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  1. Transcript 'Boleac.CG.SB_v3.S256...' > 
  2. Region 'REG00000125' > 
  3. Transcript 'KH2012:KH.L87.20.v2....'

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.L87.20.v2.A.ND1-1

Possible name(s)

HM13; SPPL2B; SPPL3

Gene model

KH2012:KH.L87.20

Location

KhL87 [38,464 / 44,053]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 378

>KH.L87.20.v2.A.ND1-1
KLKTSNMSETLGETVSNAINNFVNETFQKSNSSAKIPATPEGKLVAYTALISMAVVPIII
GAYRSVAYLEKQKLTGEKPDTITKDDAMKFPLVASCMLFGIYVFFKLFSQDHINILVSFY
FFILGIFAMAHIIGPYVEKLIPASFPNLPYHLHLTEGSEENKSVLLDLDFDRKYVVSIAL
FGLVSGWYAVKKHWLANNLIGLCFAMNGVELLQLSSIGTGCILLIGLFFYDVFWVFGTNV
MVQVAKKFDAPIKLVFPQDFLVEGVFGKNMAMLGLGDIVIPGIFIALLLRFDKSLKRDKN
LYFNSGMIAYFTGLLTTIIVMTVFNHAQPALLYLVPACISVPLGVAFYKGDLEAMFSYSD
EKSEKTEPEKQEDTKKSD

Nucleotide sequence

Length: 2,082

>KH2012:KH.L87.20.v2.A.ND1-1
GTTAGTTTCCTGGCAAGATTTTCACATGGATTAAAATGCGACAAGGAAGCTACATGGCTG
TGTATTTAGTACTAGAACATGGTGTTTAATGGCTTATGCTGTGATAAGGATTGAGAACTT
CTTATGAAATTTAAATGGGACTCTTTGTAAAAGTTAAAAACTTCCAATATGAGTGAAACA
CTAGGTGAAACGGTGAGCAATGCTATCAACAACTTTGTCAACGAAACTTTCCAAAAATCA
AACTCATCGGCTAAAATACCTGCCACACCAGAAGGCAAACTAGTTGCGTACACTGCTCTT
ATTTCTATGGCTGTTGTTCCTATTATTATTGGGGCTTACAGATCAGTTGCATATCTTGAG
AAACAAAAGTTGACGGGTGAAAAACCAGACACAATCACGAAAGATGATGCCATGAAATTT
CCTCTCGTTGCAAGTTGCATGTTGTTTGGTATTTATGTCTTCTTCAAGCTCTTCTCACAA
GATCATATTAACATCCTCGTCAGTTTCTATTTCTTTATCCTCGGTATCTTTGCTATGGCT
CACATTATTGGACCATACGTTGAGAAATTGATTCCAGCTTCATTTCCAAACTTGCCCTAT
CATTTACATCTTACTGAGGGAAGTGAAGAGAATAAATCCGTTTTATTGGACTTGGATTTT
GATCGTAAATATGTTGTTTCTATTGCTTTGTTTGGTCTTGTCTCTGGATGGTATGCAGTA
AAAAAGCACTGGTTGGCAAACAATCTAATTGGTCTTTGCTTCGCCATGAACGGTGTAGAA
TTGTTGCAACTTAGCAGTATTGGGACTGGATGCATCTTATTAATTGGTTTGTTTTTCTAT
GATGTCTTCTGGGTGTTTGGCACCAACGTGATGGTACAAGTGGCCAAGAAATTTGATGCT
CCAATCAAACTGGTTTTCCCCCAAGATTTTCTTGTAGAAGGAGTGTTTGGAAAGAACATG
GCAATGTTGGGTTTGGGGGATATTGTTATTCCAGGAATTTTCATTGCCCTTCTGCTGCGC
TTTGATAAGAGTTTAAAAAGGGACAAGAATCTGTATTTCAACTCTGGCATGATCGCTTAC
TTCACTGGATTGTTAACCACTATTATTGTAATGACCGTGTTCAACCACGCCCAACCTGCT
TTGCTATACCTTGTCCCTGCTTGTATATCTGTACCATTAGGTGTAGCTTTCTATAAAGGA
GATTTGGAAGCGATGTTCAGTTATTCGGATGAAAAAAGTGAGAAAACCGAACCTGAAAAA
CAAGAAGACACCAAAAAATCGGACTGAGTTGACCAATATTGCCGAATGTAAATTATTATT
TTAGAAACATGGAAAACGTCCTGTTGCAGTGTGTAGTTGTTGTTTTTGTTGTTTATTCTA
CACACATTGTATTTGTTGTGAAATATCTCTGTATGGTTTGTGGGAATCTATACCAATCTG
TCTACAGGTTCAAATTTAAATTCTGTTTAAAAATTGTTGCCATACTTTATCTTTGCACTA
GTTGCATTTTAATCTTGCCTATAAGTCTATCAAGATAGAAATGTGTATTCGATAACTGTA
CAATACGAGTTGATGTTGTTGGAATAGCTATTTGGGGTTTGATTTACCAAAAAAATATTT
TTTTGTTTTAAGTATGGCTGTACCTTTTTTATGAATGAATTTGTAAACTTTGCGGGAAAC
GATTTTACTTTTTATCGATGAGTGGCTCGTTCTGCCACAGGTGATTAGTGCAATGTCGGT
TGTTGCCTTTTTGTAGAATTACGCGCCAAGAAAAAGTAAAATGAAAAAAAAGGGTTGTAC
ATAAAATGTAGTACTTTATTGGCGGGAATACTGACACAGAGAATTGCACTGAAGAAAATG
GAACTGCAACTTTGGTCTTGAAAGGCACAGGAATACAAGAGGAACTTAAACATCAGCAGA
GGCTGTTGTGGTACTATGGATTTGCACTGAAGTAGTTAAAGGCACTGTTGGTGGGATATC
GATATTATTGCAACGTAGAATCTCATGCAGGCGGGACATATCTGAAAAGTTAAATTGAAT
TAATTTACAGGGGATGTATTATTATATATTGATAAACATATA

InterProScan

PANTHER
Peptidase_A22B_SPP (IPR007369) - T[25-375] 1.4E-131
Pfam
Peptidase_A22B_SPP (IPR007369) - T[77-361] 8.4E-90
SMART
Preselin/SPP (IPR006639) - T[78-349] 2.7E-78

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
SPP2B_HUMAN 26.765 % 87.8 8.75E-19
HM13_HUMAN 55 % 402 1.29E-139
SPPL3_HUMAN 29.118 % 117 8.11E-30