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  1. Transcript 'KH2012:KH.L14.2.v1.A...'

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.L14.2.v1.A.nonSL7-1

Possible name(s)

SLC28A1; SLC28A2; SLC28A3

Location

KhL14 [1,459 / 12,840]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 597

>KH.L14.2.v1.A.nonSL7-1
NMGEKEEPIELEECDLEKGEKVKLNEEVEPEVASQKNGRSCIGILLIPVLFLKSFYSERK
TVFKYIFLGLLLTGYMVYFIIAIARDPLAAKPLIILTLVILFLVLYELRFKKLFLLFFKQ
IKSKVHIKKETKNKITRFLPYVQILICVAFCIWLLVDMIIRNPSTLISVVGFIVILVVCI
CASTQPKCINWRPVIWGIGLQFILGLVVLRTSAGYTAIKFIGDQIATFMKYTDSGSTFVF
GYLPSDHIFAFKVLPMIVFFSMVTNMLFYVGLMQWFIAKLAYLTQITLGTSAIESAVAIA
NIFVGMTEAPLIVRPYLPELTKAEIHSVLTTGLASISFSVFGVYIGFGVDGVHLLTACVM
SAPAGLVVSRLLYPEVEKSKFMNTGSLALSAGTNRNIVEAAAAGASMSIKLVANIGANLI
AFLALLAFINATLHWFGAFVGIPQLSFEVICSYLFMPVAFLMGADWEDCFLVGQLFGMKT
FLNEFIAYEAMKPFINNRLNQNVVPKFINGTIQYMSERSEMVAIHALCGFCNVSSLGIII
GGLSVLMPNKKKDLAEMSVRALMGGMIACCMTASISGMLFVEPILASTSNMTATPSP

Nucleotide sequence

Length: 4,244

>KH2012:KH.L14.2.v1.A.nonSL7-1
AGTTTGGTGTGTATGTGGTTACTGTACGGTTAATGTTTTGCGAGTATTGTGGAGCAGAAA
AGTATAAGCACGGAAAAAACAATAAAACATGGGAGAAAAGGAAGAACCAATCGAACTTGA
AGAATGCGATTTAGAGAAAGGGGAAAAAGTTAAATTGAATGAAGAAGTTGAACCTGAGGT
GGCTTCGCAGAAAAATGGGAGAAGTTGTATAGGGATTCTTTTGATCCCCGTCCTATTTCT
AAAATCATTTTACTCTGAAAGGAAAACTGTCTTCAAATATATTTTCCTTGGCTTGTTGCT
TACAGGTTACATGGTGTATTTCATCATAGCCATAGCTAGAGACCCCCTCGCTGCTAAACC
TCTCATCATACTAACACTGGTTATTCTGTTTCTTGTTTTGTACGAGTTGAGGTTCAAGAA
GTTATTCTTGTTATTCTTTAAACAAATCAAATCAAAGGTTCATATTAAAAAGGAAACCAA
GAACAAGATCACACGGTTTCTGCCATATGTTCAGATCTTGATATGTGTTGCTTTCTGTAT
ATGGTTGTTGGTTGATATGATTATAAGGAATCCAAGCACTCTCATATCAGTTGTTGGGTT
CATTGTAATACTGGTGGTTTGTATATGTGCTTCTACGCAACCAAAATGTATCAACTGGCG
ACCAGTTATTTGGGGGATTGGTCTTCAATTTATCCTTGGGCTCGTAGTTCTACGCACCAG
TGCTGGGTACACTGCTATTAAGTTCATTGGGGACCAGATTGCTACTTTCATGAAATACAC
TGATAGTGGATCGACGTTTGTGTTCGGATATCTACCAAGCGATCATATCTTCGCTTTCAA
GGTTCTTCCCATGATCGTGTTCTTTAGCATGGTAACCAACATGTTGTTCTACGTTGGTTT
AATGCAATGGTTCATCGCAAAACTTGCGTATCTCACCCAAATCACATTGGGAACATCTGC
CATTGAATCTGCAGTGGCGATCGCAAATATATTTGTGGGAATGACAGAAGCGCCCTTGAT
AGTACGTCCGTACCTTCCTGAGTTAACCAAAGCTGAGATCCACTCCGTTCTCACCACTGG
GCTCGCTTCAATCTCATTCTCCGTGTTTGGGGTCTACATTGGGTTCGGGGTCGATGGCGT
CCATCTGCTCACAGCATGTGTAATGTCGGCACCAGCAGGATTAGTAGTATCTAGGTTGTT
GTATCCTGAGGTGGAGAAATCTAAGTTCATGAACACGGGATCCCTTGCTCTGTCTGCGGG
AACAAACCGCAACATAGTGGAAGCAGCAGCAGCTGGAGCTTCCATGTCAATCAAACTCGT
CGCAAATATCGGAGCAAATTTGATCGCTTTCCTTGCGTTGCTTGCTTTTATTAACGCAAC
GTTGCACTGGTTTGGGGCGTTTGTTGGAATCCCTCAGCTGTCTTTTGAGGTAATCTGCAG
CTACCTTTTCATGCCCGTGGCTTTCCTGATGGGAGCTGATTGGGAAGATTGTTTCCTCGT
TGGTCAGTTATTTGGCATGAAGACTTTCCTTAATGAGTTTATCGCATACGAAGCGATGAA
ACCATTTATCAACAACAGATTGAACCAAAATGTTGTCCCCAAGTTTATCAATGGAACCAT
ACAGTATATGTCGGAGAGATCGGAAATGGTGGCCATTCATGCATTGTGTGGTTTCTGTAA
TGTCAGTTCACTTGGTATTATTATTGGTGGTTTAAGTGTTCTGATGCCAAACAAAAAGAA
AGATTTAGCCGAGATGTCGGTGCGAGCCCTTATGGGTGGGATGATTGCTTGTTGTATGAC
GGCTTCTATATCAGGAATGTTATTTGTTGAACCCATCTTGGCATCTACTTCCAATATGAC
AGCCACCCCTTCACCATGAAGTTACAAACATATTTTTACCTTCCCTGCTTAGTGGTTTCC
ACTCCTTCTACACTCCATCATACACAACTTTTTATACTTTCCTACTTTGCTTGAAGCATT
GTGTACATAAGTCCACTGCCATTATTTCAATCATGTAGCATCTGATACACAAGTGCCTTA
GATATCAAGACAACTCCTTTGAGTATTCTTTGTTTTCTACAAAATGGGACAACAAAAAAA
ATTCAAAACATGGACCATCTTACCCCAACCTACTGTATTGCACCAGATAGTATTTGCAAT
GTATTGAAACAACAACTGCTGGCTTCATTTGGAAAATCTTTAACTTCTAATTCTTCTACA
TTCCTTACCTTGTTACTCAATGAAGCATCCGTGGTTTGTTACGAATATATATATAAATAG
TATGCCTCCTGAAATAAACCTACAACGAGGAAATTAATGCCTATGTTTGAAGCCGACCCT
ACGATGCCTCTCAAGATTTAGTTCTTACTTTGCGAAAACGTTCTGTGTGTTTGAATGAAA
CTACAATGTACATTGAAAGAGTATCAACCCAAGCTGAAGTATTTATCTTGTCATCCCTGG
AAGCCAAACCTGCTATACACCTCCCTGTTGCTTGAAACTTTTCCACATCTGGTCAAAACC
GCTGTTATTCTGCTGCTCATTCCGTTCACATTCATCTACAGTTCCCCTTTTTATAATTTA
TTGTGTGCTTCTCTTTCATACAAGCAACACTAGGATGTCCCCCCCACTCCTACTGGCCCT
GTTACATATTAAACCATTAACCAGCTGAACCATCCATTCCTTCAACATGAAGCCCCATAC
GTGTCCTTTGATCTTACGTTCCATTTACATTCAACTACAACCCACTTCGCCCCCTCATTT
TAATTTTACCGCGTGCTTCTCTCCCAGACAAGTCTTGCAAGATATCTCCTTCTCTTACTG
GTAGTTTCACATAATGAACCATCCAGCAATTCCTCAAGTCCCATTTTTTAACCCTTTGTC
TGTCACCATGTTCCTCCCCTACTAATGTTGTGTTTGTGGATGTGCGGAGTCTTTTGTTTT
TTCCGCTGCTAGTCCCTGCATGTTTTAATGCGACGACAAATCTCCATTTTTGCTTTATAC
CAGCTCTGGTTTTCCTTTCAGACTCTTAGACCAACACAACGATATATTTCCACTTTCCCC
TTTTACATATTAAACCATTAACCAGCTAAAACCACCCAGAAATTCAGCATGAAGTCAAAT
ACATTGCCCTTTGGTCGGTACCATGTTAATCCAGAAAGCCAAACTACTCTGCCTGTCAGG
ACTCTTACTGCTCATTTTGTTAACTGTTCTGTTTATACCACTGCTGTTAAGTTCATTCAT
GAAGCATCTTAGAAAAGTTACTTGAATGTAACTACCACCACTCCAACCTATGAGAAGATT
CTCTAACAGTATGTTGGAAACCAAACTACACAATGCCTCTGGAAATTTCTTTAAAAAAAA
TTGTTGTTCTGTTTATAACTCTGCTATATATTGAAGCATCTTGTACACAAGTTCCGTGAA
GATAAAAGCTTTTAGTGTTACTGTAACTGTTAAGCAGACCATGTAATGGAAAGATACATT
TCTTAGTAGTTTATTCACGTTAAGCCTGATTAATCCTTGAATCTTCCAAGAATTCACCAT
GGACTTCATAAGACATGAACCTACCACATCATTAGAACCCTGTGGGCTCTCACCCATGTA
AATTGTTCTGTAGTTCTTACTTTCTTATCCCTGGATTTCAAACTACAGTTGCTGTAATGC
TCGTGAAAGGGCCCTTTAATCTGCCTGTGAAAGGGCCCTTTTAATCTCTACCTATGTTCA
GGAAAATTATCCGAAACCACTTTAAAAGGCCCTGTTGTATGAAGCCTTTCGTTTTTTTGC
TTGTTCCGTTTGTTCTAGTGTGTTGGTTCGTAGCTTTGCTTTGCCAGGATTGCTTTACTC
GTTCAATATGTTCCATAATTGAATGTATAAAGAGACAAAACAACTTTGAATGAATGGATT
GTATCTGATTGTTGCTTTGGTATGTTAGTCTTATTTATCTGCAAGTATTGCATCAGTTAT
CCCATCGACGGTAGGTTACAACAGAATTTGATACATTACTGCGTTGTAGGATGGATACCA
TTGATTAGACAATGATATTCCATATTTTTTAATCCTGTTTTAATAATTAGCAAAAACGAC
ATGGGAGGATTCAGTTTTACATATTCTTTTTTTTTGCAACCAAATTGGGATGATAAAATA
GAATTAAACATTAGGCTTTCCAACCAACGAAATATTATTTTATCCCGGAGGTATTTGTTT
ATTCACTTAATAGCAGACTGGTGTTAGTAACCAGGGTAGCGAGA

InterProScan

PANTHER
C_nuclsd_transpt (IPR008276) - T[42-584] 5.8E-184
PANTHER
CNT3 (IPR030211) - T[42-584] 5.8E-184
TIGRFAM
C_nuclsd_transpt_met_bac (IPR018270) - T[166-579] 1.7E-134
Pfam
CNT_N_dom (IPR002668) - T[170-243] 3.5E-24
Pfam
CNT_C_dom (IPR011657) - T[353-579] 7.6E-70

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
S28A1_HUMAN 41.667 % 446 5.36E-150
S28A2_HUMAN 39.825 % 417 1.44E-138
S28A3_HUMAN 44.463 % 483 1.42E-163