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  1. Transcript 'KH2012:KH.L14.2.v1.R...'

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.L14.2.v1.R.ND1-1

Possible name(s)

SLC28A1; SLC28A2; SLC28A3

Location

KhL14 [1,459 / 12,828]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 597

>KH.L14.2.v1.R.ND1-1
NMGEKEEPIELEECDLEKGEKVKLNEEVEPEVASQKNGRSCIGILLIPVLFLKSFYSERK
TVFKYIFLGLLLTGYMVYFIIAIARDPLAAKPLIILTLVILFLVLYELRFKKLFLLFFKQ
IKSKVHIKKETKNKITRFLPYVQILICVAFCIWLLVDMIIRNPSTLISVVGFIVILVVCI
CASTQPKCINWRPVIWGIGLQFILGLVVLRTSAGYTAIKFIGDQIATFMKYTDSGSTFVF
GYLPSDHIFAFKVLPMIVFFSMVTNMLFYVGLMQWFIAKLAYLTQITLGTSAIESAVAIA
NIFVGMTEAPLIVRPYLPELTKAEIHSVLTTGLASISFSVFGVYIGFGVDGVHLLTACVM
SAPAGLVVSRLLYPEVEKSKFMNTGSLALSAGTNRNIVEAAAAGASMSIKLVANIGANLI
AFLALLAFINATLHWFGAFVGIPQLSFEVICSYLFMPVAFLMGADWEDCFLVGQLFGMKT
FLNEFIAYEAMKPFINNRLNQNVVPKFINGTIQYMSERSEMVAIHALCGFCNVSSLGIII
GGLSVLMPNKKKDLAEMSVRALMGGMIACCMTASISGMLFVEPILASTSNMTATPSP

Nucleotide sequence

Length: 4,232

>KH2012:KH.L14.2.v1.R.ND1-1
ATGTGGTTACTGTACGGTTAATGTTTTGCGAGTATTGTGGAGCAGAAAAGTATAAGCACG
GAAAAAACAATAAAACATGGGAGAAAAGGAAGAACCAATCGAACTTGAAGAATGCGATTT
AGAGAAAGGGGAAAAAGTTAAATTGAATGAAGAAGTTGAACCTGAGGTGGCTTCGCAGAA
AAATGGGAGAAGTTGTATAGGGATTCTTTTGATCCCCGTCCTATTTCTAAAATCATTTTA
CTCTGAAAGGAAAACTGTCTTCAAATATATTTTCCTTGGCTTGTTGCTTACAGGTTACAT
GGTGTATTTCATCATAGCCATAGCTAGAGACCCCCTCGCTGCTAAACCTCTCATCATACT
AACACTGGTTATTCTGTTTCTTGTTTTGTACGAGTTGAGGTTCAAGAAGTTATTCTTGTT
ATTCTTTAAACAAATCAAATCAAAGGTTCATATTAAAAAGGAAACCAAGAACAAGATCAC
ACGGTTTCTGCCATATGTTCAGATCTTGATATGTGTTGCTTTCTGTATATGGTTGTTGGT
TGATATGATTATAAGGAATCCAAGCACTCTCATATCAGTTGTTGGGTTCATTGTAATACT
GGTGGTTTGTATATGTGCTTCTACGCAACCAAAATGTATCAACTGGCGACCAGTTATTTG
GGGGATTGGTCTTCAATTTATCCTTGGGCTCGTAGTTCTACGCACCAGTGCTGGGTACAC
TGCTATTAAGTTCATTGGGGACCAGATTGCTACTTTCATGAAATACACTGATAGTGGATC
GACGTTTGTGTTCGGATATCTACCAAGCGATCATATCTTCGCTTTCAAGGTTCTTCCCAT
GATCGTGTTCTTTAGCATGGTAACCAACATGTTGTTCTACGTTGGTTTAATGCAATGGTT
CATCGCAAAACTTGCGTATCTCACCCAAATCACATTGGGAACATCTGCCATTGAATCTGC
AGTGGCGATCGCAAATATATTTGTGGGAATGACAGAAGCGCCCTTGATAGTACGTCCGTA
CCTTCCTGAGTTAACCAAAGCTGAGATCCACTCCGTTCTCACCACTGGGCTCGCTTCAAT
CTCATTCTCCGTGTTTGGGGTCTACATTGGGTTCGGGGTCGATGGCGTCCATCTGCTCAC
AGCATGTGTAATGTCGGCACCAGCAGGATTAGTAGTATCTAGGTTGTTGTATCCTGAGGT
GGAGAAATCTAAGTTCATGAACACGGGATCCCTTGCTCTGTCTGCGGGAACAAACCGCAA
CATAGTGGAAGCAGCAGCAGCTGGAGCTTCCATGTCAATCAAACTCGTCGCAAATATCGG
AGCAAATTTGATCGCTTTCCTTGCGTTGCTTGCTTTTATTAACGCAACGTTGCACTGGTT
TGGGGCGTTTGTTGGAATCCCTCAGCTGTCTTTTGAGGTAATCTGCAGCTACCTTTTCAT
GCCCGTGGCTTTCCTGATGGGAGCTGATTGGGAAGATTGTTTCCTCGTTGGTCAGTTATT
TGGCATGAAGACTTTCCTTAATGAGTTTATCGCATACGAAGCGATGAAACCATTTATCAA
CAACAGATTGAACCAAAATGTTGTCCCCAAGTTTATCAATGGAACCATACAGTATATGTC
GGAGAGATCGGAAATGGTGGCCATTCATGCATTGTGTGGTTTCTGTAATGTCAGTTCACT
TGGTATTATTATTGGTGGTTTAAGTGTTCTGATGCCAAACAAAAAGAAAGATTTAGCCGA
GATGTCGGTGCGAGCCCTTATGGGTGGGATGATTGCTTGTTGTATGACGGCTTCTATATC
AGGAATGTTATTTGTTGAACCCATCTTGGCATCTACTTCCAATATGACAGCCACCCCTTC
ACCATGAAGTTACAAACATATTTTTACCTTCCCTGCTTAGTGGTTTCCACTCCTTCTACA
CTCCATCATACACAACTTTTTATACTTTCCTACTTTGCTTGAAGCATTGTGTACATAAGT
CCACTGCCATTATTTCAATCATGTAGCATCTGATACACAAGTGCCTTAGATATCAAGACA
ACTCCTTTGAGTATTCTTTGTTTTCTACAAAATGGGACAACAAAAAAAATTCAAAACATG
GACCATCTTACCCCAACCTACTGTATTGCACCAGATAGTATTTGCAATGTATTGAAACAA
CAACTGCTGGCTTCATTTGGAAAATCTTTAACTTCTAATTCTTCTACATTCCTTACCTTG
TTACTCAATGAAGCATCCGTGGTTTGTTACGAATATATATATAAATAGTATGCCTCCTGA
AATAAACCTACAACGAGGAAATTAATGCCTATGTTTGAAGCCGACCCTACGATGCCTCTC
AAGATTTAGTTCTTACTTTGCGAAAACGTTCTGTGTGTTTGAATGAAACTACAATGTACA
TTGAAAGAGTATCAACCCAAGCTGAAGTATTTATCTTGTCATCCCTGGAAGCCAAACCTG
CTATACACCTCCCTGTTGCTTGAAACTTTTCCACATCTGGTCAAAACCGCTGTTATTCTG
CTGCTCATTCCGTTCACATTCATCTACAGTTCCCCTTTTTATAATTTATTGTGTGCTTCT
CTTTCATACAAGCAACACTAGGATGTCCCCCCCACTCCTACTGGCCCTGTTACATATTAA
ACCATTAACCAGCTGAACCATCCATTCCTTCAACATGAAGCCCCATACGTGTCCTTTGAT
CTTACGTTCCATTTACATTCAACTACAACCCACTTCGCCCCCTCATTTTAATTTTACCGC
GTGCTTCTCTCCCAGACAAGTCTTGCAAGATATCTCCTTCTCTTACTGGTAGTTTCACAT
AATGAACCATCCAGCAATTCCTCAAGTCCCATTTTTTAACCCTTTGTCTGTCACCATGTT
CCTCCCCTACTAATGTTGTGTTTGTGGATGTGCGGAGTCTTTTGTTTTTTCCGCTGCTAG
TCCCTGCATGTTTTAATGCGACGACAAATCTCCATTTTTGCTTTATACCAGCTCTGGTTT
TCCTTTCAGACTCTTAGACCAACACAACGATATATTTCCACTTTCCCCTTTTACATATTA
AACCATTAACCAGCTAAAACCACCCAGAAATTCAGCATGAAGTCAAATACATTGCCCTTT
GGTCGGTACCATGTTAATCCAGAAAGCCAAACTACTCTGCCTGTCAGGACTCTTACTGCT
CATTTTGTTAACTGTTCTGTTTATACCACTGCTGTTAAGTTCATTCATGAAGCATCTTAG
AAAAGTTACTTGAATGTAACTACCACCACTCCAACCTATGAGAAGATTCTCTAACAGTAT
GTTGGAAACCAAACTACACAATGCCTCTGGAAATTTCTTTAAAAAAAATTGTTGTTCTGT
TTATAACTCTGCTATATATTGAAGCATCTTGTACACAAGTTCCGTGAAGATAAAAGCTTT
TAGTGTTACTGTAACTGTTAAGCAGACCATGTAATGGAAAGATACATTTCTTAGTAGTTT
ATTCACGTTAAGCCTGATTAATCCTTGAATCTTCCAAGAATTCACCATGGACTTCATAAG
ACATGAACCTACCACATCATTAGAACCCTGTGGGCTCTCACCCATGTAAATTGTTCTGTA
GTTCTTACTTTCTTATCCCTGGATTTCAAACTACAGTTGCTGTAATGCTCGTGAAAGGGC
CCTTTAATCTGCCTGTGAAAGGGCCCTTTTAATCTCTACCTATGTTCAGGAAAATTATCC
GAAACCACTTTAAAAGGCCCTGTTGTATGAAGCCTTTCGTTTTTTTGCTTGTTCCGTTTG
TTCTAGTGTGTTGGTTCGTAGCTTTGCTTTGCCAGGATTGCTTTACTCGTTCAATATGTT
CCATAATTGAATGTATAAAGAGACAAAACAACTTTGAATGAATGGATTGTATCTGATTGT
TGCTTTGGTATGTTAGTCTTATTTATCTGCAAGTATTGCATCAGTTATCCCATCGACGGT
AGGTTACAACAGAATTTGATACATTACTGCGTTGTAGGATGGATACCATTGATTAGACAA
TGATATTCCATATTTTTTAATCCTGTTTTAATAATTAGCAAAAACGACATGGGAGGATTC
AGTTTTACATATTCTTTTTTTTTGCAACCAAATTGGGATGATAAAATAGAATTAAACATT
AGGCTTTCCAACCAACGAAATATTATTTTATCCCGGAGGTATTTGTTTATTCACTTAATA
GCAGACTGGTGTTAGTAACCAGGGTAGCGAGA

InterProScan

PANTHER
C_nuclsd_transpt (IPR008276) - T[42-584] 5.8E-184
PANTHER
CNT3 (IPR030211) - T[42-584] 5.8E-184
TIGRFAM
C_nuclsd_transpt_met_bac (IPR018270) - T[166-579] 1.7E-134
Pfam
CNT_N_dom (IPR002668) - T[170-243] 3.5E-24
Pfam
CNT_C_dom (IPR011657) - T[353-579] 7.6E-70

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
S28A1_HUMAN 41.667 % 446 5.36E-150
S28A2_HUMAN 39.825 % 417 1.44E-138
S28A3_HUMAN 44.463 % 483 1.42E-163