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  1. Transcript 'Phmamm.CG.MTP2014.S1...'

Transcript Model

Transcript Id

Phmamm.CG.MTP2014.S116.g03531.01.t

Possible name(s)

AGPAT4; AGPAT5; MRPL21

Location

S116 [77,995 / 85,289]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 226

>Phmamm.CG.MTP2014.S116.g03531.01.p
MISFSSQVMSTGTILRTFTSRMATSYARNQLLSRRIQLHDERTSTLKQKHVIHYPFASIC
REMSNKTESIPSFYDRYVFPEPPRLVSDEEHDTVIEKVNECMANHGRLFAVIQIASKQFK
VTDHDLVRTTGYLDAEVGDRIRLEKILLVGGTDFTLVGRPIIRRSLVRVEATVVEKSPGV
VKVIQRFIRTANFEKKKLYTPLHTVLRINSIEVNPQLDNCNESASS

Nucleotide sequence

Length: 5,789

>Phmamm.CG.MTP2014.S116.g03531.01.t
ATTTAGTTGCCAATCAAAATCCTTCAGTTGGCCACTAATTTTCTTGACATCGGTACTCAT
GCTAATTTTGAGGTTTTTAGAAGAATATGATTTGGTATTGCTTTAAAATTACAAATTTTC
TGTGGTTAATATTTATCAGGATATTAGATGCATATACAGGGTTTTTTTTAAGGTTTGGTT
TGGGTGACCGCTAAGTAGTTTTAAGAGACCGCAAGTGTTTCATTTAAATACCAAAAATAG
CCATATTTGCAAAAAACAGTTATAAGTCCAAATTTTGGGAAACCGCTGGAGAAATTCCGT
TTCGGTCCCCCAAAACACCTTAAAAAAACACTGTGCATATATATGGTGAATTGTTATTTT
GCAAGCAAGTAGTACATTATAAAGATGTTTTTTGCACATGAATACAACAACATTTCAAAG
CATATGTGGAAACTGTCTGAAGTCTGAACCGTGTAAAGTTCAATATTTGATGTATAAACG
AACAAAAAATATTTGGCTCGTTCTACACCAGCGGTTCTCAACCATGGTGGGCCATGGAAG
CAGTTTGATTGGGCCACAGACCAATCAAATAGAAAACTTTTTTTAAGAATTTTTATTTGT
GTCACTATACACTCAATTTTACAAGAATAATGGCTTGGGGAGGAATTGAGAAGGAATGTT
TTTGTTTTGTTTTTTGTTCTGAACCTATTTTATAGTTGATTTCTTTCTATCTCAAAAATT
TACTGGGCCACAGAATTTTTTTGCAATGAAAGTGGGCCACGAAAGAAAAAAGGTTGAGAA
CCACTGNTCGGTCATAACTGAAACTCTGAAAGTGCTTGGTCAAAGAAGGGAAATGATTTT
TTGCATTTTTGCAACTTATTTTGAACTTACTATTTGTTTAAAATATGTTTTTTTGTTCTG
AACCTACTTTATAATTGTTTCTTTCTTTCATAAAAATTTACTGGGCCACAAAATTTTTGT
GCAATGAAAGTAGGCCATGAAAGAAAAAAGGTTGAGAACCACTGTTCTACACAATCTACA
GCAAGATAGGCACATTTATAGAACATTTTGACAATTCTCTTTGTTAAAAAACACTACCCT
TAATCTGGGTTGGCAGCAGGGACCTAACTAACTCAAACAAAACTACCTATGCAAGTAAAG
CAAAACGCAAAACTACAAGGTATAATTCCCATTGGACTTGGGACTTATCAGATAGGTCAA
AGGTCAAGCTTAAGGGACACTCCCGAGACTGAACAGATCATTATTTGTTCATTGTTTGAT
TGTGGTTTTGATTTCAACTAACTAAAATGTGGATATACGGGTAAAATAATACAATAAGAC
AAGCTACCCTGCACATAAATTACGCTTTGTCGCCTTACATTTAAATACTTGTGTTTGTCA
TTTTGATAACATTTCGATGGTAAAAGTAAATCGGAAGCGGTGTGTGTATGTTTTCTGTTT
TGTGTTCCTAACTTTATCTTCGTTTTATGGCATGCAAGTTTGTTAAGAAAAGGCTCAGTT
TTGTTTCTAATCTTTATGATAAGTTTCAGTAGTCAAGTCATGAGTACTGGAACAATACTT
CGAACTTTTACAAGCCGAATGGCCACAAGCTATGCCAGGAATCAACTGCTATCCCGACGA
ATTCAGTTGCATGATGAGCGAACATCAACACTTAAACAAAAACATGTGATTCACTATCCT
TTTGCATCAATTTGTCGAGAAATGTCAAACAAAACTGAAAGTATTCCATCTTTTTATGAC
CGCTATGTTTTTCCTGAACCACCAAGACTTGTTTCAGATGAAGAGCATGATACTGTTATT
GAGAAAGTAAATGAATGCATGGCAAATCATGGAAGATTGTTTGCTGTCATTCAAATAGCA
AGCAAGCAGTTTAAAGTTACAGATCATGACCTTGTAAGAACTACAGGTTACTTGGATGCT
GAAGTTGGTGACAGAATTCGCTTAGAAAAGATTTTGCTTGTTGGAGGAACTGACTTTACT
TTAGTTGGTCGACCAATTATTCGTCGAAGTCTAGTTCGGGTTGAAGCCACTGTGGTTGAA
AAATCTCCAGGTGTTGTCAAAGTTATTCAAAGATTTATCAGGACAGCAAACTTTGAAAAG
AAGAAATTATATACCCCACTTCATACTGTTCTGAGGATAAATTCAATAGAAGTAAACCCA
CAGCTGGATAATTGTAATGAAAGTGCTTCAAGTTGACAAAGAAAAAGTCTTGATGAAGTA
TAAAATGACTCAACATGGCATATTGGCTTGTCTGGACATCAAGCATGTGAAAATTGATTT
GTGCAAATGTACAAGATCAATTGTTGACAGTTTTTTTTGCCCTGGTCTCATGACTTTTGT
GTTGGATATTTGTCATGAAGTACAAAGTTGCAAGTGAAAGAAAAAACATTTTTGTATTTG
TTTGATGTGTTGCAAAACATGTAAATTTATCAATGCTGCTCTCATTTCAAGTCTTAAAAT
TGTTTTCAATTGGAGTTCATAACACCAATGATTTATTTTATGTTTAGATGTAGAAAATTA
TTTAAACAATGACTAATGTAATTTTGGATGGTTTAAAAATATTATTTTCTACATTTGCCA
TTATACTTCTGGCCATCTCCACTGTGCCCTATGTCATTTTATTGCTATGTTGGTCTGTAA
TTTCCACACCTCTGCCAGCAACCTGGTTTCACACAGTTGAAGATGGCTTGTGGGGATGGT
ATCAAAGGATGGTGGTGTTTTTCTTTGAGCACTATGCTGGTGTTGAAATTCACATTGATG
GGACCATACCAAGTACAAAAGAAAATGTACTGGTATTAAGTAATCATCAATGTATGGTGG
ACTGGATTGTGGCAGACTTTCTCGCTGTGAGGCAAAATATGACTGGCAACATGAGATTTG
TTTTTAAAAACAGTCTGAAATATTATCCTATCTATGGATTTTCTTTTGGCATCCATGGTG
GGGTGTTTGTGAGGCGTGATGGTTTTTACAATAACCACAACATGCAGAGAGTTTTAGATA
CATTAAAACAAAGAAAAGCTGATCTTTACTTTCTTTTGTACCCTGAGGGAACTCGCTTTA
CTCCACACAAAAAGAGTTTGTTGGATAAAAGCCAGTCATTCGCTGTGAAGTCTGGCCTTG
AACCTCTAAATCAGGTTTTAACACCACGAGTAAAGGCATTTGATTGCACTTTGAACAGTC
TTCAGACATATATTCATGCAATATATGACATCACCATTGTTTATGACACCAGGAAAGAAG
AATATGATGGTTATCGCCCACAATCTCCACATGCATTGCAGTTTTTATTTGGAAGATGCA
AAAAAGTTTACATTAAATTTGAACGCATCCCTATTAAAGATGTGTTAAGTCAAATTTCTG
CATGTGGTGATGATGTTGCTGATGATCAGGCATCGGCTCCAATGAAATGGCTTCACAATC
GTTTTGCAATAAAAGATAAACTTCTGGAAGAGTTCTTCAGCAAAAGTAATTCGGGAAGTG
AAGGAAACTCCAACCAAGCCAAGAGATGGAGAAGGTCTCGTCTACCTTATTCTGCTACTC
TTCCCTCAACAATTTCATTCATCTTGATACATGCAGTGATTTTATATTTCCCCTTTGGAA
GGTACATTTATATTGCAACTTCCACAATTGGGGTACTTTTAATGTCTGTTTATGCTCATT
TTTGCTTTTAAAATGCAGTTATATGTGTGAAAAGACATAGTTGCTAAATGTTGTTGTGCT
AATTAAACGTTGTAGTGGAATTTGTAAATTTTGCACTCAGTACCATGTTGACATTGCAGA
ATATTTTACAAAGCCACCGTTTTTACACTAACATTTTTAAAGTATATACACTAATTTAGT
ACCAAGTTTTTACCTGATGTATTCCTTGCTTGGGAAGTGGTAAACAAGCCAATGTATGAA
ATTTTTGTTGAGGCTGAATGTTGCAAGTCACATAAACTCACTGTTGCATGCAATCTAATG
TTGTTGTTTTTTTTGTCCTTGATTCACCTCACACAACCATGTCCTATCAATCGTTAGTCT
AAAAAGTTGCATTTACCAGAGTTTCATTTTTGAAATGAAATAGTAATGTATAATGTAAAT
TAATGAAAAATATATGCATATGATGAAATTTATGCTTTGCAGTAGCATTTTTGTGTCATA
CGTCTGTACATTGAATGAGATTATATACATTGCATGTACATTTTGCCTATTGGTTGTTTT
AAACTGTTCACCCTGAATAAATTTATCTACGCAAGAAAGTGATTTGTGCATTTCCTTGGC
AAATGTTGATGTTTAAAAATAATAGCACATATTACTGCTGAATAAAAAAAATTAATACAT
TTTTTTTGTTTTTTAATGCAGCCATGTCTCAATAAACGTAAGTGTAAAATGTTGCATTTA
CCAAAGTTTATTTATAACAGAGTTAACCTAAAATGCAGGCGAATCTGGTTAATCACATAA
CCTGTTAAAAAGGATGTGAATGCCAAACCATGGATTATTATTAGCTAGTAGAAATTCGCC
TGGTTCATCGCTTAATTCTGTAGAATAGTGCAATAAACTGGAAAGTAGATGTTTTTAATG
TTAAGTCACACAGTACATTTTTCTCTCAAAACATAGGGAACATATAGATAATGGGTGGCC
AACCTATGACACATGTGCCCAGCATTGCATTAAGGATGACCACAAACAATAAACTAAGCC
TACTTACTTTCAGTGATTTTTTTTATTTCGTACAAATACTTTTTTGCAAATTTTCTTTCT
TTACAATAATCTGCTTTCGGTGAAAAAAAGTGGTCAAACCAGAGAGGGAATTTTGTACTG
CATTTGTTCCGTAATTGTTCAATACATGCATCATACTTGTGTGATCATGAGGTGCCAGAC
ATCTGACCAAGCAGTAAATCACCACCATTTTGCCAGTTTACAACTATGGCATGGTCAAGT
CACAGTCTGTATAAAACACAAGTTGTCCAATGTATATTGTTACTAGAAGAAGCCTCTATC
TTCTTAATGGATGTCACTTTGTGTCCAAAATAATACAGGTATAGGGAAAAAACATATACA
TAGAGTATTTTTACTATTCCTGGCTACAAAAGGGAAAAATCATCTCTGTCACTGGAGATG
AGCGCCAGAGTAACTTTCACTGGACTATTGGAAATTAGCATCTGTATTAACAACATGTAC
TGTTTATACAGCATCAGGATCATCACACTAATCTAATGACAAAAAGCTTGGCAGATGGGT
GATTTAACATATTTGTCCATATTTGCATGGGATACATGTCAGTGTTTTGATTCATTGGTA
TGCAAATTCAATAAGATAAAAAGTGTTGTACAAACAGTTGTCTGTTGTTTATGTGTAATT
GCAGACCCTGACTAAATGTATGTACATGAGGTGTTGATTTGTAACAAGGGTATTTAATTT
TTTAATGGTAATGGTTAAAATCTACAGCACAAAGTATATTTCATAGTGTTGTGGGGCTTG
ATTGGGTCTTTCCCAGTTGCTGTTCTTAGATCCCCATTTTAAACACAGCATTAATACACA
AACCATCTTGAACCATCATTGCCATTACATGTATAACGAATAGAAGGCTCTCAGGTGTCA
GAGCTATTGCTACTGCTATCACTGCCATAGCCACCAAGCAGTCCAAGTCCAGCAGAAGGT
TGGGGATTGGAATCTGACTTGGATTCTTTTTTCTCCTCTGTAGCGACCACTGGCTTTGGC
TTCCTCTTTACTATTCCTAGCAAAGACCTTGCTTTCTTTTGTGGGTCCACTTTTTGGGAT
TTGGCTGGAGGTGCTTCTGTGGTGTCATC

InterProScan

PANTHER
L21p-like (IPR028909) - T[41-216] 1.4E-36
SUPERFAMILY
L21-like_sf (IPR036164) - T[108-212] 1.19E-19
Pfam
L21p-like (IPR028909) - T[109-211] 1.4E-18

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
RM21_HUMAN 47.945 % 120 5.53E-34