGTAAACTCAGAGTCTGATATTGACCAACTTGGTTTGGTGTCAT
CGACTGCAAGTAAGCAAGACTGTGAATTTTTGGACCAAAGACTACATAGCATATATTTGT
GGCTTTATGAATGCTTTACTCTTGAAGATAACTCAACAGACAATTTTCAAGCTTTGTACA
AATTGGTGTCTGTGTTGTGCTTATCAGTTATGTCAGCTGATGTTATTTTGGAGTTGTGTC
GCATTGTTCTAGCTGCTCAAAATTCAGTAGTGGAAAACAGCGGAGAAAGCTTTCAGGTAG
ACAGTAATCAACAAACAATGCAGCTTTTGTCCTCAACAGCTGCATGCATTTTGGTGCTTG
CACATTTGTCAGCTGTGCCTGAATTTCAGCACTATGCCAACCAAGTAATGTTGGAAAGAA
ACTCTGTCGCACCTCAAATCATGCCAAGTTTCACACCCGGGCGCAAAAGGTTGAACAATA
CATTGCTGGATTCTAGTTCATTGTCAAAGATTGTGTTCTCTAGTACATTGATATCTGATT
CCTTAAGGGGCAGGGGTGGTTTTAACGTGGAAAAACTAAGTCAACCCCTGGCTAGCTATC
AAATAGACACTGTAAGTGCAGATGGCCATCGTGGGCCAGTAGATATTGAGTCAATCAATA
TTGAATTTCCTATTAATAAAGAAGCACCATCAATGACTGCAGTTGGTGTTAAGCCTGTTG
AAGCTATTACTTACCAATATTTTAAGCAGCTTTTGAACAAGCCGCCAATATCAAGAAAAG
AACAGATTGAAATAAACAGTAAAGTTGCAGAACATATTAAGAGTGTGCCATTTGAGCAGC
TAATGGCTGAAAGGCCACCTGATCCCTGTGTCATCACAAGAAACTGGATAAATCAGGTTA
GGGAAGCAGAGGATTTTACAACAGAAGATGATGATGGTTTGGATGCTTTGCATTTTCCTT
CCATCTATGCTTACTGAGCTTATTAACGAGGAAAAAAGTATTGATCAAAAAACGGTGGTT
AAGAACTGGTTCAATAATGTGGTGTCAGTTTCTGTTTTATTTTGTATACATGCATACATA
TTGTCATGTACATTGTTATATTTGCATATTTATTGTTGTGTACCACTACCAGATTCTGGT
AACACTGAACAGCTAAATTATAAAAAGGTGTCAAGTAACTTGTCTAGTACATTATTATCA
AATAAATCTGTTACCTTTTCTTGTAACTGCTCTTTTATGTGGTAACATTTAAGCATACCC
AACAGTTTAAGAAATATGTGTGCAATATTTGCAATTTAAAGTAATTAATTCAAGCGACTG
CTTTTATTGATTTCGATTAAATAATTGTGTTGAAATGCAGATGATACACTAAAACAGACT
TACTTTTTTCCTTGTTACCTGATTTTTAAATGTATGTTCTATGTTTAATCACTGTGCTTT
GTGACATTAGCAGGAATTACTACTAGGGTGTAACTATTAAAGCTGAAATGCAAAGCAATA
CTGATTGGGACACTGTTACTTACCTACGTAAGTCAAAACCTGCACCTGGTGCTGCGAAAT
CAAGTCAGGCTGTCAATGCGGCCTTGAGGCGTGGTGATGATATAGAGACAAGGCAAAAGT
TTGCAGCAGGCACAAACAAGAAAGCAGTAACAAGCAAAAATACAGCTAAACTTGACCGTG
AAACTGAGGAGCTGCATCATAACAAGGTATCTCTAGATGTTGGTAGATTGATTCAGAAGG
GCCGACAGGCGAAGAATCTTACCCAGAAGGATTTGGCTACCAAAATCAACGAAAAAGCTC
AAGTCATCAATGAATATGAAAATGGAAAAGCAATTCCTAACAACCAAGTATTGGGCAAAA
TTGAAAGAGCAATTGGAATTAAGCTCAGAGGGAAAGACAAGGGACAGCCTTTAGCACCCA
AAAAGTAATCTGACATGATGAATAATAAACCCTCAGGTCAATTTTGGTTTGGTTTTACAT
GATTGCATAAAACTGTAATTAATGTAACTGACTGAGGTGTTTTGGGTTTAAAAGGGTCTT
AAGTTGCCTTGTGATAAAATTGGTTTCCCTTTTGAATTGCTGGGCATGATGGTGCTAGTA
AATAGAAAGTTGCTTTTATTTCTGAGATTTCCAATGACAAGAAAAGAATCATACATGAAC
TATGTGTACATTTTTGTTGCTGCTGTTTTGGTGTGTAGAAATACCTTTCAAGCACTGTTT
GAATAATTTGAAAATTGCTTATGTTTAATATGCTTAACATTTCCATAGCCTACATTATTT
CATGTCTCATTTAGATGTGGTTCCAATGTCAAATGTGTCAGGATGCTATTTATGCAACAT
TCATGCAGTAGCAAACTTACTTTGGTTTAGTAATTACGGGTCTGGCCCTGTTGTAATGAA
TGTGCATGACTCAATTCTGATGCATCATATAATGTACAATGAGCCGTTTGTGTTGAGTGC
CACCTGTGTGTTGCGTCATGGACTGAGAAGCTTACTTCCTGTGTCTTACATATAGATTCT
AGGAACAGTCAACACTAAGGATAAAGGTGTAAAAAATTTTGGAACTATTTTTTGTGCTTT
GTTGTTTTAAAATTGAAGCCATGTCAAGTGAAGAATCCCCAGAGTTTAAGCAGCCTGCTT
CAGCAGTGAATATTGAAAAGCAACAGGAGGAAATGCTCAAAAGCAAATATGGTAATCTAA
AACCAAAAGCAGGATCGAGCATGTTGCAGAAAAGAATGAACCAAAAGAAATACTTTGACT
CGGGCGATTACAACATGGCGCGCGCGCAGATGAACAAGCCGAGTAGAATGCCTGAGAATA
AGAAACTGACGCAAGTAACTGGCGACCATATGCCAACACCGGATGAGATACCTCGGGTAA
GGAAAGCCTCTCAAAGCAACCTCGTCATGTCCAACTCCTCATAAACAGTTTGTCTCCCTG
CTGGACTAAACCATTTGAAGGCTGGTGTTTTATTCTTTATTGTTGCACAATCCTCTC

InterProScan

SUPERFAMILY
ARM-type_fold (IPR016024) - T[49-562] 5.4E-7

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
EFR3A_HUMAN 39.304 % 531 7.98E-178
EFR3B_HUMAN 39.74 % 524 3.15E-175