- Transcript 'KH2012:KH.C3.642.v1....'
Transcript Model
Transcript Id
KH2012:KH.C3.642.v1.A.SL1-1
Possible name(s)
CTBS
Gene model
Location
KhC3 [1,937,445 / 1,939,233]
Amino acid sequence
Length: 373
>KH.C3.642.v1.A.SL1-1
KESNMLRFAACLYGLLMLVLYADAYSDCFCKDPNMCKPVTKKYEKELVVFSSAKDNTWTQ
YNWTQITNVILTGTHELYKELYCYAHSKGVRVTILVGLSVNDFPKLQQPLFRKQVLTGWI
NKMQSLKLDGLNIDIEGAAYTTDIVDGISALTNETNIALKSLNPSYLLTWDVPYSPILVG
CFSGYCFDYVAISKSTDYMIVMDYDATIDILFASANSPLWLLKESYNLYLHNFSINPNQL
VMAVPWYGYDYTCSKFFNHTDHNLCLIAGAPNSQRAFADINQKFIQNQGGLKWDTRSSTP
FFTTLTDGVYHQFWYDNVQSLKIKYELAFALNLRGIGMWTADELNYTSTDATVMKQTKDM
WDTLSEYLEKMKK
Nucleotide sequence
Length: 1,762
>KH2012:KH.C3.642.v1.A.SL1-1
GTTAAAAAGTGTAAAAAGAATCTAATATGTTAAGATTTGCTGCATGCTTGTATGGTTTGC
TTATGCTGGTGCTGTATGCTGATGCATATAGTGACTGTTTCTGCAAAGACCCCAATATGT
GTAAACCAGTCACAAAAAAATATGAAAAAGAACTAGTGGTATTTTCCTCCGCAAAAGATA
ACACTTGGACACAATATAACTGGACGCAAATTACAAATGTAATTCTGACTGGCACTCATG
AATTATACAAGGAGCTGTACTGTTATGCACACAGTAAGGGTGTTCGTGTGACCATTCTGG
TCGGTTTATCAGTTAATGATTTTCCCAAACTTCAGCAGCCTTTATTTAGAAAGCAAGTTT
TGACTGGATGGATCAACAAGATGCAAAGTTTAAAATTGGATGGTCTCAACATTGATATAG
AAGGTGCAGCTTATACTACGGATATAGTGGATGGCATATCTGCCCTGACAAATGAAACAA
ACATAGCTCTAAAGAGTTTAAACCCAAGTTATCTTCTCACATGGGATGTTCCCTACTCTC
CTATACTCGTTGGTTGTTTCTCTGGTTATTGTTTTGATTATGTAGCAATTTCCAAATCAA
CAGACTACATGATAGTAATGGATTATGATGCAACAATCGATATTTTATTTGCGAGTGCCA
ACAGTCCACTGTGGTTATTAAAAGAATCTTATAATTTGTACCTGCACAATTTTTCCATTA
ACCCAAACCAACTTGTAATGGCGGTTCCATGGTATGGTTACGACTACACATGTAGTAAAT
TTTTTAATCACACTGACCACAACTTATGTCTTATTGCTGGAGCCCCGAATTCTCAGCGTG
CATTTGCCGATATCAATCAAAAATTTATCCAAAATCAAGGTGGACTAAAGTGGGATACAC
GTTCTTCTACTCCTTTCTTTACCACTTTAACTGATGGAGTTTACCATCAGTTCTGGTACG
ACAACGTGCAAAGCTTAAAAATAAAATATGAGCTAGCATTTGCACTGAACCTCAGGGGAA
TTGGAATGTGGACAGCTGATGAATTAAACTACACATCCACTGATGCGACTGTCATGAAAC
AGACCAAGGACATGTGGGATACATTGTCAGAGTATCTGGAGAAAATGAAAAAATAAACAC
TATGTGATCATTATATTTATACGATACCTTTATACTATGCAGATCTGTCCTTATGCCATT
TTATATGATTAAGTACTTAGTACTACTATTTGAGTGCATTAATAATTACAAACATGTTAT
TTCATTCATTCTTTCTTTTGCATCGAAATGTTATTAACCATAACAAGTCAACTTTATATG
TGAAAATAATTTACTTAGTTGATCACAGAATCAATGTTTACTTGTGAATTATCCCCTCAT
TCCTCATACAGTTTTTGTTGTATTTTAAAGCATTTGCCTTCATTAGTGTTAAGTTATGCT
ATAATATTGTTGAACTAAACCAAAGCAATTTATATATAATATTGCAGAAACATTTGATTT
AGACTGTTGTATTTATCACACCACTATGCATGTACTAATCTTTTCTATTTTGGGCTTTCA
AAATTTGTGCTTATAATAGTATAACAGCAGTCCCTTGGACCCTTGAATATATTTTGGTAG
CAATTTGATTATAACAACTACACTATTTGTTTTTTTCTCCAATTAATCTGACATCATTTT
ATTTTGTTTAATTATAAAATTCTGTCATTAAGAATAATTGAAATAAAATTTTATGCAGTT
GAACATCGTTTTAAAGTTTTAG
| SMART |
Chitinase_II (IPR011583) - T[45-344] 1.4E-4 |
| Pfam |
Glyco_hydro18_cat (IPR001223) - T[48-342] 2.3E-22 |
| SUPERFAMILY |
Glycoside_hydrolase_SF (IPR017853) - T[58-255] 1.1E-26 - T[324-347] 1.1E-26 |
| ProSitePatterns |
Glyco_hydro_18_chit_AS (IPR001579) - T[128-136] . |
| Gene3D |
Chitinase_insertion_sf (IPR029070) - T[249-315] 1.5E-32 |
| Protein Name | Identity | Bit Score | e-value |
|---|---|---|---|
| DIAC_HUMAN | 36.313 % | 205 | 1.23E-62 |