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Transcript Model
Transcript Id
Harore.CG.MTP2014.S447.g02162.01.t
Possible name(s)
MEX3B; MEX3C; MEX3D
Gene model
Location
S447 [71,126 / 78,325]
Amino acid sequence
Length: 674
>Harore.CG.MTP2014.S447.g02162.01.p
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EDQRALQIALELSNLGLLGTGDDDSSTSSYDEITKSKKSQNMTECVPVPSSEHVAEIVGR
QGCKIKALRAKTSTYIKTPVRGEEPVFVVTGRKEDVAMARREIQSAAEHFTQIRATRNKS
GVVGNTAVPNLPPTGNTSPTDLTSPGTITLQVRVPYRVVGLVVGPKGATIKRIQQQTHTY
IVTPSRDKEPVFEVTGLPENVEKAKEEIEAHIAARTGSQHRDVDDDFASNGTLVGSPANC
LVQDKTTSAFTPYRAAAPHNQPRSSVADAFGYGLQRMDSNPFFHCNMNVYAAKYQENQQN
HLLNMANRGMGMYARNQIDAKLDTYTSNPLEYENQAIPATSAWTNVDFNNPASVSFRLMS
AESNNLNQNMGSMISPPACINGSAQHPRLSPTLSDPDFPINSFLSPSNLQSPLSNMSNMS
RNPIQRVGSDSVDSTGSSIHSLDLAAAIATGLHKTTSNGINIESGYSSGGTTDSQTSGSP
VDTLNCNTLGNLRTGSPPRVCVMCNEGSVMAALVPCGHNLFCYECAQKAASSSAHCPCCN
QIATMALLIKTGPA
Nucleotide sequence
Length: 5,795
>Harore.CG.MTP2014.S447.g02162.01.t
ATGACACTGTGTCACATGGCTAAACTGAGTGCAGTGATTGGCTACAGGTCTCGTTTTAAC
GGTGGTCTTGTCGGCAGTAATCGAGGCGAGTTGGTTCAGTTAGCATTCTTGAATACGGCG
CAGAGTGTTTTTCCACGGCGAGGCCTTTCATTTTTCATGGGAAATGTACAGCTACTATCT
GCCCTTTGTGTGAAGAACAGTGATATTGTATCAGTGAAGTTATCACTACAATTTTATGTT
CTCATTGAATCAGGTGAATTAAATAAAATATCAATCATAATAAGAATACAAAAAGTGAAA
ATGTCTAGCCCAGTAGGATTTCAAGACTTGGAGTCGCCAACACCGTCAGGAAATTCGCAA
GAAGATCAGAGAGCTCTTCAGATTGCATTGGAATTATCTAACCTGGGACTTTTAGGGACA
GGCGATGATGATAGTTCAACTTCCAGCTATGATGAAATTACAAAGAGCAAAAAGAGCCAA
AACATGACTGAGTGCGTTCCAGTACCGAGTTCTGAGCATGTTGCTGAAATTGTTGGAAGA
CAAGGTTGTAAAATCAAAGCTTTGCGTGCGAAGACCAGTACCTACATCAAAACACCAGTT
AGAGGAGAAGAGCCGGTCTTTGTTGTGACTGGAAGAAAGGAAGATGTAGCTATGGCACGG
AGAGAAATTCAGTCAGCTGCTGAACATTTTACACAAATAAGGGCTACAAGGAACAAAAGT
GGTGTGGTTGGAAACACTGCAGTGCCGAACCTTCCACCGACTGGAAACACCTCTCCTACA
GACCTGACTTCACCCGGCACGATTACCCTGCAAGTACGAGTCCCATACAGAGTTGTTGGT
CTTGTTGTTGGTCCTAAGGGAGCGACTATCAAGAGGATACAACAGCAGACCCACACATAC
ATTGTTACACCGAGCCGAGACAAAGAGCCTGTTTTTGAAGTCACTGGTTTACCTGAAAAT
GTGGAAAAAGCAAAGGAAGAAATAGAAGCGCACATTGCCGCCAGAACAGGATCTCAGCAT
CGGGATGTTGATGATGACTTTGCTAGTAACGGGACCTTGGTTGGAAGTCCGGCCAACTGC
CTTGTTCAGGATAAAACGACTTCGGCATTCACTCCTTACAGAGCAGCTGCTCCTCACAAT
CAACCAAGGTCTAGTGTGGCAGATGCCTTCGGCTATGGACTTCAGCGTATGGATTCTAAC
CCTTTCTTCCATTGCAACATGAATGTTTATGCTGCCAAGTACCAAGAAAATCAACAAAAT
CATTTGCTAAACATGGCTAATAGAGGAATGGGGATGTATGCAAGAAACCAGATAGATGCA
AAACTTGATACGTATACCTCAAATCCTCTTGAGTATGAAAATCAGGCTATTCCAGCTACC
TCTGCATGGACAAATGTTGATTTCAACAATCCTGCTTCCGTATCATTCCGACTGATGTCT
GCCGAGTCCAATAATTTAAATCAGAATATGGGTTCGATGATCAGTCCACCGGCATGTATC
AATGGATCGGCACAACACCCACGTCTTTCTCCCACTCTATCCGACCCCGATTTTCCGATT
AATTCCTTCCTTTCTCCTTCAAACTTGCAGTCACCACTGTCCAATATGTCTAATATGTCG
AGAAATCCAATTCAGCGAGTTGGCTCGGATTCAGTAGATTCAACAGGAAGCAGTATTCAC
AGTCTTGACTTAGCTGCTGCGATTGCTACTGGATTGCATAAGACCACATCGAATGGAATT
AATATAGAGAGCGGATATTCATCAGGTGGGACAACAGACAGTCAGACCTCCGGTTCTCCT
GTTGATACTCTCAACTGCAATACATTGGGTAATCTGCGTACTGGATCACCACCAAGAGTA
TGTGTGATGTGTAATGAGGGTTCGGTTATGGCAGCGTTGGTTCCCTGCGGTCACAATCTC
TTCTGTTACGAGTGTGCACAGAAAGCTGCATCGAGTTCAGCCCATTGCCCCTGCTGCAAT
CAAATTGCTACCATGGCATTGCTGATAAAAACAGGACCGGCCTGAACGCTGATGATTGAA
GATGGCCAGAACGAGAACAAATCGCGGTAGGTTGTTGTATAGAACTATTTATGTATGAAA
GATTCTATGTAGACTTGGTTTCTTTTTACTGTGGTATTTTTTTATTGTTTCGGGGTGTAC
AGTCTTCCTTTGGTAATTCTCTTCACTCCTTTGTTGAAAGTTAGTATGCTGGCCACACTT
GTGAAACTTTTTTTTAGCCGATTACGTTATTGAGTTCGGCAGATCTTTTTACCATTAGCT
AGGTTTTTCCCATTACTATATGCCTTTAACAATAGTTGTACCAAAATCATTTAACAGTAG
ATGTGCATACTCAGATTTTTACCTTGAGGCAACAATCATTTAAAAGAACTGTTATTGAAG
GCAAACGCACTGCCAAGCATATGTGTAGTTATGTCTTGCTACAAATTGCAATTACTTGTG
TTCACTTTTCCCCTGCTGCATTTGAAATGAGGACAGATATTTCCCTACTATGACCATACT
TTTATTCCTTGGCATAGTTTCTTAATTTTCCCTGCATGTTATTTTTCCAGTAAAATATTA
TAAAAGTATATTAGATATATTATATATTTTGTAATTTTGTATGATTGCTTTTTATTTTGT
ACTTTGTTTATTAACCCTCTCCATCTTGTAAAAGTTGATATTTCTTTCACTCGCCCTTGA
CTTATACTCATCATGTGCACTAGCTGCATAGAATTTCTTAGTAAACTTGCTGTTCAAGTG
TGCACAGTTTCATGTCGTTTTGGTTGTTTTGAGCACTCATTGCATAGTTGGTTTTCTTAT
TTCACACTGCACCAGGTTGTTGTTGTTTTGCTTTATCACATATGTAAGCTCACTGCCGGC
ATGGCCATTATTAACTTGCCAGGAAATATCAAAGTTCTTGTCAAAATGTACTTAAGTATC
TAGCTAGTTTCCTCAACTGTGTATAGCTTTTAGTTTCCAACTGCCAAGTAGTTACGTTTA
TCACTTTTTATGTCCTAAGGATAGTGACCAAAATATTTAGAAAAAGTATTGGAATATAAA
ATCTCAACTGTGCTCTCTACTCTTATTAAATGGATGTATGGTGCTACAGCTTGTTGCTAT
TGTATGACTGTAAGACATGAATGTATTCTAAGTATATGATATGACAATTTTCAATTACTC
TGCAGAGCAGTGAAAATTTTGCCTTTCACACTAGTGAAGTACTCCCTATAAGCTAGTTGG
TTTTTCAGTTTTGTTTTGTCTTGCTGGCTCCATGATGAGAAAATTGCCACAGTGCCATTA
ATGATTTCTATGTTAGGAGATTAAAGTGTTCCCAATGATAATTGATGCTCTCAGTTTGTT
TGTTCCTACATTGCTGCTACCCAAACTCTGAACCTGTTAAGATATTATGCAATCAAGACA
CTTAATGTTGTGGAATGGTAGTAGATCCGTCCCGGAAAGGCACTCCACGTTAACAGTGTG
AAGAATGCTTGAAAAACTAATGTTACACCCTAACGAAAACTGTGAATTAGCATATTTATT
TTCGAACAGCAGTAGCCGTAAATTAAGCATTTTTAACTCCACTCGCCCTGTTAAATGAAT
GTCCACTGTTGATACTGACCTAGCGTTTTGTTTTCTTTGTAGTCGGCCTTTATTTTACTG
CTTTTATATTTCTATCACACAACATGTAAAACAGGTCTAAGATAAATCCCTCTTTGATTA
TCTGGTCATGATTTATTATATTAATATCAAGATGTATGTCTAAATATATATATATGTTAT
TATAGTCGTTGCAAAAAGGTACTTTTATTGCTGCCAAATTAATGTTATTGAAAAAATAGC
CTTTTTTCTATGTAATTTCATTGTTTTTTATTCCCAGATTCATTTGTTAAAGACCTAATA
ATAAATTTAATTATACATAAATACTATTTCCATGTGTTGAACAATATCTATCTGACGCTT
CCCTTCCAGTTGAGATTCTGTGCATAGAAAAGCATTGTATTTTAGTCAAGCATGCGGTTG
TTTTTAAATCTTGATGTTTTATAATGGCGAGATATTTCAAAACAACTACGCAATTGTTTG
CAACACACCTCCGACTTCCATGTACCTTTGGCTACACATGCTGTCTTCTTAACTGCTACC
ATTCGAGTGTTTCTCAACAGAACCCAAACCGTTTAGTTATATACTGTAAACATGTGTGTA
AATGATACCAATTTTCAGTTAATCCCGACTGTCCAGATTCTTCATGTTGTGTCAAAGGTC
ATTCGTTAAAAGTTTTTATTTCGTGTCGATTTGTTCTTTGTTGATTGATTCTAGCATATT
CTGTTTCACTTCATTTTTATAGTGTGTCTTTCTACTTATTATTTCAATATCAATGCCATT
TGAATTGTGTAAGCTTGTCACAACAGAATTCATTTTTGTATATTGAGCAAGAGATAACAA
AATACAATAAATCTTTATTTTATCGCTAGCTTGTGCGTTCTTTTTATGAAGTGCGACCAA
GACTTACCTATTCACATGAACTAAATCTTGTAAGACTGCTAGAACTCAGAAGCAAATAAT
GGTATGATTTACACCAGACTAGACTGTTTCCTGTTCTGATTACGCGCCGACAAACAAGCA
CGGCTGTGTGAAGTGAATATTCTTTATAAAGAATCGCAAGTGAAGCAAAACCTCCACGAA
TTCGTGAATTTTCGCAAGCGAGAAGAGATCAAATTTTTAAGGGTAGACTACTATGATCAC
TACCATGGAGTGAAATTGGAAAAGAATATTGTACTGTTCACTGTAGAGCAGACAGTTCAT
TTCCCATCAGTACTGTTAAACAAATTCTACTGACAACATAGAAAGTTCAATGGTTGATAT
ATTTCCTCTGTTAGCCGATGATAGTAGCACCTTGTCAGGGCCGTAATCCTCTTGTATCTT
ATATCGCGTTCGATAGTAATTACAATATACACATGCAGGCGTGTCGTAAACAATTTGGGC
ACGCGGCCAGATATGGAGAAGTGATCGTTTCTCCTTTGTTCAGTGGCGAGGTTTCCAATT
ATTGTTTCTGTGAATAAATTTTTGACATCTATCGAGAGTGCGTAAAAGTAATTACGCAGG
CTACAATCGGTGATAATATTCCCTATTACGCGTGATATTTTGAATGATAATTTTTCAAGT
GTCATAAGAACTTGAAATTAATGTATAACACTTATCCACTATAAATCTTCGTTTTGTTAA
GTTGCCTTCGGGGTATGTATGAACTCGATTTGCTTGCTAACTATTAACACGGTGATACTC
GATTAAATAAGTGATTGGCAAAATGTTCTTTCACGAGTGGCTAAGAGTGCCCATTGTTGT
CTGTATGTATATCTTTTCTAATTGAGATTTAGTATGTTGTGTTGTAAATTAGCGATGCGC
GAATCCACATTCTCCCTTTCCTAATAAGTACTCAATACAGTCGGCATAATAAACTATCTG
TATGTGTTACACTGAACTCATATGTACCCATATTTATTTGTATTGAACATCCACCAGATG
TTCATAATAAGAGGAAGCCTTTTGAAGGGTGCAAAGCAGTAATGCCAAATTGGGCTACTG
TTGACAGGCCCAGTGTTACTTTGATTGATTATTTATGTATTTATTATTTAGACGATGTAA
TATAATTACATTTTGAAGACACAGAGATAATGATTTATATTTCATCATATATTCCCTCAT
ATATCTCCTCCTGGGAGCTACTTTACATATGTTTTCGCGACTTTCAGTTCTTCCCTCGCT
ACTCTAGCCTAATTTTAATTTGGATATGAATACAT
| SMART |
KH_dom (IPR004087) - T[160-228] 7.4E-9 - T[266-333] 1.9E-16 |
| SUPERFAMILY |
KH_dom_type_1_sf (IPR036612) - T[161-233] 1.42E-10 - T[263-334] 4.09E-18 |
| Gene3D |
KH_dom_type_1_sf (IPR036612) - T[162-226] 3.7E-13 - T[267-333] 2.9E-21 |
| Pfam |
KH_dom_type_1 (IPR004088) - T[164-224] 1.9E-9 - T[269-329] 6.1E-15 |
| Gene3D |
Znf_RING/FYVE/PHD (IPR013083) - T[607-669] 2.1E-8 |
| ProSiteProfiles |
Znf_RING (IPR001841) - T[621-660] 10.881 |
| SMART |
Znf_RING (IPR001841) - T[621-659] 0.0022 |
| Protein Name | Identity | Bit Score | e-value |
|---|---|---|---|
| MEX3D_HUMAN | 72.195 % | 289 | 2.19E-88 |
| MEX3B_HUMAN | 72.996 % | 318 | 1.67E-100 |
| MEX3C_HUMAN | 73.632 % | 289 | 2.26E-88 |