- Transcript 'Harore.CG.MTP2014.S4...'
Transcript Model
Transcript Id
Harore.CG.MTP2014.S438.g01531.01.t
Possible name(s)
SLCO3A1; SLCO4A1; SLCO5A1
Gene model
Location
S438 [36,306 / 50,855]
Amino acid sequence
Length: 522
>Harore.CG.MTP2014.S438.g01531.01.p
MDFDLNKYNHETNEENRTKQQKDGVVPITVSSVDLTKTSCGYGACCRPLWLQFFASAKWF
LVFISAFVILQSLLVSGYLSSVITTIEKRYGMRSAESGLIVSSFDIGSLLVVVFISYFGG
KGHRPRWIGIGAVFVAIGAGLFSTPQFFSTPYAIPKVATTDDVHEHLCLNQSMTNSSLDD
TKCEAQEASSFYMFLFIIANMLMGIGSTPIYTLGITYIYDNVERDNSSLYIAIVYIMGAV
GPALGYVLGGTLIGYYVDLGVEGVPSSDPRFIGAWWSGYVLVAILIFATAIPLLGYPRIL
PKPPQFNSGSPDVETPGTPVSPGTDESEVEMNPMDASMNFGKNLKAYIPAPIYFGSAIDG
ACLIWVGATDACEDGSGACQHRKGTKKKIGSLRDKKRDDFNGGRPSSSTDSLPGFSNERE
TNYQSTSNTNANNNTMSERPVSIAGGESSRSEPIQVNTVSSSESESSMNSGGSQKPLISN
KKGRGSSKKAHSNPVLNAVSLELDVVSETPIVSGLQMMDIML
Nucleotide sequence
Length: 2,689
>Harore.CG.MTP2014.S438.g01531.01.t
AGCATCTAGCCACTTAATCTGTACAGTAATGTAAAGTATTTTGTGGCTAAAATAACTATT
TCTCAATTACATCACCATCTTCTCGTGCGCCATGGATTTTGATTTGAATAAATACAACCA
CGAGACGAACGAAGAAAACAGAACGAAACAACAAAAAGATGGTGTCGTTCCTATAACAGT
ATCAAGCGTCGATTTGACAAAGACATCGTGTGGATATGGGGCTTGCTGCCGCCCGCTCTG
GCTTCAATTTTTCGCTTCTGCAAAATGGTTTCTCGTTTTTATTTCTGCTTTCGTTATTCT
GCAGAGTCTTCTCGTCTCTGGGTACCTGAGCAGTGTTATAACAACGATTGAAAAAAGGTA
TGGAATGAGGAGCGCTGAATCCGGACTTATCGTCTCAAGTTTTGATATTGGCAGTCTACT
TGTCGTTGTTTTCATTTCTTACTTCGGGGGCAAAGGTCACAGACCGAGATGGATCGGAAT
TGGTGCTGTCTTTGTGGCGATAGGAGCTGGATTGTTTTCAACACCTCAGTTCTTCTCGAC
TCCCTACGCTATTCCTAAAGTAGCAACAACAGACGACGTGCACGAACATCTCTGTTTGAA
CCAGTCCATGACAAACAGCAGTTTGGATGATACAAAATGTGAAGCACAGGAAGCCAGTTC
TTTCTACATGTTTCTCTTCATAATTGCCAACATGCTGATGGGTATCGGTTCAACTCCGAT
CTACACGCTCGGTATAACGTATATCTATGACAATGTTGAACGGGACAACTCTTCATTGTA
TATAGCTATTGTGTACATAATGGGAGCAGTTGGACCGGCGTTAGGATACGTTCTTGGCGG
TACTCTGATTGGCTATTATGTTGACCTAGGTGTTGAAGGTGTCCCATCCAGTGATCCGAG
ATTTATTGGAGCATGGTGGTCGGGATACGTTTTAGTCGCTATTTTGATCTTCGCTACAGC
AATTCCGTTGCTTGGCTACCCGAGAATACTGCCGAAACCTCCGCAATTCAACAGTGGTTC
ACCAGATGTTGAAACACCGGGCACTCCTGTCTCTCCTGGTACCGACGAAAGTGAGGTAGA
AATGAATCCGATGGATGCCTCGATGAACTTTGGAAAGAATTTAAAAGCTTATATTCCGGC
CCCAATCTACTTTGGTTCGGCAATTGACGGAGCTTGTTTGATATGGGTGGGTGCGACAGA
TGCATGTGAAGACGGATCTGGTGCATGCCAGCATCGAAAGGGAACCAAAAAGAAAATCGG
AAGTTTGAGAGATAAAAAAAGAGATGACTTTAATGGTGGGAGACCTTCAAGTTCAACAGA
TTCTCTACCGGGTTTTAGCAACGAGAGAGAAACAAATTATCAGTCCACCAGCAACACAAA
TGCAAATAACAACACAATGTCCGAGCGACCCGTGTCTATCGCTGGAGGGGAAAGTTCACG
ATCTGAACCAATTCAGGTCAACACGGTTTCAAGCAGCGAGAGTGAGAGCTCGATGAACAG
CGGAGGGAGCCAAAAGCCGCTTATTTCAAATAAAAAGGGCAGAGGGTCATCGAAAAAGGC
TCATTCGAACCCGGTGTTAAATGCAGTCAGTTTAGAGTTGGATGTTGTTAGTGAGACACC
GATTGTTTCTGGTCTTCAGATGATGGATATCATGTTATGATGTCAGTGTGGGTGAATTTA
TTTATTGTGATGAAATAAGAGATAGGTCTGGCTTTTGATAAAATACTGGCACAGCTGTTA
TGGCTAAAGTCGATTTTTGTTTAAAAGGCCCGTTCGTTCCCGTTCAGTGTGTAGTAGCAC
AGCAGCGTCTATTATTATTAAAAGCCTTGTGTTCATTGTGGTTGTGTGTGTAAACATCTG
TGTTTCTCTCATTCCATAGTTTATTTTCATGTTATTGTGTTCAGATGAACAGAGAAAGGA
TAGTGACGCTGTGCCAGTGCTACTTACTTACTAACAAATTGATTTACTGAAGGTCTCTCT
GAATGTAACTGGGTCTTAAGCCATACTCCACTCTTCATTTATTGTTTAGAAATTGCATCG
TAGATTGCTCATTGAAGGTGTAAGAGATTAATTAATTATCTAACCTTATTAAAACCCAAC
AATAAAATAGCTGTATGGTTTCAGATCCAGAGTGAGGAAACTGCCTCGTAAGCCCATCCT
AGTAAAAGCACTTGGTCAAACTTGGGGGCTTTGGTACTTAGGAATCAAAAGCCCACTTCT
ATGTCTACCAAACTTATTCCCACTGTACTGAAATACGTTCTTCCCCAAATGCAACAAATA
TATTTTACAGGGCAGTATTTTTTTAGCACCCCTTGCTATTTTTTTTGACGAAAAAAGACT
TAAAAACGAAGACGTGCAATTTTAATTTGGCAAAAATACCATTCCTGTGTTTTCAAACAT
TTTTTTCAGTAGTTATTGTCTGCAGCATATTCAATAACAGACAGAAAAAATATTGAAGCA
TTTGTCTTACTCAATTATGAATTCCTATTGTAGTCGATAATTATTGTGTAGCGTTTTATA
TATTGGTTCGGAGTCAATTTTTACTTATCGTACTCTGCCGTGTAAATACTACAAATACAC
TCTCGGGGGGAGAGCTCTGCGATCTGCACACATTTGATGTCTGTATGCTTCATTTCTATT
ATAGGTTTATATCACCAATCACAAACTTGTTATTACAATGATCTTACAA
| Protein Name | Identity | Bit Score | e-value |
|---|---|---|---|
| SO4A1_HUMAN | 37.594 % | 193 | 5.36E-54 |
| SO3A1_HUMAN | 39.3 % | 185 | 4.36E-51 |
| SO5A1_HUMAN | 50.41 % | 229 | 2.73E-66 |
