- Transcript 'KH2012:KH.L85.1.v1.A...'
Transcript Model
Transcript Id
KH2012:KH.L85.1.v1.A.SL2-1
Possible name(s)
ARPP21; R3HDM1; R3HDM2
Gene model
Location
KhL85 [25,799 / 51,438]
Amino acid sequence
Length: 875
>KH.L85.1.v1.A.SL2-1
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EEMFTEECHPVLVGGDNIVLTSPMLNVFAAKYNSKIAQLQLNEESDNSIYLVFQSTDDMN
RALEDHKSGNEKFSLSEIANMDERNEVILQIRTVQ
Nucleotide sequence
Length: 4,377
>KH2012:KH.L85.1.v1.A.SL2-1
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GTGTTTCCATCTCCATTTGTCATTACCCAGGAAGAAGTAAGATATTCTATTCATATCTTA
AACATCACTATTTTAAGTTATACTTCACTGTTTTGTGATTGTCAAGAAAGTTTTACTTAT
AATTGTCAAACATATTTAATCATTTATTTAAGCCTGACCATTGTTTTTAACACTGAATGT
CTTGATTCGATGGGAGTGGACGTGCATGAGTTCCTCGTTAAAGCTCTGCAGGGAAATTCC
CGTGATCGTAGCATCTTGTTGAAGCTCGAACATGACATGGTTCAATTTGTCAGCAATTCA
GAGATTGCATTTATGAAATTTCCGGAAATGACATCCTACCATAGAATGTTAGTACATAGA
GTTGCTGCATATTTTGGTTTGGATCATAATATTGATGCAAAAGGGAAATCTGTGATCATC
AACAAAACAGCGTACACAAGAATGCCTGAGAAGAAGTTTAGTGACTATTCATATCACGGT
GAAATATGTAGCTCACGTGATGAAGATATGAGACGCAGATCGATATTGAAAAGGATGAAA
AATTGTCAAAGTTTTGAACATTTCAAGTCTGAGCCCCATAAAAGTTGGAAGATGATGAAG
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AAGCAATGGGATGGAACAGAACAAAGTTCTTCAAGAGATAACAGTTCCTCTCCACTGCCT
CCTAGTGATGATACACCTTCAAATCTGCGACCAAAACCTGGAATCACAGTTTTATCCCGT
CGGCATAATCCAGAATTTAATGGTAGCACCAGTCCTTCCAGCAGTACCTCTTCTACTAAC
CAGTTTGTAGCAAATGAAAGTTCAAACGAGCATTTGAATGGTGGCACACATGTCCCGTCT
TACCAAGGAGCTCCGTATGTAACTGTTGATGGCCAACCCCTTTTGTACCCATCTAAACCC
CTCATGGTCCCTACATACCCCACACCACCCTTCCCCGTGCAGATGGGCTACCAACCCCTT
CACAGACCCAACAAATTCTACTCCACCCATTACCCAGCCCATAGGCCTCCATATGCCAAC
AATCACTGTTTCATGCGACAAGATTCCAGAGAAAGCTTAATGTCTCACCCACGTAATGGT
TACTCTAATGTACCACAAATGACTGAAACAAGTGAAGGAAATTACCCCCAGCCCCAGTAC
TACCCCCCTACCTACCAACCTGCTCCAGTTCAACTGGTATATTACCCCAACCCTGTACAG
GTGGTTCCAGTTGGTAAAAACAATCAACTTACATTGAGTGAAGATGACAAAGAAAATATT
AATTCTAAAATGGATGAATTGAATATTTCTGATACACAAACTCAAGTGGTTTCTGATGAA
TCAAATCTGTCTCAAACAAATGAAGCTTCTGAGAATAATGAAGCATCTAATAATGTAAAT
AAACGTTCACTCAATCAGAATGGTTATACAAATGAGGTTGGTCTTGATGTTAAAGTGCTC
AATATATCAGAGGCCATTACAGTGATGCCAGATAACGGTGTTGCCGATCTACAAAATACG
AAGAGTATTGTAGAAACAGATGAAGTAGCGAATATAAGCACAGTAGCCACAACACCAGCT
AACGTAGTTTCCACAATTCATGCTGGACCCGGTAGTATCACATACTACACCCCCAACACC
ATCACCGCCTCAATTAACACATCACATCCCCAACCTGGGGTGGTGGGGCCACCAGTAATT
CCCCCCGCAAACCCACACCTGGGTTTTGGAAATTCTACCCCAAGCACTGACATGAATGCT
CAGGCACGCATGCCGGCTTACTATATACCAGGTTACCCCAACAACCCAATGTTTAACTAC
AACCCACCACCTCCACAAACAGTTTATTATGTGATGGGTCCTAATGGTTTGCAACCTTAT
CAGGTTGTACCAAACCAACCACCAATGCACTACAACAACATTTTTTACCCTCCTACCTGT
CTTTACAATCATGACACTGCCCAACAACTAAGCCACTCATCAAGTGCACATAACTATGTT
TATAATGGTGAACCAGCACAGGGCGGCCAGATACCAATATTTCCCAACGGAAACATGAAT
GAAGAAATGTTTACTGAAGAGTGCCACCCAGTGTTGGTAGGGGGAGATAACATTGTATTA
ACATCACCTATGTTAAACGTGTTTGCTGCAAAATATAATTCCAAAATCGCCCAGCTACAA
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CGAGCATTGGAAGATCACAAGTCTGGGAACGAGAAATTTTCACTTTCCGAGATTGCTAAC
ATGGATGAGAGGAATGAAGTCATCTTACAGATCAGAACTGTGCAATAATCTATCTCCAAG
TGGTTTGACAATGATGGGTGTACGATGTAACAGATACTTTACAGTTATCATGGCTCAAAC
TGTTCATTCAACTTTTTGTTTACCTCCATTCTGACAAATTAAATAAAGAAGGCCTTACAA
TGCTAAATTTTTCATGATGTATCACTGCTGTGTATTTATTTCTCACAAGTTTTTATGTTG
CACAGCTGTTGCATTTTACATGTTTTCCTTAACCCTGCAATCATGATTTTTACCCCCGTC
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GTTTGTTGTATCTGAAGCCTCTAGCTATATAGAGTATCGCCTATATCTTCGTTCGACTTA
CCATGTATTAGGCAAACAGTTTAATGTTGCTGTTCCACTGATTCAGTATCATTTATAAAC
TAAAAAATAGCCAATCACGCACTGTGGTATGAATGTACCCACAATGTAGGTGTGTCCTAT
CAAGAGTAAAAGCTATTTTCTCCTGTTTATAGACAATCTTGTGTTTGTACGCTTGTTACT
GTCGAAGCTGTCCCATGTTACTCTCAAGGCTACATGTGAAGGTTGAATAACTTGAAATTC
TGTTCCATCCTTTTTTACGATTTTTTTTATTTTTACTAAAACTTAGAATTTTTTTAAAAA
ATTGTTCTTGTTCATACTCTCCAAACAAAGTAGTTAATGGTATGTAGCCCAGACTCGTTG
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TGAATTATACTAAGTTAAACGTCACACCATTGCCATGTACATGTGATACGTAAGTTTTTG
GTTTACTTTAATGGTGCCTGATCAGTTAATTCCACTGCTAATAGCTTTTTTAGTAGCCCT
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AAATTGTTCTTTTGTGCTCCCAATTAAAAGAATTGTTTAGCAGGTTATGGCAGGCCTGAT
TAGTTATATGTAAGTCCTAATATTTATGCTTCCGCTGTAAAGGCAGTTGTTGTTTGTTGA
CTGGCGTTATTCCAAATCCGGTAAACACCAAATAATGAATGTAATTTATTTACGCTCACC
AACAGCCACAATAACATGGTATTCGGTTTTAAACGCATCATGCTCAGTTTCAACATAACA
GTTTTCACCAAAGGTAGTAAAGACCGGTTTACACCAAGTGCGCTTTACACATCACTCACT
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TGGGAGACTATTCTCATGAAAATACACCCCCCGTTGAACGAGGTTGATGATATCCCGTTT
AGCCGCTGACAGGCCCAAATCGATTCCATTTTAACGCGTGACGTCACACTGCTGTCACGT
GATTCTGTCCGATATATAATTCGCCCTTTCCCTAACATAAGAACTAATAACAAGAAACCA
CTTTCTGCACTGAGACCTCTGCCCAGCCGTCAAGCAAGCTTTCGCCCGATACCGTAT
| Gene3D |
R3H_dom_sf (IPR036867) - T[116-242] 2.6E-40 |
| SUPERFAMILY |
R3H_dom_sf (IPR036867) - T[120-218] 3.14E-28 |
| SMART |
R3H_dom (IPR001374) - T[126-203] 5.3E-11 |
| ProSiteProfiles |
R3H_dom (IPR001374) - T[143-206] 11.956 |
| Pfam |
R3H_dom (IPR001374) - T[146-200] 5.7E-11 |
| ProSiteProfiles |
SUZ (IPR024771) - T[207-283] 10.905 |
| Pfam |
SUZ (IPR024771) - T[230-282] 7.3E-9 |
| Protein Name | Identity | Bit Score | e-value |
|---|---|---|---|
| ARP21_HUMAN | 46.914 % | 158 | 6.21E-40 |
| R3HD1_HUMAN | 49.39 % | 160 | 2.02E-40 |
| R3HD2_HUMAN | 54.167 % | 145 | 1.5E-35 |