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  1. Transcript 'KH2012:KH.S1666.1.v1...'

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.S1666.1.v1.A.ND1-1

Possible name(s)

KH.S1666.1

Location

KhS1666 [1,233 / 3,315]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 234

>KH.S1666.1.v1.A.ND1-1
ISTIRERDIRVHSMCYPLSVRSFGSYMICRAFAITLLVVGHVGCGKRKSVNTPRITPGNP
PFTNTGVDYMGPFPVKSGRNTLKRYGCVFTCMASRAIHIEVAYSLDTSSFIQALRRFLCR
RGGSTKKLFSDNGLNFVGANKELRDSVTKWNQAQIHECMLQRGIDWEFNPPAASHQGGVR
ERMIRSVRKILRQLTLERPLDDESILTFVVEVEGILNRRPLWRNPHLTCVFLHP

Nucleotide sequence

Length: 2,082

>KH2012:KH.S1666.1.v1.A.ND1-1
TTGCGCCCGATTATAGTGAATGGTGTTTTGCGTGTTGGTGGGCGATTGTCTTGTTCTTTG
TTACCGTATGATTGAAATTTCCGATAATCCTTCCCCGGCGTTGTGGTAGATTTCTACCAT
AAGAGAGAGGGACATTCGGGTGCACAGCATGTGTTATCCGCTGTCCGTGAGAAGTTTTGG
GTCGTACATGATTTGTCGAGCGTTCGCCATTACATTGCTAGTTGTAGGGCATGTCGGCTG
TGGAAAGCGAAAGTCGGTAAACACACCCCGTATTACACCTGGCAATCCTCCATTCACCAA
CACTGGAGTTGACTACATGGGTCCTTTCCCTGTAAAATCCGGCAGAAATACGCTGAAACG
ATATGGTTGCGTGTTTACGTGCATGGCTTCACGTGCCATCCACATTGAAGTTGCTTATTC
TCTGGACACAAGCTCGTTCATACAGGCTTTGCGTCGATTCCTCTGTCGTCGTGGGGGTTC
AACAAAGAAGTTGTTCAGTGACAATGGTTTGAATTTCGTAGGTGCCAACAAGGAATTAAG
AGATTCCGTAACAAAATGGAATCAGGCACAGATACACGAATGTATGCTCCAACGAGGCAT
TGATTGGGAGTTCAACCCACCCGCCGCAAGCCACCAAGGTGGAGTGCGGGAGAGAATGAT
ACGTTCTGTCCGAAAGATCTTACGACAGTTGACGCTCGAACGACCACTCGATGATGAATC
AATTCTCACATTTGTGGTAGAGGTGGAAGGTATTTTGAATCGAAGACCGCTTTGGCGGAA
TCCCCATTTGACTTGCGTGTTCTTACACCCATGAGTTTGCTCACCGGTTGTATCGCTGAG
TCCTAAGTCCCGGTCAATTTATTGCGGCTGACGGGTACCGCAAGTCGTGGAGAGCTGTTC
AACATTTGGCTGATCGATTTAGGAGACAGTGGACGAAGCAGTATCTACCCTTGCTACAAC
AGCGACAGAAATGGCTTCTTCCGCAACGAAATTTTTCAGTTTTCGACGTCGTACTTGTTG
TCGATGAACATGTTAAACGTGGGCAGTGGTCGAAGGCGATCGTTATTGAAGTCTTCCCTG
ACCAAGAAGGAATAGTGCGACGTACGAAGATACGAACGGGAACTGGAACTTATTTAATTC
GCGATGTGCGAAAACTGTGTTTGTTGGAGGCTGCATAGTCAGCCAGATTCGTCCTCGGTC
GTTTGGATCGCGTTTGTGCTTGTGTTTGTAATACTTTTGTCAATGTTATTTTTGCTGCGC
GCCCGTCCTTTTGATAAAGTTTATTTTTGAGGTACTACCGCTGTTTCTCGCGGGCTTCGT
TTAAGCCTTGGGGGTTAAAATTAATTGGTTTCGCACATGCATACACCCGGTACCCTATTG
TAATGGCAAGCAGAAGACTTGCAAAGTTGACGTGCGTAAGAATGTCACGAATACACGTGC
ATATACCCTGCCTTGGGCAGAAGAGTCGAACAAACCGATTAAATTGAACGCGCTGCGTGA
TGCACGAGCTCTTGCTATGGGGAAATGGCCCATTGATTGGTTATTGCTACGGGTAAAGAC
CCATTATTGATATGGACGAAAGTGGACTTCACTGTACATTATTGAATTGAAAATGATTCT
GTGACAGATATCTTTTGGGGCCGGTGTGTAATGTACAGTGTCGCCCTAAATTGTCGTTTA
TTTACTCCCCATTGTTTTCCTATGTCAGCGCGATTATTTTCTCCTTTGTTTCGTATGCTT
GGTTGATTTTCGTCTCGTGTGTATATTTGACTTTGTTCGTCCTCAGTTCTATTTAACGAC
GGCTGAACAGTGCACGTCTCCGTCCACGCTTTATGTTATTTTAAGTTACCTCTACACGTT
CATGCTGTTTTAAGTTCAGTTCCTATTTTTAACCATTCTTTATTTTCTATTTGAATAAGG
AGCTAGGAATAGAAATTGTTATTTGAAAGGCCTCACAATTGGAAAACGTATATACCCACA
TACCCCTACACTCTGCGTCAACGAAGTTTGAAATACCCCTTGATTTCCCTCCCTTATACC
CGAAAGTTGATTTGTTTTACTACTTAGTTCTCGGTCGCGTGC

InterProScan

Gene3D
RNaseH_sf (IPR036397) - T[53-220] 1.2E-13
ProSiteProfiles
Integrase_cat-core (IPR001584) - T[56-234] 12.5
SUPERFAMILY
RNaseH-like_sf (IPR012337) - T[60-223] 2.28E-21
Pfam
Integrase_cat-core (IPR001584) - T[67-188] 1.0E-11

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value