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Transcript Model
Transcript Id
Harore.CG.MTP2014.S83.g12848.03.t
Possible name(s)
RNF13; RNF167; ZNRF4
Gene model
Location
S83 [86,365 / 98,376]
Amino acid sequence
Length: 602
>Harore.CG.MTP2014.S83.g12848.03.p
MRGCRVGTSVDHRNVKGGTRAFAKNENVMDYRNIGIMMYGLAISVNIVFVTSFSFADGIV
IAYDHYNGTEEFEDIESTFGSSIPDNGMLGVLVRAEPHDGCQPLKPPPYPSGFNQHNVTL
ASFALIVRGNCEFGAKILNAQNSGYLAAVVYNDKSDFLIKMSSSISGITIPSVFVGITAG
ALLNSSYLYDREGQPYIQLYEGSINPLEYYLIPFVIVLAVCFVSLLCFMVSFCKVGLQVY
IHLASSTLACASLLTSTINHSVNSSILSLIRFPSRASIVLSPDIPFTLVHEVFLVLTVLG
TSLCIVAIMRIIKCCRDRRRQRRGRLSLERLKKLPVKNFEKGDEYDVCAICLDDYEEGDK
LRILPCAHAYHCKCVDPWLTSSKRICPLCKRRVLSDDEDSSSSEEDDSDDERTPLVQTST
ASSPNSSLFATGFSRNNPIIRAIARQNRRASTSSTETVSTSTSSDEEQQMSSIRISTSTS
RSTGLSLPQTSDGYQSQRLSATPILVDTVRVYPSPVDDNEEDVHVFVTGNRVSESSITVI
SECDSPSSSISRTPEEHSYNSMDFHSLDDNSLAPQDNTLSEPYSDGNESDIQDDIIVIAG
GK
Nucleotide sequence
Length: 3,590
>Harore.CG.MTP2014.S83.g12848.03.t
ATGCGCGGGTGTAGAGTGGGTACCTCTGTGGATCATCGTAATGTAAAAGGTGGTACCCGG
GCGTTTGCGAAAAACGAAAACGTCATGGATTACCGTAACATCGGAATTATGATGTACGGA
TTGGCGATTTCCGTCAACATAGTTTTCGTCACTTCTTTTTCATTTGCGGATGGAATTGTT
ATCGCTTATGATCATTACAACGGAACTGAAGAATTTGAAGACATAGAATCGACATTTGGT
TCTTCCATTCCTGATAACGGAATGTTGGGAGTTTTAGTTCGAGCAGAGCCTCATGATGGT
TGTCAGCCATTGAAACCTCCGCCTTACCCGAGCGGATTTAATCAACATAACGTAACACTG
GCATCATTTGCACTGATTGTGAGAGGGAACTGTGAATTTGGGGCAAAGATCCTCAATGCA
CAAAACTCTGGTTATTTAGCAGCTGTAGTCTACAATGACAAATCTGATTTCCTAATAAAA
ATGAGTTCATCCATCAGTGGAATAACCATCCCATCTGTCTTTGTTGGAATAACAGCGGGT
GCCCTTCTGAACTCATCATATCTTTATGACAGAGAGGGTCAACCTTACATTCAATTGTAT
GAGGGTTCGATCAACCCGCTCGAATATTATCTCATACCATTCGTGATTGTATTAGCAGTT
TGCTTTGTATCTTTATTATGTTTTATGGTAAGTTTTTGCAAGGTAGGATTGCAAGTTTAC
ATTCACTTAGCAAGTTCAACTTTAGCATGTGCATCCCTTCTTACCTCCACAATTAACCAC
TCGGTGAATAGTAGTATACTCAGCCTCATTCGCTTTCCTTCTAGAGCGAGCATAGTTCTT
TCGCCCGACATTCCATTCACCTTGGTGCATGAAGTTTTTCTTGTCCTAACTGTTCTTGGC
ACTTCTCTGTGTATTGTTGCTATTATGAGGATTATTAAATGCTGTCGAGACAGAAGGCGG
CAACGTAGAGGACGACTCTCGCTAGAGAGACTTAAAAAACTTCCTGTTAAAAACTTTGAG
AAAGGTGATGAATACGATGTTTGTGCAATATGTTTGGATGATTATGAAGAGGGAGACAAA
TTAAGAATATTGCCTTGTGCGCATGCATATCACTGCAAATGTGTAGACCCATGGCTCACA
AGCAGTAAAAGAATTTGCCCCCTTTGCAAGCGCCGAGTTTTGAGTGATGATGAAGACAGT
TCTTCTTCTGAGGAGGATGACAGCGATGATGAAAGAACTCCTCTAGTCCAAACATCCACA
GCTTCCTCTCCAAATTCCTCCCTTTTTGCAACTGGATTCAGCAGAAATAATCCAATAATC
AGAGCAATTGCAAGACAAAATCGAAGAGCAAGTACTTCCTCAACAGAAACAGTCAGCACT
TCGACATCATCAGATGAGGAACAGCAGATGTCTTCTATCAGAATATCAACAAGTACTTCT
CGCAGCACTGGACTCTCACTGCCGCAGACATCAGATGGTTATCAATCTCAGAGACTGTCC
GCCACACCGATACTGGTCGATACCGTCCGAGTATATCCATCTCCGGTTGACGATAACGAG
GAAGATGTGCATGTTTTTGTAACAGGAAATCGTGTTTCAGAGTCATCAATTACTGTGATT
TCGGAATGTGATTCACCATCGTCAAGTATCAGTAGAACGCCAGAGGAACATTCATACAAT
TCGATGGATTTTCATAGCCTTGATGACAATTCGTTGGCACCGCAAGATAACACACTCTCG
GAACCATATTCTGATGGTAACGAAAGTGATATTCAAGACGATATCATTGTTATTGCTGGC
GGTAAGTGAGATCAAGGCAAGCTGAGCAAAGATCAACCACTGATGCCTAAAGCCAAGTAG
TAAAAGAAAGAACGAACATATTTGCCAAGTAAACTTTTCTATAACACACAAAACATCACC
ATGATTGAAAGTAAAACACTTTGATTGTTGCCTGATTCACTTCTTTCGTTTGCTATTAAC
TCACCACTCGCACCTTGGTGTGAACACTAGGCTGTTAGCAACAGGCTTGAATTCAATATC
GGCTGGTATTTTAAACCATGCATTGTACAGGATTATTATCATCATTTTTCAGTATTAATA
TCGGAATAACATTTTTTAGTCACACTGATTTTTCAAACTTTTTTACATGATAACTCAGAG
CCAAGTATTGCATTCAAATTAAGACAAAGCTGAAAGTCCATTATTTCAAAAATCTTTTAA
AATATCCGATATTAATAATATTGCAACTCACTTAGGTTCACAAGGATTGCGATAATAATA
AATGACCGATAACATGAAGCGATGCATGTATTCAACAAATGTATATAGCTGATTATGATT
TCTGATTACATATGGTGATTGATTACAGTATCTGTGATTGCAATAGGAGGATTTTATGAG
TATAAATTTCAGGGATATTACTGTATATCCTGGTATAAAAGTATCCCCCATTTTTTCAGT
AGTAATCGTATCCTACAGTTTAGTAGTGTTTAGTTTGATAATACTAAATTCATATCCATT
GAGGTGTAATAATCCAATGTCCAGAGAAACGTACGGTCTATCCCACTCTCAGTATCTAGG
AATAAAGATGTAAAACTAAAAAAATTGAAATTTTTACAGGTGTTAGTGCCAATTAAGCAG
GTCAATATATATACCCAAATTACAGTGATTTTCAACTTAATAGATGTAAGTTTTCACAAA
GACTTCTTTAGCAATACAACTTTCAATACCACATAAAATAAAATATTATTAGTTTAAGAT
AAGTCATGTATATTAAGTGTCCACTCGAAAAAAATGCAACATTCGAAAATGAAAATATTA
CTACTTTGCAGCTATGCTTTTAAATCCAATCCAAGTAGTAAATTTCCTTACTGCTTGTGC
CTTGGTAATGCTATGTGATTCTCTACTTATCACCTATCAGGTTTGCCTATATCAACCACA
CATATTGATTGTGAAATTATTAAGATGTGTTATTGGCATTGATCAGCCGTGTAGGGGTTA
TTGTCAGTGTAAATATAAATCGAGTTTCATCATATACTCACTCTCCAATAGATTTTTAAC
ATATTACGGAAGCCTTGAATTTTAACTCCTCATGTCTTGTTCGTTCATTATTTGGATATT
CTGTTTTTATTTGGGGTGTCATTTGGACATCTGCATCTCTCGTTAAATATAATAAAATGG
TAACCACCAATGTACATAAACTCGATTCTCAGAGGAATGGATTTAAATGCTGCCTAAATT
TACAAGAAGTATTTGTCAAGATTTTCTGGGACGGACTACGTCAGTGAACAAAATCATTCT
GTGGTATTAATTAGTTTGTGAAGGTTATAATACAAAGTTTTTAAATTATATCAGCTAGTT
TGTGCATGAATTCTCTTGGGGACAACTTAAATTGATGTTTATCCTGTTTGCGAGTGTATT
CTGCAATCTGCTCGAAAATTTACGCTGTGTTTGTTGTGTTTATACTTTACACTCTTGATT
TCTGTAATACCTTCTCTCTTCTAAATGGCATAGTTCAGAATTCAGTTATAGTAGTCAGTT
GGAATACCTCAGGCCGAGAAACTGTTACAAGTAGTCAGTTGGAATACCTC
| Pfam |
PA_domain (IPR003137) - T[92-182] 1.3E-6 |
| Gene3D |
Znf_RING/FYVE/PHD (IPR013083) - T[325-400] 2.2E-19 |
| Pfam |
Znf_RING (IPR001841) - T[347-390] 9.5E-13 |
| SMART |
Znf_RING-CH (IPR011016) - T[347-390] 0.0067 |
| ProSiteProfiles |
Znf_RING (IPR001841) - T[348-390] 12.711 |
| SMART |
Znf_RING (IPR001841) - T[348-389] 9.5E-8 |
| Protein Name | Identity | Bit Score | e-value |
|---|---|---|---|
| RNF13_HUMAN | 41.096 % | 147 | 3.39E-39 |
| RN167_HUMAN | 40 % | 145 | 1.66E-38 |
| ZNRF4_HUMAN | 39.394 % | 93.6 | 2.44E-20 |