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  1. Transcript 'KH2012:KH.L14.2.v1.A...'

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.L14.2.v1.A.nonSL8-1

Possible name(s)

SLC28A1; SLC28A2; SLC28A3

Location

KhL14 [1,459 / 12,845]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 597

>KH.L14.2.v1.A.nonSL8-1
NMGEKEEPIELEECDLEKGEKVKLNEEVEPEVASQKNGRSCIGILLIPVLFLKSFYSERK
TVFKYIFLGLLLTGYMVYFIIAIARDPLAAKPLIILTLVILFLVLYELRFKKLFLLFFKQ
IKSKVHIKKETKNKITRFLPYVQILICVAFCIWLLVDMIIRNPSTLISVVGFIVILVVCI
CASTQPKCINWRPVIWGIGLQFILGLVVLRTSAGYTAIKFIGDQIATFMKYTDSGSTFVF
GYLPSDHIFAFKVLPMIVFFSMVTNMLFYVGLMQWFIAKLAYLTQITLGTSAIESAVAIA
NIFVGMTEAPLIVRPYLPELTKAEIHSVLTTGLASISFSVFGVYIGFGVDGVHLLTACVM
SAPAGLVVSRLLYPEVEKSKFMNTGSLALSAGTNRNIVEAAAAGASMSIKLVANIGANLI
AFLALLAFINATLHWFGAFVGIPQLSFEVICSYLFMPVAFLMGADWEDCFLVGQLFGMKT
FLNEFIAYEAMKPFINNRLNQNVVPKFINGTIQYMSERSEMVAIHALCGFCNVSSLGIII
GGLSVLMPNKKKDLAEMSVRALMGGMIACCMTASISGMLFVEPILASTSNMTATPSP

Nucleotide sequence

Length: 4,249

>KH2012:KH.L14.2.v1.A.nonSL8-1
GTACCAGTTTGGTGTGTATGTGGTTACTGTACGGTTAATGTTTTGCGAGTATTGTGGAGC
AGAAAAGTATAAGCACGGAAAAAACAATAAAACATGGGAGAAAAGGAAGAACCAATCGAA
CTTGAAGAATGCGATTTAGAGAAAGGGGAAAAAGTTAAATTGAATGAAGAAGTTGAACCT
GAGGTGGCTTCGCAGAAAAATGGGAGAAGTTGTATAGGGATTCTTTTGATCCCCGTCCTA
TTTCTAAAATCATTTTACTCTGAAAGGAAAACTGTCTTCAAATATATTTTCCTTGGCTTG
TTGCTTACAGGTTACATGGTGTATTTCATCATAGCCATAGCTAGAGACCCCCTCGCTGCT
AAACCTCTCATCATACTAACACTGGTTATTCTGTTTCTTGTTTTGTACGAGTTGAGGTTC
AAGAAGTTATTCTTGTTATTCTTTAAACAAATCAAATCAAAGGTTCATATTAAAAAGGAA
ACCAAGAACAAGATCACACGGTTTCTGCCATATGTTCAGATCTTGATATGTGTTGCTTTC
TGTATATGGTTGTTGGTTGATATGATTATAAGGAATCCAAGCACTCTCATATCAGTTGTT
GGGTTCATTGTAATACTGGTGGTTTGTATATGTGCTTCTACGCAACCAAAATGTATCAAC
TGGCGACCAGTTATTTGGGGGATTGGTCTTCAATTTATCCTTGGGCTCGTAGTTCTACGC
ACCAGTGCTGGGTACACTGCTATTAAGTTCATTGGGGACCAGATTGCTACTTTCATGAAA
TACACTGATAGTGGATCGACGTTTGTGTTCGGATATCTACCAAGCGATCATATCTTCGCT
TTCAAGGTTCTTCCCATGATCGTGTTCTTTAGCATGGTAACCAACATGTTGTTCTACGTT
GGTTTAATGCAATGGTTCATCGCAAAACTTGCGTATCTCACCCAAATCACATTGGGAACA
TCTGCCATTGAATCTGCAGTGGCGATCGCAAATATATTTGTGGGAATGACAGAAGCGCCC
TTGATAGTACGTCCGTACCTTCCTGAGTTAACCAAAGCTGAGATCCACTCCGTTCTCACC
ACTGGGCTCGCTTCAATCTCATTCTCCGTGTTTGGGGTCTACATTGGGTTCGGGGTCGAT
GGCGTCCATCTGCTCACAGCATGTGTAATGTCGGCACCAGCAGGATTAGTAGTATCTAGG
TTGTTGTATCCTGAGGTGGAGAAATCTAAGTTCATGAACACGGGATCCCTTGCTCTGTCT
GCGGGAACAAACCGCAACATAGTGGAAGCAGCAGCAGCTGGAGCTTCCATGTCAATCAAA
CTCGTCGCAAATATCGGAGCAAATTTGATCGCTTTCCTTGCGTTGCTTGCTTTTATTAAC
GCAACGTTGCACTGGTTTGGGGCGTTTGTTGGAATCCCTCAGCTGTCTTTTGAGGTAATC
TGCAGCTACCTTTTCATGCCCGTGGCTTTCCTGATGGGAGCTGATTGGGAAGATTGTTTC
CTCGTTGGTCAGTTATTTGGCATGAAGACTTTCCTTAATGAGTTTATCGCATACGAAGCG
ATGAAACCATTTATCAACAACAGATTGAACCAAAATGTTGTCCCCAAGTTTATCAATGGA
ACCATACAGTATATGTCGGAGAGATCGGAAATGGTGGCCATTCATGCATTGTGTGGTTTC
TGTAATGTCAGTTCACTTGGTATTATTATTGGTGGTTTAAGTGTTCTGATGCCAAACAAA
AAGAAAGATTTAGCCGAGATGTCGGTGCGAGCCCTTATGGGTGGGATGATTGCTTGTTGT
ATGACGGCTTCTATATCAGGAATGTTATTTGTTGAACCCATCTTGGCATCTACTTCCAAT
ATGACAGCCACCCCTTCACCATGAAGTTACAAACATATTTTTACCTTCCCTGCTTAGTGG
TTTCCACTCCTTCTACACTCCATCATACACAACTTTTTATACTTTCCTACTTTGCTTGAA
GCATTGTGTACATAAGTCCACTGCCATTATTTCAATCATGTAGCATCTGATACACAAGTG
CCTTAGATATCAAGACAACTCCTTTGAGTATTCTTTGTTTTCTACAAAATGGGACAACAA
AAAAAATTCAAAACATGGACCATCTTACCCCAACCTACTGTATTGCACCAGATAGTATTT
GCAATGTATTGAAACAACAACTGCTGGCTTCATTTGGAAAATCTTTAACTTCTAATTCTT
CTACATTCCTTACCTTGTTACTCAATGAAGCATCCGTGGTTTGTTACGAATATATATATA
AATAGTATGCCTCCTGAAATAAACCTACAACGAGGAAATTAATGCCTATGTTTGAAGCCG
ACCCTACGATGCCTCTCAAGATTTAGTTCTTACTTTGCGAAAACGTTCTGTGTGTTTGAA
TGAAACTACAATGTACATTGAAAGAGTATCAACCCAAGCTGAAGTATTTATCTTGTCATC
CCTGGAAGCCAAACCTGCTATACACCTCCCTGTTGCTTGAAACTTTTCCACATCTGGTCA
AAACCGCTGTTATTCTGCTGCTCATTCCGTTCACATTCATCTACAGTTCCCCTTTTTATA
ATTTATTGTGTGCTTCTCTTTCATACAAGCAACACTAGGATGTCCCCCCCACTCCTACTG
GCCCTGTTACATATTAAACCATTAACCAGCTGAACCATCCATTCCTTCAACATGAAGCCC
CATACGTGTCCTTTGATCTTACGTTCCATTTACATTCAACTACAACCCACTTCGCCCCCT
CATTTTAATTTTACCGCGTGCTTCTCTCCCAGACAAGTCTTGCAAGATATCTCCTTCTCT
TACTGGTAGTTTCACATAATGAACCATCCAGCAATTCCTCAAGTCCCATTTTTTAACCCT
TTGTCTGTCACCATGTTCCTCCCCTACTAATGTTGTGTTTGTGGATGTGCGGAGTCTTTT
GTTTTTTCCGCTGCTAGTCCCTGCATGTTTTAATGCGACGACAAATCTCCATTTTTGCTT
TATACCAGCTCTGGTTTTCCTTTCAGACTCTTAGACCAACACAACGATATATTTCCACTT
TCCCCTTTTACATATTAAACCATTAACCAGCTAAAACCACCCAGAAATTCAGCATGAAGT
CAAATACATTGCCCTTTGGTCGGTACCATGTTAATCCAGAAAGCCAAACTACTCTGCCTG
TCAGGACTCTTACTGCTCATTTTGTTAACTGTTCTGTTTATACCACTGCTGTTAAGTTCA
TTCATGAAGCATCTTAGAAAAGTTACTTGAATGTAACTACCACCACTCCAACCTATGAGA
AGATTCTCTAACAGTATGTTGGAAACCAAACTACACAATGCCTCTGGAAATTTCTTTAAA
AAAAATTGTTGTTCTGTTTATAACTCTGCTATATATTGAAGCATCTTGTACACAAGTTCC
GTGAAGATAAAAGCTTTTAGTGTTACTGTAACTGTTAAGCAGACCATGTAATGGAAAGAT
ACATTTCTTAGTAGTTTATTCACGTTAAGCCTGATTAATCCTTGAATCTTCCAAGAATTC
ACCATGGACTTCATAAGACATGAACCTACCACATCATTAGAACCCTGTGGGCTCTCACCC
ATGTAAATTGTTCTGTAGTTCTTACTTTCTTATCCCTGGATTTCAAACTACAGTTGCTGT
AATGCTCGTGAAAGGGCCCTTTAATCTGCCTGTGAAAGGGCCCTTTTAATCTCTACCTAT
GTTCAGGAAAATTATCCGAAACCACTTTAAAAGGCCCTGTTGTATGAAGCCTTTCGTTTT
TTTGCTTGTTCCGTTTGTTCTAGTGTGTTGGTTCGTAGCTTTGCTTTGCCAGGATTGCTT
TACTCGTTCAATATGTTCCATAATTGAATGTATAAAGAGACAAAACAACTTTGAATGAAT
GGATTGTATCTGATTGTTGCTTTGGTATGTTAGTCTTATTTATCTGCAAGTATTGCATCA
GTTATCCCATCGACGGTAGGTTACAACAGAATTTGATACATTACTGCGTTGTAGGATGGA
TACCATTGATTAGACAATGATATTCCATATTTTTTAATCCTGTTTTAATAATTAGCAAAA
ACGACATGGGAGGATTCAGTTTTACATATTCTTTTTTTTTGCAACCAAATTGGGATGATA
AAATAGAATTAAACATTAGGCTTTCCAACCAACGAAATATTATTTTATCCCGGAGGTATT
TGTTTATTCACTTAATAGCAGACTGGTGTTAGTAACCAGGGTAGCGAGA

InterProScan

PANTHER
C_nuclsd_transpt (IPR008276) - T[42-584] 5.8E-184
PANTHER
CNT3 (IPR030211) - T[42-584] 5.8E-184
TIGRFAM
C_nuclsd_transpt_met_bac (IPR018270) - T[166-579] 1.7E-134
Pfam
CNT_N_dom (IPR002668) - T[170-243] 3.5E-24
Pfam
CNT_C_dom (IPR011657) - T[353-579] 7.6E-70

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
S28A1_HUMAN 41.667 % 446 5.36E-150
S28A2_HUMAN 39.825 % 417 1.44E-138
S28A3_HUMAN 44.463 % 483 1.42E-163