Aniseed - Transcript Card

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C7.389.v1.A.SL1-1

Possible name(s)

ARMC7

Gene model

KH2012:KH.C7.389

Location

KhC7 [4,285,607 / 4,288,446]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 177

>KH.C7.389.v1.A.SL1-1
IMFSSRQRLKNRTTPKDLNRFDYLQALVTEFQDTEDADARLQVLANLSNFAYDPINFEYL
RKLQVPELFLDCIDDDEDLAGRTVQFGIAGICNLVSDPKNRDIVLAHDTGVQCIFRCLSS
PEIETKLAAITTLIQLVIPASRDRIVTSHVLDCMRNFAHSSDSRLRNLAQVFIEDYG

Nucleotide sequence

Length: 1,893

>KH2012:KH.C7.389.v1.A.SL1-1
AATTGTTTAGAATACTTTTAATAAATATTTGTAATGGGAATAGATTGGGTTTCTGTTGCA
TATGCAGCTTCAATAGCAGCTGGTGGAATATCTGGATACTTGAAAGCTGGAAGCACAGCC
TCCCTTGGAGCTGGTCTATTATTTGGTGGATTAGCAGGAATAGGAGCTTACAGATCCTCT
GTAGATTCCTCAGATTTGTGGCTTTCACTGGGTGTCTCTCTTTCCCTTGGTGGTTTGATG
GGCTTTAGGTTTTACGGCAGTAGGAAGTTTATGCCGGCTGGACTTGTAGCTCTTCTAAGT
GTTGGAATGGTCGCACGGTGTGCTTATAACCTGAGAAACGCTCCTGTTAAAAACGAATAA
CCAATTCTTGCAGTTTTTTGAACTTCTAATTTTCCCTTTTTTTATTCCCCCCTTTGAATC
ATGTTCTCATCTCGGCAAAGACTTAAAAATCGGACGACGCCAAAAGACTTGAACCGTTTC
GATTACTTGCAAGCGTTAGTTACTGAATTCCAAGACACAGAGGACGCTGACGCACGCCTA
CAAGTTCTTGCAAATCTTTCAAACTTTGCTTACGATCCTATTAACTTTGAATACCTTAGA
AAACTTCAGGTACCTGAGCTCTTTTTGGACTGTATAGACGATGATGAAGATCTGGCAGGT
CGTACGGTACAGTTCGGTATTGCGGGCATATGTAACCTTGTATCTGACCCTAAGAACAGG
GACATTGTACTGGCCCACGATACTGGAGTACAGTGTATCTTCCGCTGTCTGTCTAGTCCT
GAGATTGAGACCAAATTAGCTGCCATTACAACGCTTATTCAGTTAGTTATTCCGGCCTCG
CGTGACCGCATTGTGACATCGCATGTTCTTGATTGTATGCGTAACTTTGCGCATTCGAGT
GATTCTCGTCTGAGGAATTTAGCTCAGGTTTTCATAGAAGATTATGGATAAATTATACAA
CTCAACAAATGTTTCATTTTAAAACATGATGGTCATTGGAAATTATGGCTAATTCATACA
ACTTAATAAATTTTCCCAAACGTAGTTTGCACAATTGTAAATGTATTTTAGCCTCGCATG
ATTAACGAAGTTATAACACGGATGTTTCGATGCATAATTTTTGTGCGCGCTTGCAAGTTA
TCACATATGTAACTTAGTGGGTGATTTCTTTTTCTACACACCGGAATATTGATCACGCAA
AGAAATATGCAACACGGTTTGAAAACACTGAAGTTATATTATTATCTTTACAGTGACAGT
ATTTAGACAGCAGGGCGTTTATTTAAAAACAGTAGAGTACCACAAATATGCTCTGTACGA
CGTTTTGCTATCTCTGAGTAAATATCGGGAAAATGAGAACTTTGCAACTGATACTATACA
TTATAACCTGTTTTCAATTCCTAAGATTTCAAAATGTGCTACAAGGTTTGAAAACACTGA
AATTATATCGAAACCGGCATCGTAGACTGTATAGCAAGTTGGGGGAAAATGGGACACTAT
TTTATTTTTCTGTCCCATTGGTTAGTAAAGAAAGAATTATAAACCATATCCTAACGTCTC
CCATAAACTGTTGTTAATTGTTTAAAACGTGATCAGGATATTCGGATATTATGTGCTATA
AAGTTGTCCCATCTCACCCCACAGAGCTATGTATTAATTTGGGATTTTTAAACTCAATAA
CGAGTTAATATTTTGGCAACTTGGGCAAAGTAGTGAAGTAGTTTCGCCAATGCACCCAAG
GGTATCCGTTGTTGCATTCCTTTGTTGCCAACGATTGTGTGTTCTTTGTGCGCGGTGTCC
AATACATTATATAGAAATTACACATTTCGTCTGTATGTTTACTCCCTGTCATTGTGACGC
GGTTCCGAAAGTTGTGCATCACGCACCTTGAAG

InterProScan

Gene3D	ARM-like (IPR011989) - T[10-176] 2.0E-12
SUPERFAMILY	ARM-type_fold (IPR016024) - T[20-169] 1.66E-16

Best Blast Hits in UniProt

Protein Name	Identity	Bit Score	e-value
ARMC7_HUMAN	50.932 %	159	7.1E-50