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  1. Transcript 'KH2012:KH.C8.209.v2....'
  2. Transcript 'KH2012:KH.L3.17.v1.A...'

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.L3.17.v1.A.SL1-1

Possible name(s)

KNTC1

Location

KhL3 [10,461 / 40,095]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 1,728

>KH.L3.17.v1.A.SL1-1
YCLIMASLYDVHPVIEIPYHPISVCDAMLPSNVIAVQSTQQDLAVSGNKEVTLITKYSSC
TQTLSFDNAVEVLSWSDDGNYLIVGACNGHLIILSKENSKELFKEVISSSYSNVGFKTID
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LSQNLMHNSDSPNQSARILPHVSDLSMECKSQTYIKHEADQSNISDSGDGDKRNNSFTSY
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IKRENNPTDLEKQQFWKRGSVSSKSLPSISSTRLPLHALLYGDTNHAWKVISAEVTKKSV
DLLVPVAKLLKLNVDKLYMTAAENMITELCGNDHGEPLELHLPEIRSLVENISSCQMCVA
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HLLALEKLNTADVLLLVNQPANLIIHLYQHPSIIQRFYAPGDAYPDIHGVVDQVAELYDQ
DVARLRLTMTLKLLLTVEKKHDQDQEEDNTVNLERLRSTLKQVSQENKEEKTLIQLLYLL
TYGNPLTQAKHLSRLLGDQKHRKVTNITKLRVLNCLFHIVDDDVIYNLTDKRADHLRDEL
QLFVYLSKLDAANFKISISHLREADKLSVVHSILSSATHRHNPDTLKVAAEMCQEFGPAP
QDTWAVILQQLVALQEVSYLHQLLPNIFHIPAVSTLPCLTSVWQTCVTLPLVALTPPLDE
QQNEFVVSCYHFLVLSPLLHRMNLAYVAQQFESLQLYALALGKNVIHS

Nucleotide sequence

Length: 5,644

>KH2012:KH.L3.17.v1.A.SL1-1
GTTTCTTGAATAGGTTATGTTTGGTATTTAATATTGTTTAATAATGGCATCATTATATGA
TGTGCATCCTGTTATTGAGATTCCCTACCATCCAATATCTGTGTGTGATGCTATGCTCCC
ATCAAATGTCATAGCTGTACAATCCACACAACAAGATCTTGCAGTTTCTGGAAACAAAGA
AGTTACTCTGATAACCAAATACTCTTCCTGTACACAGACACTTAGTTTTGATAATGCAGT
TGAAGTTTTGTCCTGGAGCGATGATGGAAATTATTTAATTGTCGGAGCGTGTAACGGTCA
TCTTATAATTCTCTCAAAAGAAAATTCAAAAGAATTATTTAAAGAAGTTATTTCATCCAG
TTACAGCAATGTTGGGTTTAAAACAATCGACCCACATTTTTGTTCAGTTAATTTGACCAA
AATGTCCAACACAGATCTCTATGTTGCAAGTGCAGCAATGGAAACTGGTGATGTGTTTGT
CTTCCATAATATTCAATTATCTGCAAATCCAGACAAAGATGCAGACATAAAAGCAAACAT
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TAAAACTAACGAATCGATCAGTTTCATAACTGGGGGACATGGTTCTGATTTTCTTGTTGT
GTGGGAAGATATAAACAAACAGATGTTTAATGAAAATAAATCAGACACACAATATAGTGC
AGTTGATTTTGTTGAACACGATAATATAAGAGGTTTACCAAACAACTGGAATTGTGAAGG
TTTTAATAAATTCTTGGTTGTTGGTTCAATGCTGTTTGCCCTTGATAATTTGGTAAATGC
AAATGATGCAGTTGTGAAAATCAAAAGTGTCACTGAGACGTCACCAATAAGTCGTTTACT
ATTTCTATTGCAACAATGTGCTTATGAAAAGGCATTTTCCTTTGCAGAAGAATATAATTT
GGATTCTCAAATCATATACCAAAACAAGGTTGGCAATTTAGATAAATATAACCAGTGCCG
TGGCAAAGTATTTAGCGTGCCTGCCTCTAACCAAGACCAGAGAATAACAGATGCTGTGTA
CATAGGAGAACTATGTATGAGTGTTGCTCTTCCTGATTTGGAAATAACATACTCACTTCT
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GAAAATGATTCCTGATGATGTTGAAATGACATCGTTGATTGATTTCTTGAAACATTTCAA
GAAACTGAGTTCGATGCATCATGTAAACAAAGATCAATCTGACAAAGTTTCTCAACTTCG
ATTGTTGATTTCGCAACTGCAAGCTTTACAGAAACTACAAACCAAGTATACGTGTGATGT
TTCGTTAAAGGAATTCACCAAGGTAAAAAAAACACTATTTATTCATGTATTTTGGTGGAA
TAAATTATCGGAAGATTGTTTGAATATTCTTGACCAAAATGTTTCGCTCGCTGTGGAGTT
AGGAGAGCATGCTCTCAAATACACCATGTCTGTACTGGATGAAAGTGATTCTGTATTTAA
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CAGTGGGAAATGGGTTGGCCTTAACTTGGCGATTCCAAGGGAGTGGAATGAAGACATTGT
GCTTGTGAAGAACATTTATACATTACAGGTAAAACACAATGAAGTTTTATCATTGACCAA
ATACAAACTTGATTCATGTCGAGACAACATTTTGTCACAAAATCTGATGCATAATAGCGA
CTCACCAAATCAAAGTGCACGGATTTTGCCACATGTAAGTGACTTATCAATGGAATGTAA
GTCACAAACATACATCAAGCATGAAGCCGACCAAAGCAATATAAGTGACTCTGGTGATGG
AGATAAGAGGAATAATTCATTCACTTCATATGCAATGATGTTGGATTTGGCAAGATTACT
TGGCTACCCTCCATTCACAATTGAGTCTTCTGTGATCATCCACACAGCTGTAAATATGCA
GCAGCAACTTGCTATTCAACTTTCCCATGAATTGTTCAGTTACGCCCCAACAGCTAAAAC
TGCTGTTACCTTGTTACAAGTTTCGCAAATATTGCTCCAGCAAATAAAACAAGTTGATAC
CTATCCACAACTTCTTCTAGAAATCCAAAATCTTGTATCTTCTGCTGCATCATGCTGTGA
TCGAAATAAACTGATATCAATTCTCTCATTTATTGAAGTTTGTAACTTGGCTGTTGAATT
ACATCTAGCGTCTGATGCCAACGCAAAGTCATGCCTTGCTCAGTGCAAGAATGCGGCTCC
AAAAGTTCGTAAAAACAAATACGAGCACAGTGATTGGTTGCATGGCTGGTACAAGGAAGA
TGATGGTCTAACTTTAAAAAGTTCAGTTGTCATGCCAATGCTCAAACAATTCATCGGCTC
AATTATACAAACTGATGGTTTATCATTATGTTGCACCCAACCACAAGATATGCAATCTAC
GAGAAATAAGTTGGCAGTGTTATATGACGGGCTCATGAAAATATCTGTAGTTTTAAAAAA
CTCCCACCATTACATGCTTGCTCTACAGTGGATGATCAAGACAATACAAACCACAATTTC
TTTCATCTGTAACCACAGGGCTTTCTTTTATAAAACTGAGGAGTTAACTGCAATGAGTGG
ACTGTTAATGCACACCATTAAGAAGGGCATGGATGAACAGATACAACATACTGAAGTACT
CGTGGAAAAGGTGTTGCTTGCAGTAAAACCAGATGTCAACTTAGCAATTGGATTCCTCAT
GGCTGTTGGTGAAACTAGGTCTATGGGAGTGCTGGAAAATATTTGTCTATCAGCAGGGAA
TAATTACACAACTATCACAGCAACAGCAGAAGCTGGCTTGTATATTTCAAGGTTTCATGG
TTTGCTTTCCCATGTACCAAAGTACAGAATGTTGCTGCTTGATGCAAAGTGGGCATATAC
ATTCACATCACTCAAGATCCCTGTGGATGGCATACTCCAGTCTACTTTACAATGGAAACA
AGCATTCCTATTTAAATTAATCACTCATCCATTGATTACTGGAAGTTTGTTGAAAAGTTA
TTGCAAAGATTATAAAATGGACAGTGACAAAACACTCCTTCAGTACGTTGATTGTTTATT
GGGTGGAGATCTACAGAACAAACAGGATTTAAAAGCAATTAATTCCCCTAATTCATTGGC
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TGTGGACCAAGTTGCTGAGTTATACGATCAAGATGTTGCGAGACTCAGGTTAACAATGAC
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TGTAAACTTGGAAAGACTTCGTTCAACTTTAAAACAAGTATCTCAAGAAAATAAAGAAGA
AAAGACTTTAATTCAGTTATTGTATTTATTAACTTATGGAAACCCTTTAACACAAGCAAA
ACACTTGAGTCGATTGCTCGGTGATCAAAAGCATAGGAAAGTTACCAACATTACCAAACT
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TGCTGCCAACTTTAAGATATCAATTTCCCATCTGCGTGAAGCAGATAAATTATCCGTGGT
CCACAGTATATTATCATCTGCAACACATAGACACAACCCAGACACTCTTAAAGTTGCAGC
TGAGATGTGCCAAGAGTTTGGACCTGCCCCACAAGATACATGGGCAGTGATACTGCAACA
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ACCTGCTGTTTCTACACTACCATGCCTTACTTCTGTATGGCAGACATGCGTCACCCTTCC
ACTTGTTGCGTTGACCCCACCATTAGATGAACAGCAGAATGAATTTGTTGTATCTTGTTA
TCACTTTCTGGTCCTAAGTCCTCTTCTGCATCGAATGAACTTGGCGTATGTTGCTCAACA
ATTTGAATCACTTCAACTTTATGCGCTTGCTTTGGGTAAAAATGTCATACATTCTTGACG
CATTAAACTTCTAGTTGTTTTCCTTTGTTGTAAATTACAGGTTGTTTGCTTGCATCACCT
GCCAGCCATGATAGAGCACGAAAGTTAGTTGAGTTAAAAGGAACTGAAATAGAAGCACAG
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CTTTCCGCTAATAAGAAAACTTAGAATTGATTGGAGAAAAGTGTATTCACAAACATGGTG
TTTTTGAAAGTATTACTCGCTTTTGTTTCTTCCTTAAATACTTGGTTTAATATTGTTTGT
TCCAATAATGTGGTACCATTCATTTACACTTTTCCTGTAAATGGTGGTATATGGTATGAT
ATGTACTGTATGATATGGTGTCCGGTATGTTCTATTTTTGTATAAACTATTTTTTGTTGT
GTTT

InterProScan

SUPERFAMILY
WD40_repeat_dom_sf (IPR036322) - T[42-214] 1.42E-7
Pfam
RZZ-complex_KNTC1/ROD_C (IPR019527) - T[1225-1722] 8.5E-68

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
KNTC1_HUMAN 23.343 % 258 3.69E-69