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  1. Transcript 'KH2012:KH.C8.512.v5....'

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C8.512.v5.A.SL2-2

Possible name(s)

SMYD1; SMYD3; SMYD5

Location

KhC8 [1,944,318 / 1,948,071]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 338

>KH.C8.512.v5.A.SL2-2
TIYIFNFPTEPWTQACDYCMKSLETTEEMCKRLAQNPGLKLPYHECCESNPVTYVHCQNE
IYCSMECREKAYNEFHKILCPSSDLIDRNALEILDETWRGCHYPPETASIQMIIRILARI
KQEEKKEEFISDIEKFCHASTNDVEQIAHKLLGEQFLVQLTTLREQLASVFFDESVQHWF
TDDGFKNLFALLGTNQQGVGTSALSVWVHNCDELDLNPQDKEELDNLIDGLYEELENVAG
SFLNCEGAGLYRIQSKCNHSCEPNAEVCFPNNNHRLAVKACRDIAAGEEITISYLSQCQI
ARGCRSRQQYLKENYLFHCCCSKCSEQTDEESSSDMED

Nucleotide sequence

Length: 1,810

>KH2012:KH.C8.512.v5.A.SL2-2
TTCAATTGTAGTTTTTCAAATTAAACTGCTGCTCTAAATTTGGTCATGACTTGGTGCATC
AGACACATAGATAACGTGAAGGGCTTTGGTTTGTTTTCCACTGAAGATATCAGTAGTGAT
TCTGTAATACTGGAAGAAGATCCAATTATTAGTTGTCAATTTTCATGGAATAAGCTATAC
AAGTACAGGGTGCCTATTTATTTCTTATCTTGAAAATTTGAAATATATTATTGTCAAACC
TAGTGAGTCATTTTCACATGACTGCAACTAAAAGTACACTAAAACTAGGTTTTTCATTTT
TTTAATAAAATGTTTATGGTTATTATCTGAACTGCTATTATGTCATATTTAGAGCACTGC
TTTATCAACTCTCATAAACCATTAAAACTGGTAATTTTTGGTTGTATAAATAACTCAGTT
CATTGATACACATAGAAACTATAAAGTAAAATTCAGTTTATTGGAATTATTTCGAATTGG
GTTTAATGATCATTAAACTATTTACATTTTTAATTTTCCAACTGAACCTTGGACCCAGGC
ATGCGATTATTGCATGAAGTCACTGGAGACCACAGAGGAAATGTGCAAACGTTTAGCTCA
AAATCCTGGGTTAAAACTTCCATATCATGAATGCTGTGAATCAAATCCTGTTACATATGT
ACACTGCCAAAATGAAATTTACTGTTCGATGGAATGTAGAGAGAAAGCTTACAACGAGTT
CCATAAAATATTGTGTCCATCATCTGACCTAATTGATCGAAATGCTCTTGAAATTCTTGA
TGAAACTTGGAGAGGATGTCATTATCCTCCAGAGACAGCTTCAATACAAATGATCATACG
TATTCTTGCAAGAATTAAGCAGGAAGAAAAAAAAGAAGAGTTTATTTCTGATATTGAAAA
ATTCTGTCATGCCAGCACTAATGATGTGGAACAAATTGCTCATAAATTGCTTGGAGAGCA
GTTCTTAGTTCAGTTAACAACTTTGCGGGAACAACTAGCATCTGTGTTTTTTGATGAGTC
TGTCCAACATTGGTTCACCGATGATGGTTTCAAAAATCTATTTGCTCTGCTTGGTACCAA
CCAGCAAGGTGTTGGTACAAGTGCTCTCAGTGTATGGGTGCACAATTGTGATGAGTTAGA
TTTAAATCCACAGGACAAGGAAGAATTAGACAACTTGATTGATGGTTTGTATGAGGAATT
AGAAAATGTTGCTGGGTCATTTTTGAACTGTGAAGGTGCTGGTTTATATAGAATACAAAG
CAAATGCAATCATAGCTGTGAGCCAAATGCTGAAGTCTGTTTTCCAAACAATAACCACAG
GCTTGCAGTGAAAGCTTGTAGAGACATAGCAGCAGGTGAAGAAATAACGATTTCATATTT
AAGCCAGTGTCAAATTGCTCGAGGTTGTCGCTCAAGACAACAATATCTGAAAGAAAACTA
TTTATTCCACTGCTGCTGCTCTAAGTGTTCAGAACAAACAGATGAAGAATCAAGTTCTGA
TATGGAGGATTGACTGTGGTAGTTGGTCTTGAGTGCAGAAATAAAACAAATTCGAGAAAT
TGTCCTAATACTTGGTTATGTAGGTTGCGTTACTTTGGTCAAAGTAAATCTACAGCTGGT
TTTTAAGTTCTTTGGCTTGGTTGGTGTTTTTTACACAAAACTATTTCTCCAATTTTGGAT
ATACTGTTGAAGTAATTGTATGTGTGAATACTGAACATAAGGGTTTTTCTGACAAAGACA
AAACACAGTTTGTTTTCTAACTTTATTTTACATGTTATAAAAGTCGTAAAAAAGGAGCAA
AAAAAAGAAA

InterProScan

ProSiteProfiles
SET_dom (IPR001214) - T[165-295] 13.901
Pfam
SET_dom (IPR001214) - T[228-294] 3.9E-12

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
SMYD5_HUMAN 49.844 % 322 1.64E-108