Aniseed - Transcript Card

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C2.775.v3.A.ND1-1

Possible name(s)

USP40; USP47; USP7

Gene model

KH2012:KH.C2.775

Location

KhC2 [3,073,392 / 3,078,794]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 349

>KH.C2.775.v3.A.ND1-1
TKELHVEMDKRMPLLSLKRHLAHFVGTATRRFVIYRKYASGQENEMSQLTEDFRSIPNST
LFVVKLGRALRKDEYRCKLYQLKLYEEETAKPLMNWVIQRGLTVGDARNLLCEDISEQCD
IHTQPERIRIRKKMWKTPSQVYLENDKFGTNISLYGTIEFFIEFLDKPEPKTAANQLVLL
CRRWRPSLLKFEDFEEVVLKDEVVSSTYLGWNADHLRKQLAVVSGIPIDDIQMAKGRGMF
PFRTSVLDADTSLDWVPTSTSPHTFSMHLTEDGTVVFYRDKNEEIKEITEEERKIIMDEE
MKSNSTISASTKTNKELNGPSTKPVSYRREKALKIFIPPSRNKEVTTEL

Nucleotide sequence

Length: 2,162

>KH2012:KH.C2.775.v3.A.ND1-1
ATGAATTGGGTGATACAACGTGGGTTGACAGTTGGTGACGCACGTAACTTGCTGTGTGAA
GATATAAGTGAACAATGTGATATACATACTCAACCAGAGAGAATTCGTATTCGTAAGAAA
ATGTGGAAGACACCAAGCCAAGTTTATCTTGAAAACGATAAATTTGGGACGAACATCAGT
TTGTACGGAACCATTGAGTTTTTCATTGAATTCCTTGATAAACCTGAACCAAAGAGCTGC
ATGTAGAAATGGACAAGCGAATGCCTTTGTTGTCATTAAAGCGACATCTTGCCCACTTTG
TAGGCACAGCTACAAGAAGGTTTGTCATCTACAGGAAATACGCCAGTGGTCAAGAGAATG
AGATGAGTCAATTAACAGAAGATTTTCGATCAATTCCTAATTCGACGTTGTTTGTTGTTA
AACTGGGTCGTGCTTTACGTAAAGATGAATATCGATGCAAACTTTATCAACTGAAGCTTT
ACGAGGAGGAGACTGCCAAACCATTAATGAATTGGGTGATACAACGTGGGTTGACAGTTG
GTGACGCACGTAACTTGCTGTGTGAAGATATAAGTGAACAGTGTGATATACATACTCAAC
CAGAGAGAATTCGTATTCGTAAGAAAATGTGGAAGACACCAAGCCAAGTTTATCTTGAAA
ACGATAAATTTGGGACGAACATCAGTTTGTACGGAACCATTGAGTTTTTCATTGAATTCC
TTGATAAACCTGAACCAAAGACAGCGGCCAATCAGCTTGTGTTGTTGTGTCGTCGATGGA
GACCATCTTTACTTAAGTTTGAAGATTTTGAGGAAGTTGTTTTAAAAGACGAAGTTGTTT
CATCGACTTACTTGGGGTGGAACGCAGATCATCTTCGAAAACAACTTGCCGTAGTTAGTG
GGATACCAATCGACGATATACAAATGGCAAAGGGACGTGGTATGTTCCCATTCAGAACCA
GTGTATTAGATGCTGATACAAGCCTTGATTGGGTTCCTACATCAACAAGCCCTCATACTT
TCTCCATGCATCTTACTGAGGATGGAACTGTTGTATTTTACAGAGATAAAAACGAGGAAA
TAAAAGAGATAACAGAGGAAGAAAGAAAGATAATCATGGACGAAGAGATGAAATCAAATT
CAACCATATCGGCTTCCACTAAAACTAACAAAGAACTGAACGGACCTTCAACAAAACCAG
TTTCTTACCGACGAGAAAAAGCTTTGAAAATCTTTATTCCGCCTTCAAGAAACAAAGAAG
TTACAACAGAGCTATAAACCTCCCAACAGCTGCCAGCATGTTACTTTCTACCCATATGCG
CCTACCATTTAATAACACAGGGGATGCAGTCATAGATAGACATACAATTCTGTGAAACGT
ATTTCGACCCATTGGTTGTAATGAAAAATTTCAAGGGTTGGACTACCCACTCTGCCACCC
AAGGTTCTGCGCTTAAAAGGTCAAAGATTCTATGTAGATGGAGTATACTGCAAGAGATTG
AAGTATCAAAAATGGTCACTTCGTTTCTATACAGAGTTTACTTTTCTTTCTGGTAAAATA
TCCTCAACCCTACTGGCTATTCAAGAAGCCAAATAATATAACAACACACTGCAAGGTGCT
TTCTTGTTTTTAAACCTACGACAGCAATACCCAAATTCACAGTACCAGCAAATTGTTATG
TGTAGATGTTATCGTTGTCTTACTGGACAGCATTTGTTAATTCTTTTTTTACATATAATG
ACAACGCTTGAAGTTTTGTTCCTATAAGCTGTGCTTCTCAACCTCTACGTCACGATTTAA
AACTAGGTCACCATTTGATTTGGTTGCCACTACAGCAGTTTGCAATATCTTTTGGCTGTG
GTTTTAAATGTTAAATTAATTTATTTCATGCCTGCAAAAAGTTGTATCAAATGTAAATTC
GCTGTTAATTAATTTAATATTTGGTTTGTGTCATTGAACAGTTAAGAAGAACTGCTATGA
AGTGTACCAAAGTGCTTTTCTCTTTAAATTGGTGTGCACTATGTTATTTACAGTTCGTAC
ACAGAGGAAAACTGGATGTGCTATATACAAATAGATGCTTGCGGTGTCATAATGTCGTTT
GCATTTTTAAAGCTTTGTTAAAATAGCATCGATTCGTGACAATAAAAGTTAATGTTGATA
AA

Best Blast Hits in UniProt

Protein Name	Identity	Bit Score	e-value
UBP47_HUMAN	39.193 %	251	3.9E-75