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  1. Region 'REG00001016'
  2. Transcript 'Phmamm.CG.MTP2014.S1...'

Transcript Model

Transcript Id

Phmamm.CG.MTP2014.S162.g04512.01.t

Possible name(s)

FBXO25; FBXO32; FBXO4

Location

S162 [101,936 / 113,464]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 342

>Phmamm.CG.MTP2014.S162.g04512.01.p
MESMPRNHVRKIIEAFLRQVQQTKNKNSYNNLTSAPISKCSVRENMPWLQVGLKGTRECH
GYTTLGEMIRRLDFTGSAFLTYRFPYILQVIYLLVKREMTTLSATAQQHLFQVIEVLLSQ
VMESKRGIRQMHYILNTLMSVLQIQSKKKMISSKATWFKKLDTVRRWQSQLKQIDVPYRM
DSHATLSDMPVEVQAFIVSCLTDHEDIRSLSCVNRTLNEICENTVVWRNLCHTNFTKFQV
TKAKNMYFKQLKKKAKSENKDNISNLIKPDSVRYWKAIHEILLKSFKPIEENYIDPLLYC
KHCSVLFWKETGHPCIQEFKDIVPNIDHLSPQQVVSFFEPKR

Nucleotide sequence

Length: 5,412

>Phmamm.CG.MTP2014.S162.g04512.01.t
GTGATGCATTTGTTCCTCAAAAGGAATTTTTGTCCATTGTGAGCACTCAATTTCGTGAAC
ATTTGTCAAAGGCATTGACTCTTACAGCAAGATCTTTGCCACATTTGGAAGAAGATGATC
GTTTACTTCCTATTTTACGATCATTCAACCAAAATGCTCTTTCCACAGCTTATGATCCAA
AGCGAAATGAGGGAAATGTTTCAATCTCAGACTTAGATGAGTTGTCAAGTGTATCATATC
CCTTATGTATGAGGGAATTACATAGGAGTTTGAAAGACAGCCACCATTTGAGGCACTGGG
GCCGAATGCAGTATGGTCTGTTTTTGAAAGGCATTGGAGTCACTTTGGAAGATTCATTAA
AGTTTTGGAGACAAGAGATGGGGAAAGGAATTGGAATTGATAAGTTTGACAAGGAGCATG
CTTACAATATTCGGCATAATTATGGTAAGGAAGGAAAAAGGACTAACTACACACCATATA
GCTGCATGACAATTATCACCAAAAACCCCCCTGCTGCTCAAGATCACCATGGTTGTCCGT
TCAAGCACACATCGCCAGACCTTCTGCGACAAAAACTAAGGAGCTATAAAGCCTCTAGCG
ACGTTATCGAACAGATCGTTGAACTGGTGAAGGGCCAACATTTCCAGATTGCGTGTCAAA
AGTATTTCGAGGCAACGCATAAGGTGGAAGATGCCTCGTTTCAAGTCACACACCCTAATC
ACTACTTTGATGAAAGTCAGCGAATTTTAAGAGGGGAGCAACCTGGACGTAGCAAGTCAT
CACGAGAAATCGCCGATGCTGCTTTTACACCAGCCTGGTCTGTACCACTTCCGAAATCAG
AAAATGTAGTTTCCCAAAATCCAAAAAACGATTTGGACGACACAGAACTGGATCAAATGC
TTCTTGAATATTCCGAACAAATCAAATAACTTCGATACATCAGCTGATGAAACCACGTGA
TACCAGTGTGCTTCGCGTCAATAATAACAAAGAACTCGTGCCCTTCAAAACAGATCGTCT
GAAGCTCTGAGCGAGGATGTGAAACTGATGGTGCTTTCGTGTTTGTGTACGTAATGTAAA
AGCTTTCTAAGAGCATTTTATCGTAGTTGCGTGACAATTATGTTGGATTGCATTGATCCC
AGAAAAAAATTTTGTTGTGGCTTATCGTAAGGATATTAACAGGGTAGTAACAGTCAGGAT
TATACCAGTGTGTTCATGTTACAAGTTTCAACACTGGTACTGCGCATTAGTAAACTCAGA
TTGGAGGGCACCTGGCCTGGATTGGGCGAAGTCTGGCTCGTCGGGTTGGGAAATCGTTGA
ACCCAGTTACGGAGTCACGATGGAATCTATGCCAAGAAATCATGTAAGAAAAATCATTGA
AGCTTTTTTGCGCCAAGTCCAACAGACAAAAAACAAGAACTCCTACAACAATTTGACCTC
AGCGCCAATTTCGAAATGCAGCGTAAGAGAAAACATGCCTTGGCTACAGGTTGGGCTCAA
AGGAACACGAGAGTGCCATGGATATACCACATTGGGAGAAATGATCAGACGTCTTGATTT
TACTGGCAGTGCTTTCTTGACTTATCGCTTTCCTTACATACTACAAGTGATCTATCTGCT
GGTGAAACGTGAAATGACAACACTTAGTGCCACAGCACAGCAACATTTATTTCAAGTTAT
TGAAGTACTTTTATCACAAGTGATGGAAAGCAAGCGTGGCATTCGTCAGATGCATTATAT
TCTGAACACTTTAATGTCAGTATTGCAAATTCAATCCAAAAAGAAAATGATCAGTTCCAA
AGCAACGTGGTTCAAAAAGCTGGACACGGTCAGAAGATGGCAGAGCCAACTGAAACAAAT
TGATGTTCCCTATAGAATGGACAGCCATGCAACACTAAGTGACATGCCGGTAGAAGTACA
AGCTTTCATTGTATCCTGTTTAACTGATCATGAGGACATAAGAAGCCTGTCATGTGTAAA
TCGCACATTGAATGAAATATGTGAAAATACAGTGGTTTGGAGAAACTTGTGTCATACCAA
CTTCACAAAGTTTCAGGTTACAAAGGCAAAGAATATGTATTTCAAACAACTCAAGAAAAA
GGCCAAGTCAGAAAACAAGGACAATATTTCCAACCTTATTAAACCAGACAGTGTTAGATA
TTGGAAAGCAATTCATGAGATACTTCTAAAATCTTTTAAACCGATCGAAGAAAATTATAT
TGATCCCCTTCTGTACTGCAAACACTGCAGTGTTTTGTTTTGGAAGGAAACAGGCCATCC
TTGCATCCAGGAATTTAAGGACATTGTTCCAAATATTGATCACTTATCACCACAACAAGT
TGTCTCATTCTTCGAACCTAAACGATAAAGCGATAAAATTGCTTTCTAACGAAAACAATT
TTGATGAACTTTTCCAATCGACTTACACTGCTGCTGTTGATATTTGGCTTCTTGGCAGAA
TTTCCTCATAATGTCCAGTTCATATTACAAACTTTACAGTCTGTTTTGACACAAACCTAA
CATATTTTATGCATAAATCAATGAATATTAAAGTGATAGAATAAACTAATGTTGCACAGC
ATGTCAGCAAATGCCTATATTTTACCTAAACTGACACAACATTGAATGTGTTAGTTGTCA
AAATCAGTTTAATTTCTATGATCAGCTGGTTTGATCTAGTTTTTGTCAAAGCTATTCTCT
TTAAAAAAAATTGTACACATGTTTGTAACTTTGTGGACAATTGGTGCAAAGAGTATGTAT
ATGTTTGTGTTGTATTGCCAACATCTTTTTATTGTTTTCATTGTCCTGGAAGAATTGTGC
TGCTTCAGTCAACCATTTATACATAAACTTAAATCAAACATTTTTTTCTGTAAATAAAAT
TGTTCTGTAATTTTTTGTTACATTTGTGGGAAAACAGTCATTATAAAAAAAACTAGACAA
CCATGAAGGTATTGCATTCACAGTTCTTGATGAAACGGAAGTACGCATACAAAGTTTAGG
TCCCTGGGATAACTTGTTCTACATTCCTTGCTTACCAAGGACAAAAGGGAAACATGCCCA
TCAGCTAGACTGTGCTGGCATAATGATGTTTTATTGTTCAAAATGGCAATTTGATGTCAT
TAACTTCAAAATCACATGAAATTCAAATGATAACATTACACTTCTCAATAAAAAGGCTCA
TCTCTGCATAAAATAGGCAATGTGTGTTAACATACAAGGTTGCGTTGAATGTAGCAAGTA
ACATAGGCAACTTTAATAAACAAGACAAAACAAAGTAAATTTGCAATGTAGACAACTTAC
TACCTAATTCATCATATGAATCAAAATAGATGGCTGTTGTTCCTATTCACTATAAGTAGC
ATTTTTAACCCAAAAATCCAGGATCAAATAGAAAGTTTTAAGATGTCTATTTGTGACTAC
CCAATAGTACGTTGAATCACATACACAAAGAAACAAACAAACAGGGGTAAAAACACTGCA
TGCACAACAACAAAAACAAAAATCGCTCTCCGAGTAGACAAATTGCATCACAGTTAAGTA
CAGGATTTAAAAATGAAGGGCTTCGAATGGGTGGTAGGGTGATTTTGGAATTATCCTGAC
TCTGTGTGTACAGTGTATAAATGTTGGTGGTGGTAGTAAAGCAAATTGAGGAACGCCAGA
ACATACAAGCACATATTGAATAAATGTATTGTGATAAGTAAAGAAATTACTGGCTTGTTT
TAAAAATGGACAAAATGCATGAACCCAGGTAATCCAGTAGTAAAAACCTCAATGCATCTA
CAACAACAGGTTCTATTGGTGCACCTTTTCCCATTAACCCCTATTTCAAGAGTATTTGAT
GAATTAGCAATATTTTTGTGTTTCAGTTGAAACAGAGTGCACCAAAAGGGCCAGGAGTTT
AGACACACTGATAAAAAAAGAATAAATACAAGCCAGAACCAAAAGGGCAGATGGAATTTA
AAAAGTAACGAGTCTGTGACCATTTGGAATATAAAAAGATGGAACAAACATGACAGCATG
ATCAGACATGAAAACAGGGTCAGAGTGCAGGTTTCTTAAAGATTATATTAAATAAAAAGG
GTTACATTGTGGCAAGGTTGGGCAGAAATAGGTCAACAGGTTTATAAAATTAATTTACAA
TATTTTTAATAGGTTGCGTATCAAACTGGAACAGCAGTCATTTTATAAATCAAACAAAAT
TTTAATCCACCGCAACCGCGAAGGTCAGTCAAGAAATGTTCGACTCATACATAGTTAACA
ATGCATCTCAGACACTGAGGATACTCCATGCAGCTAAAACAAATTTGAGGCAAAAAAAAG
GAATATTTAATTTTCCTGAAATGTTAGTTTGTGTGGCCAGCGTATGCTGAAAATTTAAGA
ACAAAGCAGTGTATCACAACTGTAGTCTGAATTAAATTAGTGTTACAAGGTTTGTTGAGT
CCCTGACTGACTTATGACATAAAACCCCTGTTTCACACCCATACACTTTCATTATTTACA
AATCAATAAATCCGCAAATGGTTATGATGGAGCAAAAGTAGTCTCCCATTGAAAAGCGCT
GTCTTTGTAAACACGTAAACAGCAAACGAAAAAACAGACTAAAACACAGAGGGCATGTTT
GTGATTTAGCTTGGAATTATGTTCACCTTGGTACTAATTCAAACAACTGTGGCCAGAAAT
CACATAATTACTAATGCGCCAATCAAATATGAAGCGCTGCAAGACAATAATAGTAATTTG
GAATAATGTAAAAACTTCACTGCACACAAAGACAGGCCAACTTGAAGCATAAAACAGATC
CAACCTCCAAGCAGATTTAATACTGCATCAAACAGATTAAACAATTCCACACCTAAAAAG
TAATACAATACTCAGATGACATGAAGGTGTTTATCCATTTTACGAGCACAGATTAGACGG
ATATTGGAAACGATTGTATGGGGCTGTCAACATACTTAAATCAAAGGGCCTTTATCTGCA
TATTGCATGACCCGAATTTAGTGTGTTGTTGCCTTATACAAATGACACCTACAGATTACA
CTACTGTAAACAGAACATGTGCCTCCATTGTTCCCAATTCACTCTGATACTACTGTGGCT
GACTATAGCTTGAGAGGATGACGTAAACAATATGTTGAGTCACTAATGCATTATATGCCG
ACCAAATAAGGTAGCTTAAAACTTTGAAGCAGGGGCATGTAAACAAAACATTCTATGTTT
ACTTTCACTTTTGGACTGAAAAGGACATATTTACTCACTTGTGTCATTTTGTTTAAACTT
CTAGCATCTTGTGAATGGCTTTTGGTGTTGATTCATCATTTAAATGTTTTGTGGTGTATC
GTAAAGCATTCAACAGGGATTTAACTTTGACTTTCCCATTTTGGTCTTTTAATACTTTGA
TTGAACCTTTGA

InterProScan

SUPERFAMILY
F-box-like_dom_sf (IPR036047) - T[179-241] 9.81E-12
ProSiteProfiles
F-box_dom (IPR001810) - T[183-230] 8.544

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
FBX25_HUMAN 29.316 % 140 1.06E-38
FBX32_HUMAN 29.054 % 144 2.21E-40