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  1. Transcript 'NCBI:KH.XM_018815987...'
  2. Transcript 'Harore.CG.MTP2014.S5...'

Transcript Model

Transcript Id

Harore.CG.MTP2014.S530.g04786.01.t

Possible name(s)

ARMC6

Location

S530 [41,806 / 51,471]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 342

>Harore.CG.MTP2014.S530.g04786.01.p
MTEERALKAISQETFDIVVKENVEEFEMDEEEAVKDAIEQFHSQGVNINIIIKEFPKYDG
THLVVMLTDSLSRAMEEDKLETESTREILTQLSREFTESLSKRYQACKLANASDVIFKVC
ELLSKKNVFALDAFTSLSMLIDGQPDELSGGRLQFFVHELKDCENEDIIQIALRIIKQAC
TKHEDNRQALVKIGIIPLLLRTIEQYSDNKNVVREGCIALRNLTLDDDIRVTFGNAHDHA
KMIVLDDGLKRLINAFKVCFLISRRVIRSNGFGFNLVFFSEHCHDSSLAKEFASTMSKVM
VRNEYCQEFVDLGGCKVIKELVEVHNNNSVSSFLLCHNNILC

Nucleotide sequence

Length: 4,790

>Harore.CG.MTP2014.S530.g04786.01.t
AGCCACCCTATAACTTGAAAGTACTTAGTTTTTACATTTCTTTACTGAATTCAAAATGAC
TGAAGAGAGAGCGTTGAAAGCAATAAGTCAAGAAACTTTTGATATTGTTGTAAAAGAAAA
TGTTGAAGAATTTGAAATGGATGAAGAGGAAGCAGTAAAAGATGCAATAGAGCAATTTCA
TTCACAGGGTGTCAATATTAACATCATTATCAAAGAATTTCCTAAGTATGATGGAACACA
CCTTGTGGTAATGCTAACTGATTCTTTATCAAGAGCAATGGAAGAGGATAAATTGGAAAC
AGAATCAACACGGGAAATCTTAACTCAGCTATCAAGAGAATTTACAGAAAGTTTATCGAA
GAGATATCAAGCTTGTAAATTGGCAAATGCCTCAGATGTCATTTTCAAAGTGTGTGAATT
GTTATCGAAAAAGAATGTTTTTGCCCTGGATGCATTCACGTCTCTATCAATGCTTATCGA
CGGCCAACCAGATGAGTTAAGTGGTGGAAGACTTCAGTTCTTCGTTCATGAGTTGAAAGA
TTGTGAAAATGAAGACATCATTCAAATTGCCCTACGAATAATCAAGCAGGCATGCACAAA
ACATGAAGACAATCGTCAAGCTTTAGTCAAGATTGGCATCATTCCTTTGTTACTACGGAC
TATTGAACAATACAGTGATAACAAAAATGTGGTCCGTGAAGGTTGCATCGCGCTGAGAAA
TCTTACATTAGATGATGATATTCGTGTTACTTTTGGAAATGCTCATGATCATGCAAAAAT
GATTGTGCTAGATGATGGACTCAAGAGACTGATAAATGCATTTAAAGTGTGCTTTTTAAT
AAGTAGAAGGGTCATCAGATCAAATGGATTTGGATTCAATTTGGTGTTTTTTTCAGAACA
CTGCCATGACAGCAGTTTAGCAAAAGAGTTTGCATCTACTATGTCCAAAGTAATGGTACG
GAATGAATATTGTCAAGAATTCGTTGATCTTGGTGGTTGCAAAGTCATCAAGGAACTGGT
TGAGGTACATAACAACAATTCGGTGAGTTCATTTCTCCTTTGTCATAACAACATTCTATG
TTGAATACATGACGGGCATAACGATTTTTACCTTGAATTCAACCTCAACAACTGTCCCTG
CTGACCATATAGTTTCTGGAGGTATAATGAATTCTTCATAAGGCGTAACGTTGCATAGGT
ACTCCTGATTGTTCATGACTGATGCACATACAGAAAGACTTCGCTCATAACCGACAGAAA
CTGTCAAATCCTTTTGTAGTATTTCATTGGACGGAATGGCTCTTTGTCTCTCAGCATTTG
TCTTGACAACATGTGGAAGATCGTCACAAATGCATACCTTAACAACTTGTTCTTGTTGCT
TCGCATTCGCTAGATATACCGATGTTGACATCCGTTTACTGCTTGCTTCATTTCCAACAA
CTTGAAACTGACAGTAGTATGCTTTCATCATTACCTGGTTTTCTTCCGTGTGAACTAAGA
TACGACTGATGATGATATAGGCGCTACAAAAAAAAAGATTTTGATATTATTTCACTACTG
AGTATATTCGAAATAGAATACCGTTCCATCGTGTAGTTAGTATACTCTACTGCCTTAGTT
TTGTCCTTGTTACTTTTTGAATGGTCTATTTGGTATTGAAGTGTAGTGCTAACATTATTG
TGTCTACCAATACCTGCCATAGAAAATATGCTAAAAGCGTATACTTTTTTTTCTTTCACG
TTAGTACTCTCATGTAAAAATGTGTACGCTCCCAAGCCGTGTTCGAAACTCCATTCTCAT
ACATGCCTCTATTTGAGAGTCCAATACCTCTCCAGCCTGTAATGCTTCTGTGAAATCCCC
AAATAGCTTGCTTTGTTTTATATTCGAAAGGTTCTATGGAATTATACTGAACAAACACTT
TTCTGATTAAAATTCCTGGTATATTTGTGGACCACGACAGCTAGAAATCGTTTCACACTA
TGATCGTATTTAACGGTCTCGTCAATTCAATGTCTGTTACAAACAATTGACTTCGTAACA
TGATAGACAAGAGTATTGTCATTGTTTTCCTAAATTCATTTCAGGAAAAAAAATGGCTTG
TACTACCGTTCCTTCTATACAGTATACATAAATATAGTTGAAATGCTGATCTACCTTGGG
AACTCGTTCATTTTCAAAATTTCACGTTGAGGTTTTCTGTTAACTCAAAAAACTATTGTT
GTTAAATTTATCGGAAATGAATAAAAATACCCCCTACGTTTAGTTAGGTTATGGTACCTT
AGGTTTGGGTAAGAGGTAGAGTTAGTTAACACTCACCAATGAATATCCATACCCACATCA
CCCATGGCATTATTTAAAATTAATTAAACGTAAATAGATGATATTCAAAACAGTTCAACT
TCTGAAATGTAACTTGTGCCTATTTCATTTTTCCTGGATCTTATTGTTTTATTAACAAGT
TCGAAATTCGTTCATTTCTTCAAAGATAGACGGCAACTGTTCTAATTACAAAACTGCTTT
CACACTTAACGTTGGTCACTTTAGCTATAAACTCGTTTGTGTTTGATCAGTACTGCATTA
TTATCCTAACGAGCCACGTTTGCATTCTGAACTAATTCAGCGTTAGTGTTCACAATTATA
ACGATTCTTCCGTACTCGCGCTGCTGTTCAGACCTCAAATACAGTACGAAGCACTTGTTT
AAACGATCGCTTCGGCATGTTGAACATATACATGTGTCACAGAGATACAACAACGTTAAA
ATATACTATATTAAAAAATGGATTAATTCTTAATTGAGCGTTCATCTAACATTGCTTAAC
ATATGACATCATTAGAAATGTGCTTTCTTCCTTTTCGGTTTTAACATTATCTGCGTGACT
GCTTTTGAATGGATTATCTTGATGATATTCTGAATTTCTGGTACTAAGTCGAAGAATCGA
GATTGCTGGAGAGAATATGAATCTCGATGTGATTACGGTATTTTAGCTAAATAAACTACC
TGAGCGTAATTCTGTTTGCTTTTTAACCGCGATAGAGATAAATGTACCTGCAATGTTAAA
AACCTCATCGACAAGCTAGTACACGACACTTACTGTAGTTTACGATGTTTGCTCACCTAA
TGTTTATAATTTGGTACCAGGTGATGCGAACGTATTTTGCTATCTTGTTTCTTTCCACTG
TCTCTTTGCGTCGAGTACCTTTTGTGAGTATTCTGAGTAGATTCCATGAACAGTATCGCA
CTTTAAAAGCATTCCCCCTGAAGTTTACTACACCAACTCTGGTTTTGTCTATTAAGTGCT
GTATGTAGTTATAGCCAGTGACTGCCTCGCCTCGGGCATACGATCTGTGCTTTTAGACTT
ATGACGGAGTTCTCGTGCCAATACTATCCGTAGTTATTAAGATAATTCGTAATACCGCGC
GATATACGATGATGACATCGTTCGGTCGTAGTATTACTGAACATTCATCAAGACTCAGTT
AACGCCACTATAAGGTAATTCTTTGGTAGTAATTTATATTAGTCGTGTAGTCTAGATTCA
ATATTTCTTTCATTACTTTACAGATTTACAACAATACTACATATACCTCTACCAGTCAAT
ATATTGTTTCAAAGTTCCCACATAAAATACTGTATACTGAAACACTTTCATTTCTGATAT
TATGTATTAGTCATATATGTTTACAGAACGCTAGTATTTTTTGCACTCACCAGAATGAAA
TATGCTCCGCCTTCTTCGTTGCATTCCTTAACAATGTCGTAAGCGAGTACTGTAACCTGT
TTCACGCACTGCTAGCTTTCTTTACGTTTTTTGTTGCTGTAATATAATGTTCTGTTCTAA
ATCACTAGCAGCTATTTTCGCCTTTTGCTGCACTTCCAAAAATTACTATGGTTGATATAT
ATATCACTTATTCCTTTGCTCCTGACCCTGTTGAAGTAAATTACATTCATATTATTCAGC
CTTGTTTAATAGTCGTTACTTGTACACATGACCAGGTAAATTCTTACTATACATCTTCTA
AACCCTCGACTAAATCAAAGCTTTGTTGTTATTAATTTATGATTCGTTCACCCTAGACAA
TGAAATTAATTTGACCAGCAAATATCACGATCAAGCACATTCTACAATACTTAATTTAAT
TTTACAGTAATTCGTTCCGCCACTTCATAGGAATGACTCAACCCGAAATCACGAAACTTA
CTCCCGGGCGCAGTCTATACAGCGTTAAGTGTAAATACTTGCCTTGTATATGATTTTGGT
GATTGTTTTTTTCCATCTCCAATATTCGCTTTTACTTTAACTGAAAATATATAACTACGG
ATATAACTTTTCAGGAAAGTAAGCTTTATTCTTCAACAGTTTCTTTTTGCTTTGTCTTGT
CACCTGAAAATAATAATCGATTCTAATGTTGCATAGTGGTCAGTAGATATTTGATTCGGT
GTTTGAAATATCTTGTGCTGCACCACGAGACACCACTGTACTTTGAATTGGCTTTTTGTA
GTATTAAATACTATAGTATATACTATATAGTAATGGGAATGATCTTGCGCCTACTTCACA
TTGACCACGATTTATACTGAATATATTCGATGAATAATGAATATTAAGATTTGGTTTCAT
ACGAACTGAATACTCTGTGCACGGGCTCCTCCCTATAAGTTGTACAGTGCTTGGCTGAAT
GTATTTCAAAGTACAACTGTTTTATATAATATACCGTAATTCGATTTGTACAAAAAAATA
TTTTAAGTGAATTAATCATGACAGTAGAATACTTGAATACTCTGCTCCAT

InterProScan

SUPERFAMILY
ARM-type_fold (IPR016024) - T[101-330] 1.42E-16
SMART
Armadillo (IPR000225) - T[183-225] 5.6E-4
ProSiteProfiles
Armadillo (IPR000225) - T[194-228] 9.747

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
ARMC6_HUMAN 38.988 % 207 9.66E-63