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  1. Transcript 'Boschl.CG.Botznik201...'

Transcript Model

Transcript Id

Boschl.CG.Botznik2013.chrUn.g00136.01.t

Possible name(s)

LINS1

Location

chrUn [817,351 / 818,830]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 492

>Boschl.CG.Botznik2013.chrUn.g00136.01.p
MAALGTLYRKLSDKLASLGSSTSNTTCDLTSYVEDVKVVVCEIFPFSDENISLTLSKLSL
LKLFFELILSMQRSPSSKVVFEEIFTPNFLDRILSEHKQDQDKNLTYLMCEVTAYFVFTA
YEVQVDYYTNHDHGCEDLTVYLAQRNLPVLIKLSLINAFHKLLKLYSSADFAPIFSKIFS
GIFWNSEMLASTNSPCFYLKLCRDSLTTGAGTQIRNIMFKDFDFFVTYISNAVDGTLEFV
MTFLNELFPYHGDSGFETPVIIAIASKILTVLRKCLESRMENAHVPTMSLTILKISLLVM
SNINSVLVSNDTVLDVFALLNVFTYTEKQWLSMTIHEDDDLIDFLWLHLEFFWISHKEAI
RSDVCLLLRMTPCSLFLELMLRLSFNISILNDWLISNETHFLRYFLKLLKMIRFFWSDFL
DKCELMYTLPHVRDAISLLGAPSVLDACMSAIIRLKMKISRLHKSNLYPYSPKPLIKLLA
AVEALYEETYSE

Nucleotide sequence

Length: 1,479

>Boschl.CG.Botznik2013.chrUn.g00136.01.t
CATGGCTGCTTTGGGAACACTTTACCGCAAACTTTCCGATAAACTCGCTTCACTTGGAAG
TTCGACGTCAAATACAACTTGTGATTTAACATCATATGTGGAGGATGTTAAAGTCGTTGT
TTGTGAAATATTTCCTTTTTCTGATGAGAACATTTCACTCACATTGTCAAAATTGTCTCT
TCTGAAACTCTTTTTTGAATTGATTCTTTCGATGCAGCGTTCTCCATCGTCAAAAGTCGT
ATTTGAGGAAATATTCACTCCAAATTTTTTGGATCGCATTTTAAGCGAGCACAAGCAGGA
CCAAGATAAAAATTTAACTTATCTGATGTGTGAGGTAACCGCATATTTTGTATTTACTGC
CTATGAAGTGCAAGTTGACTATTATACCAATCATGATCATGGTTGCGAGGATCTAACTGT
GTATCTTGCCCAGAGAAACTTACCCGTGCTTATCAAGCTCTCCCTTATCAATGCATTTCA
TAAATTGCTGAAACTGTACAGCAGCGCTGATTTTGCTCCAATTTTCAGTAAAATATTTTC
GGGTATTTTTTGGAATTCCGAAATGCTAGCCTCCACTAATAGTCCTTGTTTTTATCTGAA
ACTTTGCCGAGATTCGTTGACCACAGGTGCAGGCACACAAATTAGAAATATCATGTTTAA
AGACTTTGACTTCTTTGTAACGTACATTTCCAATGCTGTTGACGGGACGTTAGAATTTGT
CATGACATTTTTGAATGAACTCTTTCCTTATCATGGAGATAGTGGGTTTGAAACACCTGT
TATCATCGCTATCGCAAGTAAAATTTTGACTGTTTTGCGTAAATGTTTAGAGTCACGTAT
GGAAAATGCTCATGTGCCTACCATGTCTCTAACAATACTGAAAATCTCTTTGTTGGTCAT
GAGCAATATTAATTCTGTGCTGGTATCGAATGACACAGTGTTGGATGTTTTTGCTTTGTT
GAATGTATTTACCTACACTGAAAAACAATGGCTATCAATGACTATCCATGAAGATGATGA
CCTAATTGATTTTTTATGGCTACATTTGGAATTTTTTTGGATCAGTCACAAGGAAGCTAT
AAGAAGCGACGTTTGTTTGCTACTACGAATGACGCCGTGTAGTTTGTTTCTCGAGCTGAT
GCTGCGTCTCTCTTTCAATATCTCAATATTGAATGATTGGTTGATATCAAACGAGACTCA
TTTCCTGAGATATTTTCTAAAACTCCTCAAAATGATTAGATTTTTCTGGTCTGATTTTCT
TGATAAATGTGAACTGATGTACACTTTGCCACATGTTCGAGACGCCATTTCTTTGCTCGG
GGCGCCTTCCGTCCTGGATGCCTGCATGTCGGCAATCATAAGGTTGAAAATGAAAATCAG
TAGGCTTCATAAATCGAACTTGTACCCCTACTCACCCAAACCGTTGATAAAACTGCTGGC
AGCGGTTGAAGCATTGTATGAAGAAACATATTCTGAGTA

InterProScan

PANTHER
Protein_Lines (IPR024875) - T[43-74] 3.1E-22 - T[77-488] 3.1E-22
Pfam
LINES_N (IPR032794) - T[327-423] 1.6E-8
Pfam
Lines_C (IPR029415) - T[449-483] 9.2E-13

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value