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  1. Transcript 'KH2012:KH.C1.840.v1....'

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C1.840.v1.A.SL1-1

Possible name(s)

DHRS13; RDH12; RDH14

Location

KhC1 [7,230,809 / 7,232,184]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 330

>KH.C1.840.v1.A.SL1-1
VIMVSFVVVYPAVIFVGILSYAWWGNKYKRSICKSKASLKGKTALITGGNSGIGKATAIE
LAKRDARVIIACRNKAKAEAAVFDIRKESGNPEVLYRIVDFMEFSSVKSFAENFCKDEPH
LDILVHNAAVFGTGEKYGYSAMVVTNVFGPFIMMHYLMRKMLQQAETRPVRIVVVGSDAY
MFETFTKDKLGQIPDKTSSSKTVFKMYGLSKLCSLYHFLALTKKLQGKNISTFCVHPGTV
NTGLGNGFSHETSYGPWLRRIIMGLFATDPYFGCQTAVECAVAEGMEHRSGKYWSYFKEQ
ELKPHALDQDLEKELWEECEKITECKWEFT

Nucleotide sequence

Length: 1,375

>KH2012:KH.C1.840.v1.A.SL1-1
GTGCTTATAGGTGATCATGGTTTCTTTTGTAGTTGTTTACCCTGCTGTAATATTTGTTGG
CATACTGAGTTATGCTTGGTGGGGTAATAAATACAAGCGAAGCATCTGCAAGTCGAAGGC
TTCTTTGAAAGGGAAAACTGCTCTTATTACTGGAGGAAACTCGGGTATTGGAAAAGCAAC
AGCAATTGAGTTGGCGAAGCGTGATGCACGAGTAATTATTGCTTGCAGAAATAAAGCAAA
GGCCGAAGCAGCCGTGTTTGATATTCGAAAAGAGTCTGGCAACCCTGAAGTTCTTTACAG
GATTGTGGATTTCATGGAATTTAGCTCTGTGAAGTCATTTGCAGAGAACTTTTGTAAAGA
TGAACCACACCTTGATATTTTGGTTCACAATGCTGCTGTGTTTGGTACTGGAGAGAAATA
TGGATATTCTGCTATGGTTGTAACCAACGTTTTTGGACCGTTTATTATGATGCATTATTT
AATGAGGAAGATGCTGCAACAAGCTGAAACAAGACCTGTTCGAATTGTTGTAGTTGGTTC
TGATGCTTATATGTTTGAGACCTTCACCAAAGACAAATTAGGACAAATACCGGACAAGAC
TTCGTCATCTAAAACTGTTTTTAAAATGTACGGACTTAGTAAATTGTGCAGTTTGTACCA
TTTTCTTGCCTTGACCAAGAAACTACAGGGCAAAAACATATCTACATTCTGTGTTCATCC
AGGAACAGTAAATACAGGATTGGGTAATGGGTTTTCACATGAAACATCATATGGTCCATG
GCTTAGAAGAATAATTATGGGTCTGTTTGCAACTGATCCTTACTTTGGCTGCCAGACAGC
AGTTGAATGTGCTGTTGCTGAAGGGATGGAACATAGAAGTGGAAAATATTGGAGCTATTT
CAAAGAGCAAGAGTTAAAACCACATGCACTTGATCAAGACCTGGAGAAAGAACTTTGGGA
AGAATGTGAAAAGATCACTGAATGCAAATGGGAGTTTACATAAATTAAAAAAAAACAATC
AACATTTTTCACATTGTATAATTATTGTAAATTTTGATTAACTGGTATCATTTTATTGCT
TTTTTGCAATGAATTATTTTTTTTAATTGTTTTTCACATGTCAACACTGCACCCATATTA
CTGTAAATTTGGTGGTGTCTAAATTAAGTATAAACTCAATTAGATCTTAACAGCTATAAT
AAATATAGACTACTTTAAAATTTAGGTGTCAAATAAAAATTTAAATGTGGAAGGAATAAT
TACTAATTAACTTTGCATGTTGTTTGAAGGTTTATTTATGAAACTATGTAGCAAATGATT
TTTTTTTAAATTCACTGTTTTTGTTTCAATTGATTAATGGCTTTGTGGTACTCAG

InterProScan

SUPERFAMILY
NAD(P)-bd_dom_sf (IPR036291) - T[38-294] 4.21E-44
Pfam
SDR_fam (IPR002347) - T[42-179] 2.8E-22
PRINTS
SDR_fam (IPR002347) - T[43-60] 2.0E-10 - T[119-130] 2.0E-10 - T[228-245] 2.0E-10

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
DHR13_HUMAN 34.783 % 179 1.68E-53
RDH14_HUMAN 33.221 % 151 4.83E-43
RDH12_HUMAN 33.993 % 152 7.55E-44