Aniseed - Transcript Card

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C3.642.v1.A.SL2-1

Possible name(s)

CTBS

Gene model

KH2012:KH.C3.642

Location

KhC3 [1,937,445 / 1,938,898]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 266

>KH.C3.642.v1.A.SL2-1
QPLFRKQVLTGWINKMQSLKLDGLNIDIEGAAYTTDIVDGISALTNETNIALKSLNPSYL
LTWDVPYSPILVGCFSGYCFDYVAISKSTDYMIVMDYDATIDILFASANSPLWLLKESYN
LYLHNFSINPNQLVMAVPWYGYDYTCSKFFNHTDHNLCLIAGAPNSQRAFADINQKFIQN
QGGLKWDTRSSTPFFTTLTDGVYHQFWYDNVQSLKIKYELAFALNLRGIGMWTADELNYT
STDATVMKQTKDMWDTLSEYLEKMKK

Nucleotide sequence

Length: 1,427

>KH2012:KH.C3.642.v1.A.SL2-1
CAGCCTTTATTTAGAAAGCAAGTTTTGACTGGATGGATCAACAAGATGCAAAGTTTAAAA
TTGGATGGTCTCAACATTGATATAGAAGGTGCAGCTTATACTACGGATATAGTGGATGGC
ATATCTGCCCTGACAAATGAAACAAACATAGCTCTAAAGAGTTTAAACCCAAGTTATCTT
CTCACATGGGATGTTCCCTACTCTCCTATACTCGTTGGTTGTTTCTCTGGTTATTGTTTT
GATTATGTAGCAATTTCCAAATCAACAGACTACATGATAGTAATGGATTATGATGCAACA
ATCGATATTTTATTTGCGAGTGCCAACAGTCCACTGTGGTTATTAAAAGAATCTTATAAT
TTGTACCTGCACAATTTTTCCATTAACCCAAACCAACTTGTAATGGCGGTTCCATGGTAT
GGTTACGACTACACATGTAGTAAATTTTTTAATCACACTGACCACAACTTATGTCTTATT
GCTGGAGCCCCGAATTCTCAGCGTGCATTTGCCGATATCAATCAAAAATTTATCCAAAAT
CAAGGTGGACTAAAGTGGGATACACGTTCTTCTACTCCTTTCTTTACCACTTTAACTGAT
GGAGTTTACCATCAGTTCTGGTACGACAACGTGCAAAGCTTAAAAATAAAATATGAGCTA
GCATTTGCACTGAACCTCAGGGGAATTGGAATGTGGACAGCTGATGAATTAAACTACACA
TCCACTGATGCGACTGTCATGAAACAGACCAAGGACATGTGGGATACATTGTCAGAGTAT
CTGGAGAAAATGAAAAAATAAACACTATGTGATCATTATATTTATACGATACCTTTATAC
TATGCAGATCTGTCCTTATGCCATTTTATATGATTAAGTACTTAGTACTACTATTTGAGT
GCATTAATAATTACAAACATGTTATTTCATTCATTCTTTCTTTTGCATCGAAATGTTATT
AACCATAACAAGTCAACTTTATATGTGAAAATAATTTACTTAGTTGATCACAGAATCAAT
GTTTACTTGTGAATTATCCCCTCATTCCTCATACAGTTTTTGTTGTATTTTAAAGCATTT
GCCTTCATTAGTGTTAAGTTATGCTATAATATTGTTGAACTAAACCAAAGCAATTTATAT
ATAATATTGCAGAAACATTTGATTTAGACTGTTGTATTTATCACACCACTATGCATGTAC
TAATCTTTTCTATTTTGGGCTTTCAAAATTTGTGCTTATAATAGTATAACAGCAGTCCCT
TGGACCCTTGAATATATTTTGGTAGCAATTTGATTATAACAACTACACTATTTGTTTTTT
TCTCCAATTAATCTGACATCATTTTATTTTGTTTAATTATAAAATTCTGTCATTAAGAAT
AATTGAAATAAAATTTTATGCAGTTGAACATCGTTTTAAAGTTTTAG

InterProScan

Pfam	Glyco_hydro18_cat (IPR001223) - T[5-235] 5.5E-21
SUPERFAMILY	Glycoside_hydrolase_SF (IPR017853) - T[5-148] 8.78E-25 - T[217-240] 8.78E-25
ProSitePatterns	Glyco_hydro_18_chit_AS (IPR001579) - T[21-29] .

Best Blast Hits in UniProt

Protein Name	Identity	Bit Score	e-value
DIAC_HUMAN	36 %	149	1.3E-42