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  1. Transcript 'KH2012:KH.L41.50.v1....'

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.L41.50.v1.A.SL1-1

Possible name(s)

SLC12A2; SLC12A3; SLC12A9

Location

KhL41 [9,306 / 22,364]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 928

>KH.L41.50.v1.A.SL1-1
NTMATGTDKDLLINKTSPKSDYAASHTSVRLSSIVDHDQNTLGPQQPKLSTFFGVVVPCC
LSMFSVILFLRMGFIVGQAGMLEGLAMLLLAYSIIGLTVLSVCAISTNGAIEGGGAYFMI
SRALGPEFGGAIGLMFFLANVASTALYVFGLVEAMLSFFGPEGQLQPNIFPKGQWWSYLY
GSIILLVCLVVCVVGADIYAKTTFLIFVVVMVCIASIFISFLAKPTFVLKSNVTMVHMNV
LHECNATNVTYTSFSEKTFRENLGYDWTIDYTTLKMQNFVIVFAVLFNGCTGIMAGANMS
GDLKNPSRSIPVGTISACLITFVVYMALIVLISATTPRSILHCNYSFLLTINLWGPFIAI
GVFASSLSAALSCLIGASRILFALARDDLFGIILRPMTKSTSSGNPIVAVLFSWFLVQMT
LFVGQLNTIAPIVTIFFLISYAATDLACLALEWASAPNFRPTFKLFTWHTCVLGFISCVI
MMFLIQALYTSVSVVVLIILLIIIHYRVPTSSWGYISQALIFHQVRKYMLMLDVRKEHVK
FWRPQILLMVKNPRSSCQLIEFINSIKKSGLYVLGHVSIGSLSEMESDILKPQYNHWLNL
VDEMGVKAFVELTLSKSVREGTEHLLRISGLGGMKPNTLVLGFHDNLPQKDTFKDLGIFK
GGHSRTGSSIASIISHDQPIEEDDAFDSGSFFPDVVETDDSGKLATVDYVAIIADAIKLQ
KNVCLARYFNQLDKTSMAQDKAKVHYIDVWPVNFLTHIVDRRNNSEASTSAFRTTSSSFF
DTTCVFLMQMACILNMTPFWKNRTKLRIFLFTETSDDSTAPGDEELEEFLKTVRIKAEIK
PVKWGDVATSSDQTATNPQSNYSDTLKKINSLIRSQHSSTAVTFLYLPTPPMSMDQCVDY
IDMLTQISDNLGPTLFVHGLSHVISTTL

Nucleotide sequence

Length: 3,361

>KH2012:KH.L41.50.v1.A.SL1-1
AGCCATGTTTGTAGTATTGTTATATGATTAAAGTACAAAGTTATCACTCAAATAAAACAC
CATGGCTACTGGTACAGATAAAGACCTTCTTATCAATAAAACTTCCCCCAAAAGTGATTA
TGCTGCATCACATACATCAGTTCGTCTCTCAAGCATTGTGGATCATGACCAGAACACCCT
GGGACCTCAGCAACCAAAACTCTCAACATTCTTTGGTGTTGTGGTGCCTTGTTGTTTATC
TATGTTTAGTGTGATCCTCTTCCTTAGAATGGGGTTCATAGTTGGTCAGGCCGGGATGCT
TGAAGGGCTGGCTATGCTTCTACTTGCTTATTCAATCATCGGGTTAACCGTGTTATCTGT
GTGTGCCATATCAACTAATGGAGCCATTGAAGGGGGAGGGGCTTACTTCATGATAAGCAG
AGCATTAGGACCTGAGTTTGGAGGCGCGATTGGTTTGATGTTCTTCCTTGCAAATGTGGC
TTCAACCGCACTCTATGTGTTTGGGTTAGTGGAAGCAATGCTGTCTTTCTTTGGCCCTGA
AGGTCAATTGCAACCAAATATATTCCCGAAGGGTCAGTGGTGGAGTTATTTATACGGCTC
AATTATTCTCCTTGTGTGTCTGGTTGTTTGTGTGGTTGGTGCGGATATCTACGCCAAAAC
TACTTTCCTTATATTTGTGGTTGTTATGGTTTGCATTGCGTCAATATTTATAAGTTTTCT
TGCGAAACCCACCTTTGTATTGAAGAGCAATGTCACCATGGTGCACATGAATGTATTACA
TGAATGTAATGCCACTAATGTGACTTACACAAGCTTCAGTGAAAAAACATTTCGGGAAAA
CTTGGGATATGATTGGACGATAGACTACACAACATTAAAGATGCAAAACTTTGTCATTGT
GTTTGCTGTCTTGTTTAATGGTTGCACAGGTATTATGGCGGGAGCAAATATGTCAGGTGA
TTTAAAAAACCCAAGTCGTTCCATCCCAGTGGGAACGATATCTGCTTGTCTCATAACGTT
CGTTGTATATATGGCACTTATTGTACTTATTAGTGCTACTACTCCAAGGTCAATTCTTCA
CTGCAACTACAGTTTCTTACTCACCATCAACTTATGGGGTCCGTTTATCGCGATTGGGGT
GTTTGCATCCTCGCTCTCTGCTGCCCTCAGCTGCTTGATTGGAGCGTCAAGGATATTATT
CGCTCTTGCCCGAGACGATTTGTTTGGAATCATCTTACGTCCAATGACAAAATCTACAAG
TTCAGGCAACCCAATAGTAGCCGTGTTATTCTCATGGTTTCTTGTGCAGATGACTTTATT
TGTTGGCCAGTTGAACACCATAGCTCCCATAGTCACAATATTCTTCCTTATTTCTTACGC
AGCAACTGATCTTGCTTGTCTTGCATTGGAATGGGCGTCAGCTCCTAACTTCAGGCCAAC
ATTCAAGTTATTCACATGGCATACATGCGTGCTTGGGTTCATCAGTTGTGTAATCATGAT
GTTTCTTATACAAGCCTTGTACACCTCAGTTAGTGTGGTTGTGTTGATTATTCTGTTGAT
CATCATCCACTATAGAGTTCCTACTTCATCGTGGGGTTATATCAGCCAAGCTCTTATTTT
CCATCAGGTTCGTAAATACATGTTAATGTTGGACGTACGCAAGGAACACGTTAAGTTTTG
GAGACCTCAGATTCTGCTTATGGTTAAAAACCCACGAAGTTCTTGTCAGCTGATTGAGTT
TATTAATTCAATCAAGAAATCAGGCCTGTACGTCCTCGGCCACGTAAGTATTGGCAGCTT
GTCTGAGATGGAGAGCGACATCTTGAAACCCCAATACAACCATTGGTTGAATCTTGTGGA
TGAGATGGGGGTCAAAGCATTTGTGGAACTCACGTTGTCAAAGTCGGTTAGGGAGGGAAC
GGAACACTTGTTGCGAATATCTGGTCTTGGAGGAATGAAACCAAACACTTTGGTTCTTGG
GTTCCATGATAATTTACCTCAGAAAGATACTTTCAAAGACCTTGGGATATTCAAAGGAGG
CCATAGTAGGACTGGTTCCAGCATTGCTTCCATCATCTCACACGACCAACCAATTGAAGA
AGATGACGCGTTCGATTCTGGAAGCTTCTTTCCCGATGTCGTAGAAACCGATGACTCGGG
AAAACTAGCAACTGTTGATTACGTTGCAATTATTGCTGATGCCATAAAACTGCAGAAGAA
TGTTTGTCTTGCTAGATATTTTAATCAGCTTGACAAAACAAGCATGGCACAGGACAAAGC
CAAGGTTCATTACATCGATGTTTGGCCCGTCAACTTTCTCACTCATATTGTGGATAGAAG
GAATAACTCAGAAGCCAGTACCTCGGCTTTCCGCACCACATCCTCATCTTTCTTCGACAC
TACTTGTGTCTTCCTGATGCAGATGGCTTGCATCCTTAATATGACTCCTTTCTGGAAGAA
TCGAACAAAGTTGAGGATCTTCCTTTTCACCGAAACATCTGATGACTCTACTGCTCCCGG
TGACGAGGAATTGGAGGAGTTTCTTAAAACTGTCCGCATCAAAGCTGAGATAAAACCCGT
CAAGTGGGGTGATGTGGCGACATCCAGTGACCAAACCGCAACGAATCCGCAAAGCAATTA
TTCCGATACGCTAAAAAAAATAAATTCTCTCATACGTTCACAACACTCAAGTACAGCAGT
TACATTCCTCTATCTACCAACCCCACCCATGAGCATGGATCAGTGTGTGGATTACATTGA
CATGTTAACGCAGATTAGTGACAACCTCGGCCCAACCCTATTTGTCCATGGTCTCTCCCA
TGTTATTTCAACTACTTTGTGATGTCATAGTCACCTTTTATGAGACATGAATGCTGCGTA
TTGTGACATATTACCTGCTGTGGCCTGTACCCAAAGTGCAATTAGAAATATTAGCCATAT
TCAAGCAACTGGTATTTTGTTAAAAATGTTTAACTTAATATTTTATAAAGACCAACAATC
CTCTGGCATGTGGGATACCTCATCAAAGTTTGTGTTAATAACAACTTAATGCTAAACAGT
TTCCCAAACATAAATTGATAAAGCATATTTTTTGCAACATCAGCAAACATTAGGCATATT
TGTAATTGAAATCAGTATACTAAATTATGCATGCATATGCTGTATGCATAAGATGTTTAC
TAAGTTTACCTTTTTCTCTGTACAGCTTAATAATATGAAACAGTCATAAATATCATTTAT
TCATTCATCTTAAAATCAGGATATATGAACAACATTCTTGTTTTAGGGATCTTTTGAATA
TTTATTTTTGTCCTGTGAATATTTCTTTGTGCAATAAGCTGCTTGCAGCGGCATTCATGG
T

InterProScan

Pfam
AA-permease/SLC12A_dom (IPR004841) - T[54-547] 3.8E-91
Pfam
SLC12_C (IPR018491) - T[558-646] 4.6E-14

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
S12A9_HUMAN 47.18 % 789 0
S12A2_HUMAN 31.221 % 302 5.8E-87
S12A3_HUMAN 29.922 % 293 1.05E-84