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  1. Transcript 'Harore.CG.MTP2014.S3...'

Transcript Model

Transcript Id

Harore.CG.MTP2014.S389.g10059.03.t

Possible name(s)

SURF4

Location

S389 [74,304 / 78,749]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 227

>Harore.CG.MTP2014.S389.g10059.03.p
MSQNPMISKAEDVADTVLRRTKFILPHVGRFCLVSTFVEDGIRMWVQWGEQRDYIASTWS
CGFFIATLFVLINMLGQIGACVGVLIRRHVPIMCGTLFFIIGLQTIAYSILWDLKFLARN
LALVGAVLLLLAESKAENRSLFAGVPQLERNTPKSYMQLSGRVLLVLMFMTLLHFTFDPV
DVSGVFYLSIILLKIMRVSVIVCESVLRYISVKSFKIFHAAKAELIF

Nucleotide sequence

Length: 2,621

>Harore.CG.MTP2014.S389.g10059.03.t
AGAATTTGCTTGAGAGTTCGAGGCGTGCCATACAAAATATTAGTAAGATTTCTGAAATTA
TACGTTAAAAACATTCCACCATGTCACAGAATCCAATGATTAGCAAAGCCGAAGATGTTG
CCGATACTGTTCTAAGAAGGACGAAATTCATTTTACCACATGTGGGACGTTTTTGTCTAG
TTTCAACTTTTGTGGAAGATGGGATTCGAATGTGGGTGCAGTGGGGTGAACAAAGAGATT
ACATTGCCAGTACTTGGAGCTGTGGTTTTTTCATTGCAACTCTATTTGTTCTTATTAATA
TGCTCGGACAAATAGGAGCCTGTGTTGGAGTACTCATAAGAAGACATGTCCCCATAATGT
GCGGAACATTATTTTTTATCATCGGGCTGCAAACGATTGCATACAGCATTCTGTGGGACT
TGAAATTTCTAGCGAGAAATCTTGCCCTGGTTGGAGCGGTCTTACTTTTACTTGCCGAAA
GCAAAGCTGAGAATCGTTCGCTGTTTGCCGGCGTTCCCCAGCTGGAACGAAACACACCAA
AGTCGTACATGCAGCTCAGCGGACGCGTCCTCCTCGTTTTGATGTTCATGACCCTTTTAC
ATTTCACCTTTGACCCTGTCGATGTAAGTGGTGTTTTTTACCTAAGTATTATACTGTTGA
AGATCATGAGAGTTAGTGTGATAGTTTGCGAATCTGTTTTGAGATACATTTCAGTTAAGA
GTTTCAAGATTTTCCATGCAGCAAAAGCCGAGTTGATATTTTGAAGTTAACCATTCCAGG
TTACATAAGGAAATTCTGATTTTTCATTGGATTCCTTATAATCATCATCTTAATTCAATC
CAATACTTGAGCCAATTTCCCATCTAATTTGTTGTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGAAAAAT
CCTGTGTTGTGCAAATGGTGACTTGAGTATGTGAATGCAATTAGTATAATGTAACGTTAT
GTTTTGTAACCAACCTTTCGTGTATACATTAATTTTCTATGTCTGCTGGTTGCAAAACAT
ATGGCTATGCTCACAGCTTACAGATAAACATAGGCCGTAGTTATTAATTTTGTACCTACA
AATTTTCGTCAAGTATGTACTGCTTCAATTTGGCTTAAATTCTGTTGTGGAGAATATATA
ACTTGCTTTTAGCAAGTTAATTTTTTAACTCTTTTAATAAGAGTTGTTATCAAGTGGCTT
ATGGTAAAATTGAGGACTGTATTTATAACTAAAAGTGGATATTGAGTTGTTTTCTAAAAT
TCAATTCTTGTGGCTACTAGCTGACTTAAGCCAAGCCAACTTTGTAATTCAGGATTTGAC
CATAAATTCTTTACCTGTGTGATATGTTAGCATTCCGTTTTCTCTTCTTTGTGTTCATTT
TTTTGTCTTTCCTTAACTTCTTTTGGCATGCTGTGCTGTGAAGCCTCAATCAGCTTTGGC
CAGGATGATATCAAGAGATTTCGAAACCTTCTTATCTATAAATGGATGCAAAGTAATTTG
ATTTGTCTTCTCTTACCAAATCCACCATCTTCTAACACCTATCTTCCTGTTCTTCTACGC
ATTTCTTGCTCCTCAGGTCATCCTGGACCTTGTTTTCACCATTGGACTCGGGTGCATCGT
GGCAGGATACAGGATAAAACTGGTCGCCCCAATCATGATCATTATCTTGCTCCTGGACTT
GATGTTTGGTCTGGCGTTTTGGTTATATCCAGCCGGTAGCAAGTTGCACGCTGTCATAAA
AACAAGTTTCTTTGAAACTCTTGGTTTCACCGGTGCTATAATGATATTGCTTCATCAAGG
GCCGGGTGACATCACCTATAAAACAGTGATGAAACGCAATTAATGATATCGTTCGAATCG
CATTTATACACTCTGTATATTGCAAGAGAGTTATAAAAGTTTTAGCTGATTTAATGTTGT
AATGTTCTAGTTTGCTATCAGTCAAGTACTTGAGAGTTAATTTTAAGGAAATTTTTTTTG
AAGGATGTCATTTCAGATCCTGTGTGTTTTGTCTTATATATTCCTAATTCTGGTTACAGG
AATTTGTGTGTCTATTTAATTGTTTTTGTTGTGGAGCGAATTTGAACTCTTATTGTGATC
TACTAACTGCTGTTAGTTTGAAGTACTTGAATACTATTTGCTAATTAAAATCAAGTATTA
GCAAAATAGAAATGTTCAGATCAAAGTGAAACCATGATGGGATTTTGCATTACCTTGGCA
GATATTTTTAACTGATGGGTTCTATTATTCATATTACCTATTCATATTTCAAGTCCTACT
TAGAACCAAGAGCTACCCTTCATCTTTGCATCGCAATTGAAAGGTACAACTTGTTTGAAA
ATGGAAATTGAAATAAATTAAATCAGTTCGTAGTCCAACTTAGGTCTGTTTGGATTCAGT
TCGAGTCGTTGAGTCAAGAATAGACAGGTGTGTAGTTCAAGCATAGTAAATACAATCGAG
TAGAACACATAGTAGTTGTAGTGAAGGTTTATAAACATGGATTTAAGGTTGTGGCATAAT
TTCATAATTCATCCATTCTCTTATGGTAAGTGTATATAATTTTGTTTGCTATCAATTTAT
TTGTAATTCATACGGTTTAATTCTGGTTGTATATTGACCAT

InterProScan

Pfam
Surf4 (IPR002995) - T[5-201] 3.6E-66

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
SURF4_HUMAN 65.714 % 224 5.58E-74