- Transcript 'Harore.CG.MTP2014.S3...'
Transcript Model
Transcript Id
Harore.CG.MTP2014.S30.g00048.02.t
Possible name(s)
GALNT1; GALNT13; GALNT4
Gene model
Location
S30 [144,829 / 161,667]
Amino acid sequence
Length: 633
>Harore.CG.MTP2014.S30.g00048.02.p
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GGGGAADFIANKVIPAIGNALPSFNSNPKGPGEMGKAVIIPKDREKEKLDKFKINQFNLL
ASEMISVNRSLPDVRMDGCKKKTYPKKLPKTSVVIVFHNEAWTTLLRTVHSIINRSPREY
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YDDDTHLLKHTNTGQCLGKIKEGGQVPSMQRCDNSDTSLLGSSSLASKKNFIISGQPARG
FLVKGANRQISTESRNRNIYVLSDNYPYFELPD
Nucleotide sequence
Length: 5,676
>Harore.CG.MTP2014.S30.g00048.02.t
GTACACGACGGAACTCGTCAAAGGATCAGTCGGTTAGAAGTCGCCAAGCAGTCAACACTG
CCAATAATATATGAACTGATTCGCTATACACAGAACAGTGTAGATTGTTATCAAGACTTA
TATCATCAGGAACTTTGAATAGGTCCGTGTAAACAAAAAGTTATAGCCGGCTCTCTACGT
GTCTTCAACGTATTAACATCCACGTCTGTAACGGCGGATATAAAACTCATATATTTTTCC
TAACGGGATTTAAAAGATGGTAAAAATATGCGGGCGAAGATATTGCAAGATGGATGCAAG
TAATTTTCGAGTTGATAAAATGGTTATTCTGACGACCTCCCTTTTCTGGTTAATGGTTGA
TGTTTTTTTCATATTTTATTTCACCGACTGTAAAACCAATTGTCCCAGCAACAGCAAAGA
CACAAAAGACCTTGGAGGTGGTGGTGGTGCAGCTGATTTTATAGCTAATAAGGTTATACC
TGCTATTGGAAATGCCCTTCCAAGCTTCAACAGCAACCCCAAGGGACCCGGGGAGATGGG
CAAGGCAGTCATCATACCGAAAGACAGAGAAAAGGAAAAACTAGACAAATTTAAAATAAA
TCAGTTCAATCTGCTCGCCTCGGAAATGATCTCGGTCAACCGGTCATTACCTGATGTTAG
GATGGATGGGTGCAAAAAGAAAACTTATCCCAAAAAACTCCCAAAAACTTCCGTTGTAAT
TGTGTTTCATAATGAAGCATGGACCACATTACTTCGTACAGTACACAGTATTATAAACAG
GTCTCCAAGGGAGTATTTGGAGGAAATTATTCTTGTTGACGACGCAAGTGAAAGAGATTT
TCTTGGCAAACCGCTGGAGGATTATGTCAAAACATTGTCTGTACGAACACTTGTGGTACG
GATGGGCAAACGTTCGGGACTTATCCGGGCCCGGTTAAAGGGGGCTTCCACCTCTGTGGG
ACAGGTCATTACGTTCCTCGACGCTCACTGTGAATGCACTGAAGGGTGGCTCGAGCCTTT
ATTAGCAGAAATTGCAAAAGATTCATCAACCGTGGTGTGTCCTATCATTGACGTTATTAG
CGATGAAACTTTCGAATTTTTAGTCGGATCCGATATGACTTACGGAGGATTTAACTGGAA
ACTCAACTTCCGTTGGTATCCTGTTCCTCAGAGAGAAATGGATAGAAGGCATAACGACCG
TTCTTTACCTGTGAGGACGCCTACGATGGCCGGCGGATTGTTCTCAATCGACCGGGATTA
TTTTGCGAAGATCGGGACTTACGACGCGGGGATGGATATCTGGGGTGGCGAAAACTTGGA
AATGTCTTTCAGGATTTGGCAGTGCGGTGGTACCTTGCTAATCGTGACATGTTCTCACGT
TGGTCACGTCTTCCGCAAAGCGACACCTTACTCCTTTCCAGGTGGAACGGGTCATATCAT
CAACAAGAACAATCGGAGATTGGCAGAAGTATGGATGGATGAATACAAGAACTTCTTCTA
CATCATTTCCCCAGGTGTATTGAAACAAGAGTATGGTGATGTGAGTGAACGTGTCAAGCT
CCGTGAAAAACTGCAGTGCAAATCTTTTCAGTGGTATCTCGACAACATTTATCCTGATTC
CCAAATTCCCTCCAAATACAAGTCACTCGGCGAGGTGCGGAATGAACAGACCGGTTTCTG
TCTCGATACCATGGCGAGGAAAGAAAACGACAAAGTCGGAATGTTCAATTGCCACAGTAT
GGGTGGCAATCAGGTGTGGGCTTACACTGGAAACAAGGAAATTCGTACAGATGATTTGTG
TTTGGACGTGTCCAAGATGGGCGGCCCGGTAATGATGGTCAAATGCCATCATTTGAAGGG
AAATCAGCTCTGGGAATATGATGATGATACTCATTTATTGAAGCACACAAATACCGGACA
GTGCCTTGGTAAAATAAAAGAGGGCGGGCAGGTTCCCTCGATGCAAAGATGTGATAATTC
GGACACTTCCTTACTCGGATCCTCCTCTCTTGCTTCAAAAAAAAATTTCATCATCAGTGG
TCAGCCGGCCAGGGGCTTTCTAGTAAAAGGGGCGAATCGTCAAATTTCAACCGAATCAAG
AAACCGGAATATTTATGTTCTCTCAGATAATTATCCTTACTTTGAACTACCAGATTAATC
GACCTGAAAGGGAAGGGGGGTGAGATGTCTAGTACTGTGATTCCCAACCTTTTTACCCTC
CCCCTTTCCAGTCCACCAAAGTCCCCAACCTGTAGTATATTATTCTTAGGAAAATCATAC
CACCACATGTGCAATTGAACATTTTCAAAAGCATCAATTTTAATATGGGAAAATTAGGGA
AAATTCAATCCCAAAATACCATCCTGTTACCTCCCCTGTTAGAACCAAATTGCATGACCC
ATGTTGGGAACCACTGGCCTACGACGTCTGCTTATAAAACAACTCTCGATGCAGATATAC
AGCTTCATTCTTGTACTGTGCTTAATATCTCTAATCTAGATTTACTATTTCTGTAATTCA
TTTAGCAGACAGAAAGCCAATCCAGTTTAAGTAATACTAGAGAATTGGTCAATTGAAATT
TAATTTCTTAAAATGATTGCAGAATGAATTAGGTATTCTGGAAGGATTTCAAATTGAGTA
CCATGCCTCCCTATCTCCAGGTCACACTGCTTTCTAGAGGTGATTAAAACTTTGCGATCG
TCAACAAAATAATAAATACCAACGATGAATGAACCGTCCCCTAGTTCGCTTGAAAGATAA
TGCATATTAAAACACTGTACTGAGCTTATATTCTCACAGCCTTGTGATGTTTATCCACTC
GTAATTTTTAGCATTCTGGTTTTCCCATTTATAATATTCAAGTGAATGCCCAATTAAAGG
TATAGATAGGATATATATATAAACAAATATTCCAAGAGAGGCCTAAAAATTATTCCTGGC
CTCACGAAGTTTCCAATCTATCTATCTATCTGTACAACCATTGCCCATAATGCAGCAGTG
GGATTTGAATTTCTGCGGAACCGGTTCTCGTGCTTTGCACCCCTAGATTTTTTTGTTGAT
AGAATTCAATAAATGAGGTGTACTGCTAGTATTGCGTTGGTGGCGGGAAAACTTAATTTC
GAAACAATTCGAGATCTGGTTCTGCGAAATTATGTAGTAGTAGTAATACACATTGGATCC
CACCACTGCCAATATGATATATGGATGCTACGCTAGCAATACTACTGTGCATGTATTTTA
TTATTTTTAGATAGGCTTTTCATAGGACTAGATAGATTTCCATAGGAACAGTTAACTGGA
TTTTTACGAAAGATTTAATTCGGTAAATGGTTATGTCTGGGCTTATTATGATCACATAAA
CAAAAATATTTTATTATGAAAAAAACCTTGAAAATTAAAAATTACTTGATAGATCATCTG
AACCTCTTTTTTCTACGATTGAGTTTTAACCAAGTTATATATCCTTAATGAGAAGTTTCC
CAGCGCAACATTATAAAAGTCTGCACTAGTTCATGCCGATATATTTTAGCAGTAATTTTC
ATTTCCGTCCACGAGAACATTTTTTGTGCACTATATTTTAGTTTTGTCATTTATCTTGTT
AGTTTGCTATGTGAATTTTGAATCGTCCTGCTAGGAACTTTGATCACAAACAGAAGGTAG
ATGGCCGATTTTATTTATGTAATCATTTGAAAAATGAGTCTAAAACTGCTTTGCAGCTAC
ACTCCTATTCCTATATGAATCTTGTCTGTGGTTTTGGACACGTCTGTTATTGAGAGAGGT
AGCTTCGAGTTACTCATGCACAATCTTCTGGTATCAATTTGTCTTCTGTTCATCTGTCGT
TAGCTCGAACTCTTAATTTTTGACGCAATAAATACTTTATCTACTGTAATTTTTATGTTT
CTCATGATTTTTACCATTTAATTTTATTGTGGATTCATTTTTTCGATTCGTTTCTAAAAG
TGCAACAGTGTAACTTTATTATATCTCTTCTCAGTGTGAGATGAATTCACACATGGACCC
TTTTTTGATCAAGTTAAGTGGTAGAACACAGATTTACCACAATGACATTTTATGGACCCC
CAACCAGCAGTATAATAAAGTTACACTGGATCTTCAACAGGAAACGTGAATATTATTCAC
GTCACTGCTTATTTACTTTTATCAATAGAAATGATTTAAGGGCAATTTAAAATTCTTGTT
TACCTCGTTCCTATGGTGCTGAATGCACTAAATACTGGGCAACTCTACGTGCATGCTCAT
CTGTGGGACCTTCTCGAATGAATATATACTTTCACTATCATCAAAAATCACACCTTGGAT
TACATATTGAAGGTGTAAGATTAAATGAAAATTTAGTCTTAATTAAACCAAAGAAGGAAC
AGGTAAACTTTTTAGTATTGTACAAACTAGTTGCTAAGTAAAAATGAATTATCAGAAGTA
GTACAATGAAGTAGATGTATGATTTCTGATCCAGAGTAACCCATTTGCAAAATTCATGCA
CTGTAATATACTTGAATGTGCTATTTTAATTGATTGATCTGTCATGTATGATTGCTTTTT
TTTCTTGCATATATTCAGTAGAATCCAGTCATTAGAATAAGGTTTGACGCCTCTCTAGTG
GTAATAGTAAACTGTTGATAAAATATTGTCGCTACTGATTCAACTTCGATCAGGCTAGGC
CCTTGGGTATTACATTTTCATCGTAGAAGTAGTAAAGAGATATTCTGTTTAGAACTGTTG
ATCGTCGCTCACATATCCGTCTAATTTTTATATGCAAAAGTTAAGCTAGTTACGGTACTG
TGGGTAGTTCTACCATCCCACTGTTTTCATTTATCAGCTTTGCCCTCTCGCTCGAAAGAT
ATGATTCTACCTTGCTCTTGATATATTGAATATTATTTTAATTGTATTAATTCATGCTCT
CTGGCTCTGCTCATTGGTGGTATTATGCCCATAATCTATACTTAACAGTCAGGCGATGTG
TTCCCTCAATATCAAGTATTTGGCAGTTATTGGTTGGTTGGTTACTATTAGTCACAATTA
TTACCATCATTAGCTGTCTATAAAATTAATTTTACTCTCTATAACGTTTCCTGCATTATT
AATTGCAATAATCAACTGGGCAATCTTTGTTAGGGATCGATTTCAATATTAAAATGATTT
AATTTTTCTCCAATGGAATCTCCTATAAAAGGTATCCATATGCATCCAATGTTGGAAGGG
GCTGGCAGTGGCTGTATGATTCATAATTTGAGATAACAGTTGATCATAATGTTGGTGATA
AGTCTGTAGTCTCACAACAGACAAAATGTTGTACACTTCACAAAAAATCGATTTGCATCA
AAACTGCTATTCTATAATTTAAAATGAGTGTTCTCCATTATAACTTTGATATTGTTGATT
TAAAAATGCTTTTAGATATAAAAATAGGAGGTAAGATACCACCGTATTCATTGTGCTCTC
GTAAGAGCGCTATCATGATCATAGCATACGAGTGACAATGAAATATTAGGTCTTCAAGCT
TTTCTTCTATATGTATTTAAACTGTCATTATTTTTCTGGAATTCACTTTTCTGTATATTT
AGGAAGTGGTGAAGGTTTTACTATTTATGCTTCGTTTTATTTCATAATTGATATGGCATG
ATTATATTAAAGCGAAACATATCTGATGAAGATTAG
| Gene3D |
Nucleotide-diphossugar_trans (IPR029044) - T[79-460] 3.2E-167 |
| SUPERFAMILY |
Nucleotide-diphossugar_trans (IPR029044) - T[128-454] 3.09E-66 |
| Pfam |
Glyco_trans_2-like (IPR001173) - T[152-336] 2.0E-33 |
| SUPERFAMILY |
Ricin_B-like_lectins (IPR035992) - T[459-576] 1.49E-34 |
| SMART |
Ricin_B_lectin (IPR000772) - T[461-583] 2.1E-26 |
| ProSiteProfiles |
Ricin_B_lectin (IPR000772) - T[463-557] 22.81 |
| Pfam |
Ricin_B_lectin (IPR000772) - T[465-577] 1.9E-27 |
| CDD |
Ricin_B_lectin (IPR000772) - T[465-574] 3.26434E-26 |
| Protein Name | Identity | Bit Score | e-value |
|---|---|---|---|
| GALT4_HUMAN | 44.961 % | 434 | 1.05E-145 |
| GALT1_HUMAN | 71.48 % | 830 | 0 |
| GLT13_HUMAN | 68.953 % | 813 | 0 |
