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  1. Transcript 'Harore.CG.MTP2014.S2...'

Transcript Model

Transcript Id

Harore.CG.MTP2014.S285.g00083.01.t

Possible name(s)

CDS1; CDS2

Location

S285 [109,579 / 117,761]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 340

>Harore.CG.MTP2014.S285.g00083.01.p
VLCIQVKCFHEIITIGHQYYKSYDLPWFRSLSWYFLLCVNYFFYGETIAETFGSNTKNHL
LEALLRYHRMISFAAYLVGFILFVLSLVKKRYRLQFFMFGWTHVTLLIIVTQSYLIVQNL
FDGIIWLIVPVSMVICNDIMAYICGFFFGRTPLIQLSPKKTWEGFIGGGIFTVLFGWLIA
GFLSQYKFMICPTELSSEMVLKMDCDAPLSFVTQEYNIPIFIQVLLKLVGLQWTSFHAVP
FQLYSIAFSLFSSVIAPFGGFFASGFKRAFKIKDFGDVIPGHGGLMDRFDCQYLMATFVH
VFISSFVRVQSPHKLLPMILAMKTTDQIWLLNKLQDHLDQ

Nucleotide sequence

Length: 2,634

>Harore.CG.MTP2014.S285.g00083.01.t
GTTCTATGCATCCAAGTGAAATGTTTTCATGAAATTATCACCATTGGACATCAGTATTAT
AAGTCGTACGATCTGCCATGGTTCAGGAGCCTTAGTTGGTATTTCCTTCTCTGCGTGAAT
TATTTCTTTTACGGAGAAACCATAGCGGAGACTTTTGGATCGAACACCAAAAATCATCTT
CTGGAAGCTCTTCTACGTTATCACAGGATGATTTCATTTGCTGCCTATCTAGTTGGTTTT
ATCCTGTTCGTTCTAAGCCTGGTGAAGAAGCGATACCGATTGCAGTTCTTCATGTTCGGT
TGGACTCACGTGACTTTATTGATTATCGTCACCCAATCTTATCTCATCGTACAAAATCTC
TTCGACGGCATCATCTGGCTCATCGTGCCAGTTTCCATGGTGATATGCAATGACATCATG
GCGTACATCTGCGGTTTTTTCTTCGGGAGGACTCCGCTGATTCAGCTCTCCCCAAAGAAA
ACCTGGGAAGGATTCATTGGTGGCGGAATATTCACTGTTCTGTTTGGATGGCTTATTGCC
GGATTCCTGAGCCAGTACAAGTTTATGATTTGTCCGACCGAACTTAGTTCTGAAATGGTG
TTGAAAATGGATTGTGATGCTCCGTTGAGTTTCGTCACCCAAGAATATAATATCCCAATC
TTTATACAAGTACTCCTGAAATTGGTTGGGCTGCAATGGACTTCGTTTCATGCGGTTCCG
TTCCAACTTTATTCAATAGCATTCTCACTCTTCAGTTCAGTGATAGCGCCATTCGGTGGA
TTCTTTGCGAGCGGATTCAAACGAGCTTTCAAAATTAAGGACTTTGGTGATGTCATTCCT
GGTCACGGTGGACTCATGGATCGATTCGATTGTCAATATCTGATGGCTACCTTCGTGCAC
GTTTTTATTTCATCATTCGTTCGTGTTCAATCCCCCCATAAGCTTCTTCCAATGATACTA
GCTATGAAGACGACCGATCAGATATGGCTGCTAAATAAACTCCAAGACCATCTCGATCAA
TAAAGAAAGATTCGTCAACGGGCCGATGAAGTCGCTGTCGTCCTGTGAATTATTATTTGT
AAAATTAACTGTAATCACTGGTTGAATGTTGTTGTTTTCTCTCCTTGGATTTTAACTGTG
TATCATTTTGTTGTATATACTTACTGTTTTGCTTCATCATAAGCAGCAGCTATTTGATCA
AGCGTTATGAAAAGTATGCGGACAGGTTCAGAAAAACGGCCGACGAAATTGCGACCGTGT
GATAATAAGCGTTTTAAAAAACGACTGCCCCTAGCTATTTGAAAATCTCTTTTTTGACTA
ATGTTATATGGAGATATATATGAGAAAATATGATATTATATTCATATTTCTCCCATGTGG
ATAAAAAATATATGTATTATGTAATGAACGTAATTTTGAGTGGTTTTATCTCTGAAGTTC
AAATTGGGATGGTTAAATAAGCTATTTTAGTAGTTGAAAATTTAATTACGGAAAAAGAAA
GTTGCTTCGGGGTTAAGAATGGGTCCTAAAATTCAGAATTTTCGGTTTTAGGGTTGACGA
CCGAGGTGGACGGTTGGGTTAAGATCGGGCACTACAAAATAAAAGTAAGATAAAAATCAT
GTTTTAAAAAAAAATTTCACGTTTTTTTCACTCGTTTTGTCAAGTCTTTTTTTAATCAAA
TTTAATGAAGTTTTATCATTTTTGATCAATTGCATGGTGATTTTTTATGCTGGTGTCCAT
TTCTCAACGTTTTTACTGTGAGATTTTTTCCTGATTCTAACTAAATGTGCAGTGCAGTTA
CATCTCTTACGATAATGAGACGTACAAACTCTTACATAATCTTCCGGGTTTATCAGCAAA
CTACAGATAAGATCTATGAATGTCCATATATTTTCAACTTACTGGATCATATGGATATAC
AGTGGGGCCTCGTACATAACCCTAACTTCGTACATTCTAGATTTAGAATGCTAAATTCGT
GAGAAATTCCATTCGGAGCTTCTATGTTCGAACTACATACATAATAAAAAAAAATGCACC
ATTAAAGGGTCTAGGAACGGATAAATTCACCCTCCATTATTTCTGTTGGGGATAGGTACG
ATTCAGAATTCGAAAGCCCTCCTGAAACGGATTAAGTACTGGGCACCACTGGACTGGATA
CAATAATTATTGTGCACCAAAGATACTGCATAGTTGCTTCATAATAGTTAAATTGAAATG
TTTTCTTGTTTTTCAAAAATTACTTTTAAGATTATTATTTTCTATTTACTCAAGATGAAG
CTAATGTAGCAGTCAATTTGTACACGTTTGTAATTGTAATCTTGTGCAATTAAGCCTGTA
GCTTATGTGAAAAGTTCCTTCACCATAGCCCATCGTATCTTACATTAAAGACTTCAGACT
TCAAAATTTTGTAATCTCTTTAACAAAAGTGATGCCCCGCTTAGCTTAACGCTCATGATG
CGTACCTGAGAACAGGGCTGAGCGAATCAGTGTTTTGTCAATATAACATTATTGTATATG
AGATTAGGTTCTCCAAGCCTTGGTTTCTTGGTGATATACGCATATACTTTCTTCCTAACA
TGATGGATTGATTAATGAACTATAGATATGTATATGGGAAGCTAACTACTGAGG

InterProScan

ProSitePatterns
PC_trans (IPR000374) - T[264-290] .

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
CDS1_HUMAN 61.176 % 427 5.57E-149
CDS2_HUMAN 61.176 % 432 1.83E-151