- Transcript 'Harore.CG.MTP2014.S5...'
Transcript Model
Transcript Id
Harore.CG.MTP2014.S563.g04288.01.t
Possible name(s)
SAMD8; SGMS1; SGMS2
Gene model
Location
S563 [34,198 / 44,216]
Amino acid sequence
Length: 172
>Harore.CG.MTP2014.S563.g04288.01.p
AHYPTMYARLERTFQICVGFGMSLSGLQTCGDYMFSGHTVILTIVNHLITEYTPMRMYSL
HIASWVLNLFGIFFILAAHEHYSIDVVIAFYISSRIFCYYHMLANTRSYRHSKRIRIWFP
LFSYFECNVPGKVPNEFEWPFTVKKIKNFFRLMPAKEKYVNIFPGYSSEGYR
Nucleotide sequence
Length: 2,028
>Harore.CG.MTP2014.S563.g04288.01.t
AGCACATTATCCAACTATGTACGCTCGTTTGGAGAGGACATTTCAGATTTGTGTTGGATT
TGGAATGTCGCTGTCTGGTTTACAAACATGCGGAGATTATATGTTCAGCGGGCACACCGT
GATTCTTACAATAGTTAATCATTTGATCACAGAATATACTCCTATGCGTATGTATTCGCT
GCACATCGCCTCGTGGGTATTAAACCTATTTGGGATATTCTTCATTCTTGCTGCTCATGA
ACACTACTCGATCGATGTGGTCATAGCATTCTACATTTCTTCAAGAATATTTTGTTATTA
CCACATGCTGGCAAATACAAGGAGTTACAGACACAGCAAAAGAATAAGGATCTGGTTTCC
GTTATTCTCCTACTTCGAATGTAATGTTCCCGGCAAAGTACCGAATGAATTCGAATGGCC
GTTCACTGTAAAAAAAATAAAGAATTTTTTCAGGTTAATGCCTGCTAAAGAAAAGTACGT
CAATATATTTCCTGGGTACAGTAGTGAAGGTTATCGATGACGGGAGTTAATGTCTGTAAG
TTGTATATTTATGTGAGGCAATGTTTAATTATATGATGTTGATCACGATTTTGCCCTCGT
TTTGATTGATTGAGCGACGTCTGTATAGCAGTATCTGAACAGTGTTTTTTTAAGTTTTAA
TAATTTATTACCGGATCTGAATGATTTATATTTTGCACAGATGTATATTGTGTTCAATAA
TTTTTTTATATTCTCAATGCTTTATTCGCTGTCATGGCACATGTTACTTTGAGATGGTGT
GGGAAAAACGCTGCACATTTCTTGGTATGGAGACTAGTTGGTTGTTTTCAAATTGGTTGT
ACAAATTCCTGATTCTAGTGATATAAGAATGAGCACGGGCGCACGAGTTGGAACTTTTAA
GATGTGTGCGGGAAAATGTCGCGCACTTTTATGGTAAAGGGATTGTTCATTTGATAATTT
ATTTTAATATATTTAACAGTCTTCTTACTGTAATGAATATTGTGTTGACCTTTTACTGAA
AGAGTACTTATCCCCAGGGGTTAAGTGGGGCATGATTGAATTTTATGAAATGGGACTTGT
GCCTCATCTTATAACCAAAAATCTGCATAAAATTTGAGAATTGTTTCAAACTCTTTATTC
CAGCAAATTTAGGACCAAGCTTTTTCCACACCACTAAGGGAACCCGAATATTCCCTATGT
TCGATCTTGCCAGTTCATGCCATAAATATATTGCCGTGGTATTAAGGGTAGAAAATATCT
TGAGACATGAAATAATACAACAATTGTAACTTCCAAGCAAGGTTTTTATTGCTTCATGTA
ATTTAAAGGTTGCATCACCTCCTCCACCTCTCAGTCAGCTGGATGACACCCTGAATGTTT
AAAATACAGCTGAATACATGAAATTAAACTTGTACAAGCAAAGCATACTGGTGAAAATAG
TCTGAATAGTACACAAATGTATAGTTGAAGTGGTCACTACGATTACCAGATCCCAATCAA
ACCCCCACCCCGAAAACAATTAGATCTTCAATTAATAATATATTTAAAACTAAAATGTTT
GTGAGCATGACATTTGCACAAGGGTTCAAGAAACAACTGCCTCCATGTTTTAGGAAGTGT
TTCCCATAGTTGGTAATACCGTGTTGGTATTACTTGCCTACATGTAATATAATGCAATAT
TTATCCTGTAACTAGTTAACTGTGAATTTTTTAATTTCTTCTGAGAGATTATATTTCTTT
ATATCTTAATTGGCATTAAGAAAAGGAGGTGCTCCAATTCATTTTGACATAGGGCACTTA
CATACTAGAGCGGACAACATTTCAGAAAGGCACTTACATACTAGAGCGGACAACATTTCA
GGAAAGGGTACACTCTTCAAGTTGTCGCTGTTTTTTCTCTCTCCACGACCTAAAAACGAG
ATAATCGTCTTTGCTCTTATACGACTATGTTATAACTAAGCGCTGAATTAAATTTTACCT
AAATATTTCCCAAATTTTTGAATGAGTGCAATAAATCTCTCCATGACC
| Protein Name | Identity | Bit Score | e-value |
|---|---|---|---|
| SMS1_HUMAN | 42.857 % | 130 | 1.1E-36 |
| SMS2_HUMAN | 42.553 % | 127 | 8.79E-36 |
| SAMD8_HUMAN | 65.972 % | 206 | 1.07E-65 |
