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  1. Transcript 'Phmamm.CG.MTP2014.S3...'
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  5. Transcript 'KH2012:KH.L153.6.v1....'

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.L153.6.v1.A.ND1-1

Possible name(s)

COG4

Location

KhL153 [557,768 / 561,471]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 764

>KH.L153.6.v1.A.ND1-1
LLISKMESEWPSLDDIRQLTTSEEIEKAFKEVESSEQRYTNELNEQLENKSVLDERMDSL
NKMLPNLDLLHSDSKNLFGIIQFTYTLAENISSKVRLLDLAKSQVFKAIQRVDDVLDLKF
CTDGVKTAMESNDYEKAAANIHRYLCLDENVIKQTVHEGTESSSINASLKVLKEARVAMS
QVVAEQFDLAVLNNDLTGVERFFKIFPLLKMEDEGLDKFSHYLCQEIAKSSSENLKQALQ
IETGDTRYSLIFADVLTLLFEGIARTVEKQQPLVETYYGPGKLFVLIKNVQLECDKQTNV
VLQKFKEVRSFKGTVQRVQQSLFSSKKPENEQKVDPRDLEPLLTEVTIISSRTELYLRFI
KRRVQADIEIVFPTKEIKQERQKELQAWITNCELSHCIQEVIGYYIIMEEYYMRESIAKA
IQLDSFEPGNLTSSMIDDVFYILKQCIKRSMMSSSIDCVCAMLNHATSVLDGEFRDVLVN
QVKIGFPSGGMLDNISSAYTVMQSSFQHGKLQSVDEQSTATRQKFLCTLNNAEVASEHVQ
TLKHSLDAEVTKVFNQLTEQEMAKMESCLADLALLSTKFRNVLQSGLTDLSVSLIKPEIK
PLVSNFLSVSHNINEDDLTDYEANDPWVQEVIFNIQELLNKFQPVLSPNIYDQLISHLIN
EVVVQLEKAILKSTFNRLGALFFDKELRSLVSYLTSTSSWSVRDRFARMMQICTILNLDK
VSEIDDYWGHNAGSLTWRLTPAEVRQVLSLRPDFKSDEIRQLKL

Nucleotide sequence

Length: 3,703

>KH2012:KH.L153.6.v1.A.ND1-1
AATTTTGACAAAATTCATTAATAAGTTTCGTATTGAATCTTGTGACTTAGATTTTTTGTG
GTTTATTGTTGTCGTATATTAGCTTCTAATCTCCAAAATGGAGTCGGAATGGCCGTCTTT
AGACGACATTCGCCAATTAACAACATCTGAAGAAATTGAAAAAGCGTTTAAAGAAGTTGA
AAGCAGTGAACAACGATATACAAACGAATTAAATGAGCAACTCGAAAATAAATCTGTACT
TGACGAACGAATGGATAGCTTGAACAAAATGCTGCCTAATTTAGACCTTCTACATTCTGA
CTCAAAAAACCTCTTTGGGATAATTCAATTTACGTATACCTTAGCTGAAAACATAAGCTC
AAAAGTACGTTTACTCGATTTAGCAAAATCGCAAGTTTTTAAAGCGATTCAAAGAGTAGA
CGACGTTTTGGACTTAAAATTTTGCACAGACGGTGTGAAAACTGCTATGGAGTCAAACGA
CTACGAAAAAGCTGCAGCAAACATACACAGGTATTTGTGTTTAGACGAAAACGTTATAAA
ACAGACTGTACATGAAGGTACTGAAAGCTCAAGTATAAATGCTTCCCTAAAAGTGCTGAA
GGAGGCCAGAGTGGCTATGTCCCAGGTCGTAGCTGAACAGTTTGATCTTGCCGTGCTAAA
TAATGACCTTACTGGAGTTGAAAGATTTTTCAAAATTTTTCCGTTGCTAAAAATGGAAGA
CGAAGGCCTTGACAAATTTTCGCATTATTTGTGCCAAGAGATTGCTAAGAGTTCGAGTGA
AAATTTAAAACAAGCTTTGCAAATCGAGACTGGCGATACAAGGTATAGTTTAATTTTTGC
CGATGTTTTGACCCTGCTTTTTGAAGGGATAGCTAGAACTGTAGAAAAGCAGCAACCGTT
GGTAGAAACATATTATGGGCCGGGAAAATTATTCGTTTTGATCAAAAACGTCCAATTAGA
GTGCGATAAACAAACGAATGTGGTCCTGCAAAAGTTTAAAGAAGTACGCAGCTTTAAGGG
TACTGTCCAAAGGGTACAGCAATCGTTATTTTCAAGTAAAAAACCTGAAAATGAGCAAAA
AGTTGACCCACGAGACCTGGAGCCACTACTTACAGAAGTTACCATAATAAGTTCTCGAAC
AGAGCTTTATTTACGGTTTATAAAGCGAAGAGTCCAAGCTGATATAGAAATCGTTTTCCC
CACGAAAGAAATTAAACAAGAGCGACAAAAAGAGTTGCAAGCGTGGATCACGAATTGTGA
ATTAAGCCATTGTATACAAGAGGTCATAGGATACTATATTATAATGGAGGAATATTACAT
GCGTGAGTCCATAGCAAAAGCTATACAACTCGACAGTTTTGAGCCTGGGAATTTAACATC
TAGCATGATAGATGATGTGTTTTATATATTAAAACAGTGCATTAAAAGGTCCATGATGAG
TTCTTCGATAGATTGTGTTTGCGCTATGCTAAACCATGCGACTTCTGTTTTGGACGGTGA
GTTCCGTGATGTTTTGGTTAACCAAGTTAAAATCGGCTTCCCTTCTGGTGGAATGTTGGA
TAATATAAGTTCCGCTTATACTGTGATGCAGTCGTCATTTCAGCACGGAAAACTACAAAG
CGTGGACGAGCAGAGCACCGCAACCAGGCAGAAGTTTCTCTGTACTCTAAACAATGCCGA
AGTAGCTAGCGAGCACGTACAGACACTAAAACACAGCTTAGACGCTGAAGTAACCAAGGT
ATTCAACCAGCTTACAGAACAAGAAATGGCCAAAATGGAAAGCTGTCTTGCAGATTTAGC
TTTGCTGTCCACGAAATTCAGGAACGTTTTACAAAGTGGTTTAACCGATTTAAGCGTCTC
GCTCATAAAGCCAGAAATTAAGCCATTAGTTTCAAATTTCTTATCCGTAAGTCATAATAT
AAATGAAGATGATCTAACAGATTACGAGGCCAACGACCCTTGGGTGCAAGAAGTTATTTT
CAACATACAAGAACTCTTAAACAAATTCCAGCCAGTACTATCTCCTAATATATATGACCA
ACTGATCAGTCATTTAATAAATGAAGTAGTAGTGCAACTCGAAAAAGCTATTTTAAAAAG
CACGTTTAACCGTCTCGGAGCTCTCTTTTTTGACAAAGAACTGCGTTCTCTTGTGAGCTA
CTTAACTTCTACAAGCTCTTGGAGTGTTCGCGACCGTTTTGCAAGAATGATGCAGATATG
TACCATTTTGAATTTGGATAAAGTATCAGAAATAGACGATTACTGGGGACACAACGCGGG
TTCCCTAACATGGCGTTTAACACCTGCAGAAGTCCGTCAAGTTCTGAGTTTGAGACCGGA
TTTTAAATCGGATGAAATTCGGCAACTAAAGCTTTAGTGTGCTAAGTTTTTCTATTTATT
TATTCCGTAAACAGAAGTTTTATGTAAAATAATTTCAATATTATATAGTTTTGTGGGTCA
GTGCTATTAGTATGTTCGGTTTTGTATAAACTGTTTGCATTTAAATTCAAAATCAAGTTA
TATAAATAGCTTACTTGAAGTCTACAGATCTCTTTGCGCCATTTAAAAAAAAATTTGTAT
CTTATAAAAATGCATACGAAAACCTTTTCGTAAAGTAATATATATAATGTATATATATTG
TTATTTGGTAAAAGTTTAATATATATATATAAATTGTATGCAATACTGGTGCTTCTATAA
ATAAATATAGTAGGCAGGGGGACGATGGGACACCTTTAGCACATAATATCCAAATATCCT
GATCGTGTTTTAAACAATTAACAACGGTCTTTTTGGGAGTTGTGAGGATGCGGTTTCACA
ATTCTTTGAATGTTCTTTGTTTACTACCAAATGAAATGAGAAAATGGAAAAAAAGGGTGT
CTCATTCCCCCCACCTTACTATATATATGTTACACATTTTACATAGTGGCCAAAATGTTT
TAATACTAATATATTGGTGTTATATACAAATGTATTGTATATTTGAAACCAAATACTTAT
AAACGGTTATTACTTCCTGTTATTTTCTTCTTTAAGGTCTGAATAATCCACTTTCTTAAC
AAGACATATTCACTCTTTTATAAATAGCAATCATATTATTAATGAGCATAAATTAGTAGT
ATTGTATTGAGACCCCCAAAAAATTAATTGACAACCCAATTAATCAAACAAAAACAACCG
ATTAGTTAAAATACAATGACATAATGTTTTTTAAATATTCTTATGCCTTTTCTTATGCTA
CAATTTAAACTAATTATCACATTGGTGCATTAAAATCATATATGGAGTATTGTGGGGTAA
GACGGGACACCTTTAGCACATAATATCCAAATATCCTGATCCTGTTTTTAACAATTAACA
ACGGTCTATGGGAATCGTGAGGATTCGGTTTTATAATTTTTGAAATATTTTTTGTTTACT
ATCAAATGGGCCGGAAAAAAGAATAAAAGGTGTTCCATCTTCCCCAACCCTACTATATAG
TAGTTTAAAGTTCATTTATCCAGTGGCAGTGTCCATTAGTTACTAGATTTTTTCCCGCTC
TATATTTAAATAATTCCAATTCGGAAACCCAATGTTATATTCAATATATGTCTGTGTACA
AAATATTTTGCATTGATACCTACACATATTTAAGAATACTGAATGCCTTGTTTATAAATG
TCTGTTTAAGTGTAGTTTTTCATACTCGAAATTGTATTACCAG

InterProScan

Pfam
COG_su4 (IPR013167) - T[172-480] 7.2E-93
SMART
COG_su4 (IPR013167) - T[172-483] 1.7E-97

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
COG4_HUMAN 52.312 % 823 0