Aniseed - Transcript Card

Transcript 'KH2012:KH.L171.11.v1...'

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.L171.11.v1.A.SL3-1

Possible name(s)

FBXL15; FBXL20; FBXL7

Gene model

KH2012:KH.L171.11

Location

KhL171 [170,249 / 181,419]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 264

>KH.L171.11.v1.A.SL3-1
ILDFLSIKEVFLLREVSKKYQTTVDEYFMTCRKLQLAEHSCDVTPEAFLLMTKKNNILQE
LNLNNSKHWLDDNLFLSVVCRCPMLKNVDITNCSRLTNRSLHTLASYCQFLTRLSIHGCH
WIDKDTFKVVISSNQNLIDVDASGCWSLDDDCIITMAAKCTKLKKLALVNVYPITDRSID
SLALNCKHLTTLKVSGCWRITNTSIGKIGEYCKKLHLLHVKDCRDISESSLARLRVRNVV
IDKPVPPKTFSRRLLVQPYVNLQV

Nucleotide sequence

Length: 1,393

>KH2012:KH.L171.11.v1.A.SL3-1
ATTTTGGATTTTTTATCTATAAAAGAGGTTTTCTTATTAAGGGAAGTATCCAAAAAGTAC
CAAACAACGGTGGATGAATATTTTATGACTTGCCGAAAGCTGCAGTTAGCTGAGCACAGT
TGTGATGTTACCCCAGAAGCTTTTCTACTTATGACTAAAAAAAACAACATTTTGCAAGAG
TTAAATCTTAACAATTCAAAACATTGGCTTGATGACAATTTGTTTTTATCCGTGGTCTGC
AGATGCCCAATGTTAAAGAATGTTGATATTACTAACTGCTCACGGCTTACCAATCGTTCG
CTGCACACTCTTGCTTCGTACTGCCAATTTCTTACAAGACTTTCGATTCATGGCTGCCAT
TGGATAGACAAGGATACTTTCAAAGTTGTTATTTCAAGTAATCAGAATCTGATTGATGTG
GATGCAAGTGGTTGCTGGTCGCTGGATGATGACTGCATAATTACAATGGCTGCAAAATGT
ACAAAATTAAAAAAACTTGCGTTGGTGAATGTATATCCAATCACAGATCGTTCAATAGAC
TCACTGGCACTTAATTGTAAACATCTGACAACACTAAAGGTTTCTGGATGTTGGCGAATA
ACCAACACTTCTATTGGGAAAATAGGTGAATACTGCAAGAAACTACACCTACTACATGTG
AAGGACTGTAGAGACATATCGGAATCTAGTCTGGCCCGACTAAGGGTTCGAAATGTTGTG
ATAGACAAACCAGTTCCACCCAAGACTTTTTCTAGGAGGCTATTGGTTCAACCATATGTC
AACCTACAGGTGTAATATATATGGTGTTCAAAGTTACGTGTTAAATACTTTGATATGTGT
TGTCAATTTCAATTTATGAACGCAATGTGTTTAATCGAACTCGTTAGATATTGTTGTTGG
TTTCCTTTTGTTGAAAGGTTTAAATTAGGATATACTTACCTTATTGGACATTTTTGTTAA
AAAAAATATAAAACTGTCCTTTTTTAATTCCCACAATGTCACAGAAAAAAAAAATTCAAA
GTTTGGTTGGCTGAAAAACTAAGTTTTTGACTGGTTAAACAAGTGCTTATGCGGGAGTAA
ATGGGAGAATTCTTCTATTCGATCTTTTTTGATTTTAAACTTATATGTTTAAATATTTTA
ACTCTTTGTTATGTTTTCTTTAAATGACACTATTTAAGGTGCTCTAGTTGACCAAATTTA
AGGTTATCCTTCTGTCATTAGTCCCATTTATTTTGTTATTCTGTAATCAACATGCCTATT
TGTTTGCTTGCCTAAATGTCCAATTTTTTTCTTTTTTTGCAGCTCTTTCTTGTTTTTTCA
TTCGTCTATCAAGAAGGATGTAATTTATTAACTAAATGAAAACTGACACTGTTGTTTAGC
AGTAGGAAATAAA

InterProScan

Gene3D	LRR_dom_sf (IPR032675) - T[15-242] 4.5E-34
SMART	Leu-rich_rpt_Cys-con_subtyp (IPR006553) - T[82-107] 1.1E-4 - T[108-133] 470.0 - T[160-185] 1.0 - T[186-211] 3.9 - T[212-237] 28.0

Best Blast Hits in UniProt

Protein Name	Identity	Bit Score	e-value
FBXL7_HUMAN	31.646 %	79.7	6.44E-17
FXL20_HUMAN	30.323 %	84	1.67E-18
FXL15_HUMAN	30.627 %	144	9.11E-42