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Transcript 'KH2012:KH.C3.642.v1....'

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C3.642.v1.A.SL3-1

Possible name(s)

CTBS

Gene model

KH2012:KH.C3.642

Location

KhC3 [1,937,445 / 1,938,895]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 265

>KH.C3.642.v1.A.SL3-1
PLFRKQVLTGWINKMQSLKLDGLNIDIEGAAYTTDIVDGISALTNETNIALKSLNPSYLL
TWDVPYSPILVGCFSGYCFDYVAISKSTDYMIVMDYDATIDILFASANSPLWLLKESYNL
YLHNFSINPNQLVMAVPWYGYDYTCSKFFNHTDHNLCLIAGAPNSQRAFADINQKFIQNQ
GGLKWDTRSSTPFFTTLTDGVYHQFWYDNVQSLKIKYELAFALNLRGIGMWTADELNYTS
TDATVMKQTKDMWDTLSEYLEKMKK

Nucleotide sequence

Length: 1,424

>KH2012:KH.C3.642.v1.A.SL3-1
CCTTTATTTAGAAAGCAAGTTTTGACTGGATGGATCAACAAGATGCAAAGTTTAAAATTG
GATGGTCTCAACATTGATATAGAAGGTGCAGCTTATACTACGGATATAGTGGATGGCATA
TCTGCCCTGACAAATGAAACAAACATAGCTCTAAAGAGTTTAAACCCAAGTTATCTTCTC
ACATGGGATGTTCCCTACTCTCCTATACTCGTTGGTTGTTTCTCTGGTTATTGTTTTGAT
TATGTAGCAATTTCCAAATCAACAGACTACATGATAGTAATGGATTATGATGCAACAATC
GATATTTTATTTGCGAGTGCCAACAGTCCACTGTGGTTATTAAAAGAATCTTATAATTTG
TACCTGCACAATTTTTCCATTAACCCAAACCAACTTGTAATGGCGGTTCCATGGTATGGT
TACGACTACACATGTAGTAAATTTTTTAATCACACTGACCACAACTTATGTCTTATTGCT
GGAGCCCCGAATTCTCAGCGTGCATTTGCCGATATCAATCAAAAATTTATCCAAAATCAA
GGTGGACTAAAGTGGGATACACGTTCTTCTACTCCTTTCTTTACCACTTTAACTGATGGA
GTTTACCATCAGTTCTGGTACGACAACGTGCAAAGCTTAAAAATAAAATATGAGCTAGCA
TTTGCACTGAACCTCAGGGGAATTGGAATGTGGACAGCTGATGAATTAAACTACACATCC
ACTGATGCGACTGTCATGAAACAGACCAAGGACATGTGGGATACATTGTCAGAGTATCTG
GAGAAAATGAAAAAATAAACACTATGTGATCATTATATTTATACGATACCTTTATACTAT
GCAGATCTGTCCTTATGCCATTTTATATGATTAAGTACTTAGTACTACTATTTGAGTGCA
TTAATAATTACAAACATGTTATTTCATTCATTCTTTCTTTTGCATCGAAATGTTATTAAC
CATAACAAGTCAACTTTATATGTGAAAATAATTTACTTAGTTGATCACAGAATCAATGTT
TACTTGTGAATTATCCCCTCATTCCTCATACAGTTTTTGTTGTATTTTAAAGCATTTGCC
TTCATTAGTGTTAAGTTATGCTATAATATTGTTGAACTAAACCAAAGCAATTTATATATA
ATATTGCAGAAACATTTGATTTAGACTGTTGTATTTATCACACCACTATGCATGTACTAA
TCTTTTCTATTTTGGGCTTTCAAAATTTGTGCTTATAATAGTATAACAGCAGTCCCTTGG
ACCCTTGAATATATTTTGGTAGCAATTTGATTATAACAACTACACTATTTGTTTTTTTCT
CCAATTAATCTGACATCATTTTATTTTGTTTAATTATAAAATTCTGTCATTAAGAATAAT
TGAAATAAAATTTTATGCAGTTGAACATCGTTTTAAAGTTTTAG

InterProScan

Pfam	Glyco_hydro18_cat (IPR001223) - T[4-234] 6.2E-21
SUPERFAMILY	Glycoside_hydrolase_SF (IPR017853) - T[4-147] 1.08E-24 - T[216-239] 1.08E-24
ProSitePatterns	Glyco_hydro_18_chit_AS (IPR001579) - T[20-28] .

Best Blast Hits in UniProt

Protein Name	Identity	Bit Score	e-value
DIAC_HUMAN	36 %	149	1.56E-42