Aniseed - Transcript Card

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.L171.11.v1.A.SL1-1

Possible name(s)

FBXL15; FBXL20; FBXL7

Gene model

KH2012:KH.L171.11

Location

KhL171 [170,217 / 181,419]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 274

>KH.L171.11.v1.A.SL1-1
LPFHDVLFPKILDFLSIKEVFLLREVSKKYQTTVDEYFMTCRKLQLAEHSCDVTPEAFLL
MTKKNNILQELNLNNSKHWLDDNLFLSVVCRCPMLKNVDITNCSRLTNRSLHTLASYCQF
LTRLSIHGCHWIDKDTFKVVISSNQNLIDVDASGCWSLDDDCIITMAAKCTKLKKLALVN
VYPITDRSIDSLALNCKHLTTLKVSGCWRITNTSIGKIGEYCKKLHLLHVKDCRDISESS
LARLRVRNVVIDKPVPPKTFSRRLLVQPYVNLQV

Nucleotide sequence

Length: 1,425

>KH2012:KH.L171.11.v1.A.SL1-1
CTCTGCCGTTTCATGATGTCTTGTTTCCAAAGATTTTGGATTTTTTATCTATAAAAGAGG
TTTTCTTATTAAGGGAAGTATCCAAAAAGTACCAAACAACGGTGGATGAATATTTTATGA
CTTGCCGAAAGCTGCAGTTAGCTGAGCACAGTTGTGATGTTACCCCAGAAGCTTTTCTAC
TTATGACTAAAAAAAACAACATTTTGCAAGAGTTAAATCTTAACAATTCAAAACATTGGC
TTGATGACAATTTGTTTTTATCCGTGGTCTGCAGATGCCCAATGTTAAAGAATGTTGATA
TTACTAACTGCTCACGGCTTACCAATCGTTCGCTGCACACTCTTGCTTCGTACTGCCAAT
TTCTTACAAGACTTTCGATTCATGGCTGCCATTGGATAGACAAGGATACTTTCAAAGTTG
TTATTTCAAGTAATCAGAATCTGATTGATGTGGATGCAAGTGGTTGCTGGTCGCTGGATG
ATGACTGCATAATTACAATGGCTGCAAAATGTACAAAATTAAAAAAACTTGCGTTGGTGA
ATGTATATCCAATCACAGATCGTTCAATAGACTCACTGGCACTTAATTGTAAACATCTGA
CAACACTAAAGGTTTCTGGATGTTGGCGAATAACCAACACTTCTATTGGGAAAATAGGTG
AATACTGCAAGAAACTACACCTACTACATGTGAAGGACTGTAGAGACATATCGGAATCTA
GTCTGGCCCGACTAAGGGTTCGAAATGTTGTGATAGACAAACCAGTTCCACCCAAGACTT
TTTCTAGGAGGCTATTGGTTCAACCATATGTCAACCTACAGGTGTAATATATATGGTGTT
CAAAGTTACGTGTTAAATACTTTGATATGTGTTGTCAATTTCAATTTATGAACGCAATGT
GTTTAATCGAACTCGTTAGATATTGTTGTTGGTTTCCTTTTGTTGAAAGGTTTAAATTAG
GATATACTTACCTTATTGGACATTTTTGTTAAAAAAAATATAAAACTGTCCTTTTTTAAT
TCCCACAATGTCACAGAAAAAAAAAATTCAAAGTTTGGTTGGCTGAAAAACTAAGTTTTT
GACTGGTTAAACAAGTGCTTATGCGGGAGTAAATGGGAGAATTCTTCTATTCGATCTTTT
TTGATTTTAAACTTATATGTTTAAATATTTTAACTCTTTGTTATGTTTTCTTTAAATGAC
ACTATTTAAGGTGCTCTAGTTGACCAAATTTAAGGTTATCCTTCTGTCATTAGTCCCATT
TATTTTGTTATTCTGTAATCAACATGCCTATTTGTTTGCTTGCCTAAATGTCCAATTTTT
TTCTTTTTTTGCAGCTCTTTCTTGTTTTTTCATTCGTCTATCAAGAAGGATGTAATTTAT
TAACTAAATGAAAACTGACACTGTTGTTTAGCAGTAGGAAATAAA

InterProScan

Gene3D	LRR_dom_sf (IPR032675) - T[4-255] 1.7E-34
SMART	Leu-rich_rpt_Cys-con_subtyp (IPR006553) - T[92-117] 1.1E-4 - T[118-143] 470.0 - T[170-195] 1.0 - T[196-221] 3.9 - T[222-247] 28.0

Best Blast Hits in UniProt

Protein Name	Identity	Bit Score	e-value
FBXL7_HUMAN	31.646 %	79.7	6.94E-17
FXL20_HUMAN	30.323 %	84	2.32E-18
FXL15_HUMAN	31.673 %	157	1.18E-46