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  1. Transcript 'KH2012:KH.L18.53.v1....'

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.L18.53.v1.A.ND1-1

Possible name(s)

TPRA1

Location

KhL18 [747,390 / 750,659]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 336

>KH.L18.53.v1.A.ND1-1
FVPNTLFLIFVLYRMRHVWHRILSGIGSGGSPIFVTYFILVAITAVVGVIRGIVSMTVDS
ASISGGDANKILWVILRFFLLTAEMSVLVFGLAFGHLDSKTSIKRVLCVTTMLALIYSTI
QCVLELITPDVHYEVPSSKWVVYGHGGATFTFVTSVIFLLVYILIGILPFIKWLQKYLSV
PSRRSFYVYVGVMAFMNFIAVIGSGLLFYCDMVGLCLIDVFSLAYFTCFAPLLYWTFLSS
YFSNTQPNSTLFSYSNQVDEGLTDVADYDMPSNGITVDSTLSGILVFNHGDQEPYQSSNG
LIDEPLHDFAEMPRRSFDSTTNPMDSTHTFFNDSIS

Nucleotide sequence

Length: 1,889

>KH2012:KH.L18.53.v1.A.ND1-1
TTCGTTAGGTTTATGTTATGCAATTTTTGTATAGAAATCTTCACTAGCACCAAAACTGTG
TAAAGATAATAAACTGACTGCCAACCTGATTTTCAGAACTGTAAATATCGTTGGGTTTTG
AATTATTATTCTTAATGGCAAACGTCACAAGCAACTCCACAACAGTTGCACCAACTACTG
TACATTACACAACTCAACCGAGCAACAGCACAATATCAGCACACACATCAGGTGCAGTTT
CAACAAGCACTTTCCATACGAATTTGACAACCAGCGCTGCAACATGGAACACCACATCCG
CGTATAGTTCCTCTACTGTCTCACCTTTCAACACAACCTTGCCAGAAGTAAATGTGACCC
CAACTACTATTTCTCCATTTACTTACCCTTGTCATGAAGCAAATGAGAGCAGATGTCTGC
GTATTCTGTATGAAGATGTTGGTGAATCCAGAGTTCGCATTTGGGATGTGGTTTTAGTTT
GTCCCCAACACGCTGTTCTTGATCTTTGTCCTTTACCGGATGCGTCACGTGTGGCATCGA
ATTCTTTCTGGCATCGGAAGTGGCGGAAGTCCCATTTTTGTTACTTACTTTATTCTTGTA
GCCATCACTGCTGTGGTTGGAGTGATTAGAGGAATTGTGTCAATGACAGTTGACAGTGCA
TCGATATCTGGTGGAGATGCAAACAAGATTCTGTGGGTAATTCTCAGATTTTTCTTACTC
ACTGCTGAAATGAGTGTGCTTGTGTTTGGACTTGCATTTGGTCACCTTGATAGCAAAACA
AGCATCAAAAGGGTTTTATGTGTAACCACCATGTTGGCTCTTATCTATTCCACAATACAG
TGCGTTCTTGAGTTAATTACACCAGACGTGCACTACGAGGTGCCATCATCAAAGTGGGTT
GTGTATGGTCATGGAGGGGCCACCTTTACCTTTGTTACTTCAGTTATATTTTTACTGGTT
TATATCTTGATAGGTATCTTACCTTTTATCAAGTGGTTGCAAAAATATTTATCTGTTCCA
AGTCGCAGATCCTTCTATGTTTATGTTGGTGTTATGGCGTTCATGAATTTTATTGCTGTC
ATTGGATCCGGTTTGCTTTTCTACTGTGATATGGTTGGTCTGTGCTTAATTGATGTGTTT
TCTCTTGCTTACTTCACCTGCTTTGCCCCACTTTTGTACTGGACCTTCCTGAGCTCCTAC
TTCTCAAACACACAGCCTAATAGCACATTGTTCTCATACTCCAACCAAGTAGATGAGGGA
CTGACAGATGTAGCTGATTACGACATGCCAAGCAATGGGATCACGGTGGATTCTACCTTA
AGTGGCATTCTCGTGTTTAACCATGGAGACCAGGAACCATACCAATCATCAAATGGATTG
ATAGATGAACCACTTCATGACTTTGCAGAGATGCCAAGAAGGAGTTTTGACTCAACCACC
AACCCCATGGACAGCACCCATACCTTTTTTAATGATAGTATAAGCTAAGCACAATATTGT
ATATTAAAGCCACACTAGTATACTCTCTGTATTTATAACCACAGCACATTATCATTGTTG
GAGATCCTAATTAGTTTAGGTGCTTCTGTTCCTATGCTTCATATTTTAACCACTCATTGT
AAATTGTGCAAATATGCTTCCATTATATTCGTTACCATCTGCTTGTTTTGCCTTGAGATT
GCTTTATAAAACAAAAACTATTTTCTCAGAGTGTGTTAGCCTTCTTTAACTTATTATCCT
AAATAATAGGGGTATACAGCATTCTTTTGGTTTACTTTAACTTAAGAAGTTTTATTTTTC
AGTGTTGAATAATTCTTACATTTGAAGTTGCAATTTATCCTTGTATTAAAGTGACGTGTA
AGTTCTTAAAATATATTCGCATAAACTTA

InterProScan

Pfam
TPRA40 (IPR018781) - T[2-245] 5.0E-57
PANTHER
TPRA40 (IPR018781) - T[2-330] 2.7E-98

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
TPRA1_HUMAN 47.426 % 217 4.05E-68