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  1. Transcript 'Harore.CG.MTP2014.S6...'

Transcript Model

Transcript Id

Harore.CG.MTP2014.S67.g14265.02.t

Possible name(s)

RAB18; RAB2A; RAB2B

Location

S67 [149,867 / 155,013]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 205

>Harore.CG.MTP2014.S67.g14265.02.p
MDEELLTTLKILIIGESGVGKSSLLLRFTDDKFDPDQPATIGVDFKVKAITVDGNMVKLA
LWDTAGQERFRTLTPSYYRGAQGVIFVYDCTRADTFSRIGAWMTELETYATKPNVVKMLV
GNKIDKDGRLVQRDEGLKFARKHAMLFIEASAKTKDGVQCAFEELVEKIIQTPGLWEKDG
QKGGGSFSVGGSNAQPQGMCGCSLI

Nucleotide sequence

Length: 3,123

>Harore.CG.MTP2014.S67.g14265.02.t
CTTCCTTCATGGATGAATGATTTGAACTTTGTTATTGATGACGTATGTAAATGTGACATG
TAAATAAAAGAGCGTGAAGAAAGAACACCTCTACGTATTCCGAAACAAAAAAAAACATTG
CAAAATGGACGAGGAATTACTAACTACGTTGAAAATATTGATTATCGGCGAAAGTGGCGT
TGGAAAATCAAGTTTGCTGCTGAGGTTCACAGATGACAAGTTCGACCCAGATCAGCCTGC
AACTATTGGTGTTGATTTTAAGGTGAAAGCTATCACTGTCGATGGTAACATGGTCAAGCT
CGCATTGTGGGATACTGCAGGACAGGAAAGGTTCAGAACTCTCACACCCAGCTACTATAG
AGGAGCACAAGGCGTTATTTTTGTTTATGATTGCACCAGAGCTGACACTTTCTCCAGAAT
TGGTGCATGGATGACGGAATTAGAAACATATGCCACTAAACCAAATGTTGTCAAAATGCT
TGTTGGAAACAAAATAGACAAGGACGGAAGACTAGTCCAGAGAGACGAGGGTTTGAAGTT
TGCACGGAAACATGCAATGCTTTTCATTGAAGCCAGCGCAAAGACTAAAGACGGTGTCCA
GTGTGCTTTTGAAGAACTCGTTGAAAAAATCATTCAGACCCCTGGCTTGTGGGAAAAAGA
TGGACAGAAAGGCGGAGGCTCCTTTTCTGTCGGAGGTTCGAATGCACAGCCGCAGGGAAT
GTGTGGTTGTAGTTTAATATGAAAACAAATCAAAACAATCCATTAAAACTTGATGAATAT
AACCAGCGAACAAGTATTAAGACATACCTTCGAATATGTGTTGAATACCGTGATGTACAC
GAAGATGAAAAGACAGATGAACTTACACTGAACTTGAATAAGAAAATAATACAGTTTTGC
AATAATTATCCATCAAACAAATGTGTATTTCTAATTAATTCTTGCCTTCGGCTACCCCTC
TAAGTATATTGTATTCAGTGGAAAACATGAGGTTAGTTTGTAGTAAAAAGAAGATTGGGG
TAGTGATGTATCAAATAGATTTATCCACTTTTTATGAATTTTTACTCAACAGAATGACAT
AAATTTGTTAAGATACTGTATAACACAAGAATATAGTTAACTGGAATAGGTTTCAGCTGA
AGATGTAAACTTAATTGTGAGAATGATTAATAACAATCACTGGTGAACTATCTAGACTTC
TACAGAAATTACCTATGCATGTAGTGTAATGATGGATGAAGAGTAGTCTTAATTCTATTG
CCGAAGTAAACTAGAATAACAAGATTTTTCATCATTATTTTTATCATTTATCAACAATAA
ATATAATCCTGAATCACTATAGTAATAGTATCACATATTCTTAATGCTACATATTACAAT
TGAGTAACGTTGTTGCCCAGTAATCTTAATCCATACACTATTGTCTTCTTGCTGTTCATG
TAAAATTTCACTCCATGTACTTTGAACTACTTTGTGACATATTAATGGAATATTGCTCCA
TTGGACCTGATAGCTATAGCTTCTAAATATTTGTATTTATCATGGTGTTGACTTATTGTA
CTTAAGTAAAGAATACAAGTTTGGTTACGGATGGCCCTCGACTTACGATAGGGTTACTTC
CGAAAAAAACAATCGTGATTTGAAAATATATTCCGTAATTTTGATAATTTTAAATACGTT
TCATCATTCATCAAACCTACAGCCATACTATTGCAGGATTCTTGCTCCTCCAGACTGGCT
CGTTTCTTGTTAAATACTAACTTTCAGACATCATCTGACAATAGTAGGGTGATGAATATA
TTCGCAACACGAAAGGGGAAAAGGGAAAGTACTATCATAAAGCAGAACTTTCGCAAGTCG
GTACCACCTGTAACTTTGAGTCGGTACCACCTGTAACTTAACTTCGAATTTTTTACTCGC
TCTTTCAAATTCTGCCTTGAATTTCTAGCCTTTAAGTCAATTCTCAGCAAGTGATCGTTT
CAGATGTGTTGCTTCGCTTTTTTAACGGCATCTACTTTTGCCTAAAATGTTTTTACAAAG
TCCGGTATTTATAAAATGATATTTTATTGAATAATAGGGATATAATGATATAGAATGTGA
TAATATAGACCAGGGCTTCCCAACCTTTTTTCGCTGTACACCTCCAAGCGCTGATTTAGC
CAGGATTTTTTTTGGGATGGTCAAGTTATACTACTTGCTGCTTAATGTAACTATTAGTGT
ACTTAGTATTTAATAAAAAGCTCACGACGATACCTCATCCCTATTTCGTTTATTAGTTTT
TTTTTTGGGCCCCCTTTAATCGCGCTGTGGACCCAAGGGGGTTTACCCCAACCCCATTGG
GAAGCCCTGATATAGACCCAATATATATATATATTATCTTTAGTGGAATATTGAAAACCA
CAGATGGATAAAGTTGAGCTTGATTTTCGTTTGGTTGTATAATTTGTGATATAGAGAACA
GTTTTTTCAGTGAACGCTTTCCTTTCTTTGCTCTGTACTATTTTTTCGCCTATTTAAAGA
AAGATTTAGGAATATTTAATGGTTATTTCTTTGATTGCTGTTGCAGTTCTAAGTTGTTTT
GAGTTGCCAGTACAATAGATACACTACATCAAATAGTTGTACTATGTCAATAACTATCCA
CTTATATCACCACTTGGAATTTCTCTGTAATTGTTCGGTGGCATGTATAACGTTTTATAA
TAGAGTTTTCCTTACCGACAGGTAAATATAATGGTAGTTTTGATCACGGTATATTTGGGA
TGCTGTTTAAAATGACACCCTCTCTTCTATGAAGTCGTAGGAAAACATTAGTTCAGTTTC
TAATACAAAGAAGAGTGCGGCATGTCATCGTATTCGTTACTGTAATTAATAACTTTGCCT
GTGTTTCATATAGGCCTAAGCGTAAGCTTCCTCTATATTAATAAACCATTTGTAACTGTA
TTCAAACACGGAATTCCGTTGTTTGATTTCCAACAAAGGTCCGACTATTATTTTTTTATG
CGTGCGTGAAAACCGCCATTGTGGATAAATGATGAACAAATGACGATTATTGTATTCATT
CTCGTAATATAAACATGCACGTAGCGAATATATAATGGAGAGTAACGGCACATTAATCAT
CAG

InterProScan

SUPERFAMILY
P-loop_NTPase (IPR027417) - T[6-174] 5.18E-55
TIGRFAM
Small_GTP-bd_dom (IPR005225) - T[8-164] 1.1E-31
Pfam
Small_GTPase (IPR001806) - T[10-170] 1.6E-54
ProSitePatterns
Sigma_54_int_dom_ATP-bd_1 (IPR025662) - T[11-24] .

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
RAB18_HUMAN 77.66 % 304 1.98E-106
RAB2A_HUMAN 46.961 % 169 3.34E-53
RAB2B_HUMAN 46.409 % 166 5.33E-52