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Transcript Model
Transcript Id
KH2012:KH.C1.937.v1.A.SL1-1
Possible name(s)
AL109827.1; NFS1; SCLY
Gene model
Location
KhC1 [9,186,793 / 9,191,563]
Amino acid sequence
Length: 399
>KH.C1.937.v1.A.SL1-1
FQLLLNINVMVYLDYNATAPLADEVVEVITKSLTEGWGNPSSDHGPGRHAKQLISEARSN
IADCIGCFASNIIFTSGGSEANNWVIQSVLSCHNGGEPHHKPHIVTSSVEHDSVLVPLIV
LQQRGLIELTKVSVNHSSGEISCDDVIKEIKPNTVLVTVMMANNETGTIMPIKDIVRDIR
TLEEKNNRKILIHTDAAQAIGKIGVNVGKLGVDFLTTVGHKFYGPRIGALYVKDVNALTP
LIYGGGQEWGLRAGTENTPMITGLGEAAKLVKDNLNFYADNMKLTRDYLEERLKKEFGSR
ITFNCKSNNRLPNTCNFSFVGQGFEGYKVVKMAKSFTCSTGSACHASECLPSKVLLNFHI
ERNVAANALRLSTGRTTTIEDIDCVINELKSIFTNIQNT
Nucleotide sequence
Length: 1,901
>KH2012:KH.C1.937.v1.A.SL1-1
GCTATGACGTAAATTAGTTTTAAACTGATTTCAACTGTTGTTAAATATCAATGTAATGGT
ATATTTGGATTACAACGCAACAGCGCCTCTAGCGGACGAAGTGGTTGAAGTTATAACAAA
GTCTTTAACTGAGGGTTGGGGAAACCCCAGTAGTGATCATGGGCCAGGAAGGCATGCGAA
ACAACTGATATCCGAAGCAAGAAGTAACATAGCCGACTGTATTGGTTGTTTTGCATCAAA
CATTATCTTTACATCTGGTGGCAGCGAGGCTAATAACTGGGTGATACAATCTGTATTGTC
ATGTCATAATGGAGGCGAACCGCATCATAAACCACACATTGTTACATCTTCAGTTGAACA
TGATTCAGTGTTGGTTCCTTTGATTGTTTTGCAACAAAGAGGATTAATAGAGCTTACCAA
AGTTTCTGTAAATCACAGTAGTGGGGAAATAAGTTGTGATGATGTCATTAAAGAGATCAA
ACCAAACACAGTTCTTGTCACGGTCATGATGGCTAATAATGAAACTGGAACAATAATGCC
CATCAAAGACATTGTTCGTGATATACGAACATTGGAGGAAAAAAATAATCGGAAGATATT
AATCCACACGGACGCTGCACAAGCTATTGGGAAGATAGGAGTTAATGTTGGAAAATTGGG
GGTGGATTTCCTCACAACAGTCGGCCACAAGTTTTATGGACCAAGAATTGGAGCTCTTTA
TGTGAAAGATGTCAACGCATTAACTCCTCTTATATATGGTGGGGGGCAGGAGTGGGGGTT
GAGGGCAGGGACCGAGAACACACCCATGATAACCGGGCTCGGTGAAGCAGCTAAATTAGT
AAAAGATAATTTGAATTTTTACGCTGATAATATGAAACTAACGAGGGATTATTTAGAAGA
AAGACTGAAGAAAGAATTTGGAAGCCGTATAACTTTTAACTGTAAATCCAACAACAGATT
ACCAAACACTTGTAACTTCTCATTTGTTGGTCAAGGATTTGAAGGTTACAAAGTAGTTAA
GATGGCCAAGAGCTTCACATGCAGTACTGGATCTGCTTGCCATGCAAGTGAATGTTTGCC
TTCTAAGGTTTTACTCAACTTTCATATTGAAAGAAATGTGGCAGCAAATGCACTTCGTTT
ATCAACTGGAAGAACAACAACTATAGAAGATATTGATTGTGTGATTAATGAATTAAAATC
AATATTTACGAACATACAAAACACATAACTTCATAAACATTTCTTCCTATTTAGCAAAAA
AACATAATTTTTCTCTAACACAGTGATCACTAACTTGATTCATACAGTAGGGTGGGAAAG
ATTTCTTACCTTTTTTTTCCTATCTCAAAATGACTATTCAAAGAATTATGAAAACCCATT
CTCATGACTCCCATAAACCGTTGTTAATTGTGTAAAACACGGTTAGGATATTTGGATTTT
ATGTGATAACGGTGTCCCATCTTCCCACCACACTGTAATATTTAGGACAAAAGGAACTAA
ATATCCTATTTCCACAATGCTTTTAAAAGAGTGGAGTTCTAATTGCTTTGTTATATATTT
GATCTGTCATGGAACGATACACGATTTTGTTTGTCATCCTTGGCTTTGGCCCAGAAAGTC
CAGCCCTGGTTATTTAAATGAAATTAGTGCATTTATAATTCATACAACACAAAGCATTGC
AATGACTAGATGGAAAACGCTTATAACATGTAGTTTACCAGATTCCTTTAATACCATTGT
GAGTTAATGAAGGTTGTACAGCATTGCTGTAATGTGGAGTGACGTTACAAGCGTCCACGT
TTACCCCTTTAATTTTTTAGAATGTACTTGACATGCATGGTGTCGCATTGGTGGTTCTTA
GCGTATATATTTTAATATGGTGCAATAAACGTTACTTTCAA
| PIRSF |
Cysteine_dSase (IPR016454) - T[8-399] 2.6E-124 |
| SUPERFAMILY |
PyrdxlP-dep_Trfase (IPR015424) - T[10-393] 1.73E-83 |
| Gene3D |
PyrdxlP-dep_Trfase_dom1 (IPR015422) - T[11-21] 4.8E-137 - T[298-390] 4.8E-137 |
| Pfam |
Aminotrans_V_dom (IPR000192) - T[11-383] 8.9E-63 |
| Gene3D |
PyrdxlP-dep_Trfase_major (IPR015421) - T[68-253] 4.8E-137 |
| Protein Name | Identity | Bit Score | e-value |
|---|---|---|---|
| NFS1_HUMAN | 33.505 % | 201 | 3.59E-60 |
| SCLY_HUMAN | 48.309 % | 382 | 1.49E-130 |