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  1. Transcript 'KH2012:KH.L170.77.v2...'

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.L170.77.v2.A.SL3-2

Possible name(s)

EFR3A; EFR3B

Location

KhL170 [174,524 / 177,802]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 796

>KH.L170.77.v2.A.SL3-2
KCGKNLENCYTMSCCSCFSALRPQYKRLVDSIYPANPEDGLVRSEMEKLTYYAASAPEKL
DRIGDYLARRLTRDMARKREMPVVIAMEALNQLLLACHAQQINLFVESFLKMVATLLESD
NPEFLTLGTNSFEKFSEIKEDTASYHRRYDFFVSKFSSMCHSQQKNSAIRQKVQLHGVRG
LRGVIRKTVTDELQVNIWEKQHMDKIIPSLLYSMQDDPDSSLTEEASPGNNKNNVNHSAL
AEEALRELFSRATFANVSAALVPALSHMDNHSLWGPKNGFAIKCFKVIMYSIQAQYSHVV
VKMLLDHLDENTKEDDDIKASMLQVLCIIVPIPSSAAIGPSVLDVFNRISKHLHLCADSK
PHSKFEEALIETTGVLAAVVPDYQKLETMTFYVNRANEVLHNSEDLNETDVEQNFAHLLL
LCLVQIAKTYHCSNISNLTVTLLEPLLKVAFSAQPGDRLLAQSLLASLLDKNKNYGKLKL
VSHQREVESLKLITSTAGKYDGDFLERRLPSIYNWLYSSYTLETNTIANFTSLYKCAAVL
CLSIVSHDVIMDVTRIMLAVQSVAVDSISNSGMTHFSCGVLASTSCCLLILAHVSAVPEF
QHYVNQVIHAREKFALQFLPKNALDSHVNHKPQKLSPENAEKVYFNSSEIYNALKGRSGY
NIEKLTRPFQANLQMDTLSSDAQRSIDVESINIEFSVDKQQSVVMEDGTMSAENITYEYL
KQVFYKPPMSKEERLAKQKKLADHIRSAPFEQLLSEMQPDPVDSTQKLVSQLLEDEDLYV
QDYDLESMEYPSIYAY

Nucleotide sequence

Length: 3,278

>KH2012:KH.L170.77.v2.A.SL3-2
AAATTCCTTTAAAAATGTGGTAAGAATCTTGAAAACTGCTACACCATGAGTTGCTGTTCT
TGTTTTTCTGCTCTAAGGCCACAATATAAAAGATTAGTTGACAGTATTTACCCTGCTAAC
CCTGAAGATGGGTTGGTTCGGAGTGAGATGGAAAAATTAACTTACTATGCCGCGTCTGCA
CCGGAAAAACTTGATCGAATCGGGGATTATTTGGCACGAAGGCTCACAAGAGACATGGCA
AGGAAAAGAGAAATGCCTGTCGTGATCGCCATGGAAGCTTTAAACCAGTTACTGCTAGCT
TGTCATGCGCAGCAGATTAATCTGTTTGTTGAGAGCTTTTTAAAAATGGTGGCTACGCTG
CTGGAGTCTGACAACCCTGAGTTTCTGACTCTTGGCACGAATTCGTTTGAGAAGTTTTCT
GAAATTAAAGAGGACACGGCTTCATATCATCGAAGGTATGATTTCTTTGTTTCAAAGTTT
AGCTCAATGTGTCACAGTCAGCAGAAGAACAGCGCAATACGACAGAAAGTGCAGCTGCAT
GGTGTCAGAGGTTTAAGAGGGGTTATACGAAAAACTGTAACAGACGAACTACAAGTTAAT
ATATGGGAAAAGCAGCATATGGATAAGATAATTCCATCACTGTTGTACAGCATGCAAGAT
GACCCTGATTCGAGTTTGACTGAGGAGGCATCACCGGGAAATAATAAAAATAATGTGAAT
CATTCAGCTTTGGCAGAAGAAGCATTGAGGGAGCTTTTTTCTCGCGCAACATTCGCAAAT
GTGTCTGCAGCTCTTGTACCTGCACTATCACATATGGATAACCATAGTTTATGGGGCCCG
AAAAATGGTTTCGCAATTAAGTGTTTTAAAGTTATAATGTATTCTATACAAGCACAATAC
AGTCATGTTGTTGTTAAAATGCTTCTTGATCATTTGGATGAAAACACAAAAGAAGATGAT
GATATTAAAGCAAGCATGTTACAAGTTCTTTGTATAATAGTTCCTATACCTTCTTCTGCT
GCTATAGGGCCTTCAGTTTTGGATGTATTTAATCGCATATCAAAACACCTGCATTTGTGT
GCGGACAGCAAACCACACAGCAAATTTGAGGAGGCTCTTATTGAAACAACAGGTGTTCTT
GCTGCCGTGGTGCCAGATTACCAAAAACTAGAAACCATGACATTTTATGTGAACCGTGCG
AATGAGGTTCTTCATAACAGCGAAGACCTGAATGAAACGGATGTAGAACAAAACTTTGCT
CATTTGCTTCTGCTGTGTTTGGTACAAATAGCAAAAACTTATCACTGCAGCAACATTTCA
AATTTAACAGTAACACTGTTGGAGCCGCTGTTAAAAGTTGCATTTTCTGCCCAACCAGGC
GATCGCCTACTTGCTCAAAGTTTGTTAGCTTCGTTGCTTGATAAGAATAAAAATTATGGA
AAACTTAAGTTGGTTTCACATCAGCGAGAAGTTGAATCTCTTAAACTGATAACATCAACT
GCTGGCAAATATGATGGTGATTTTCTAGAGCGCAGGTTGCCTAGTATCTACAATTGGTTG
TACAGTAGCTACACCCTTGAAACAAACACCATTGCCAACTTCACTTCATTATACAAATGT
GCGGCAGTGCTTTGCCTCTCTATAGTTTCCCATGATGTGATTATGGATGTGACACGAATC
ATGCTTGCTGTACAATCTGTAGCTGTTGATTCAATTAGCAACTCTGGCATGACTCACTTT
TCATGCGGCGTGCTTGCTTCTACAAGCTGTTGTTTATTGATTCTTGCGCACGTATCAGCT
GTTCCTGAGTTCCAGCATTATGTGAATCAGGTCATTCACGCCCGAGAAAAATTTGCCCTT
CAGTTTTTGCCTAAAAACGCACTCGATAGCCATGTTAACCACAAACCACAGAAGCTATCA
CCAGAAAATGCAGAGAAGGTTTATTTCAACAGCTCAGAGATATACAATGCTCTTAAAGGA
AGAAGTGGATACAATATCGAGAAATTAACCAGGCCTTTTCAGGCAAACTTACAAATGGAT
ACTCTCAGCTCAGATGCTCAACGTTCAATAGATGTTGAATCAATCAACATTGAATTCTCA
GTTGATAAACAGCAGTCAGTAGTCATGGAAGATGGAACAATGTCAGCGGAAAACATAACA
TATGAATATCTGAAGCAAGTCTTTTATAAGCCACCCATGAGTAAAGAAGAGCGTCTAGCT
AAGCAGAAAAAGCTTGCCGACCATATTAGAAGCGCTCCGTTTGAACAATTACTGTCGGAA
ATGCAACCTGACCCTGTAGATTCAACGCAGAAACTTGTAAGTCAGTTATTAGAGGACGAG
GATCTGTATGTACAAGACTATGATCTTGAATCTATGGAATATCCGTCAATTTACGCTTAT
TAAGTTATTTCTTTAATTTTAAATTTGACAGTGCAATTTTCTGCAGCATATACAGTATAT
TTGGGTGGGATAAGATTGGGTATTTTATTATTCTATTTTTTTATTCCATTTGGTAATACA
CAAAGCACACTCAAAGAATTATAAAACTGTATCGTTACGACTCCCATAGACTGTTGTTAA
TTGTTTAAAACACAATCAGGATACTTGGATTAAGGTGCCCGGCTTTCCCCACCGTACTAT
ATAGATAAAAGTAAAATATGTTATTTTATTTTTGTCACAAATTATATTGGTACTTACTGG
TTCCTGCTACACATGAATCATGCTATGATTTGTGCTTTTAATGTTTTCTATTTATTTGTA
AATTTATGTCAAGTGAAATAATATTCCTATGTTTTTTAATGTTAAAATGTCATCATAGGC
GAAATGTTATTGTTGTTATTCCAACTTTTGAAACAGGGGTGACATTGTATGTTTTAGCAT
CAAGTAGCTTTAACCTTGTTAGTTGTCTATAAAAAAAAGCAGAGCGAAGTTATTACATTC
ACCACATTAATCAATGAAGTTCCCCATGTTGAATGACCATACGTGTAACTGCATTTTAAC
AGTGGCACACCAGATTTTGTTAAAAATTTAAATAACATGGCGCCTGTGAATGCCATCATG
TTGTAAAAATGTTTTTGTGTGACCGGAATTAAAGCATTTAGCGGTAAATTGCTCATTCAT
ACACCTTATGCTCTCATAAACACCCACTCTTAGCTGTCAACAAATTGTGCTTAATTACTT
ATATACTCTGACAATTTTTCTCTAATATGGTGATTATGTAATGCATTTTGACAGATACAG
TACCACAGTAGTTATATATATATGTGTGTTTATATTTA

InterProScan

SUPERFAMILY
ARM-type_fold (IPR016024) - T[40-473] 1.2E-9

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
EFR3A_HUMAN 38.718 % 538 1.33E-180
EFR3B_HUMAN 40.572 % 533 8.94E-179