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  1. Transcript 'KH2012:KH.L14.2.v2.A...'

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.L14.2.v2.A.SL3-1

Possible name(s)

SLC28A1; SLC28A2; SLC28A3

Location

KhL14 [1,459 / 12,421]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 592

>KH.L14.2.v2.A.SL3-1
EEPIELEECDLEKGEKVKLNEEVEPEVASQKNGRSCIGILLIPVLFLKSFYSERKTVFKY
IFLGLLLTGYMVYFIIAIARDPLAAKPLIILTLVILFLVLYELRFKKLFLLFFKQIKSKV
HIKKETKNKITRFLPYVQILICVAFCIWLLVDMIIRNPSTLISVVGFIVILVVCICASTQ
PKCINWRPVIWGIGLQFILGLVVLRTSAGYTAIKFIGDQIATFMKYTDSGSTFVFGYLPS
DHIFAFKVLPMIVFFSMVTNMLFYVGLMQWFIAKLAYLTQITLGTSAIESAVAIANIFVG
MTEAPLIVRPYLPELTKAEIHSVLTTGLASISFSVFGVYIGFGVDGVHLLTACVMSAPAG
LVVSRLLYPEVEKSKFMNTGSLALSAGTNRNIVEAAAAGASMSIKLVANIGANLIAFLAL
LAFINATLHWFGAFVGIPQLSFEVICSYLFMPVAFLMGADWEDCFLVGQLFGMKTFLNEF
IAYEAMKPFINNRLNQNVVPKFINGTIQYMSERSEMVAIHALCGFCNVSSLGIIIGGLSV
LMPNKKKDLAEMSVRALMGGMIACCMTASISGMLFVEPILASTSNMTATPSP

Nucleotide sequence

Length: 4,144

>KH2012:KH.L14.2.v2.A.SL3-1
GAAGAACCAATCGAACTTGAAGAATGCGATTTAGAGAAAGGGGAAAAAGTTAAATTGAAT
GAAGAAGTTGAACCTGAGGTGGCTTCGCAGAAAAATGGGAGAAGTTGTATAGGGATTCTT
TTGATCCCCGTCCTATTTCTAAAATCATTTTACTCTGAAAGGAAAACTGTCTTCAAATAT
ATTTTCCTTGGCTTGTTGCTTACAGGTTACATGGTGTATTTCATCATAGCCATAGCTAGA
GACCCCCTCGCTGCTAAACCTCTCATCATACTAACACTGGTTATTCTGTTTCTTGTTTTG
TACGAGTTGAGGTTCAAGAAGTTATTCTTGTTATTCTTTAAACAAATCAAATCAAAGGTT
CATATTAAAAAGGAAACCAAGAACAAGATCACACGGTTTCTGCCATATGTTCAGATCTTG
ATATGTGTTGCTTTCTGTATATGGTTGTTGGTTGATATGATTATAAGGAATCCAAGCACT
CTCATATCAGTTGTTGGGTTCATTGTAATACTGGTGGTTTGTATATGTGCTTCTACGCAA
CCAAAATGTATCAACTGGCGACCAGTTATTTGGGGGATTGGTCTTCAATTTATCCTTGGG
CTCGTAGTTCTACGCACCAGTGCTGGGTACACTGCTATTAAGTTCATTGGGGACCAGATT
GCTACTTTCATGAAATACACTGATAGTGGATCGACGTTTGTGTTCGGATATCTACCAAGC
GATCATATCTTCGCTTTCAAGGTTCTTCCCATGATCGTGTTCTTTAGCATGGTAACCAAC
ATGTTGTTCTACGTTGGTTTAATGCAATGGTTCATCGCAAAACTTGCGTATCTCACCCAA
ATCACATTGGGAACATCTGCCATTGAATCTGCAGTGGCGATCGCAAATATATTTGTGGGA
ATGACAGAAGCGCCCTTGATAGTACGTCCGTACCTTCCTGAGTTAACCAAAGCTGAGATC
CACTCCGTTCTCACCACTGGGCTCGCTTCAATCTCATTCTCCGTGTTTGGGGTCTACATT
GGGTTCGGGGTCGATGGCGTCCATCTGCTCACAGCATGTGTAATGTCGGCACCAGCAGGA
TTAGTAGTATCTAGGTTGTTGTATCCTGAGGTGGAGAAATCTAAGTTCATGAACACGGGA
TCCCTTGCTCTGTCTGCGGGAACAAACCGCAACATAGTGGAAGCAGCAGCAGCTGGAGCT
TCCATGTCAATCAAACTCGTCGCAAATATCGGAGCAAATTTGATCGCTTTCCTTGCGTTG
CTTGCTTTTATTAACGCAACGTTGCACTGGTTTGGGGCGTTTGTTGGAATCCCTCAGCTG
TCTTTTGAGGTAATCTGCAGCTACCTTTTCATGCCCGTGGCTTTCCTGATGGGAGCTGAT
TGGGAAGATTGTTTCCTCGTTGGTCAGTTATTTGGCATGAAGACTTTCCTTAATGAGTTT
ATCGCATACGAAGCGATGAAACCATTTATCAACAACAGATTGAACCAAAATGTTGTCCCC
AAGTTTATCAATGGAACCATACAGTATATGTCGGAGAGATCGGAAATGGTGGCCATTCAT
GCATTGTGTGGTTTCTGTAATGTCAGTTCACTTGGTATTATTATTGGTGGTTTAAGTGTT
CTGATGCCAAACAAAAAGAAAGATTTAGCCGAGATGTCGGTGCGAGCCCTTATGGGTGGG
ATGATTGCTTGTTGTATGACGGCTTCTATATCAGGAATGTTATTTGTTGAACCCATCTTG
GCATCTACTTCCAATATGACAGCCACCCCTTCACCATGAAGTTACAAACATATTTTTACC
TTCCCTGCTTAGTGGTTTCCACTCCTTCTACACTCCATCATACACAACTTTTTATACTTT
CCTACTTTGCTTGAAGCATTGTGTACATAAGTCCACTGCCATTATTTCAATCATGTAGCA
TCTGATACACAAGTGCCTTAGATATCAAGACAACTCCTTTGAGTATTCTTTGTTTTCTAC
AAAATGGGACAACAAAAAAAATTCAAAACATGGACCATCTTACCCCAACCTACTGTATTG
CACCAGATAGTATTTGCAATGTATTGAAACAACAACTGCTGGCTTCATTTGGAAAATCTT
TAACTTCTAATTCTTCTACATTCCTTACCTTGTTACTCAATGAAGCATCCGTGGTTTGTT
ACGAATATATATATAAATAGTATGCCTCCTGAAATAAACCTACAACGAGGAAATTAATGC
CTATGTTTGAAGCCGACCCTACGATGCCTCTCAAGATTTAGTTCTTACTTTGCGAAAACG
TTCTGTGTGTTTGAATGAAACTACAATGTACATTGAAAGAGTATCAACCCAAGCTGAAGT
ATTTATCTTGTCATCCCTGGAAGCCAAACCTGCTATACACCTCCCTGTTGCTTGAAACTT
TTCCACATCTGGTCAAAACCGCTGTTATTCTGCTGCTCATTCCGTTCACATTCATCTACA
GTTCCCCTTTTTATAATTTATTGTGTGCTTCTCTTTCATACAAGCAACACTAGGATGTCC
CCCCCACTCCTACTGGCCCTGTTACATATTAAACCATTAACCAGCTGAACCATCCATTCC
TTCAACATGAAGCCCCATACGTGTCCTTTGATCTTACGTTCCATTTACATTCAACTACAA
CCCACTTCGCCCCCTCATTTTAATTTTACCGCGTGCTTCTCTCCCAGACAAGTCTTGCAA
GATATCTCCTTCTCTTACTGGTAGTTTCACATAATGAACCATCCAGCAATTCCTCAAGTC
CCATTTTTTAACCCTTTGTCTGTCACCATGTTCCTCCCCTACTAATGTTGTGTTTGTGGA
TGTGCGGAGTCTTTTGTTTTTTCCGCTGCTAGTCCCTGCATGTTTTAATGCGACGACAAA
TCTCCATTTTTGCTTTATACCAGCTCTGGTTTTCCTTTCAGACTCTTAGACCAACACAAC
GATATATTTCCACTTTCCCCTTTTACATATTAAACCATTAACCAGCTAAAACCACCCAGA
AATTCAGCATGAAGTCAAATACATTGCCCTTTGGTCGGTACCATGTTAATCCAGAAAGCC
AAACTACTCTGCCTGTCAGGACTCTTACTGCTCATTTTGTTAACTGTTCTGTTTATACCA
CTGCTGTTAAGTTCATTCATGAAGCATCTTAGAAAAGTTACTTGAATGTAACTACCACCA
CTCCAACCTATGAGAAGATTCTCTAACAGTATGTTGGAAACCAAACTACACAATGCCTCT
GGAAATTTCTTTAAAAAAAATTGTTGTTCTGTTTATAACTCTGCTATATATTGAAGCATC
TTGTACACAAGTTCCGTGAAGATAAAAGCTTTTAGTGTTACTGTAACTGTTAAGCAGACC
ATGTAATGGAAAGATACATTTCTTAGTAGTTTATTCACGTTAAGCCTGATTAATCCTTGA
ATCTTCCAAGAATTCACCATGGACTTCATAAGACATGAACCTACCACATCATTAGAACCC
TGTGGGCTCTCACCCATGTAAATTGTTCTGTAGTTCTTACTTTCTTATCCCTGGATTTCA
AACTACAGTTGCTGTAATGCTCGTGAAAGGGCCCTTTAATCTGCCTGTGAAAGGGCCCTT
TTAATCTCTACCTATGTTCAGGAAAATTATCCGAAACCACTTTAAAAGGCCCTGTTGTAT
GAAGCCTTTCGTTTTTTTGCTTGTTCCGTTTGTTCTAGTGTGTTGGTTCGTAGCTTTGCT
TTGCCAGGATTGCTTTACTCGTTCAATATGTTCCATAATTGAATGTATAAAGAGACAAAA
CAACTTTGAATGAATGGATTGTATCTGATTGTTGCTTTGGTATGTTAGTCTTATTTATCT
GCAAGTATTGCATCAGTTATCCCATCGACGGTAGGTTACAACAGAATTTGATACATTACT
GCGTTGTAGGATGGATACCATTGATTAGACAATGATATTCCATATTTTTTAATCCTGTTT
TAATAATTAGCAAAAACGACATGGGAGGATTCAGTTTTACATATTCTTTTTTTTTGCAAC
CAAATTGGGATGATAAAATAGAATTAAACATTAGGCTTTCCAACCAACGAAATATTATTT
TATCCCGGAGGTATTTGTTTATTCACTTAATAGCAGACTGGTGTTAGTAACCAGGGTAGC
GAGA

InterProScan

PANTHER
CNT3 (IPR030211) - T[37-579] 5.6E-184
PANTHER
C_nuclsd_transpt (IPR008276) - T[37-579] 5.6E-184
TIGRFAM
C_nuclsd_transpt_met_bac (IPR018270) - T[161-574] 1.7E-134
Pfam
CNT_N_dom (IPR002668) - T[165-238] 3.5E-24
Pfam
CNT_C_dom (IPR011657) - T[348-574] 7.5E-70

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
S28A1_HUMAN 41.696 % 444 4.15E-149
S28A2_HUMAN 39.825 % 417 9.8E-139
S28A3_HUMAN 44.674 % 479 1.66E-162