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Transcript Model
Transcript Id
KH2012:KH.C1.1085.v1.A.SL1-1
Possible name(s)
ATRN; ATRNL1; MEGF8
Gene model
Location
KhC1 [3,377,398 / 3,395,903]
Amino acid sequence
Length: 710
>KH.C1.1085.v1.A.SL1-1
LLNLCMLLTRIRIPAMEMDIMLTGNVSVMMVSVVKCVNHALGDSCKLNITVEQYLSGADM
VHFSNCMGIIQPKNITNKSIYIQFVYVENSCSCDFLNVYDGYSVHDPFLATYHGAVNPIQ
LPAVVSSTGSVVLQFNNDDMPFLNKGYTLYYWLDDYPPSDPGDVGSGDEPENNTSCIDNW
CIHKWPEFLKQGRASAALQSLNGMLYIYGGYLFTLASEQNDFMRMNMTSFEWDVVTMGNT
SNTPGTRYDHTMVVWQVCNSGENLYIYGGSLSSHIITNEMWMYNTTNSTWKKIIANKTFD
FEIPRLKGHTAHSVKLKNGRDVMLVFFGYHPGWKFSPFVFEFDFSKLYFLVILFYQECNL
LYFILAWPEKEIHYYTSVLFHTPPASLRVVCHVCYFVVKNLWSKVTTMGAMPIGRYGHTS
VHDQDTNNVYVHGGSNDNIYYHLYVYNADAMLWTILPHSPQVRYLHSMVMLGRSLYVYGG
LSDAAHCQCSKLTTVRYSIGKYIVGWGKMGHLVNVTVTAHVVPTNQMFALNARVVRVAPS
AVCVMGSIMVTPPMAETAQLVNVMDMLKNVSQMVNVCVMLKACGSISGYQGDAQNDTCFC
KLCVYNIYSCGVRCWMLFVKNLALMVKLQFLPLSCFYQVKQKSSHYFAFGSCIGTTTTTT
GSVVFPQSTKHKESKFNSFVNSARSVVTITRSPRDRSGFDNPVLQLELAD
Nucleotide sequence
Length: 3,408
>KH2012:KH.C1.1085.v1.A.SL1-1
TGCAATATGTTTGGTAATGCTGTTAAGATATTTGTGCTTCTAATGCAATATACTGTAATT
ACTGAATCTCTGTATGCTCTTAACAAGAATACGAATTCCTGCAATGGAAATGGACATTAT
GTTGACGGGAAATGTCAGTGTAATGATGGTTTCAGTGGTGAAGTGTGTGAATCATGCATT
GGGAGATTCGTGTAAGTTGAATATAACAGTGGAACAATATCTAAGTGGTGCAGACATGGT
ACACTTCAGTAACTGCATGGGAATCATTCAACCAAAGAATATCACAAACAAGTCAATCTA
CATTCAGTTTGTCTACGTTGAAAATTCTTGTTCTTGTGATTTTCTGAATGTATACGATGG
TTACTCTGTACATGATCCATTTCTTGCAACATATCATGGTGCTGTGAACCCAATTCAATT
ACCAGCAGTTGTATCTAGCACTGGTTCAGTTGTCCTTCAATTCAACAATGATGACATGCC
ATTTCTTAACAAAGGTTACACACTATATTACTGGTTAGATGATTATCCACCAAGTGATCC
AGGGGATGTTGGAAGTGGTGATGAACCAGAAAACAACACAAGTTGCATAGACAACTGGTG
TATACATAAATGGCCAGAGTTCCTTAAACAAGGAAGAGCTTCAGCTGCCCTGCAGTCTTT
AAATGGCATGTTATATATATATGGAGGATACCTATTTACCCTGGCATCAGAACAAAACGA
TTTTATGAGAATGAACATGACAAGTTTTGAATGGGATGTAGTAACAATGGGCAACACTTC
AAACACACCTGGTACCAGATATGATCACACCATGGTTGTTTGGCAAGTATGTAACAGTGG
TGAGAACTTGTATATTTACGGTGGCAGCTTAAGCAGTCACATCATCACCAACGAAATGTG
GATGTATAACACAACAAATTCAACTTGGAAAAAAATTATTGCAAACAAAACTTTCGACTT
TGAAATACCAAGATTAAAAGGTCATACAGCACATAGCGTTAAGTTAAAGAACGGCCGAGA
TGTTATGTTGGTGTTTTTTGGATACCATCCTGGCTGGAAATTCTCACCTTTTGTTTTTGA
ATTTGATTTCAGTAAGTTGTATTTTTTGGTTATCCTTTTTTACCAGGAATGTAACTTACT
TTACTTTATCCTCGCATGGCCGGAAAAGGAGATCCATTATTACACGAGTGTTCTGTTTCA
TACACCTCCTGCCAGCTTACGAGTTGTATGCCATGTATGCTACTTTGTGGTGAAAAACCT
GTGGAGCAAAGTAACAACTATGGGTGCAATGCCCATCGGTAGATATGGCCATACATCAGT
ACATGATCAGGATACAAACAATGTTTATGTGCATGGTGGATCGAATGACAACATTTATTA
TCATCTGTATGTATATAATGCTGATGCAATGCTATGGACAATATTACCGCATTCACCACA
AGTACGTTACTTGCATTCTATGGTAATGTTGGGACGTTCACTTTATGTTTATGGAGGTTT
ATCAGATGCTGCCCACTGTCAATGTTCAAAGCTCACTACAGTGAGATACAGCATTGGTAA
GTATATAGTAGGATGGGGGAAGATGGGACACCTTGTCAATGTAACGGTCACAGCACATGT
AGTCCCGACCAACCAGATGTTTGCACTGAATGCACGGGTGGTACGAGTGGCTCCAAGTGC
AGTTTGTGTGATGGGCTCTATTATGGTGACCCCTCCAATGGCAGAAACTGCACAGCTTGT
GAATGTAATGGACATGCTGAAGAATGTGAGTCAGATGGTGAATGTGTGTGTAATGTTAAA
GGCGTGTGGTTCTATTAGTGGCTACCAAGGAGATGCACAAAATGATACTTGCTTTTGTAA
GTTGTGTGTCTATAATATATACTCATGTGGGGTAAGATGTTGGATGTTATTTGTGAAGAA
CCTTGCTCTGATGGTGAAGCTTCAGTTTTTACCACTGTCTTGTTTCTACCAAGTGAAACA
AAAGTCCTCGCATTACTTTGCGTTTGGAAGCTGCATTGGAACAACAACAACAACAACAGG
CAGTGTAGTATTTCCACAATCAACTAAACACAAAGAATCAAAATTCAACTCCTTCGTCAA
CTCAGCCCGATCAGTAGTAACCATCACCCGGTCACCCAGAGATAGATCAGGATTCGACAA
CCCAGTTTTGCAACTGGAACTGGCTGATTAAAATCGGTCATATTGTTTTACGAAATTATA
AAAATATTGAATCTTTCATATTGTTTTCATATTTGTATTACGAAATTTTCATTTTATTTT
ACGAAATTTTCATTTTGTTTTACGAAATTTTCATTTTGTTTTACGAAATTTTTATTTTGT
TTTACGAAATTTTCATTTTGTTTTACGAAATTATAAAAATATTGAAATTTTAAATGCTTT
TTATTAATACATTATCCCAGGGATGTGGAACCTGTAGCATGTGGGCCAAATACGACCCGC
AAAAAAAGTTCTGCAGCCCATGAAGTCAGCTGCATATATTTTTTAAATTTATATAGTAGT
TTTCTTCAGAAATTTCTGCATCCGAACTTGATATTTCTGCAAGAGGAAATCTGCCCTTTT
AATATTGTAAGTTCATAGACAAAAAGAAACTATTATTGGTCCATGCAAGCCTATATTAAA
TAAAGTACGACCGCGTTTTCAACCAGTAATTTAACCTTGCCCTCCTGTAATAAAGGTTGC
ACGTCCCTAAATTATATTTTTGCTATGTTTAAGTTTCAATTTCCAAAGCATCAACCAAAC
TTTTATAACCAACTGAATATATTAAGTTAAAATCTAAGCATTTTTTAAAATTTAGTAATA
AGTGCCTTAATAATAAATTCTATAACTTTTTTTTATAAATTTTGTATACTCATATAGTTC
TGTTTTATTAAAATATTTTCGTATGTTTCAAAATTTATATGCAATTGTTTATTAAAATTG
TTTATTGAATTTTGTGAGCCTGTTTACCCACCATCTCATATTATTTCATGTATGCTGTAC
TTACGAGTAAACTAGTATTACTTATATTTGAATGTGAATGTAACTTACTTTATCTTCGCG
TGGCAAAAAAACGACAGTCATTATAATATGGGTGTTTTGTTTCATACACCCTGAATGTGA
ATGTAACTTACTTTATCATGTGTCGTCGGAAAACGATAGTCCTTATAACACGGAAGTTCT
GTGTCATACACCTCGTGCCAGCTTCAAGTAACCATGTATGTTACTTTGTGGGTAATGGTT
GATGTATCCCTTATAAAAGTGTGTTACTTTGCAGCGCTGGTGTTGTTTAAGTTCCCTTTG
TTCAATTTATTTTGTATGATTAAAACTTATTTATTTCCTTGTTTATTTTCATATTCTGCT
GTACATTTATAATTCTGCATTTCCTGTAGGTAATTTCTGCTTTTGCAG
| SMART |
CUB_dom (IPR000859) - T[36-154] 0.0092 |
| ProSiteProfiles |
CUB_dom (IPR000859) - T[36-154] 9.776 |
| Gene3D |
Sperma_CUB_dom_sf (IPR035914) - T[46-153] 2.0E-8 |
| CDD |
CUB_dom (IPR000859) - T[62-152] 1.76838E-7 |
| SUPERFAMILY |
Sperma_CUB_dom_sf (IPR035914) - T[65-152] 2.88E-10 |
| Gene3D |
Kelch-typ_b-propeller (IPR015915) - T[167-346] 3.5E-12 - T[383-506] 1.3E-12 |
| SUPERFAMILY |
Kelch-typ_b-propeller (IPR015915) - T[183-349] 9.42E-31 - T[406-499] 9.42E-31 |
| Protein Name | Identity | Bit Score | e-value |
|---|---|---|---|
| ATRN1_HUMAN | 27.331 % | 109 | 1.55E-24 |