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  1. Transcript 'KH2012:KH.L18.53.v1....'

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.L18.53.v1.A.SL2-1

Possible name(s)

TPRA1

Location

KhL18 [747,390 / 750,563]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 336

>KH.L18.53.v1.A.SL2-1
FVPNTLFLIFVLYRMRHVWHRILSGIGSGGSPIFVTYFILVAITAVVGVIRGIVSMTVDS
ASISGGDANKILWVILRFFLLTAEMSVLVFGLAFGHLDSKTSIKRVLCVTTMLALIYSTI
QCVLELITPDVHYEVPSSKWVVYGHGGATFTFVTSVIFLLVYILIGILPFIKWLQKYLSV
PSRRSFYVYVGVMAFMNFIAVIGSGLLFYCDMVGLCLIDVFSLAYFTCFAPLLYWTFLSS
YFSNTQPNSTLFSYSNQVDEGLTDVADYDMPSNGITVDSTLSGILVFNHGDQEPYQSSNG
LIDEPLHDFAEMPRRSFDSTTNPMDSTHTFFNDSIS

Nucleotide sequence

Length: 1,793

>KH2012:KH.L18.53.v1.A.SL2-1
AACTGTAAATATCGTTGGGTTTTGAATTATTATTCTTAATGGCAAACGTCACAAGCAACT
CCACAACAGTTGCACCAACTACTGTACATTACACAACTCAACCGAGCAACAGCACAATAT
CAGCACACACATCAGGTGCAGTTTCAACAAGCACTTTCCATACGAATTTGACAACCAGCG
CTGCAACATGGAACACCACATCCGCGTATAGTTCCTCTACTGTCTCACCTTTCAACACAA
CCTTGCCAGAAGTAAATGTGACCCCAACTACTATTTCTCCATTTACTTACCCTTGTCATG
AAGCAAATGAGAGCAGATGTCTGCGTATTCTGTATGAAGATGTTGGTGAATCCAGAGTTC
GCATTTGGGATGTGGTTTTAGTTTGTCCCCAACACGCTGTTCTTGATCTTTGTCCTTTAC
CGGATGCGTCACGTGTGGCATCGAATTCTTTCTGGCATCGGAAGTGGCGGAAGTCCCATT
TTTGTTACTTACTTTATTCTTGTAGCCATCACTGCTGTGGTTGGAGTGATTAGAGGAATT
GTGTCAATGACAGTTGACAGTGCATCGATATCTGGTGGAGATGCAAACAAGATTCTGTGG
GTAATTCTCAGATTTTTCTTACTCACTGCTGAAATGAGTGTGCTTGTGTTTGGACTTGCA
TTTGGTCACCTTGATAGCAAAACAAGCATCAAAAGGGTTTTATGTGTAACCACCATGTTG
GCTCTTATCTATTCCACAATACAGTGCGTTCTTGAGTTAATTACACCAGACGTGCACTAC
GAGGTGCCATCATCAAAGTGGGTTGTGTATGGTCATGGAGGGGCCACCTTTACCTTTGTT
ACTTCAGTTATATTTTTACTGGTTTATATCTTGATAGGTATCTTACCTTTTATCAAGTGG
TTGCAAAAATATTTATCTGTTCCAAGTCGCAGATCCTTCTATGTTTATGTTGGTGTTATG
GCGTTCATGAATTTTATTGCTGTCATTGGATCCGGTTTGCTTTTCTACTGTGATATGGTT
GGTCTGTGCTTAATTGATGTGTTTTCTCTTGCTTACTTCACCTGCTTTGCCCCACTTTTG
TACTGGACCTTCCTGAGCTCCTACTTCTCAAACACACAGCCTAATAGCACATTGTTCTCA
TACTCCAACCAAGTAGATGAGGGACTGACAGATGTAGCTGATTACGACATGCCAAGCAAT
GGGATCACGGTGGATTCTACCTTAAGTGGCATTCTCGTGTTTAACCATGGAGACCAGGAA
CCATACCAATCATCAAATGGATTGATAGATGAACCACTTCATGACTTTGCAGAGATGCCA
AGAAGGAGTTTTGACTCAACCACCAACCCCATGGACAGCACCCATACCTTTTTTAATGAT
AGTATAAGCTAAGCACAATATTGTATATTAAAGCCACACTAGTATACTCTCTGTATTTAT
AACCACAGCACATTATCATTGTTGGAGATCCTAATTAGTTTAGGTGCTTCTGTTCCTATG
CTTCATATTTTAACCACTCATTGTAAATTGTGCAAATATGCTTCCATTATATTCGTTACC
ATCTGCTTGTTTTGCCTTGAGATTGCTTTATAAAACAAAAACTATTTTCTCAGAGTGTGT
TAGCCTTCTTTAACTTATTATCCTAAATAATAGGGGTATACAGCATTCTTTTGGTTTACT
TTAACTTAAGAAGTTTTATTTTTCAGTGTTGAATAATTCTTACATTTGAAGTTGCAATTT
ATCCTTGTATTAAAGTGACGTGTAAGTTCTTAAAATATATTCGCATAAACTTA

InterProScan

Pfam
TPRA40 (IPR018781) - T[2-245] 5.0E-57
PANTHER
TPRA40 (IPR018781) - T[2-330] 2.7E-98

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
TPRA1_HUMAN 47.426 % 217 4.05E-68