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  1. Transcript 'KH2012:KH.L144.7.v1....'

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.L144.7.v1.A.SL1-1

Possible name(s)

PATJ; PDZD8; PDZRN4

Location

KhL144 [123,053 / 127,290]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 779

>KH.L144.7.v1.A.SL1-1
PTLLLKLVFKMGGLISLITNVTDAVQYLSAITISFILGALTVVAVVMYLLHEYTKSIAPP
KKPKLFKKLSVGRLLHENLNSGGDEHCSETCRFLNMIIFFVFNEWRNSMDLHKWVLKKIN
VELMELMETKAASRFLQSLKIHDIELGSNLPIIHGVTMDDPKCQINGPLPDNVTIDIDIE
YDGNLRLAVDVDLVFGKTAFVSLRIKYLKGSIRLQFSRFPCAHWSVCFVEEPDIKFDVDT
SFETKQLPQLGSLIVNQIRRTIKKKHTFPHYKLRYNPVFSFQHVKHHSEEEVSEVHVNLT
AVEVIIAACTRLLIPVKDGKDPNSQTVVFATLSLDEVSCENTPLLNEEKIERSFFGSPQK
EKRDVSSEVKANGINLEPKKLFQTFTNGSASTSEKLSTTHETLKASTSNLSDFKPIGVTT
PKRKSNLKKVVPSTLSYLMVTRNFSATLHELPFTKPDGETVTAVHVKSLTENASIFRQSG
IHTGDKILEINGNSISSLSQAVAVIESIRNKKERFRFKVQRVRSYSKMSNSSTVDLDSSC
DRFTNKGSFLTEEMTNDSLHSDEDTESDYSDLDSEEYRELLKIEENVLKPKTPDLPPPVV
EDLIRSPKTPGIDLSVKEVAPAPSTSSLRASFSTDRESNSEKLNFAKVTKTSVISKTTLC
PTGSNEYTWKNEKFKLPVTTEHKYLNIRFWFASKNQPMANYTQPKLMGNLAIPLFELEMH
CRLVTSQKFTRLYKISPPLKSLLEFRGRVNENFRHRSGFRLEYCFGDATIITKVEAPVL

Nucleotide sequence

Length: 4,237

>KH2012:KH.L144.7.v1.A.SL1-1
TATAGACATTATAGTGGTTATTTACCATACTGTGAAAAATATTTATTCAATGGATAAAAT
GTGAAGCTACGAGACTTGCACGAAATAACCAACGTTATTGTTGAAACTTGTGTTCAAAAT
GGGCGGCTTAATATCTCTTATTACGAACGTAACTGATGCTGTACAATATCTCAGTGCAAT
AACAATTTCATTCATTCTCGGGGCTTTGACAGTTGTTGCTGTTGTTATGTATCTTCTGCA
TGAATACACAAAGTCCATTGCACCGCCTAAAAAGCCTAAGTTGTTCAAAAAATTAAGCGT
TGGCCGCTTGTTGCATGAGAACTTGAACTCCGGGGGAGATGAGCATTGTTCGGAGACATG
TAGGTTTCTAAATATGATCATTTTCTTCGTTTTCAACGAATGGAGAAACTCAATGGACCT
ACACAAGTGGGTGTTAAAGAAAATCAATGTGGAGCTGATGGAGTTAATGGAAACAAAAGC
TGCTAGCCGGTTTTTACAGTCGCTTAAAATCCATGACATAGAACTTGGGAGTAATTTGCC
GATAATACACGGTGTAACTATGGATGATCCAAAGTGTCAGATAAATGGACCATTACCGGA
CAATGTAACCATAGATATTGATATTGAATATGACGGAAATCTCCGTCTAGCTGTGGACGT
GGATTTAGTGTTCGGTAAAACTGCATTTGTTTCGCTTCGGATTAAATATTTAAAGGGGAG
CATTCGACTTCAATTTTCACGATTCCCATGTGCGCATTGGTCAGTATGTTTTGTGGAGGA
ACCAGACATTAAGTTTGACGTTGATACAAGTTTTGAGACGAAGCAACTTCCCCAACTTGG
GTCTTTAATTGTGAACCAGATTCGACGAACAATTAAAAAGAAACACACCTTTCCACATTA
TAAACTACGGTACAACCCAGTCTTTTCGTTCCAGCACGTCAAGCATCATTCTGAGGAGGA
AGTAAGTGAAGTCCATGTAAATCTGACAGCTGTTGAAGTAATTATAGCTGCATGTACAAG
ACTGCTTATTCCTGTAAAAGACGGAAAAGATCCAAACTCTCAAACTGTTGTTTTCGCGAC
ATTGTCGCTTGATGAGGTATCCTGTGAGAATACGCCCTTGTTAAATGAGGAAAAAATAGA
AAGAAGTTTTTTTGGTTCGCCACAAAAAGAGAAACGAGATGTGAGTTCTGAAGTTAAAGC
AAACGGGATAAACTTAGAGCCTAAAAAACTTTTTCAAACTTTTACAAATGGTTCAGCAAG
TACAAGTGAAAAGCTTAGCACAACACATGAAACTTTGAAGGCAAGCACGTCTAACCTTTC
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TCCGTCAACTCTTTCCTACTTAATGGTGACGCGTAATTTTAGTGCTACATTACACGAATT
GCCTTTCACCAAACCAGACGGTGAAACAGTGACTGCTGTTCATGTTAAATCACTCACGGA
AAACGCGTCGATATTTAGACAGTCTGGAATTCATACTGGAGATAAAATTCTCGAGATAAA
CGGGAATTCTATCTCGTCATTAAGCCAAGCTGTAGCGGTGATTGAGAGCATTAGAAACAA
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TAGCACAGTGGATCTGGATTCATCTTGTGATAGGTTTACTAATAAAGGAAGCTTCTTAAC
TGAAGAAATGACGAATGATAGCCTTCATAGTGATGAAGACACTGAATCAGATTACTCTGA
TCTTGACTCTGAAGAGTACAGGGAGCTGCTTAAAATTGAGGAGAATGTATTAAAACCAAA
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TTTTTCTACAGACCGAGAATCAAATTCAGAAAAACTAAATTTTGCCAAAGTAACTAAAAC
TTCCGTTATTTCAAAGACCACACTCTGCCCTACCGGAAGCAACGAATACACATGGAAAAA
TGAAAAATTTAAACTGCCTGTCACAACCGAACATAAGTACCTCAATATACGGTTTTGGTT
TGCTTCGAAAAACCAGCCAATGGCGAATTATACGCAGCCAAAGCTTATGGGAAATCTAGC
CATTCCATTATTCGAGCTTGAAATGCATTGTCGATTGGTAACGTCACAGAAATTCACACG
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GAATTTTCGACACAGAAGCGGTTTTCGACTTGAGTATTGTTTTGGAGACGCTACAATCAT
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ACATCTGCGGACCAAAGTAAAATACTTAAACTAGATTTAGTTTAATATATATATATATAT
ATATATATAATACGTCCCAGCTTTTACTCTTCAATTTTGCATTTGCTCTTTCATGTTTAC
ATCATGTACAGTTTTTCATTTTAAATCTTACTCTTTTCTGCCAATATGAAAATTACTTTT
ATATTTTTTCCGTGCAGTAAATATAAAACCCAGGGTTATTTAGTTTGTACATTAATTGTA
GTTGTGCAAATATCTTCACTTTTATCATCAATTTCTTCATTGCTTTTTCTTACATGCCTT
CCAGTGCAATTTTACCCAATTATAATTTATTTAACAATTCTACAACAGCAGAGTTATTTA
CTTTAGATATATCTTCAGTTGTATCCTGTTTTAATTAAAATGTATTTTAATTGAATATAA
AAAGTTTAATGGCATTTTTGGATAAAATTAAAACTATTCTCAGGGTAAAACCAATTAATA
TTTATACTTTGCATTCAAATAGTTTTGGATATTTTCTTTTGTAATTTTATCTTTTTTGAA
AGTTTTTTTATTAAGGAAGTTTGGTATTGTATCATTAGGGTTCCCACTGCTTAGCAGTTG
TTTAAAATTGTTTTATAATCATGTTCTAGTCTTCCATTCTGTATTTGCGCAAACAAATGA
CACATGATGTATTTTATGAATAACTGATTCATTGTTTAATGTTTCATGCCCATTTTTCTC
ATAATGCATTTCTATCTTCTTTGCCACATTTTCTTCCGTCTATTTTTATATTTTAAGCCA
TACAATGCAAGGAAAAGCATGCAAGTTTCAATATAGTAGGATGGGTGAAGATGGGACACC
TTTTCATTCTATTTTCTCGTCCCATTTGGTAGTAAACAAAGAACATTCAAAGAATTATAA
AAATCGTATACTCACGAATCCCATAGACCGTTGTTAATTGTTTAAAACACGATCAGAATA
TTTGGATATTATGTGTTAAAGGTGTCCAATCTTACCTCACCCTACTATATGTTATCTACA
TTGGTTACATTATACTATACAAGGTTTATTGGCTGATTCATACCATGATACTGTCCTATT
ACTCATTGGTGTTTTTCACACATTATTTATTGCAGTGGTTTTGAATCATAGGGAAACTAA
AACTATAGGATAGTGGATTTTTTAAATCTGTACAAGACCGTATTTTAGTGGTTTTTAAAC
TATGTGGTGCACATACTTGTTCATGAAAACCACATATACAATATATATATCTGTGGTTAA
GTCCTTGCAATTTGTGCCTAAATATTTGGTCTGATTTTTGCAGTTTTTTTTGCTACTGTT
ACCAGCTAAACCCAATTTAGTTTAAACACTGCTATTATATATATATTGTATTTCTTTACA
GTGAAATAATCAGTACCCATCATTAACTATCTATCAATGTATTAGTACAAGCAGATTAAA
AACCACTGCCTTAAAATATGATGTGCAATAAAACCGTAGACTTGCCGAATTTTTATCTTT
GTGTTAACTTAAAGATTAATGTTTTGTTGTTTTTACA

InterProScan

Pfam
MMM1_dom (IPR019411) - T[84-198] 9.3E-6
SMART
PDZ (IPR001478) - T[442-523] 9.2E-4
ProSiteProfiles
PDZ (IPR001478) - T[458-523] 9.612
Pfam
PDZ (IPR001478) - T[460-513] 2.3E-6
SUPERFAMILY
PDZ_sf (IPR036034) - T[462-521] 5.52E-7

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
PDZD8_HUMAN 34.925 % 199 3.82E-53