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Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.L153.6.v1.A.nonSL2-1

Possible name(s)

COG4

Gene model

KH2012:KH.L153.6

Location

KhL153 [557,840 / 561,471]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 764

>KH.L153.6.v1.A.nonSL2-1
LLISKMESEWPSLDDIRQLTTSEEIEKAFKEVESSEQRYTNELNEQLENKSVLDERMDSL
NKMLPNLDLLHSDSKNLFGIIQFTYTLAENISSKVRLLDLAKSQVFKAIQRVDDVLDLKF
CTDGVKTAMESNDYEKAAANIHRYLCLDENVIKQTVHEGTESSSINASLKVLKEARVAMS
QVVAEQFDLAVLNNDLTGVERFFKIFPLLKMEDEGLDKFSHYLCQEIAKSSSENLKQALQ
IETGDTRYSLIFADVLTLLFEGIARTVEKQQPLVETYYGPGKLFVLIKNVQLECDKQTNV
VLQKFKEVRSFKGTVQRVQQSLFSSKKPENEQKVDPRDLEPLLTEVTIISSRTELYLRFI
KRRVQADIEIVFPTKEIKQERQKELQAWITNCELSHCIQEVIGYYIIMEEYYMRESIAKA
IQLDSFEPGNLTSSMIDDVFYILKQCIKRSMMSSSIDCVCAMLNHATSVLDGEFRDVLVN
QVKIGFPSGGMLDNISSAYTVMQSSFQHGKLQSVDEQSTATRQKFLCTLNNAEVASEHVQ
TLKHSLDAEVTKVFNQLTEQEMAKMESCLADLALLSTKFRNVLQSGLTDLSVSLIKPEIK
PLVSNFLSVSHNINEDDLTDYEANDPWVQEVIFNIQELLNKFQPVLSPNIYDQLISHLIN
EVVVQLEKAILKSTFNRLGALFFDKELRSLVSYLTSTSSWSVRDRFARMMQICTILNLDK
VSEIDDYWGHNAGSLTWRLTPAEVRQVLSLRPDFKSDEIRQLKL

Nucleotide sequence

Length: 3,631

>KH2012:KH.L153.6.v1.A.nonSL2-1
CGTATATTAGCTTCTAATCTCCAAAATGGAGTCGGAATGGCCGTCTTTAGACGACATTCG
CCAATTAACAACATCTGAAGAAATTGAAAAAGCGTTTAAAGAAGTTGAAAGCAGTGAACA
ACGATATACAAACGAATTAAATGAGCAACTCGAAAATAAATCTGTACTTGACGAACGAAT
GGATAGCTTGAACAAAATGCTGCCTAATTTAGACCTTCTACATTCTGACTCAAAAAACCT
CTTTGGGATAATTCAATTTACGTATACCTTAGCTGAAAACATAAGCTCAAAAGTACGTTT
ACTCGATTTAGCAAAATCGCAAGTTTTTAAAGCGATTCAAAGAGTAGACGACGTTTTGGA
CTTAAAATTTTGCACAGACGGTGTGAAAACTGCTATGGAGTCAAACGACTACGAAAAAGC
TGCAGCAAACATACACAGGTATTTGTGTTTAGACGAAAACGTTATAAAACAGACTGTACA
TGAAGGTACTGAAAGCTCAAGTATAAATGCTTCCCTAAAAGTGCTGAAGGAGGCCAGAGT
GGCTATGTCCCAGGTCGTAGCTGAACAGTTTGATCTTGCCGTGCTAAATAATGACCTTAC
TGGAGTTGAAAGATTTTTCAAAATTTTTCCGTTGCTAAAAATGGAAGACGAAGGCCTTGA
CAAATTTTCGCATTATTTGTGCCAAGAGATTGCTAAGAGTTCGAGTGAAAATTTAAAACA
AGCTTTGCAAATCGAGACTGGCGATACAAGGTATAGTTTAATTTTTGCCGATGTTTTGAC
CCTGCTTTTTGAAGGGATAGCTAGAACTGTAGAAAAGCAGCAACCGTTGGTAGAAACATA
TTATGGGCCGGGAAAATTATTCGTTTTGATCAAAAACGTCCAATTAGAGTGCGATAAACA
AACGAATGTGGTCCTGCAAAAGTTTAAAGAAGTACGCAGCTTTAAGGGTACTGTCCAAAG
GGTACAGCAATCGTTATTTTCAAGTAAAAAACCTGAAAATGAGCAAAAAGTTGACCCACG
AGACCTGGAGCCACTACTTACAGAAGTTACCATAATAAGTTCTCGAACAGAGCTTTATTT
ACGGTTTATAAAGCGAAGAGTCCAAGCTGATATAGAAATCGTTTTCCCCACGAAAGAAAT
TAAACAAGAGCGACAAAAAGAGTTGCAAGCGTGGATCACGAATTGTGAATTAAGCCATTG
TATACAAGAGGTCATAGGATACTATATTATAATGGAGGAATATTACATGCGTGAGTCCAT
AGCAAAAGCTATACAACTCGACAGTTTTGAGCCTGGGAATTTAACATCTAGCATGATAGA
TGATGTGTTTTATATATTAAAACAGTGCATTAAAAGGTCCATGATGAGTTCTTCGATAGA
TTGTGTTTGCGCTATGCTAAACCATGCGACTTCTGTTTTGGACGGTGAGTTCCGTGATGT
TTTGGTTAACCAAGTTAAAATCGGCTTCCCTTCTGGTGGAATGTTGGATAATATAAGTTC
CGCTTATACTGTGATGCAGTCGTCATTTCAGCACGGAAAACTACAAAGCGTGGACGAGCA
GAGCACCGCAACCAGGCAGAAGTTTCTCTGTACTCTAAACAATGCCGAAGTAGCTAGCGA
GCACGTACAGACACTAAAACACAGCTTAGACGCTGAAGTAACCAAGGTATTCAACCAGCT
TACAGAACAAGAAATGGCCAAAATGGAAAGCTGTCTTGCAGATTTAGCTTTGCTGTCCAC
GAAATTCAGGAACGTTTTACAAAGTGGTTTAACCGATTTAAGCGTCTCGCTCATAAAGCC
AGAAATTAAGCCATTAGTTTCAAATTTCTTATCCGTAAGTCATAATATAAATGAAGATGA
TCTAACAGATTACGAGGCCAACGACCCTTGGGTGCAAGAAGTTATTTTCAACATACAAGA
ACTCTTAAACAAATTCCAGCCAGTACTATCTCCTAATATATATGACCAACTGATCAGTCA
TTTAATAAATGAAGTAGTAGTGCAACTCGAAAAAGCTATTTTAAAAAGCACGTTTAACCG
TCTCGGAGCTCTCTTTTTTGACAAAGAACTGCGTTCTCTTGTGAGCTACTTAACTTCTAC
AAGCTCTTGGAGTGTTCGCGACCGTTTTGCAAGAATGATGCAGATATGTACCATTTTGAA
TTTGGATAAAGTATCAGAAATAGACGATTACTGGGGACACAACGCGGGTTCCCTAACATG
GCGTTTAACACCTGCAGAAGTCCGTCAAGTTCTGAGTTTGAGACCGGATTTTAAATCGGA
TGAAATTCGGCAACTAAAGCTTTAGTGTGCTAAGTTTTTCTATTTATTTATTCCGTAAAC
AGAAGTTTTATGTAAAATAATTTCAATATTATATAGTTTTGTGGGTCAGTGCTATTAGTA
TGTTCGGTTTTGTATAAACTGTTTGCATTTAAATTCAAAATCAAGTTATATAAATAGCTT
ACTTGAAGTCTACAGATCTCTTTGCGCCATTTAAAAAAAAATTTGTATCTTATAAAAATG
CATACGAAAACCTTTTCGTAAAGTAATATATATAATGTATATATATTGTTATTTGGTAAA
AGTTTAATATATATATATAAATTGTATGCAATACTGGTGCTTCTATAAATAAATATAGTA
GGCAGGGGGACGATGGGACACCTTTAGCACATAATATCCAAATATCCTGATCGTGTTTTA
AACAATTAACAACGGTCTTTTTGGGAGTTGTGAGGATGCGGTTTCACAATTCTTTGAATG
TTCTTTGTTTACTACCAAATGAAATGAGAAAATGGAAAAAAAGGGTGTCTCATTCCCCCC
ACCTTACTATATATATGTTACACATTTTACATAGTGGCCAAAATGTTTTAATACTAATAT
ATTGGTGTTATATACAAATGTATTGTATATTTGAAACCAAATACTTATAAACGGTTATTA
CTTCCTGTTATTTTCTTCTTTAAGGTCTGAATAATCCACTTTCTTAACAAGACATATTCA
CTCTTTTATAAATAGCAATCATATTATTAATGAGCATAAATTAGTAGTATTGTATTGAGA
CCCCCAAAAAATTAATTGACAACCCAATTAATCAAACAAAAACAACCGATTAGTTAAAAT
ACAATGACATAATGTTTTTTAAATATTCTTATGCCTTTTCTTATGCTACAATTTAAACTA
ATTATCACATTGGTGCATTAAAATCATATATGGAGTATTGTGGGGTAAGACGGGACACCT
TTAGCACATAATATCCAAATATCCTGATCCTGTTTTTAACAATTAACAACGGTCTATGGG
AATCGTGAGGATTCGGTTTTATAATTTTTGAAATATTTTTTGTTTACTATCAAATGGGCC
GGAAAAAAGAATAAAAGGTGTTCCATCTTCCCCAACCCTACTATATAGTAGTTTAAAGTT
CATTTATCCAGTGGCAGTGTCCATTAGTTACTAGATTTTTTCCCGCTCTATATTTAAATA
ATTCCAATTCGGAAACCCAATGTTATATTCAATATATGTCTGTGTACAAAATATTTTGCA
TTGATACCTACACATATTTAAGAATACTGAATGCCTTGTTTATAAATGTCTGTTTAAGTG
TAGTTTTTCATACTCGAAATTGTATTACCAG

InterProScan

Pfam
COG_su4 (IPR013167) - T[172-480] 7.2E-93
SMART
COG_su4 (IPR013167) - T[172-483] 1.7E-97

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
COG4_HUMAN 52.312 % 823 0