- Transcript 'Phmamm.CG.MTP2014.S1...'
Transcript Model
Transcript Id
Phmamm.CG.MTP2014.S150.g04250.01.t
Possible name(s)
SHMT1; SHMT2
Gene model
Location
S150 [148,478 / 154,008]
Amino acid sequence
Length: 477
>Phmamm.CG.MTP2014.S150.g04250.01.p
MASGDFTCNGGSNWLEESLKENDPDIYRIIRNEKERQRDGLELIASENFASAAVLQALGS
CLNNKYSEGYPGVRYYGGTENIDELERLCQKRALSLYKLSPEEWGVNVQPYSGSPGNFAV
YTAIVEPHGRIMGLDLPDGGHLTHGFMTEKKKISATSIFFESMPYKVNPETGLIDYEQLA
NNAKLFKPKMIIAGMSCYPRLLDYKKFREIASENQAYLMADMAHVSGLVAAGVIPSPFEH
CDIVTSTTHKTLRGPRAGIIFYRRGVRFPATQTKPAVMYNLEKPINEAVFPGLQGGPHNH
AIAGVAVALHQAATPQFVEYQKRVIRNSQELAKSLTKMGYTVVSGGTDTHLILVNLTSQG
TDGNRTDKVLELIGVACNKNTCPGDKSALRPSGLRLGSPALTSRGLNENDFQKVAEFVDR
GVQLTVEIQSSLSPKATFKDFKTKLYGDPGVQQKITEIKNEVTAFARGFNIPGLQYL
Nucleotide sequence
Length: 4,600
>Phmamm.CG.MTP2014.S150.g04250.01.t
TTAAAAAATTCTCAGCATTCAGCTGGTTTGAACTAACAAACAAAAAGTCATCAGCAAAGC
GTACAAGAAGACCAGATGATGTTCCTGATGCTAAACTTGGAAAATACTTGATTTCCATGT
CACCATAAAGAATGTCACATAAAATTTTTGATAAACACCACCCTTGGGGTATTCCTTCTA
ATTTTGCATATTTCTAAAACGAATAAGTAAGCTTATGAAGAAAACAATTTTCATAGTTTA
TTGTGAAAATCACCTTGCCCATGCAAGTTATAGAAACATTCTCAAGAGATTTTTGTACAA
AGAGTAAAATTTCCTCTGAGCAATCAAAAACTTTTCTGTAAGTCTAAAAACAAAAGTTTG
AATACATAATTTTTATTGGCAAACCAATGATACTAAACATCTATTGTTTGATCAAAGGTT
AGGGGGGAGGACTTTTTACCATTTTAATAAACCCTCAATGTAGAAGTGATGTAAATATTT
AGTACTGGTTTACATTTCATTTATTGATTTGCAATGTATACTAATGCACTTCTATTGTGA
AGTTTAATTTCACACACACTATAAAAAATCTTACCAGAGATAAGTGTGATACTTTTGTGC
TTCCAGCTCTACAAAGTAAATGCAACATAAAACAATAAAGCATACTTCAAACATGATTGA
ATATACTTCAAACACATACTTTTGCAAAATTAACTTCAAAACTTCCAATAACTTGTCAAC
AGGTATTCTGTCAAAACAACGATCAGCATCAACCTGCAAGAGGGGTTAGGTTTCAAACAC
TACACACATATATAACTATGGAATGAAGGCTTTGGTTCCAAACATTTGTAAGTACAGACA
AAAATTTAGCCTGTGAACAACCATCACCAAACCTTGGGAGACCAGCGCGAAAAATACACT
AGAATATATCGTCCCATTTTTAATGAAAATTGGGATTGACAAAAAAGGGTCAAAATATCG
AATTAAAACAACAACGGTGAAGCGTACTGTCCAATTTCCTTCAAGTTTAATAATATCCAC
TTGAAATAGACAAGGGAAACCATAAATACTTACACACCTTTACAAAGAACAATTTTAAAT
CATGTGCAGTAGATTGTGAAGCTGTTACAAACTTATTCCACTTAAGATGAATTTCTTTTA
TTCCTTGTGCAGCACAACCTATTAACCATGGACATTTCTTGCATATGTGTTGCAAAATCT
TCAAAACTATAGTTGCTTCCATTTTCTAAGCAAGGTTATAAAAGTGGTTAGTGGTCTGCT
TTTGTGCTTTGTTATTGCAGTTGTATTTAAATAAATTGTAGAACTGTATTGTAAAACACT
GTTGCCTGAAAAAAATGCAGCCCACAGCTGCAATGTAAAGGTGTTCTGCTAAAATGGTTT
TTACTTACACCTGCTGGCTTGTCTGTCATTTTTGCCACTGGTAAATATATGATAGGTCGA
ATACTGGATGATTTAGGACAAAATCTGCACCGAAAACAAGCTCCTTCTTTGTTTGTACTT
AAATTATAACCCCAAATTTTATTGTTGAGCAAAATTGTGACACCATTTCGTACAATACTC
TTCCAGAGTTCTTTGCGATAAAACACCAGCCTAAATAATAGCATCATTAAATTTTTATTT
TTATTTACTTTTACTAGCATTATATGTTGAACTGAGAAATACGAGCATCATTCAATAATG
AATATAAGATTAAATTATAACATTCAATACTTTCCTATTTCTGAAGCATGAATGTTCAGT
TATATAAAAGAAATGCCTGATGATGACATATAGAACATCTTTCAAAAACCAGAAAACAAA
GGTTTTGAGCATTTTCAATCTATGGCCATCTAAAATACAAAGCATAATTTTTAAAAGATC
TTTTAGGGTTTAGTACTTGCTTCGTTGGAATCTTTTTTTTTCTTTTTTTTGTGTAAAATT
GCAAGTAAGTTTTGTATGCTAAAAAAATCTCACTTGAAAGCCACGGAATGTCTTTTGTTA
TTAAGCCATCAACCATTTCTTCAACACTAATTTTGTCATATGCACGCATGGTCAGTAAGC
TTTTAATGTGTTTTAAAAACAAAGATTCATTTTTACCGCAACCCCATGTTTCCTTCATTG
GTAGGATTCTTCTTATGACAGCACGTAGGAATAAAAACACCTAAAAAAGAATTGTTAATA
CTCCTTGCTAACACCTATCAGCTGACAGTTGACAACAATAATAAATCTTTATTGACAAAC
CTCCGTTTTAGAGGTATCCATTTCCAAATATCTTGCATTTTCTTCAACCAATTCTTGAGT
TGACTTTTGGGCAATAATATCATCTGAAAAATTGTTTGGCAATACCAGTGGACAGTAGAT
GTTAAGCAATGGATAGTAATATTTTTTCTTTGATTGTTTTAAGATAATCTTGCACAATTT
AATGGCTTTGCGTGATGACCTTGGAACACTAACTTTTGTTTGGCAAATAAGTGTTCTTTC
TTGTTCCTGAAAATCTCTGTGCAGAAATCCAAATGTTTTCATAAACTCTGATGTTTCTTT
GGTTTTTTTCTGATTCTGTAAACTTTTCTTTAAGTTTATTCTTCTTACTACCAATCGTTT
GTAAGTGTCTTTTGCTGATTGCTGATGAAATATTTCTCTGACCATTTTTCTGGCGGAGGT
TTGACTTGATGATAAATATTGCAGCAAGTGACTGCATGTAAAGGGGTGAGATTTAACTGC
ACAATTGGAAGAATATCGTAGAGACCACAAACTAAGATTTTGAGACTCTTGATTGCACAT
TTTTCAAGTAAGTGCATGTTATATCCAACATCAAATTGAATAGAAAAATAGGGAAGAGTG
ATCAACCAATCCCCGATAGCCGATACATCACCATCACGGGAATTTGTTACAGAGCATCTG
GATTTTTTTTTAATAGCACGTATTAATATTAACTAATTGTAATTAGAAAAGCAGAAGAAG
ATAACACCTAATGCTCTTAAACTGCTGCCCAAGTTGCAGTTGCAGTTTCCCGCCAAAAAA
AGCAATGTTTTGATCGTTCTGCATGATTGATTTCATGTTGCCATATATAAATAGGAAATT
TGACGTTATCGTTCCATTCAGCGGTATCTGTGGCACGTGGTTGGTGTGTTGTTGCTGCAT
TGGAAGAAAGGACCATGGCTTCAGGCGATTTTACTTGTAATGGCGGTTCAAACTGGCTGG
AGGAGTCGCTTAAAGAAAATGACCCTGATATTTACAGAATTATTCGAAATGAAAAGGAGC
GCCAAAGGGACGGACTGGAATTAATCGCCTCAGAAAATTTTGCAAGTGCCGCCGTTCTGC
AAGCACTTGGTTCATGTTTGAACAACAAGTATTCGGAAGGCTATCCAGGCGTAAGATACT
ATGGTGGTACAGAAAACATTGATGAATTAGAAAGACTTTGTCAAAAAAGAGCACTGAGTC
TGTATAAGTTGTCACCAGAAGAATGGGGTGTAAATGTGCAGCCATATTCTGGTTCACCAG
GAAATTTTGCTGTATATACTGCAATTGTTGAGCCACATGGACGGATTATGGGATTGGATT
TACCTGACGGAGGACATTTGACTCATGGGTTTATGACAGAGAAAAAGAAAATCTCTGCCA
CTTCTATATTTTTTGAATCCATGCCATATAAAGTTAATCCAGAAACAGGTTTAATTGATT
ATGAGCAACTTGCAAACAATGCCAAATTATTTAAACCAAAAATGATTATAGCAGGAATGA
GCTGCTATCCCCGTCTTCTGGATTATAAAAAATTCAGAGAAATTGCTTCAGAAAACCAAG
CATATTTAATGGCAGACATGGCTCATGTTAGTGGGCTAGTTGCTGCTGGAGTTATTCCAT
CACCATTCGAACACTGTGACATTGTGACAAGTACCACTCATAAAACATTGAGGGGTCCAC
GGGCAGGAATTATATTCTATCGCCGAGGTGTTAGATTTCCAGCAACACAAACAAAGCCTG
CTGTAATGTACAATCTGGAAAAGCCAATAAATGAAGCTGTGTTTCCTGGTCTGCAGGGTG
GGCCACATAATCATGCAATTGCTGGTGTTGCAGTAGCTTTACATCAAGCTGCAACACCTC
AGTTTGTTGAATATCAAAAGCGGGTTATCCGAAATTCGCAAGAGCTTGCCAAATCACTTA
CCAAAATGGGCTATACTGTTGTTTCTGGTGGCACTGATACTCATCTTATTCTTGTAAACC
TGACAAGCCAGGGAACAGATGGAAATCGTACTGACAAAGTTCTTGAGCTAATTGGTGTGG
CTTGCAACAAGAACACTTGTCCAGGTGACAAATCAGCTTTGCGTCCAAGTGGTTTGCGAC
TAGGCTCGCCTGCATTGACTTCAAGAGGCTTAAACGAAAATGATTTCCAAAAGGTGGCTG
AGTTTGTTGACAGGGGCGTTCAATTAACAGTTGAAATTCAATCATCTCTGTCACCCAAGG
CAACTTTTAAGGATTTTAAGACAAAATTGTATGGTGATCCAGGAGTGCAACAAAAAATAA
CAGAGATTAAAAATGAGGTCACTGCTTTTGCTAGGGGTTTCAATATACCTGGCTTGCAAT
ACTTGTAGTTTTTGTGCTCTGCTTTGTTGTTATGTTGGTA
| PIRSF |
Ser_HO-MeTrfase (IPR001085) - T[5-476] 3.5E-173 |
| SUPERFAMILY |
PyrdxlP-dep_Trfase (IPR015424) - T[14-473] 5.97E-180 |
| PANTHER |
Ser_HO-MeTrfase (IPR001085) - T[15-475] 4.2E-233 |
| Hamap |
Ser_HO-MeTrfase (IPR001085) - T[18-473] 43.037 |
| CDD |
Ser_HO-MeTrfase (IPR001085) - T[20-441] 0.0 |
| Gene3D |
PyrdxlP-dep_Trfase_dom1 (IPR015422) - T[23-472] 5.4E-211 |
| Gene3D |
PyrdxlP-dep_Trfase_major (IPR015421) - T[48-322] 5.4E-211 |
| ProSitePatterns |
Ser_HO-MeTrfase_PLP_BS (IPR019798) - T[242-258] . |
| Protein Name | Identity | Bit Score | e-value |
|---|---|---|---|
| GLYC_HUMAN | 69.783 % | 658 | 0 |
| GLYM_HUMAN | 60.566 % | 608 | 0 |